RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000568829.1

SPNS1-211, Transcript of sphingolipid transporter 1 (putative), humanhuman

TSL 5

Gene SPNS1, Length 780 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPNS1-211ENST00000568829 TMEM168Q9H0V1 697 aa16.6■□□□□ 0.25
SPNS1-211ENST00000568829 CDH19Q9H159 772 aa16.6■□□□□ 0.25
SPNS1-211ENST00000568829 EPB41L5Q9HCM4 733 aa16.6■□□□□ 0.25
SPNS1-211ENST00000568829 LRIT1Q9P2V4 623 aa16.6■□□□□ 0.25
SPNS1-211ENST00000568829 RPL26L1Q9UNX3 145 aaKnown RBP16.6■□□□□ 0.25
SPNS1-211ENST00000568829 NBEAQ8NFP9 2946 aa16.59■□□□□ 0.25
SPNS1-211ENST00000568829 RHPN2P1A8MT19 583 aa16.59■□□□□ 0.25
SPNS1-211ENST00000568829 HNRNPH3P31942 346 aaKnown RBP16.59■□□□□ 0.25
SPNS1-211ENST00000568829 MAN1A1P33908 653 aa16.59■□□□□ 0.25
SPNS1-211ENST00000568829 ETV3P41162 512 aa16.59■□□□□ 0.25
SPNS1-211ENST00000568829 CCL7P80098 99 aa16.59■□□□□ 0.25
SPNS1-211ENST00000568829 CDK3Q00526 305 aa16.59■□□□□ 0.25
SPNS1-211ENST00000568829 TRAF2Q12933 501 aa16.59■□□□□ 0.25
SPNS1-211ENST00000568829 DPYSL3Q14195 570 aa16.59■□□□□ 0.25
SPNS1-211ENST00000568829 TAF1BQ53T94 588 aaPredicted RBP16.59■□□□□ 0.25
SPNS1-211ENST00000568829 ANKRD20A8PQ5CZ79 823 aa16.59■□□□□ 0.25
SPNS1-211ENST00000568829 SPECC1LQ69YQ0 1117 aa16.59■□□□□ 0.25
SPNS1-211ENST00000568829 CLEC14AQ86T13 490 aa16.59■□□□□ 0.25
SPNS1-211ENST00000568829 PGBD5Q8N414 524 aa16.59■□□□□ 0.25
SPNS1-211ENST00000568829 GPBAR1Q8TDU6 330 aa16.59■□□□□ 0.25
SPNS1-211ENST00000568829 AP2M1Q96CW1 435 aa16.59■□□□□ 0.25
SPNS1-211ENST00000568829 CRELD1Q96HD1 420 aa16.59■□□□□ 0.25
SPNS1-211ENST00000568829 TSGA13Q96PP4 275 aa16.59■□□□□ 0.25
SPNS1-211ENST00000568829 MAK16Q9BXY0 300 aaKnown RBP16.59■□□□□ 0.25
SPNS1-211ENST00000568829 MRPL40Q9NQ50 206 aaKnown RBP16.59■□□□□ 0.25
SPNS1-211ENST00000568829 RBM22Q9NW64 420 aaKnown RBP eCLIP16.59■□□□□ 0.258e-6■□□□□ 10.3
SPNS1-211ENST00000568829 TTLL3Q9Y4R7 772 aa16.59■□□□□ 0.25
SPNS1-211ENST00000568829 PCDHGA7Q9Y5G6 932 aa16.59■□□□□ 0.25
SPNS1-211ENST00000568829 SSU72P8A0A1W2PR75 194 aa16.58■□□□□ 0.24
SPNS1-211ENST00000568829 TTC24A2A3L6 582 aaPredicted RBP16.58■□□□□ 0.24
