RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000589969.1

NFIC-209, Transcript of nuclear factor I C, humanhuman

TSL 3

Gene NFIC, Length 614 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NFIC-209ENST00000589969 COL27A1Q8IZC6 1860 aaPredicted RBP20.64■□□□□ 0.89
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NFIC-209ENST00000589969 CASC3O15234 703 aaKnown RBP20.63■□□□□ 0.89
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NFIC-209ENST00000589969 CD48P09326 243 aa20.63■□□□□ 0.89
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NFIC-209ENST00000589969 HLTFQ14527 1009 aaKnown RBP eCLIP20.63■□□□□ 0.89
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NFIC-209ENST00000589969 ANKRD20A8PQ5CZ79 823 aa20.62■□□□□ 0.89
NFIC-209ENST00000589969 NCBP2-AS2Q69YL0 99 aa20.62■□□□□ 0.89
NFIC-209ENST00000589969 RAET1GQ6H3X3 334 aa20.62■□□□□ 0.89
NFIC-209ENST00000589969 SPRED1Q7Z699 444 aa20.62■□□□□ 0.89
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NFIC-209ENST00000589969 B3GNT8Q7Z7M8 397 aa20.62■□□□□ 0.89
NFIC-209ENST00000589969 NLRP8Q86W28 1048 aa20.62■□□□□ 0.89
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NFIC-209ENST00000589969 RNF215Q9Y6U7 377 aa20.62■□□□□ 0.89
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NFIC-209ENST00000589969 GOLGA6DP0CG33 693 aa20.61■□□□□ 0.89
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NFIC-209ENST00000589969 SLC18A3Q16572 532 aa20.61■□□□□ 0.89
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NFIC-209ENST00000589969 FOXP3Q9BZS1 431 aa20.61■□□□□ 0.89
NFIC-209ENST00000589969 CPNE5Q9HCH3 593 aa20.61■□□□□ 0.89
NFIC-209ENST00000589969 RBM22Q9NW64 420 aaKnown RBP eCLIP20.61■□□□□ 0.89
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NFIC-209ENST00000589969 SLC17A4Q9Y2C5 497 aa20.61■□□□□ 0.89
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NFIC-209ENST00000589969 TRBC1P01850 177 aa20.6■□□□□ 0.89
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NFIC-209ENST00000589969 C17orf82Q86X59 251 aaPredicted RBP20.6■□□□□ 0.89
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NFIC-209ENST00000589969 ZDHHC1Q8WTX9 485 aa20.6■□□□□ 0.89
NFIC-209ENST00000589969 FAF2Q96CS3 445 aa20.6■□□□□ 0.89
NFIC-209ENST00000589969 AP2M1Q96CW1 435 aa20.6■□□□□ 0.89
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NFIC-209ENST00000589969 RPL26L1Q9UNX3 145 aaKnown RBP20.6■□□□□ 0.89
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NFIC-209ENST00000589969 ZNF438Q7Z4V0 828 aa20.59■□□□□ 0.89
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NFIC-209ENST00000589969 NRSN1Q8IZ57 195 aa20.59■□□□□ 0.89
NFIC-209ENST00000589969 SCARF2Q96GP6 870 aaPredicted RBP20.59■□□□□ 0.89
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