RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000550159.5

CS-218, Transcript of citrate synthase, humanhuman

TSL 5

Gene CS, Length 646 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CS-218ENST00000550159 RPL6Q02878 288 aaKnown RBP9.65□□□□□ -0.86
CS-218ENST00000550159 NIPAL4Q0D2K0 466 aa9.65□□□□□ -0.86
CS-218ENST00000550159 CNTN1Q12860 1018 aa9.65□□□□□ -0.86
CS-218ENST00000550159 GALNT3Q14435 633 aa9.65□□□□□ -0.86
CS-218ENST00000550159 SLMAPQ14BN4 828 aa9.65□□□□□ -0.86
CS-218ENST00000550159 ACOX1Q15067 660 aa9.65□□□□□ -0.86
CS-218ENST00000550159 SPDYCQ5MJ68 293 aa9.65□□□□□ -0.86
CS-218ENST00000550159 FAXCQ5TGI0 409 aa9.65□□□□□ -0.86
CS-218ENST00000550159 PKN3Q6P5Z2 889 aa9.65□□□□□ -0.86
CS-218ENST00000550159 LRRC8BQ6P9F7 803 aa9.65□□□□□ -0.86
CS-218ENST00000550159 TMEM92Q6UXU6 159 aa9.65□□□□□ -0.86
CS-218ENST00000550159 OTUD6BQ8N6M0 293 aa9.65□□□□□ -0.86
CS-218ENST00000550159 ARRDC2Q8TBH0 407 aa9.65□□□□□ -0.86
CS-218ENST00000550159 BRSK1Q8TDC3 778 aa9.65□□□□□ -0.86
CS-218ENST00000550159 SLC39A7Q92504 469 aa9.65□□□□□ -0.86
CS-218ENST00000550159 SNX19Q92543 992 aa9.65□□□□□ -0.86
CS-218ENST00000550159 EZH1Q92800 747 aaPredicted RBP9.65□□□□□ -0.86
CS-218ENST00000550159 ERLEC1Q96DZ1 483 aa9.65□□□□□ -0.86
CS-218ENST00000550159 RHOXF2Q9BQY4 288 aa9.65□□□□□ -0.86
CS-218ENST00000550159 LRRC1Q9BTT6 524 aa9.65□□□□□ -0.86
CS-218ENST00000550159 MTG2Q9H4K7 406 aa9.65□□□□□ -0.86
CS-218ENST00000550159 ARGLU1Q9NWB6 273 aaPredicted RBP9.65□□□□□ -0.86
CS-218ENST00000550159 APPL1Q9UKG1 709 aa9.65□□□□□ -0.86
CS-218ENST00000550159 CYP8B1Q9UNU6 501 aa9.65□□□□□ -0.86
CS-218ENST00000550159 SNX24Q9Y343 169 aa9.65□□□□□ -0.86
CS-218ENST00000550159 NYNRINQ9P2P1 1898 aaKnown RBP9.65□□□□□ -0.86
CS-218ENST00000550159 A0A0J9YYE9 177 aa9.64□□□□□ -0.87
CS-218ENST00000550159 LOC285095A0A1B0GVY8 99 aa9.64□□□□□ -0.87
CS-218ENST00000550159 TSPAN11A1L157 253 aa9.64□□□□□ -0.87
CS-218ENST00000550159 GOLGA8CPA6NN73 597 aa9.64□□□□□ -0.87
CS-218ENST00000550159 MUSKO15146 869 aa9.64□□□□□ -0.87
CS-218ENST00000550159 EIF3HO15372 352 aaKnown RBP eCLIP9.64□□□□□ -0.872e-6■■■■□ 21.8
CS-218ENST00000550159 ZNF821O75541 412 aaPredicted RBP9.64□□□□□ -0.87
CS-218ENST00000550159 C1QL1O75973 258 aa9.64□□□□□ -0.87
CS-218ENST00000550159 SEC31AO94979 1220 aaKnown RBP9.64□□□□□ -0.87
CS-218ENST00000550159 METTL18O95568 372 aa9.64□□□□□ -0.87
CS-218ENST00000550159 TRBC1P01850 177 aa9.64□□□□□ -0.87
CS-218ENST00000550159 LPOP22079 712 aaPredicted RBP9.64□□□□□ -0.87
CS-218ENST00000550159 ADRA1DP25100 572 aa9.64□□□□□ -0.87
CS-218ENST00000550159 GKP32189 559 aa9.64□□□□□ -0.87
CS-218ENST00000550159 CD68P34810 354 aaPredicted RBP9.64□□□□□ -0.87
CS-218ENST00000550159 PHBP35232 272 aa9.64□□□□□ -0.87
CS-218ENST00000550159 ABL2P42684 1182 aa9.64□□□□□ -0.87
CS-218ENST00000550159 PTGIRP43119 386 aa9.64□□□□□ -0.87
CS-218ENST00000550159 RGRP47804 291 aa9.64□□□□□ -0.87
CS-218ENST00000550159 COPAP53621 1224 aa9.64□□□□□ -0.87
CS-218ENST00000550159 ITGA8P53708 1063 aa9.64□□□□□ -0.87
CS-218ENST00000550159 SESN2P58004 480 aaPredicted RBP9.64□□□□□ -0.87
CS-218ENST00000550159 PRAMEP78395 509 aa9.64□□□□□ -0.87
