RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000635853.1

SPTAN1-228, Transcript of spectrin alpha, non-erythrocytic 1, humanhuman

TSL 5

Gene SPTAN1, Length 5,870 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPTAN1-228ENST00000635853 CEPT1Q9Y6K0 416 aa9.86□□□□□ -0.83
SPTAN1-228ENST00000635853 KRBA1A5PL33 1030 aa9.85□□□□□ -0.83
SPTAN1-228ENST00000635853 CCDC154A6NI56 674 aa9.85□□□□□ -0.83
SPTAN1-228ENST00000635853 TTC34A8MYJ7 566 aa9.85□□□□□ -0.83
SPTAN1-228ENST00000635853 SLC22A2O15244 555 aa9.85□□□□□ -0.83
SPTAN1-228ENST00000635853 SLC37A4O43826 429 aa9.85□□□□□ -0.83
SPTAN1-228ENST00000635853 IFI30P13284 250 aa9.85□□□□□ -0.83
SPTAN1-228ENST00000635853 FMO4P31512 558 aa9.85□□□□□ -0.83
SPTAN1-228ENST00000635853 LAMTOR4Q0VGL1 99 aa9.85□□□□□ -0.83
SPTAN1-228ENST00000635853 RBM48Q5RL73 367 aaKnown RBP9.85□□□□□ -0.83
SPTAN1-228ENST00000635853 OGFRL1Q5TC84 451 aaPredicted RBP9.85□□□□□ -0.83
SPTAN1-228ENST00000635853 SERPINA13PQ6UXR4 307 aa9.85□□□□□ -0.83
SPTAN1-228ENST00000635853 KCNK18Q7Z418 384 aa9.85□□□□□ -0.83
SPTAN1-228ENST00000635853 UBR7Q8N806 425 aa9.85□□□□□ -0.83
SPTAN1-228ENST00000635853 TRPV3Q8NET8 790 aa9.85□□□□□ -0.83
SPTAN1-228ENST00000635853 OR56A4Q8NGH8 313 aa9.85□□□□□ -0.83
SPTAN1-228ENST00000635853 SLC35C1Q96A29 364 aa9.85□□□□□ -0.83
SPTAN1-228ENST00000635853 FAIM2Q9BWQ8 316 aa9.85□□□□□ -0.83
SPTAN1-228ENST00000635853 MTFR1LQ9H019 292 aa9.85□□□□□ -0.83
SPTAN1-228ENST00000635853 ARMC1Q9NVT9 282 aa9.85□□□□□ -0.83
SPTAN1-228ENST00000635853 GULP1Q9UBP9 304 aa9.85□□□□□ -0.83
SPTAN1-228ENST00000635853 B3GNT3Q9Y2A9 372 aa9.85□□□□□ -0.83
SPTAN1-228ENST00000635853 ACOT9Q9Y305 439 aa9.85□□□□□ -0.83
SPTAN1-228ENST00000635853 USP31Q70CQ4 1352 aa9.85□□□□□ -0.83
SPTAN1-228ENST00000635853 RGS14O43566 566 aa9.85□□□□□ -0.83
SPTAN1-228ENST00000635853 SCN2BO60939 215 aa9.85□□□□□ -0.83
SPTAN1-228ENST00000635853 PRKAR1AP10644 381 aa9.85□□□□□ -0.83
SPTAN1-228ENST00000635853 ETS1P14921 441 aa9.85□□□□□ -0.83
SPTAN1-228ENST00000635853 NFKB1P19838 968 aa9.85□□□□□ -0.83
SPTAN1-228ENST00000635853 SLC26A2P50443 739 aa9.85□□□□□ -0.83
SPTAN1-228ENST00000635853 PABPC1LQ4VXU2 614 aaKnown RBP9.85□□□□□ -0.83
