RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000602338.1

TTLL3-233, Transcript of tubulin tyrosine ligase like 3, human

Gene TTLL3, Length 693 nt, Biotype retained intron.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
TTLL3-233	ENST00000602338	TMCO5B	A8MYB1	307 aa		11.92	□□□□□ -0.5
TTLL3-233	ENST00000602338	EIF3CL	B5ME19	914 aa	Known RBP	11.92	□□□□□ -0.5
TTLL3-233	ENST00000602338	STMND1	H3BQB6	276 aa		11.92	□□□□□ -0.5
TTLL3-233	ENST00000602338	PPM1D	O15297	605 aa		11.92	□□□□□ -0.5
TTLL3-233	ENST00000602338	PPFIA2	O75334	1257 aa		11.92	□□□□□ -0.5
TTLL3-233	ENST00000602338	SOD1	P00441	154 aa		11.92	□□□□□ -0.5
TTLL3-233	ENST00000602338	CP	P00450	1065 aa		11.92	□□□□□ -0.5
TTLL3-233	ENST00000602338	TPM2	P07951	284 aa		11.92	□□□□□ -0.5
TTLL3-233	ENST00000602338	THRA	P10827	490 aa		11.92	□□□□□ -0.5
TTLL3-233	ENST00000602338	LIF	P15018	202 aa		11.92	□□□□□ -0.5
TTLL3-233	ENST00000602338	TCF4	P15884	667 aa		11.92	□□□□□ -0.5
TTLL3-233	ENST00000602338	MPST	P25325	297 aa		11.92	□□□□□ -0.5
TTLL3-233	ENST00000602338	MIP	P30301	263 aa		11.92	□□□□□ -0.5
TTLL3-233	ENST00000602338	VIPR1	P32241	457 aa		11.92	□□□□□ -0.5
TTLL3-233	ENST00000602338	LIMK2	P53671	638 aa		11.92	□□□□□ -0.5
TTLL3-233	ENST00000602338	POLR2L	P62875	67 aa	Known RBP	11.92	□□□□□ -0.5
TTLL3-233	ENST00000602338	CTBS	Q01459	385 aa		11.92	□□□□□ -0.5
TTLL3-233	ENST00000602338	UBXN1	Q04323	297 aa		11.92	□□□□□ -0.5
TTLL3-233	ENST00000602338	ILF3	Q12906	894 aa	Known RBP eCLIP	11.92	□□□□□ -0.5
TTLL3-233	ENST00000602338	RFTN1	Q14699	578 aa	Predicted RBP	11.92	□□□□□ -0.5
TTLL3-233	ENST00000602338	LBR	Q14739	615 aa	Known RBP	11.92	□□□□□ -0.5
TTLL3-233	ENST00000602338	TMCO4	Q5TGY1	634 aa		11.92	□□□□□ -0.5
TTLL3-233	ENST00000602338	RFLNA	Q6ZTI6	216 aa		11.92	□□□□□ -0.5
TTLL3-233	ENST00000602338		Q6ZVL8	140 aa		11.92	□□□□□ -0.5
TTLL3-233	ENST00000602338	CBARP	Q8N350	705 aa	Predicted RBP	11.92	□□□□□ -0.5
TTLL3-233	ENST00000602338	ZSCAN1	Q8NBB4	408 aa		11.92	□□□□□ -0.5
TTLL3-233	ENST00000602338	FNIP1	Q8TF40	1166 aa		11.92	□□□□□ -0.5
TTLL3-233	ENST00000602338	PDCD6IP	Q8WUM4	868 aa	Known RBP	11.92	□□□□□ -0.5
TTLL3-233	ENST00000602338	ART4	Q93070	314 aa		11.92	□□□□□ -0.5
TTLL3-233	ENST00000602338	SMIM14	Q96QK8	99 aa		11.92	□□□□□ -0.5
TTLL3-233	ENST00000602338	ERGIC2	Q96RQ1	377 aa		11.92	□□□□□ -0.5
TTLL3-233	ENST00000602338	EIF3C	Q99613	913 aa	Known RBP	11.92	□□□□□ -0.5