CS-218ENST00000550159 ILF2Q12905 390 aaKnown RBP9.64□□□□□ -0.87
CS-218ENST00000550159 TRAF2Q12933 501 aa9.64□□□□□ -0.87
CS-218ENST00000550159 TAF1AQ15573 450 aaPredicted RBP9.64□□□□□ -0.87
CS-218ENST00000550159 AARS2Q5JTZ9 985 aaKnown RBP9.64□□□□□ -0.87
CS-218ENST00000550159 PCID2Q5JVF3 399 aa9.64□□□□□ -0.87
CS-218ENST00000550159 SIRPB2Q5JXA9 342 aa9.64□□□□□ -0.87
CS-218ENST00000550159 DENND2CQ68D51 928 aa9.64□□□□□ -0.87
CS-218ENST00000550159 DPPA4Q7L190 304 aa9.64□□□□□ -0.87
CS-218ENST00000550159 PARS2Q7L3T8 475 aaKnown RBP9.64□□□□□ -0.87
CS-218ENST00000550159 CCDC25Q86WR0 208 aa9.64□□□□□ -0.87
CS-218ENST00000550159 PALM2Q8IXS6 379 aa9.64□□□□□ -0.87
CS-218ENST00000550159 NRSN1Q8IZ57 195 aa9.64□□□□□ -0.87
CS-218ENST00000550159 RGL4Q8IZJ4 473 aa9.64□□□□□ -0.87
CS-218ENST00000550159 MDGA1Q8NFP4 955 aa9.64□□□□□ -0.87
CS-218ENST00000550159 CADM4Q8NFZ8 388 aa9.64□□□□□ -0.87
CS-218ENST00000550159 MDM1Q8TC05 714 aa9.64□□□□□ -0.87
CS-218ENST00000550159 SPOCK2Q92563 424 aa9.64□□□□□ -0.87
CS-218ENST00000550159 ECHDC3Q96DC8 303 aa9.64□□□□□ -0.87
CS-218ENST00000550159 TOE1Q96GM8 510 aaKnown RBP9.64□□□□□ -0.87
CS-218ENST00000550159 TTC25Q96NG3 672 aa9.64□□□□□ -0.87
CS-218ENST00000550159 UBL7Q96S82 380 aaPredicted RBP9.64□□□□□ -0.87
CS-218ENST00000550159 FMO2Q99518 471 aa9.64□□□□□ -0.87
CS-218ENST00000550159 TRIM51Q9BSJ1 452 aa9.64□□□□□ -0.87
CS-218ENST00000550159 TPSD1Q9BZJ3 242 aa9.64□□□□□ -0.87
CS-218ENST00000550159 MKRN2Q9H000 416 aaKnown RBP9.64□□□□□ -0.87
CS-218ENST00000550159 NEUROG2Q9H2A3 272 aa9.64□□□□□ -0.87
CS-218ENST00000550159 PCDH12Q9NPG4 1184 aa9.64□□□□□ -0.87
CS-218ENST00000550159 TXNDC16Q9P2K2 825 aa9.64□□□□□ -0.87
CS-218ENST00000550159 SUSD2Q9UGT4 822 aa9.64□□□□□ -0.87
CS-218ENST00000550159 DMTF1Q9Y222 760 aa9.64□□□□□ -0.87
CS-218ENST00000550159 VPS9D1Q9Y2B5 631 aa9.64□□□□□ -0.87
CS-218ENST00000550159 NEU2Q9Y3R4 380 aa9.64□□□□□ -0.87
CS-218ENST00000550159 SLC30A1Q9Y6M5 507 aa9.64□□□□□ -0.87
CS-218ENST00000550159 FAM169AQ9Y6X4 670 aa9.64□□□□□ -0.87
CS-218ENST00000550159 COL4A2P08572 1712 aa9.64□□□□□ -0.87
CS-218ENST00000550159 PIEZO2Q9H5I5 2752 aa9.63□□□□□ -0.87
CS-218ENST00000550159 TTC24A2A3L6 582 aaPredicted RBP9.63□□□□□ -0.87
CS-218ENST00000550159 PCNX2A6NKB5 2137 aa9.63□□□□□ -0.87
CS-218ENST00000550159 GOLGA8MH3BSY2 632 aa9.63□□□□□ -0.87
CS-218ENST00000550159 TK2O00142 265 aa9.63□□□□□ -0.87
CS-218ENST00000550159 TRAFD1O14545 582 aaPredicted RBP9.63□□□□□ -0.87
CS-218ENST00000550159 RIOK3O14730 519 aaKnown RBP9.63□□□□□ -0.87
CS-218ENST00000550159 WNT9AO14904 365 aa9.63□□□□□ -0.87
CS-218ENST00000550159 FANCGO15287 622 aa9.63□□□□□ -0.87
CS-218ENST00000550159 PLRG1O43660 514 aaKnown RBP9.63□□□□□ -0.87
CS-218ENST00000550159 RNGTTO60942 597 aaKnown RBP9.63□□□□□ -0.87
CS-218ENST00000550159 SPAG6O75602 509 aa9.63□□□□□ -0.87
CS-218ENST00000550159 FSBPO95073 299 aa9.63□□□□□ -0.87
CS-218ENST00000550159 AGTP01019 485 aa9.63□□□□□ -0.87
CS-218ENST00000550159 CTSLP07711 333 aa9.63□□□□□ -0.87
CS-218ENST00000550159 RALBP11234 206 aa9.63□□□□□ -0.87
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 20.7 ms