SPNS1-211ENST00000568829 CDRT15L2A8MXV6 281 aa16.58■□□□□ 0.24
SPNS1-211ENST00000568829 AKR1B10O60218 316 aa16.58■□□□□ 0.24
SPNS1-211ENST00000568829 IL4RP24394 825 aa16.58■□□□□ 0.24
SPNS1-211ENST00000568829 GJC1P36383 396 aa16.58■□□□□ 0.24
SPNS1-211ENST00000568829 VAC14Q08AM6 782 aa16.58■□□□□ 0.24
SPNS1-211ENST00000568829 HLTFQ14527 1009 aaKnown RBP eCLIP16.58■□□□□ 0.24
SPNS1-211ENST00000568829 TMEM164Q5U3C3 297 aa16.58■□□□□ 0.24
SPNS1-211ENST00000568829 TXNRD3NBQ6F5E7 133 aa16.58■□□□□ 0.24
SPNS1-211ENST00000568829 ZNF765Q7L2R6 523 aa16.58■□□□□ 0.24
SPNS1-211ENST00000568829 NRSN1Q8IZ57 195 aa16.58■□□□□ 0.24
SPNS1-211ENST00000568829 CBARPQ8N350 705 aaPredicted RBP16.58■□□□□ 0.24
SPNS1-211ENST00000568829 Q8N9G6 341 aaPredicted RBP16.58■□□□□ 0.24
SPNS1-211ENST00000568829 CCNYQ8ND76 341 aa16.58■□□□□ 0.24
SPNS1-211ENST00000568829 CCHCR1Q8TD31 782 aa16.58■□□□□ 0.24
SPNS1-211ENST00000568829 TRAF3IP1Q8TDR0 691 aaPredicted RBP16.58■□□□□ 0.24
SPNS1-211ENST00000568829 ZDHHC1Q8WTX9 485 aa16.58■□□□□ 0.24
SPNS1-211ENST00000568829 MAML1Q92585 1016 aa16.58■□□□□ 0.24
SPNS1-211ENST00000568829 WBP1Q96G27 269 aa16.58■□□□□ 0.24
SPNS1-211ENST00000568829 LGR4Q9BXB1 951 aa16.58■□□□□ 0.24
SPNS1-211ENST00000568829 SEPT10Q9P0V9 454 aa16.58■□□□□ 0.24
SPNS1-211ENST00000568829 ASXL3Q9C0F0 2248 aa16.58■□□□□ 0.24
SPNS1-211ENST00000568829 IGSF10Q6WRI0 2623 aa16.58■□□□□ 0.24
SPNS1-211ENST00000568829 A0A0J9YYE9 177 aa16.57■□□□□ 0.24
SPNS1-211ENST00000568829 NPIPB15A6NHN6 443 aaPredicted RBP16.57■□□□□ 0.24
SPNS1-211ENST00000568829 MFSD11O43934 449 aa16.57■□□□□ 0.24
SPNS1-211ENST00000568829 NOBOXO60393 691 aa16.57■□□□□ 0.24
SPNS1-211ENST00000568829 TRBC1P01850 177 aa16.57■□□□□ 0.24
SPNS1-211ENST00000568829 CEACAM5P06731 702 aa16.57■□□□□ 0.24
SPNS1-211ENST00000568829 IVLP07476 585 aa16.57■□□□□ 0.24
SPNS1-211ENST00000568829 ZFXP17010 805 aaPredicted RBP16.57■□□□□ 0.24
SPNS1-211ENST00000568829 ARHGAP25P42331 645 aa16.57■□□□□ 0.24
SPNS1-211ENST00000568829 GPR3P46089 330 aa16.57■□□□□ 0.24
SPNS1-211ENST00000568829 GNPDA1P46926 289 aa16.57■□□□□ 0.24
SPNS1-211ENST00000568829 LRP8Q14114 963 aa16.57■□□□□ 0.24
SPNS1-211ENST00000568829 MAP9Q49MG5 647 aa16.57■□□□□ 0.24