TTLL3-233	ENST00000602338	B3GNT4	Q9C0J1	378 aa		11.92	□□□□□ -0.5
TTLL3-233	ENST00000602338	HSD3B7	Q9H2F3	369 aa		11.92	□□□□□ -0.5
TTLL3-233	ENST00000602338	ETNK2	Q9NVF9	386 aa		11.92	□□□□□ -0.5
TTLL3-233	ENST00000602338	GEMIN8	Q9NWZ8	242 aa	Known RBP	11.92	□□□□□ -0.5
TTLL3-233	ENST00000602338	TRNAU1AP	Q9NX07	287 aa	Known RBP	11.92	□□□□□ -0.5
TTLL3-233	ENST00000602338	DONSON	Q9NYP3	566 aa		11.92	□□□□□ -0.5
TTLL3-233	ENST00000602338	SEPT3	Q9UH03	358 aa		11.92	□□□□□ -0.5
TTLL3-233	ENST00000602338	SLC17A4	Q9Y2C5	497 aa		11.92	□□□□□ -0.5
TTLL3-233	ENST00000602338	PCDHGA3	Q9Y5H0	932 aa		11.92	□□□□□ -0.5
TTLL3-233	ENST00000602338	B3GALT1	Q9Y5Z6	326 aa		11.92	□□□□□ -0.5
TTLL3-233	ENST00000602338	ZNF106	Q9H2Y7	1883 aa	Known RBP	11.91	□□□□□ -0.5
TTLL3-233	ENST00000602338	IGHV1OR21-1	A0A087WYE8	117 aa		11.91	□□□□□ -0.5
TTLL3-233	ENST00000602338	GOLGA6C	A6NDK9	693 aa		11.91	□□□□□ -0.5
TTLL3-233	ENST00000602338	GOLGA6B	A6NDN3	693 aa		11.91	□□□□□ -0.5
TTLL3-233	ENST00000602338	TMEM191C	A6NGB0	347 aa		11.91	□□□□□ -0.5
TTLL3-233	ENST00000602338	PDE2A	O00408	941 aa	Predicted RBP	11.91	□□□□□ -0.5
TTLL3-233	ENST00000602338	DAPK3	O43293	454 aa		11.91	□□□□□ -0.5
TTLL3-233	ENST00000602338	SOCS5	O75159	536 aa		11.91	□□□□□ -0.5
TTLL3-233	ENST00000602338	LRCH4	O75427	683 aa		11.91	□□□□□ -0.5
TTLL3-233	ENST00000602338	GOLGA6D	P0CG33	693 aa		11.91	□□□□□ -0.5
TTLL3-233	ENST00000602338	UGT1A3	P35503	534 aa		11.91	□□□□□ -0.5
TTLL3-233	ENST00000602338	ADCY8	P40145	1251 aa		11.91	□□□□□ -0.5
TTLL3-233	ENST00000602338	MAX	P61244	160 aa		11.91	□□□□□ -0.5
TTLL3-233	ENST00000602338	TLE1	Q04724	770 aa		11.91	□□□□□ -0.5
TTLL3-233	ENST00000602338	SRSF1	Q07955	248 aa	Known RBP eCLIP	11.91	□□□□□ -0.5	7e-16	■■■■□ 20.7
TTLL3-233	ENST00000602338	ZNF235	Q14590	738 aa		11.91	□□□□□ -0.5
TTLL3-233	ENST00000602338	TMEM164	Q5U3C3	297 aa		11.91	□□□□□ -0.5
TTLL3-233	ENST00000602338	E4F1	Q66K89	784 aa	Predicted RBP	11.91	□□□□□ -0.5
TTLL3-233	ENST00000602338	RAET1G	Q6H3X3	334 aa		11.91	□□□□□ -0.5
TTLL3-233	ENST00000602338	DOK6	Q6PKX4	331 aa		11.91	□□□□□ -0.5
TTLL3-233	ENST00000602338	RBM43	Q6ZSC3	357 aa	Known RBP	11.91	□□□□□ -0.5
TTLL3-233	ENST00000602338	IRF2BP2	Q7Z5L9	587 aa		11.91	□□□□□ -0.5
TTLL3-233	ENST00000602338	TRIM74	Q86UV6	250 aa		11.91	□□□□□ -0.5
TTLL3-233	ENST00000602338	ZNF761	Q86XN6	746 aa	Predicted RBP	11.91	□□□□□ -0.5
