RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000284957.9

RABGEF1-201, Transcript of RAB guanine nucleotide exchange factor 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene RABGEF1, Length 3,733 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGEF1-201ENST00000284957 CRABP2P29373 138 aa9.32□□□□□ -0.92
RABGEF1-201ENST00000284957 GJA4P35212 333 aa9.32□□□□□ -0.92
RABGEF1-201ENST00000284957 PTSQ03393 145 aa9.32□□□□□ -0.92
RABGEF1-201ENST00000284957 COL19A1Q14993 1142 aa9.32□□□□□ -0.92
RABGEF1-201ENST00000284957 C6orf89Q6UWU4 347 aa9.32□□□□□ -0.92
RABGEF1-201ENST00000284957 ATG14Q6ZNE5 492 aa9.32□□□□□ -0.92
RABGEF1-201ENST00000284957 NUDCD3Q8IVD9 361 aa9.32□□□□□ -0.92
RABGEF1-201ENST00000284957 ANKRD49Q8WVL7 239 aa9.32□□□□□ -0.92
RABGEF1-201ENST00000284957 ELSPBP1Q96BH3 223 aa9.32□□□□□ -0.92
RABGEF1-201ENST00000284957 NXNL1Q96CM4 212 aa9.32□□□□□ -0.92
RABGEF1-201ENST00000284957 BIRC8Q96P09 236 aa9.32□□□□□ -0.92
RABGEF1-201ENST00000284957 HEPHQ9BQS7 1158 aa9.32□□□□□ -0.92
RABGEF1-201ENST00000284957 BRD9Q9H8M2 597 aa9.32□□□□□ -0.92
RABGEF1-201ENST00000284957 NMRAL1Q9HBL8 299 aa9.32□□□□□ -0.92
RABGEF1-201ENST00000284957 IL26Q9NPH9 171 aa9.32□□□□□ -0.92
RABGEF1-201ENST00000284957 PKP3Q9Y446 797 aa9.32□□□□□ -0.92
RABGEF1-201ENST00000284957 TARM1B6A8C7 271 aa9.32□□□□□ -0.92
RABGEF1-201ENST00000284957 OR1I1O60431 355 aa9.32□□□□□ -0.92
RABGEF1-201ENST00000284957 FGF3P11487 239 aaPredicted RBP9.32□□□□□ -0.92
RABGEF1-201ENST00000284957 BPIP17213 487 aa9.32□□□□□ -0.92
RABGEF1-201ENST00000284957 NNMTP40261 264 aa9.32□□□□□ -0.92
RABGEF1-201ENST00000284957 BST1Q10588 318 aa9.32□□□□□ -0.92
RABGEF1-201ENST00000284957 CHI3L2Q15782 390 aa9.32□□□□□ -0.92
RABGEF1-201ENST00000284957 CCDC153Q494R4 210 aa9.32□□□□□ -0.92
RABGEF1-201ENST00000284957 SETMARQ53H47 684 aaPredicted RBP9.32□□□□□ -0.92
RABGEF1-201ENST00000284957 ARSIQ5FYB1 569 aa9.32□□□□□ -0.92
RABGEF1-201ENST00000284957 GRAMD4Q6IC98 578 aa9.32□□□□□ -0.92
RABGEF1-201ENST00000284957 ZCCHC23Q6ZST2 131 aa9.32□□□□□ -0.92
RABGEF1-201ENST00000284957 SDCCAG8Q86SQ7 713 aaPredicted RBP9.32□□□□□ -0.92
RABGEF1-201ENST00000284957 C10orf107Q8IVU9 208 aa9.32□□□□□ -0.92
RABGEF1-201ENST00000284957 E2F7Q96AV8 911 aa9.32□□□□□ -0.92
