RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000237247.10

SGIP1-201, Transcript of SH3 domain GRB2 like endophilin interacting protein 1, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 5 BASIC

Gene SGIP1, Length 3,997 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGIP1-201ENST00000237247 PMEPA1Q969W9 287 aa6.3□□□□□ -1.4
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SGIP1-201ENST00000237247 CCDC126Q96EE4 140 aa6.3□□□□□ -1.4
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SGIP1-201ENST00000237247 TSGA13Q96PP4 275 aa6.3□□□□□ -1.4
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SGIP1-201ENST00000237247 KCTD13Q8WZ19 329 aa6.29□□□□□ -1.4
SGIP1-201ENST00000237247 PBXIP1Q96AQ6 731 aa6.29□□□□□ -1.4
SGIP1-201ENST00000237247 PGAP3Q96FM1 320 aaPredicted RBP6.29□□□□□ -1.4
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SGIP1-201ENST00000237247 SETD4Q9NVD3 440 aa6.29□□□□□ -1.4
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SGIP1-201ENST00000237247 MBD2Q9UBB5 411 aa6.29□□□□□ -1.4
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SGIP1-201ENST00000237247 PCDHGA10Q9Y5H3 936 aa6.29□□□□□ -1.4
SGIP1-201ENST00000237247 OR6C65A6NJZ3 312 aa6.29□□□□□ -1.4
SGIP1-201ENST00000237247 TAF4O00268 1085 aa6.29□□□□□ -1.4
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