RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000635776.1

SCN1A-210, Transcript of sodium voltage-gated channel alpha subunit 1, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene SCN1A, Length 10,107 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCN1A-210ENST00000635776 SKAP2O75563 359 aaPredicted RBP4.55□□□□□ -1.68
SCN1A-210ENST00000635776 LYPLA1O75608 230 aaPredicted RBP4.55□□□□□ -1.68
SCN1A-210ENST00000635776 BAIAP3O94812 1187 aa4.55□□□□□ -1.68
SCN1A-210ENST00000635776 TNFAIP8O95379 198 aa4.55□□□□□ -1.68
SCN1A-210ENST00000635776 MAP4P27816 1152 aaKnown RBP4.55□□□□□ -1.68
SCN1A-210ENST00000635776 RPL3P39023 403 aaKnown RBP4.55□□□□□ -1.68
SCN1A-210ENST00000635776 DSC2Q02487 901 aa4.55□□□□□ -1.68
SCN1A-210ENST00000635776 PTPRNQ16849 979 aa4.55□□□□□ -1.68
SCN1A-210ENST00000635776 PLEKHG4Q58EX7 1191 aa4.55□□□□□ -1.68
SCN1A-210ENST00000635776 ERAP2Q6P179 960 aa4.55□□□□□ -1.68
SCN1A-210ENST00000635776 PROSER1Q86XN7 944 aa4.55□□□□□ -1.68
SCN1A-210ENST00000635776 CAMK1DQ8IU85 385 aa4.55□□□□□ -1.68
SCN1A-210ENST00000635776 CBARPQ8N350 705 aaPredicted RBP4.55□□□□□ -1.68
SCN1A-210ENST00000635776 NPWQ8N729 165 aa4.55□□□□□ -1.68
SCN1A-210ENST00000635776 SLC43A3Q8NBI5 491 aa4.55□□□□□ -1.68
SCN1A-210ENST00000635776 MCOLN3Q8TDD5 553 aa4.55□□□□□ -1.68
SCN1A-210ENST00000635776 IGSF21Q96ID5 467 aa4.55□□□□□ -1.68
SCN1A-210ENST00000635776 ALG9Q9H6U8 611 aa4.55□□□□□ -1.68
SCN1A-210ENST00000635776 SLC7A8Q9UHI5 535 aa4.55□□□□□ -1.68
SCN1A-210ENST00000635776 YIPF1Q9Y548 306 aa4.55□□□□□ -1.68
SCN1A-210ENST00000635776 RNF103-CHMP3A0A140T963 221 aa4.55□□□□□ -1.68
SCN1A-210ENST00000635776 A8MT66 165 aa4.55□□□□□ -1.68
SCN1A-210ENST00000635776 C1RP00736 705 aa4.55□□□□□ -1.68
SCN1A-210ENST00000635776 ASLP04424 464 aa4.55□□□□□ -1.68
SCN1A-210ENST00000635776 FGF4P08620 206 aa4.55□□□□□ -1.68
SCN1A-210ENST00000635776 INHBCP55103 352 aa4.55□□□□□ -1.68
SCN1A-210ENST00000635776 RAB33AQ14088 237 aa4.55□□□□□ -1.68
SCN1A-210ENST00000635776 AGKQ53H12 422 aa4.55□□□□□ -1.68
SCN1A-210ENST00000635776 PPM1JQ5JR12 505 aa4.55□□□□□ -1.68
SCN1A-210ENST00000635776 GPRIN3Q6ZVF9 776 aa4.55□□□□□ -1.68
SCN1A-210ENST00000635776 ZNF781Q8N8C0 355 aa4.55□□□□□ -1.68
SCN1A-210ENST00000635776 VPS33AQ96AX1 596 aa4.55□□□□□ -1.68
SCN1A-210ENST00000635776 ASB9Q96DX5 294 aa4.55□□□□□ -1.68
SCN1A-210ENST00000635776 LRIG1Q96JA1 1093 aa4.55□□□□□ -1.68
SCN1A-210ENST00000635776 YME1L1Q96TA2 773 aa4.55□□□□□ -1.68
SCN1A-210ENST00000635776 WDR83Q9BRX9 315 aaKnown RBP4.55□□□□□ -1.68
SCN1A-210ENST00000635776 C9orf16Q9BUW7 83 aa4.55□□□□□ -1.68
SCN1A-210ENST00000635776 OSBPL10Q9BXB5 764 aa4.55□□□□□ -1.68
SCN1A-210ENST00000635776 MAGEE1Q9HCI5 957 aa4.55□□□□□ -1.68
SCN1A-210ENST00000635776 ASAH2Q9NR71 780 aa4.55□□□□□ -1.68
SCN1A-210ENST00000635776 G3BP2Q9UN86 482 aaKnown RBP4.55□□□□□ -1.68
SCN1A-210ENST00000635776 RAI2Q9Y5P3 530 aa4.55□□□□□ -1.68
SCN1A-210ENST00000635776 HCRTO43612 131 aa4.55□□□□□ -1.68
SCN1A-210ENST00000635776 NRP2O60462 931 aa4.55□□□□□ -1.68
SCN1A-210ENST00000635776 FASP25445 335 aa4.55□□□□□ -1.68
SCN1A-210ENST00000635776 MTTPP55157 894 aa4.55□□□□□ -1.68
SCN1A-210ENST00000635776 GTF2H3Q13889 308 aa4.55□□□□□ -1.68
SCN1A-210ENST00000635776 TECRLQ5HYJ1 363 aa4.55□□□□□ -1.68