SPTAN1-228ENST00000635853 UGT2A3Q6UWM9 527 aa9.85□□□□□ -0.83
SPTAN1-228ENST00000635853 EIF3MQ7L2H7 374 aaKnown RBP9.85□□□□□ -0.83
SPTAN1-228ENST00000635853 P2RY8Q86VZ1 359 aa9.85□□□□□ -0.83
SPTAN1-228ENST00000635853 KAZALD1Q96I82 304 aa9.85□□□□□ -0.83
SPTAN1-228ENST00000635853 HGH1Q9BTY7 390 aa9.85□□□□□ -0.83
SPTAN1-228ENST00000635853 PXMP2Q9NR77 195 aa9.85□□□□□ -0.83
SPTAN1-228ENST00000635853 SACM1LQ9NTJ5 587 aa9.85□□□□□ -0.83
SPTAN1-228ENST00000635853 ZNF222Q9UK12 451 aa9.85□□□□□ -0.83
SPTAN1-228ENST00000635853 CDH9Q9ULB4 789 aa9.85□□□□□ -0.83
SPTAN1-228ENST00000635853 PLCL2Q9UPR0 1127 aa9.85□□□□□ -0.83
SPTAN1-228ENST00000635853 IFT52Q9Y366 437 aa9.85□□□□□ -0.83
SPTAN1-228ENST00000635853 TLL1O43897 1013 aa9.85□□□□□ -0.83
SPTAN1-228ENST00000635853 PTPN1P18031 435 aaKnown RBP9.85□□□□□ -0.83
SPTAN1-228ENST00000635853 CXCR2P25025 360 aa9.85□□□□□ -0.83
SPTAN1-228ENST00000635853 IGFALSP35858 605 aa9.85□□□□□ -0.83
SPTAN1-228ENST00000635853 PSEN2P49810 448 aa9.85□□□□□ -0.83
SPTAN1-228ENST00000635853 STXBP1P61764 594 aaKnown RBP9.85□□□□□ -0.83
SPTAN1-228ENST00000635853 TGFB2P61812 414 aa9.85□□□□□ -0.83
SPTAN1-228ENST00000635853 MGAT5Q09328 741 aa9.85□□□□□ -0.83
SPTAN1-228ENST00000635853 FSCN1Q16658 493 aaKnown RBP9.85□□□□□ -0.83
SPTAN1-228ENST00000635853 RBM23Q86U06 439 aaKnown RBP9.85□□□□□ -0.83
SPTAN1-228ENST00000635853 MIPEPQ99797 713 aa9.85□□□□□ -0.83
SPTAN1-228ENST00000635853 AIFM2Q9BRQ8 373 aa9.85□□□□□ -0.83
SPTAN1-228ENST00000635853 HERC2P3Q9BVR0 1158 aa9.85□□□□□ -0.83
SPTAN1-228ENST00000635853 EPB41L4BQ9H329 900 aa9.85□□□□□ -0.83
SPTAN1-228ENST00000635853 ZNF99A8MXY4 864 aaPredicted RBP9.85□□□□□ -0.83
SPTAN1-228ENST00000635853 B8ZZF3 427 aa9.85□□□□□ -0.83
SPTAN1-228ENST00000635853 NCAM2O15394 837 aa9.85□□□□□ -0.83
SPTAN1-228ENST00000635853 BANF1O75531 89 aa9.85□□□□□ -0.83
SPTAN1-228ENST00000635853 NPR3P17342 541 aa9.85□□□□□ -0.83
SPTAN1-228ENST00000635853 AOC1P19801 751 aa9.85□□□□□ -0.83
SPTAN1-228ENST00000635853 IDH3AP50213 366 aa9.85□□□□□ -0.83
SPTAN1-228ENST00000635853 ADIGQ0VDE8 80 aa9.85□□□□□ -0.83
SPTAN1-228ENST00000635853 POLNQ7Z5Q5 900 aa9.85□□□□□ -0.83
SPTAN1-228ENST00000635853 SLC44A1Q8WWI5 657 aa9.85□□□□□ -0.83