SPNS1-211ENST00000568829 LRRC66Q68CR7 880 aa16.57■□□□□ 0.24
SPNS1-211ENST00000568829 NCBP2-AS2Q69YL0 99 aa16.57■□□□□ 0.24
SPNS1-211ENST00000568829 ALG1LQ6GMV1 187 aa16.57■□□□□ 0.24
SPNS1-211ENST00000568829 ADAMTSL4Q6UY14 1074 aa16.57■□□□□ 0.24
SPNS1-211ENST00000568829 Q6ZVL8 140 aa16.57■□□□□ 0.24
SPNS1-211ENST00000568829 HSD11B1LQ7Z5J1 315 aa16.57■□□□□ 0.24
SPNS1-211ENST00000568829 SPRED1Q7Z699 444 aa16.57■□□□□ 0.24
SPNS1-211ENST00000568829 PIM3Q86V86 326 aa16.57■□□□□ 0.24
SPNS1-211ENST00000568829 JAMLQ86YT9 394 aa16.57■□□□□ 0.24
SPNS1-211ENST00000568829 EXD1Q8NHP7 514 aa16.57■□□□□ 0.24
SPNS1-211ENST00000568829 PIH1D2Q8WWB5 315 aa16.57■□□□□ 0.24
SPNS1-211ENST00000568829 DPYSL5Q9BPU6 564 aa16.57■□□□□ 0.24
SPNS1-211ENST00000568829 ADGRE3Q9BY15 652 aa16.57■□□□□ 0.24
SPNS1-211ENST00000568829 FRMD8Q9BZ67 464 aaPredicted RBP16.57■□□□□ 0.24
SPNS1-211ENST00000568829 SUFUQ9UMX1 484 aa16.57■□□□□ 0.24
SPNS1-211ENST00000568829 SLC17A4Q9Y2C5 497 aa16.57■□□□□ 0.24
SPNS1-211ENST00000568829 RGSL1A5PLK6 1076 aa16.56■□□□□ 0.24
SPNS1-211ENST00000568829 FZD6O60353 706 aa16.56■□□□□ 0.24
SPNS1-211ENST00000568829 CPNE6O95741 557 aa16.56■□□□□ 0.24
SPNS1-211ENST00000568829 TMEM253P0C7T8 217 aa16.56■□□□□ 0.24
SPNS1-211ENST00000568829 CTPS1P17812 591 aa16.56■□□□□ 0.24
SPNS1-211ENST00000568829 GM2AP17900 193 aa16.56■□□□□ 0.24
SPNS1-211ENST00000568829 LHCGRP22888 699 aa16.56■□□□□ 0.24
SPNS1-211ENST00000568829 UGT1A5P35504 534 aa16.56■□□□□ 0.24
SPNS1-211ENST00000568829 ARSEP51690 589 aa16.56■□□□□ 0.24
SPNS1-211ENST00000568829 PDX1P52945 283 aa16.56■□□□□ 0.24
SPNS1-211ENST00000568829 SKOR1P84550 965 aa16.56■□□□□ 0.24
SPNS1-211ENST00000568829 MMRN1Q13201 1228 aa16.56■□□□□ 0.24
SPNS1-211ENST00000568829 ZSCAN23Q3MJ62 389 aa16.56■□□□□ 0.24
SPNS1-211ENST00000568829 ARHGAP40Q5TG30 622 aa16.56■□□□□ 0.24
SPNS1-211ENST00000568829 CCDC81Q6ZN84 652 aa16.56■□□□□ 0.24
SPNS1-211ENST00000568829 TECPR1Q7Z6L1 1165 aa16.56■□□□□ 0.24
SPNS1-211ENST00000568829 VSIG1Q86XK7 387 aa16.56■□□□□ 0.24
SPNS1-211ENST00000568829 RHOT2Q8IXI1 618 aa16.56■□□□□ 0.24
SPNS1-211ENST00000568829 CCDC13Q8IYE1 715 aa16.56■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 21.1 ms