RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000574217.1

PRPF8-210, Transcript of pre-mRNA processing factor 8, humanhuman

TSL 2

Gene PRPF8, Length 310 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRPF8-210ENST00000574217 BTBD1Q9H0C5 482 aa6.7□□□□□ -1.34
PRPF8-210ENST00000574217 KDM4CQ9H3R0 1056 aa6.7□□□□□ -1.34
PRPF8-210ENST00000574217 SGK2Q9HBY8 427 aa6.7□□□□□ -1.34
PRPF8-210ENST00000574217 MRM3Q9HC36 420 aaKnown RBP6.7□□□□□ -1.34
PRPF8-210ENST00000574217 CHRAC1Q9NRG0 131 aa6.7□□□□□ -1.34
PRPF8-210ENST00000574217 ZC3H7BQ9UGR2 993 aaKnown RBP6.7□□□□□ -1.34
PRPF8-210ENST00000574217 GGT7Q9UJ14 662 aa6.7□□□□□ -1.34
PRPF8-210ENST00000574217 SOX13Q9UN79 622 aa6.7□□□□□ -1.34
PRPF8-210ENST00000574217 SMG5Q9UPR3 1016 aaKnown RBP6.7□□□□□ -1.34
PRPF8-210ENST00000574217 ITM2BQ9Y287 266 aa6.7□□□□□ -1.34
PRPF8-210ENST00000574217 PKP3Q9Y446 797 aa6.7□□□□□ -1.34
PRPF8-210ENST00000574217 FADS3Q9Y5Q0 445 aa6.7□□□□□ -1.34
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PRPF8-210ENST00000574217 TEX264Q9Y6I9 313 aa6.7□□□□□ -1.34
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PRPF8-210ENST00000574217 PLXNA2O75051 1894 aa6.7□□□□□ -1.34
PRPF8-210ENST00000574217 DOCK9Q9BZ29 2069 aa6.7□□□□□ -1.34
PRPF8-210ENST00000574217 TBC1D3DA0A087WVF3 549 aa6.69□□□□□ -1.34
PRPF8-210ENST00000574217 TBC1D3IA0A087WXS9 549 aa6.69□□□□□ -1.34
PRPF8-210ENST00000574217 TBC1D3EA0A087X179 549 aa6.69□□□□□ -1.34
PRPF8-210ENST00000574217 TBC1D3KA0A087X1G2 549 aa6.69□□□□□ -1.34
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PRPF8-210ENST00000574217 PAMP19021 973 aa6.69□□□□□ -1.34
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PRPF8-210ENST00000574217 SKIDA1Q1XH10 827 aa6.69□□□□□ -1.34
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PRPF8-210ENST00000574217 SEMA4AQ9H3S1 761 aa6.69□□□□□ -1.34
PRPF8-210ENST00000574217 C6orf106Q9H6K1 298 aaPredicted RBP6.69□□□□□ -1.34
PRPF8-210ENST00000574217 PREBQ9HCU5 417 aa6.69□□□□□ -1.34
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PRPF8-210ENST00000574217 NLE1Q9NVX2 485 aaPredicted RBP6.69□□□□□ -1.34
PRPF8-210ENST00000574217 ARGLU1Q9NWB6 273 aaPredicted RBP6.69□□□□□ -1.34
PRPF8-210ENST00000574217 PKD2L2Q9NZM6 624 aa6.69□□□□□ -1.34
PRPF8-210ENST00000574217 IL17CQ9P0M4 197 aa6.69□□□□□ -1.34
PRPF8-210ENST00000574217 RAB23Q9ULC3 237 aa6.69□□□□□ -1.34
PRPF8-210ENST00000574217 RIMKLBQ9ULI2 386 aa6.69□□□□□ -1.34
PRPF8-210ENST00000574217 RPS6KL1Q9Y6S9 549 aa6.69□□□□□ -1.34
PRPF8-210ENST00000574217 LRRK1Q38SD2 2015 aa6.69□□□□□ -1.34
PRPF8-210ENST00000574217 ADAMTS9Q9P2N4 1935 aa6.68□□□□□ -1.34
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