TTLL3-233	ENST00000602338	TAAR9	Q96RI9	348 aa		11.91	□□□□□ -0.5
TTLL3-233	ENST00000602338	MCCC1	Q96RQ3	725 aa	Predicted RBP	11.91	□□□□□ -0.5
TTLL3-233	ENST00000602338	MGME1	Q9BQP7	344 aa		11.91	□□□□□ -0.5
TTLL3-233	ENST00000602338	SLC25A18	Q9H1K4	315 aa		11.91	□□□□□ -0.5
TTLL3-233	ENST00000602338	NOD2	Q9HC29	1040 aa		11.91	□□□□□ -0.5
TTLL3-233	ENST00000602338	PARVA	Q9NVD7	372 aa		11.91	□□□□□ -0.5
TTLL3-233	ENST00000602338	OCIAD1	Q9NX40	245 aa		11.91	□□□□□ -0.5
TTLL3-233	ENST00000602338	GOLGA6A	Q9NYA3	693 aa		11.91	□□□□□ -0.5
TTLL3-233	ENST00000602338	CHMP5	Q9NZZ3	219 aa		11.91	□□□□□ -0.5
TTLL3-233	ENST00000602338	PCYT1B	Q9Y5K3	369 aa	Predicted RBP	11.91	□□□□□ -0.5
TTLL3-233	ENST00000602338	UTP20	O75691	2785 aa	Known RBP	11.91	□□□□□ -0.5
TTLL3-233	ENST00000602338	USP9X	Q93008	2570 aa	Predicted RBP	11.91	□□□□□ -0.5
TTLL3-233	ENST00000602338	LOC107983988	A0A1B0GUW6	1196 aa	Predicted RBP	11.9	□□□□□ -0.5
TTLL3-233	ENST00000602338	PRPSAP2	O60256	369 aa		11.9	□□□□□ -0.5
TTLL3-233	ENST00000602338	EML2	O95834	649 aa		11.9	□□□□□ -0.5
TTLL3-233	ENST00000602338	IVL	P07476	585 aa		11.9	□□□□□ -0.5
TTLL3-233	ENST00000602338	FER	P16591	822 aa		11.9	□□□□□ -0.5
TTLL3-233	ENST00000602338	IL1R2	P27930	398 aa		11.9	□□□□□ -0.5
TTLL3-233	ENST00000602338	ACTR1B	P42025	376 aa		11.9	□□□□□ -0.5
TTLL3-233	ENST00000602338	GPR3	P46089	330 aa		11.9	□□□□□ -0.5
TTLL3-233	ENST00000602338	RENBP	P51606	427 aa		11.9	□□□□□ -0.5
TTLL3-233	ENST00000602338	POLE2	P56282	527 aa		11.9	□□□□□ -0.5
TTLL3-233	ENST00000602338	ACTR1A	P61163	376 aa		11.9	□□□□□ -0.5
TTLL3-233	ENST00000602338	MYL5	Q02045	173 aa		11.9	□□□□□ -0.5
TTLL3-233	ENST00000602338	CLPP	Q16740	277 aa	Predicted RBP	11.9	□□□□□ -0.5
TTLL3-233	ENST00000602338	SMTNL2	Q2TAL5	461 aa		11.9	□□□□□ -0.5
TTLL3-233	ENST00000602338	COLEC12	Q5KU26	742 aa		11.9	□□□□□ -0.5
TTLL3-233	ENST00000602338	PTRH1	Q86Y79	214 aa	Known RBP	11.9	□□□□□ -0.5
TTLL3-233	ENST00000602338	BMPER	Q8N8U9	685 aa		11.9	□□□□□ -0.5
TTLL3-233	ENST00000602338	OR4D9	Q8NGE8	314 aa		11.9	□□□□□ -0.5
TTLL3-233	ENST00000602338	SCARF2	Q96GP6	870 aa	Predicted RBP	11.9	□□□□□ -0.5
TTLL3-233	ENST00000602338	ZNF599	Q96NL3	588 aa		11.9	□□□□□ -0.5
TTLL3-233	ENST00000602338	NUDCD1	Q96RS6	583 aa		11.9	□□□□□ -0.5
TTLL3-233	ENST00000602338	EPN3	Q9H201	632 aa		11.9	□□□□□ -0.5

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