SCN1A-210ENST00000635776 TMEM154Q6P9G4 183 aa4.55□□□□□ -1.68
SCN1A-210ENST00000635776 FRMD7Q6ZUT3 714 aa4.55□□□□□ -1.68
SCN1A-210ENST00000635776 TNS4Q8IZW8 715 aa4.55□□□□□ -1.68
SCN1A-210ENST00000635776 PQLC1Q8N2U9 271 aa4.55□□□□□ -1.68
SCN1A-210ENST00000635776 KCNV2Q8TDN2 545 aa4.55□□□□□ -1.68
SCN1A-210ENST00000635776 AGAP2Q99490 1192 aa4.55□□□□□ -1.68
SCN1A-210ENST00000635776 UGT2B28Q9BY64 529 aa4.55□□□□□ -1.68
SCN1A-210ENST00000635776 CWH43Q9H720 699 aa4.55□□□□□ -1.68
SCN1A-210ENST00000635776 TMEM39AQ9NV64 488 aa4.55□□□□□ -1.68
SCN1A-210ENST00000635776 GABRQQ9UN88 632 aa4.55□□□□□ -1.68
SCN1A-210ENST00000635776 BTN3A1O00481 513 aa4.55□□□□□ -1.68
SCN1A-210ENST00000635776 DLX3O60479 287 aa4.55□□□□□ -1.68
SCN1A-210ENST00000635776 WDR47O94967 919 aa4.55□□□□□ -1.68
SCN1A-210ENST00000635776 ZDHHC11BP0C7U3 371 aa4.55□□□□□ -1.68
SCN1A-210ENST00000635776 C7P10643 843 aa4.55□□□□□ -1.68
SCN1A-210ENST00000635776 NRLP54845 237 aa4.55□□□□□ -1.68
SCN1A-210ENST00000635776 ADARP55265 1226 aaKnown RBP4.55□□□□□ -1.68
SCN1A-210ENST00000635776 PITX1P78337 314 aaPredicted RBP4.55□□□□□ -1.68
SCN1A-210ENST00000635776 TRIM25Q14258 630 aaKnown RBP4.55□□□□□ -1.68
SCN1A-210ENST00000635776 WFIKKN2Q8TEU8 576 aa4.55□□□□□ -1.68
SCN1A-210ENST00000635776 MYRFLQ96LU7 910 aa4.55□□□□□ -1.68
SCN1A-210ENST00000635776 TBATAQ96M53 351 aa4.55□□□□□ -1.68
SCN1A-210ENST00000635776 FCRL3Q96P31 734 aaPredicted RBP4.55□□□□□ -1.68
SCN1A-210ENST00000635776 MGME1Q9BQP7 344 aa4.55□□□□□ -1.68
SCN1A-210ENST00000635776 ASPSCR1Q9BZE9 553 aa4.55□□□□□ -1.68
SCN1A-210ENST00000635776 KCNK13Q9HB14 408 aa4.55□□□□□ -1.68
SCN1A-210ENST00000635776 PLK2Q9NYY3 685 aa4.55□□□□□ -1.68
SCN1A-210ENST00000635776 MAGEL2Q9UJ55 1249 aa4.55□□□□□ -1.68
SCN1A-210ENST00000635776 CCDC78A2IDD5 438 aa4.55□□□□□ -1.68
SCN1A-210ENST00000635776 GABBR2O75899 941 aa4.55□□□□□ -1.68
SCN1A-210ENST00000635776 FTH1P02794 183 aa4.55□□□□□ -1.68
SCN1A-210ENST00000635776 GPIP06744 558 aa4.55□□□□□ -1.68
SCN1A-210ENST00000635776 OR4Q2P0C623 313 aa4.55□□□□□ -1.68
SCN1A-210ENST00000635776 RPS3P23396 243 aaKnown RBP eCLIP4.55□□□□□ -1.68
SCN1A-210ENST00000635776 ACVR1Q04771 509 aa4.55□□□□□ -1.68
SCN1A-210ENST00000635776 NFYCQ13952 458 aa4.55□□□□□ -1.68
SCN1A-210ENST00000635776 TRIM71Q2Q1W2 868 aaKnown RBP4.55□□□□□ -1.68
SCN1A-210ENST00000635776 TCEAL8Q8IYN2 117 aa4.55□□□□□ -1.68
SCN1A-210ENST00000635776 C3orf58Q8NDZ4 430 aa4.55□□□□□ -1.68
SCN1A-210ENST00000635776 OR6Y1Q8NGX8 325 aa4.55□□□□□ -1.68
SCN1A-210ENST00000635776 METTL6Q8TCB7 284 aa4.55□□□□□ -1.68
SCN1A-210ENST00000635776 KLHL5Q96PQ7 755 aa4.55□□□□□ -1.68
SCN1A-210ENST00000635776 COPS8Q99627 209 aa4.55□□□□□ -1.68
SCN1A-210ENST00000635776 PKMYT1Q99640 499 aa4.55□□□□□ -1.68
SCN1A-210ENST00000635776 OMDQ99983 421 aa4.55□□□□□ -1.68
SCN1A-210ENST00000635776 TRIM4Q9C037 500 aa4.55□□□□□ -1.68
SCN1A-210ENST00000635776 DYRK4Q9NR20 520 aa4.55□□□□□ -1.68
SCN1A-210ENST00000635776 OPTCQ9UBM4 332 aa4.55□□□□□ -1.68
SCN1A-210ENST00000635776 PSAT1Q9Y617 370 aa4.55□□□□□ -1.68
SCN1A-210ENST00000635776 MYADML2A6NDP7 307 aa4.55□□□□□ -1.68
SCN1A-210ENST00000635776 ZNF839A8K0R7 811 aa4.55□□□□□ -1.68
SCN1A-210ENST00000635776 SLC35E2BP0CK96 405 aa4.55□□□□□ -1.68
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