RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000549340.5

LETMD1-218, Transcript of LETM1 domain containing 1, humanhuman

TSL 5

Gene LETMD1, Length 818 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LETMD1-218ENST00000549340 CDKN2DP55273 166 aa14.63□□□□□ -0.07
LETMD1-218ENST00000549340 RAD51Q06609 339 aa14.63□□□□□ -0.07
LETMD1-218ENST00000549340 RCN2Q14257 317 aa14.63□□□□□ -0.07
LETMD1-218ENST00000549340 CSHL1Q14406 222 aa14.63□□□□□ -0.07
LETMD1-218ENST00000549340 TBCCQ15814 346 aa14.63□□□□□ -0.07
LETMD1-218ENST00000549340 FUT11Q495W5 492 aa14.63□□□□□ -0.07
LETMD1-218ENST00000549340 DGKKQ5KSL6 1271 aa14.63□□□□□ -0.07
LETMD1-218ENST00000549340 ZNF549Q6P9A3 640 aa14.63□□□□□ -0.07
LETMD1-218ENST00000549340 ASRGL1Q7L266 308 aa14.63□□□□□ -0.07
LETMD1-218ENST00000549340 SPRED2Q7Z698 418 aa14.63□□□□□ -0.07
LETMD1-218ENST00000549340 SLC22A9Q8IVM8 553 aa14.63□□□□□ -0.07
LETMD1-218ENST00000549340 STK40Q8N2I9 435 aa14.63□□□□□ -0.07
LETMD1-218ENST00000549340 CELF5Q8N6W0 485 aaKnown RBP14.63□□□□□ -0.07
LETMD1-218ENST00000549340 EFHBQ8N7U6 833 aa14.63□□□□□ -0.07
LETMD1-218ENST00000549340 INPP5DQ92835 1189 aa14.63□□□□□ -0.07
LETMD1-218ENST00000549340 TBRG4Q969Z0 631 aaKnown RBP eCLIP14.63□□□□□ -0.07
LETMD1-218ENST00000549340 LYSMD1Q96S90 227 aa14.63□□□□□ -0.07
LETMD1-218ENST00000549340 CCDC68Q9H2F9 335 aa14.63□□□□□ -0.07
LETMD1-218ENST00000549340 SYTL2Q9HCH5 934 aa14.63□□□□□ -0.07
LETMD1-218ENST00000549340 CPSF2Q9P2I0 782 aaKnown RBP14.63□□□□□ -0.07
LETMD1-218ENST00000549340 FKBPLQ9UIM3 349 aa14.63□□□□□ -0.07
LETMD1-218ENST00000549340 APOBEC2Q9Y235 224 aaKnown RBP14.63□□□□□ -0.07
LETMD1-218ENST00000549340 PPIL1Q9Y3C6 166 aa14.63□□□□□ -0.07
LETMD1-218ENST00000549340 MRPS23Q9Y3D9 190 aaKnown RBP14.63□□□□□ -0.07
LETMD1-218ENST00000549340 RAP2CQ9Y3L5 183 aa14.63□□□□□ -0.07
LETMD1-218ENST00000549340 CAPN8A6NHC0 703 aa14.62□□□□□ -0.07
LETMD1-218ENST00000549340 NEDD8-MDP1E9PL57 170 aa14.62□□□□□ -0.07
LETMD1-218ENST00000549340 SLCO1B7G3V0H7 640 aa14.62□□□□□ -0.07
LETMD1-218ENST00000549340 DLX3O60479 287 aa14.62□□□□□ -0.07
LETMD1-218ENST00000549340 CSPG5O95196 566 aa14.62□□□□□ -0.07
LETMD1-218ENST00000549340 POP4O95707 220 aaKnown RBP14.62□□□□□ -0.07
LETMD1-218ENST00000549340 CCDC166P0CW27 439 aa14.62□□□□□ -0.07
LETMD1-218ENST00000549340 TYRP14679 529 aa14.62□□□□□ -0.07
LETMD1-218ENST00000549340 CEBPBP17676 345 aa14.62□□□□□ -0.07
LETMD1-218ENST00000549340 SERPINB3P29508 390 aa14.62□□□□□ -0.07
LETMD1-218ENST00000549340 MC4RP32245 332 aa14.62□□□□□ -0.07
LETMD1-218ENST00000549340 PPARGP37231 505 aaPredicted RBP14.62□□□□□ -0.07
LETMD1-218ENST00000549340 GLRBP48167 497 aa14.62□□□□□ -0.07