RABGEF1-201ENST00000284957 CCDC97Q96F63 343 aaPredicted RBP9.32□□□□□ -0.92
RABGEF1-201ENST00000284957 UBXN10Q96LJ8 280 aa9.32□□□□□ -0.92
RABGEF1-201ENST00000284957 UNKQ9C0B0 810 aaKnown RBP9.32□□□□□ -0.92
RABGEF1-201ENST00000284957 NSRP1Q9H0G5 558 aaKnown RBP9.32□□□□□ -0.92
RABGEF1-201ENST00000284957 IGSF5Q9NSI5 407 aa9.32□□□□□ -0.92
RABGEF1-201ENST00000284957 INTS10Q9NVR2 710 aaKnown RBP9.32□□□□□ -0.92
RABGEF1-201ENST00000284957 STARD13Q9Y3M8 1113 aa9.32□□□□□ -0.92
RABGEF1-201ENST00000284957 TK2O00142 265 aa9.31□□□□□ -0.92
RABGEF1-201ENST00000284957 KLHL2O95198 593 aa9.31□□□□□ -0.92
RABGEF1-201ENST00000284957 COL6A2P12110 1019 aa9.31□□□□□ -0.92
RABGEF1-201ENST00000284957 FDXRP22570 491 aa9.31□□□□□ -0.92
RABGEF1-201ENST00000284957 PMLP29590 882 aa9.31□□□□□ -0.92
RABGEF1-201ENST00000284957 GLRBP48167 497 aa9.31□□□□□ -0.92
RABGEF1-201ENST00000284957 RAD51Q06609 339 aa9.31□□□□□ -0.92
RABGEF1-201ENST00000284957 TAF1BQ53T94 588 aaPredicted RBP9.31□□□□□ -0.92
RABGEF1-201ENST00000284957 LRRC66Q68CR7 880 aa9.31□□□□□ -0.92
RABGEF1-201ENST00000284957 TPRG1Q6ZUI0 275 aa9.31□□□□□ -0.92
RABGEF1-201ENST00000284957 CACNA2D3Q8IZS8 1091 aa9.31□□□□□ -0.92
RABGEF1-201ENST00000284957 FSTL5Q8N475 847 aaPredicted RBP9.31□□□□□ -0.92
RABGEF1-201ENST00000284957 TERB1Q8NA31 727 aa9.31□□□□□ -0.92
RABGEF1-201ENST00000284957 CCDC63Q8NA47 563 aa9.31□□□□□ -0.92
RABGEF1-201ENST00000284957 TCF12Q99081 682 aa9.31□□□□□ -0.92
RABGEF1-201ENST00000284957 C19orf43Q9BQ61 176 aa9.31□□□□□ -0.92
RABGEF1-201ENST00000284957 CPSF2Q9P2I0 782 aaKnown RBP9.31□□□□□ -0.92
RABGEF1-201ENST00000284957 RUVBL2Q9Y230 463 aaKnown RBP9.31□□□□□ -0.92
RABGEF1-201ENST00000284957 PALM2-AKAP2B1ALY0 433 aaPredicted RBP9.31□□□□□ -0.92
RABGEF1-201ENST00000284957 ARRB2P32121 409 aa9.31□□□□□ -0.92
RABGEF1-201ENST00000284957 RECQLP46063 649 aaPredicted RBP9.31□□□□□ -0.92
RABGEF1-201ENST00000284957 ZRANB3Q5FWF4 1079 aa9.31□□□□□ -0.92
RABGEF1-201ENST00000284957 FAM151BQ6UXP7 276 aa9.31□□□□□ -0.92
RABGEF1-201ENST00000284957 RFLNAQ6ZTI6 216 aa9.31□□□□□ -0.92
RABGEF1-201ENST00000284957 SPATA21Q7Z572 469 aa9.31□□□□□ -0.92
RABGEF1-201ENST00000284957 PAF1Q8N7H5 531 aa9.31□□□□□ -0.92
RABGEF1-201ENST00000284957 SMRP1Q8NCR6 262 aa9.31□□□□□ -0.92
RABGEF1-201ENST00000284957 OR6Y1Q8NGX8 325 aa9.31□□□□□ -0.92
