RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000607882.5

RABGEF1-209, Transcript of RAB guanine nucleotide exchange factor 1, humanhuman

TSL 2

Gene RABGEF1, Length 2,654 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGEF1-209ENST00000607882 IZUMO3Q5VZ72 239 aa12.6□□□□□ -0.39
RABGEF1-209ENST00000607882 FITM2Q8N6M3 262 aa12.6□□□□□ -0.39
RABGEF1-209ENST00000607882 MAIP1Q8WWC4 291 aa12.6□□□□□ -0.39
RABGEF1-209ENST00000607882 KLHL29Q96CT2 875 aa12.6□□□□□ -0.39
RABGEF1-209ENST00000607882 WRAP53Q9BUR4 548 aaKnown RBP12.6□□□□□ -0.39
RABGEF1-209ENST00000607882 CDV3Q9UKY7 258 aaKnown RBP12.6□□□□□ -0.39
RABGEF1-209ENST00000607882 ZFHX4Q86UP3 3567 aa12.59□□□□□ -0.39
RABGEF1-209ENST00000607882 ZSCAN9O15535 394 aaPredicted RBP12.59□□□□□ -0.39
RABGEF1-209ENST00000607882 CDH16O75309 829 aa12.59□□□□□ -0.39
RABGEF1-209ENST00000607882 KRT38O76015 456 aa12.59□□□□□ -0.39
RABGEF1-209ENST00000607882 IMPDH2P12268 514 aa12.59□□□□□ -0.39
RABGEF1-209ENST00000607882 ID4P47928 161 aa12.59□□□□□ -0.39
RABGEF1-209ENST00000607882 KLF1Q13351 362 aaPredicted RBP12.59□□□□□ -0.39
RABGEF1-209ENST00000607882 TMED2Q15363 201 aa12.59□□□□□ -0.39
RABGEF1-209ENST00000607882 BOLA3Q53S33 107 aa12.59□□□□□ -0.39
RABGEF1-209ENST00000607882 ZNF542PQ5EBM4 170 aa12.59□□□□□ -0.39
RABGEF1-209ENST00000607882 STPG1Q5TH74 334 aa12.59□□□□□ -0.39
RABGEF1-209ENST00000607882 FAM47EQ6ZV65 393 aa12.59□□□□□ -0.39
RABGEF1-209ENST00000607882 SYDE1Q6ZW31 735 aaPredicted RBP12.59□□□□□ -0.39
RABGEF1-209ENST00000607882 PARS2Q7L3T8 475 aaKnown RBP12.59□□□□□ -0.39
RABGEF1-209ENST00000607882 KDELC2Q7Z4H8 507 aa12.59□□□□□ -0.39
RABGEF1-209ENST00000607882 VOPP1Q96AW1 172 aa12.59□□□□□ -0.39
RABGEF1-209ENST00000607882 CLIP3Q96DZ5 547 aa12.59□□□□□ -0.39
RABGEF1-209ENST00000607882 PHACTR1Q9C0D0 580 aa12.59□□□□□ -0.39
RABGEF1-209ENST00000607882 UBA2Q9UBT2 640 aaPredicted RBP12.59□□□□□ -0.39
RABGEF1-209ENST00000607882 TRIM33Q9UPN9 1127 aa12.59□□□□□ -0.39
RABGEF1-209ENST00000607882 ARL2BPQ9Y2Y0 163 aa12.59□□□□□ -0.39
RABGEF1-209ENST00000607882 COQ6Q9Y2Z9 468 aa12.59□□□□□ -0.39
RABGEF1-209ENST00000607882 MAP1BP46821 2468 aaKnown RBP12.59□□□□□ -0.39
RABGEF1-209ENST00000607882 A8MUI8 341 aa12.59□□□□□ -0.39
RABGEF1-209ENST00000607882 H3BRJ5 948 aa12.59□□□□□ -0.39