SPTAN1-228ENST00000635853 MYDGFQ969H8 173 aa9.85□□□□□ -0.83
SPTAN1-228ENST00000635853 CEP295NLQ96MC4 621 aa9.85□□□□□ -0.83
SPTAN1-228ENST00000635853 RUSC1Q9BVN2 902 aa9.85□□□□□ -0.83
SPTAN1-228ENST00000635853 TTLL2Q9BWV7 592 aa9.85□□□□□ -0.83
SPTAN1-228ENST00000635853 USP29Q9HBJ7 922 aa9.85□□□□□ -0.83
SPTAN1-228ENST00000635853 A0A1W2PPW3 197 aa9.85□□□□□ -0.83
SPTAN1-228ENST00000635853 H3BNH8 94 aa9.85□□□□□ -0.83
SPTAN1-228ENST00000635853 TSPAN1O60635 241 aa9.85□□□□□ -0.83
SPTAN1-228ENST00000635853 MAGP20916 626 aa9.85□□□□□ -0.83
SPTAN1-228ENST00000635853 PPATQ06203 517 aa9.85□□□□□ -0.83
SPTAN1-228ENST00000635853 DPYSL3Q14195 570 aa9.85□□□□□ -0.83
SPTAN1-228ENST00000635853 HIST2H2ABQ8IUE6 130 aaPredicted RBP9.85□□□□□ -0.83
SPTAN1-228ENST00000635853 PIK3C3Q8NEB9 887 aa9.85□□□□□ -0.83
SPTAN1-228ENST00000635853 JPH3Q8WXH2 748 aaPredicted RBP9.85□□□□□ -0.83
SPTAN1-228ENST00000635853 UTP4Q969X6 686 aaKnown RBP9.85□□□□□ -0.83
SPTAN1-228ENST00000635853 PHF21BQ96EK2 531 aa9.85□□□□□ -0.83
SPTAN1-228ENST00000635853 SIPA1Q96FS4 1042 aa9.85□□□□□ -0.83
SPTAN1-228ENST00000635853 VPS35Q96QK1 796 aa9.85□□□□□ -0.83
SPTAN1-228ENST00000635853 RIBC2Q9H4K1 309 aa9.85□□□□□ -0.83
SPTAN1-228ENST00000635853 NMRAL1Q9HBL8 299 aa9.85□□□□□ -0.83
SPTAN1-228ENST00000635853 GPRC5CQ9NQ84 441 aa9.85□□□□□ -0.83
SPTAN1-228ENST00000635853 H0YJX3 145 aa9.84□□□□□ -0.83
SPTAN1-228ENST00000635853 AXIN1O15169 862 aa9.84□□□□□ -0.83
SPTAN1-228ENST00000635853 NUAK1O60285 661 aa9.84□□□□□ -0.83
SPTAN1-228ENST00000635853 PGAM1P18669 254 aa9.84□□□□□ -0.83
SPTAN1-228ENST00000635853 NR4A1P22736 598 aa9.84□□□□□ -0.83
SPTAN1-228ENST00000635853 WARSP23381 471 aaKnown RBP9.84□□□□□ -0.83
SPTAN1-228ENST00000635853 NPTX2P47972 431 aa9.84□□□□□ -0.83
SPTAN1-228ENST00000635853 ITGA1P56199 1179 aa9.84□□□□□ -0.83
SPTAN1-228ENST00000635853 ZNF181Q2M3W8 571 aa9.84□□□□□ -0.83
SPTAN1-228ENST00000635853 RASAL3Q86YV0 1011 aa9.84□□□□□ -0.83
SPTAN1-228ENST00000635853 TBC1D21Q8IYX1 336 aa9.84□□□□□ -0.83
SPTAN1-228ENST00000635853 ITFG1Q8TB96 612 aa9.84□□□□□ -0.83
SPTAN1-228ENST00000635853 EEF1AKMT1Q8WVE0 214 aa9.84□□□□□ -0.83
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 35.4 ms