RABGEF1-201ENST00000284957 SCG3Q8WXD2 468 aaKnown RBP9.31□□□□□ -0.92
RABGEF1-201ENST00000284957 THOC1Q96FV9 657 aaKnown RBP9.31□□□□□ -0.92
RABGEF1-201ENST00000284957 AARSD1Q9BTE6 412 aaKnown RBP9.31□□□□□ -0.92
RABGEF1-201ENST00000284957 YY1AP1Q9H869 796 aa9.31□□□□□ -0.92
RABGEF1-201ENST00000284957 EBAG9O00559 213 aa9.31□□□□□ -0.92
RABGEF1-201ENST00000284957 SNNO75324 88 aaPredicted RBP9.31□□□□□ -0.92
RABGEF1-201ENST00000284957 SRP72O76094 671 aaKnown RBP9.31□□□□□ -0.92
RABGEF1-201ENST00000284957 HLA-EP13747 358 aa9.31□□□□□ -0.92
RABGEF1-201ENST00000284957 CPA3P15088 417 aa9.31□□□□□ -0.92
RABGEF1-201ENST00000284957 SUOXP51687 545 aa9.31□□□□□ -0.92
RABGEF1-201ENST00000284957 OVGP1Q12889 678 aa9.31□□□□□ -0.92
RABGEF1-201ENST00000284957 FAM45BPQ6NSW5 357 aa9.31□□□□□ -0.92
RABGEF1-201ENST00000284957 LCA5Q86VQ0 697 aa9.31□□□□□ -0.92
RABGEF1-201ENST00000284957 CPA6Q8N4T0 437 aa9.31□□□□□ -0.92
RABGEF1-201ENST00000284957 GPR26Q8NDV2 337 aa9.31□□□□□ -0.92
RABGEF1-201ENST00000284957 FAM45AQ8TCE6 357 aa9.31□□□□□ -0.92
RABGEF1-201ENST00000284957 HEXDCQ8WVB3 486 aa9.31□□□□□ -0.92
RABGEF1-201ENST00000284957 RIPOR3Q96MK2 946 aa9.31□□□□□ -0.92
RABGEF1-201ENST00000284957 TSSK1BQ9BXA7 367 aa9.31□□□□□ -0.92
RABGEF1-201ENST00000284957 TMEM245Q9H330 911 aa9.31□□□□□ -0.92
RABGEF1-201ENST00000284957 CXorf56Q9H5V9 222 aa9.31□□□□□ -0.92
RABGEF1-201ENST00000284957 GPAMQ9HCL2 828 aa9.31□□□□□ -0.92
RABGEF1-201ENST00000284957 FBRSL1Q9HCM7 1045 aaKnown RBP9.31□□□□□ -0.92
RABGEF1-201ENST00000284957 B4GALT6Q9UBX8 382 aa9.31□□□□□ -0.92
RABGEF1-201ENST00000284957 IL36AQ9UHA7 158 aa9.31□□□□□ -0.92
RABGEF1-201ENST00000284957 SARDHQ9UL12 918 aa9.31□□□□□ -0.92
RABGEF1-201ENST00000284957 PLA2G4CQ9UP65 541 aa9.31□□□□□ -0.92
RABGEF1-201ENST00000284957 USP15Q9Y4E8 981 aaPredicted RBP9.31□□□□□ -0.92
RABGEF1-201ENST00000284957 PLXNB3Q9ULL4 1909 aa9.31□□□□□ -0.92
RABGEF1-201ENST00000284957 A0A087X1B8 175 aa9.3□□□□□ -0.92
RABGEF1-201ENST00000284957 TSPAN11A1L157 253 aa9.3□□□□□ -0.92
RABGEF1-201ENST00000284957 PRAMEF1O95521 474 aa9.3□□□□□ -0.92
RABGEF1-201ENST00000284957 IL1BP01584 269 aa9.3□□□□□ -0.92
RABGEF1-201ENST00000284957 GDI1P31150 447 aa9.3□□□□□ -0.92
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 30.3 ms