RABGEF1-209ENST00000607882 NEMP1O14524 444 aa12.59□□□□□ -0.39
RABGEF1-209ENST00000607882 CDX4O14627 284 aaPredicted RBP12.59□□□□□ -0.39
RABGEF1-209ENST00000607882 KRT1P04264 644 aa12.59□□□□□ -0.39
RABGEF1-209ENST00000607882 SLC1A1P43005 524 aa12.59□□□□□ -0.39
RABGEF1-209ENST00000607882 ATXN3P54252 364 aaPredicted RBP12.59□□□□□ -0.39
RABGEF1-209ENST00000607882 NRG1Q02297 640 aaPredicted RBP12.59□□□□□ -0.39
RABGEF1-209ENST00000607882 SLC10A2Q12908 348 aaPredicted RBP12.59□□□□□ -0.39
RABGEF1-209ENST00000607882 GALNTL6Q49A17 601 aa12.59□□□□□ -0.39
RABGEF1-209ENST00000607882 PIP5KL1Q5T9C9 394 aa12.59□□□□□ -0.39
RABGEF1-209ENST00000607882 CGB2Q6NT52 195 aa12.59□□□□□ -0.39
RABGEF1-209ENST00000607882 PPP1R2P3Q6NXS1 205 aa12.59□□□□□ -0.39
RABGEF1-209ENST00000607882 SLC36A4Q6YBV0 504 aa12.59□□□□□ -0.39
RABGEF1-209ENST00000607882 GSTA5Q7RTV2 222 aa12.59□□□□□ -0.39
RABGEF1-209ENST00000607882 PLPP6Q8IY26 295 aa12.59□□□□□ -0.39
RABGEF1-209ENST00000607882 UMODL1-AS1Q8N2C9 162 aa12.59□□□□□ -0.39
RABGEF1-209ENST00000607882 DRAXINQ8NBI3 349 aaPredicted RBP12.59□□□□□ -0.39
RABGEF1-209ENST00000607882 LGMNQ99538 433 aa12.59□□□□□ -0.39
RABGEF1-209ENST00000607882 TACO1Q9BSH4 297 aaKnown RBP12.59□□□□□ -0.39
RABGEF1-209ENST00000607882 OSBPL8Q9BZF1 889 aa12.59□□□□□ -0.39
RABGEF1-209ENST00000607882 VPS45Q9NRW7 570 aa12.59□□□□□ -0.39
RABGEF1-209ENST00000607882 NKIRAS1Q9NYS0 192 aa12.59□□□□□ -0.39
RABGEF1-209ENST00000607882 STK38LQ9Y2H1 464 aa12.59□□□□□ -0.39
RABGEF1-209ENST00000607882 FARP1Q9Y4F1 1045 aaPredicted RBP12.59□□□□□ -0.39
RABGEF1-209ENST00000607882 DSPP15924 2871 aaKnown RBP12.59□□□□□ -0.39
RABGEF1-209ENST00000607882 BPTFQ12830 3046 aa12.59□□□□□ -0.39
RABGEF1-209ENST00000607882 KCNK1O00180 336 aa12.58□□□□□ -0.4
RABGEF1-209ENST00000607882 BCAT2O15382 392 aaPredicted RBP12.58□□□□□ -0.4
RABGEF1-209ENST00000607882 FGF10O15520 208 aaPredicted RBP12.58□□□□□ -0.4
RABGEF1-209ENST00000607882 PAK4O96013 591 aaPredicted RBP12.58□□□□□ -0.4
RABGEF1-209ENST00000607882 C5AR1P21730 350 aa12.58□□□□□ -0.4
RABGEF1-209ENST00000607882 COPS2P61201 443 aa12.58□□□□□ -0.4
RABGEF1-209ENST00000607882 CAV1Q03135 178 aa12.58□□□□□ -0.4
RABGEF1-209ENST00000607882 ITKQ08881 620 aa12.58□□□□□ -0.4
RABGEF1-209ENST00000607882 BNIP1Q12981 228 aa12.58□□□□□ -0.4
RABGEF1-209ENST00000607882 HADHQ16836 314 aaKnown RBP12.58□□□□□ -0.4
RABGEF1-209ENST00000607882 CCDC92Q53HC0 331 aaPredicted RBP12.58□□□□□ -0.4
RABGEF1-209ENST00000607882 HP1BP3Q5SSJ5 553 aaPredicted RBP12.58□□□□□ -0.4
RABGEF1-209ENST00000607882 AGAP9Q5VTM2 703 aa12.58□□□□□ -0.4
RABGEF1-209ENST00000607882 ALKBH2Q6NS38 261 aa12.58□□□□□ -0.4
RABGEF1-209ENST00000607882 FBXL19Q6PCT2 694 aa12.58□□□□□ -0.4
RABGEF1-209ENST00000607882 TTC7BQ86TV6 843 aa12.58□□□□□ -0.4
RABGEF1-209ENST00000607882 ZSWIM9Q86XI8 627 aa12.58□□□□□ -0.4
RABGEF1-209ENST00000607882 CCDC89Q8N998 374 aa12.58□□□□□ -0.4
RABGEF1-209ENST00000607882 CCNYQ8ND76 341 aa12.58□□□□□ -0.4
RABGEF1-209ENST00000607882 OR2AP1Q8NGE2 309 aa12.58□□□□□ -0.4
RABGEF1-209ENST00000607882 AGAP11Q8TF27 550 aa12.58□□□□□ -0.4
RABGEF1-209ENST00000607882 ZNF483Q8TF39 744 aaPredicted RBP12.58□□□□□ -0.4
RABGEF1-209ENST00000607882 SERAC1Q96JX3 654 aa12.58□□□□□ -0.4
RABGEF1-209ENST00000607882 RBM15Q96T37 977 aaKnown RBP eCLIP12.58□□□□□ -0.41e-6■■■■□ 22.4
RABGEF1-209ENST00000607882 HEPHQ9BQS7 1158 aa12.58□□□□□ -0.4
RABGEF1-209ENST00000607882 DYRK4Q9NR20 520 aa12.58□□□□□ -0.4
RABGEF1-209ENST00000607882 SPATA7Q9P0W8 599 aa12.58□□□□□ -0.4
RABGEF1-209ENST00000607882 PCDHGC4Q9Y5F7 938 aa12.58□□□□□ -0.4
RABGEF1-209ENST00000607882 A0A1W2PQU0 124 aa12.58□□□□□ -0.4
RABGEF1-209ENST00000607882 KRT16P08779 473 aa12.58□□□□□ -0.4
RABGEF1-209ENST00000607882 BNC1Q01954 994 aa12.58□□□□□ -0.4
RABGEF1-209ENST00000607882 MGAT5Q09328 741 aa12.58□□□□□ -0.4
RABGEF1-209ENST00000607882 GRIK2Q13002 908 aa12.58□□□□□ -0.4
RABGEF1-209ENST00000607882 KIF19Q2TAC6 998 aa12.58□□□□□ -0.4
RABGEF1-209ENST00000607882 P3H1Q32P28 736 aa12.58□□□□□ -0.4
RABGEF1-209ENST00000607882 SYCP2LQ5T4T6 812 aa12.58□□□□□ -0.4
RABGEF1-209ENST00000607882 FAAH2Q6GMR7 532 aa12.58□□□□□ -0.4
RABGEF1-209ENST00000607882 SMYD5Q6GMV2 418 aa12.58□□□□□ -0.4
RABGEF1-209ENST00000607882 CAPN12Q6ZSI9 719 aa12.58□□□□□ -0.4
RABGEF1-209ENST00000607882 ARHGEF18Q6ZSZ5 1173 aa12.58□□□□□ -0.4
RABGEF1-209ENST00000607882 MINDY1Q8N5J2 469 aa12.58□□□□□ -0.4
RABGEF1-209ENST00000607882 PQLC3Q8N755 202 aa12.58□□□□□ -0.4
RABGEF1-209ENST00000607882 NIPA2Q8N8Q9 360 aa12.58□□□□□ -0.4
RABGEF1-209ENST00000607882 GBP7Q8N8V2 638 aaPredicted RBP12.58□□□□□ -0.4
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 22.1 ms