LETMD1-218ENST00000549340 NTHL1P78549 312 aa14.62□□□□□ -0.07
LETMD1-218ENST00000549340 CACNG1Q06432 222 aa14.62□□□□□ -0.07
LETMD1-218ENST00000549340 PRKAA1Q13131 559 aa14.62□□□□□ -0.07
LETMD1-218ENST00000549340 DUSP6Q16828 381 aa14.62□□□□□ -0.07
LETMD1-218ENST00000549340 CTC1Q2NKJ3 1217 aa14.62□□□□□ -0.07
LETMD1-218ENST00000549340 MYLK3Q32MK0 819 aa14.62□□□□□ -0.07
LETMD1-218ENST00000549340 HSF5Q4G112 596 aaPredicted RBP14.62□□□□□ -0.07
LETMD1-218ENST00000549340 ASTLQ6HA08 431 aaPredicted RBP14.62□□□□□ -0.07
LETMD1-218ENST00000549340 NAPRTQ6XQN6 538 aa14.62□□□□□ -0.07
LETMD1-218ENST00000549340 CERS6Q6ZMG9 384 aa14.62□□□□□ -0.07
LETMD1-218ENST00000549340 PIWIL4Q7Z3Z4 852 aaKnown RBP14.62□□□□□ -0.07
LETMD1-218ENST00000549340 LDB1Q86U70 411 aaPredicted RBP14.62□□□□□ -0.07
LETMD1-218ENST00000549340 CAMK1DQ8IU85 385 aa14.62□□□□□ -0.07
LETMD1-218ENST00000549340 KIRREL3Q8IZU9 778 aa14.62□□□□□ -0.07
LETMD1-218ENST00000549340 CBARPQ8N350 705 aaPredicted RBP14.62□□□□□ -0.07
LETMD1-218ENST00000549340 SMG7Q92540 1137 aaKnown RBP14.62□□□□□ -0.07
LETMD1-218ENST00000549340 KLHL29Q96CT2 875 aa14.62□□□□□ -0.07
LETMD1-218ENST00000549340 ECHDC3Q96DC8 303 aa14.62□□□□□ -0.07
LETMD1-218ENST00000549340 ZNF641Q96N77 438 aaPredicted RBP14.62□□□□□ -0.07
LETMD1-218ENST00000549340 GPR63Q9BZJ6 419 aa14.62□□□□□ -0.07
LETMD1-218ENST00000549340 ILKAPQ9H0C8 392 aaPredicted RBP14.62□□□□□ -0.07
LETMD1-218ENST00000549340 CDH19Q9H159 772 aa14.62□□□□□ -0.07
LETMD1-218ENST00000549340 RASSF4Q9H2L5 321 aa14.62□□□□□ -0.07
LETMD1-218ENST00000549340 TAS2R13Q9NYV9 303 aa14.62□□□□□ -0.07
LETMD1-218ENST00000549340 LNPEPQ9UIQ6 1025 aa14.62□□□□□ -0.07
LETMD1-218ENST00000549340 CRYL1Q9Y2S2 319 aa14.62□□□□□ -0.07
LETMD1-218ENST00000549340 MYO7AQ13402 2215 aa14.61□□□□□ -0.07
LETMD1-218ENST00000549340 WASH3PC4AMC7 463 aa14.61□□□□□ -0.07
LETMD1-218ENST00000549340 FCHO1O14526 889 aa14.61□□□□□ -0.07
LETMD1-218ENST00000549340 PYGLP06737 847 aa14.61□□□□□ -0.07
LETMD1-218ENST00000549340 KITP10721 976 aa14.61□□□□□ -0.07
LETMD1-218ENST00000549340 NQO1P15559 274 aaKnown RBP14.61□□□□□ -0.07
LETMD1-218ENST00000549340 ARRB2P32121 409 aa14.61□□□□□ -0.07
LETMD1-218ENST00000549340 PTGER3P43115 390 aa14.61□□□□□ -0.07
LETMD1-218ENST00000549340 XIAPP98170 497 aa14.61□□□□□ -0.07
LETMD1-218ENST00000549340 ECT2LQ008S8 904 aa14.61□□□□□ -0.07
LETMD1-218ENST00000549340 TIAL1Q01085 375 aaKnown RBP eCLIP14.61□□□□□ -0.07
LETMD1-218ENST00000549340 PEX6Q13608 980 aa14.61□□□□□ -0.07
LETMD1-218ENST00000549340 CARD16Q5EG05 197 aa14.61□□□□□ -0.07
LETMD1-218ENST00000549340 LY6G5CQ5SRR4 150 aa14.61□□□□□ -0.07
LETMD1-218ENST00000549340 C9orf50Q5SZB4 431 aa14.61□□□□□ -0.07
LETMD1-218ENST00000549340 COL13A1Q5TAT6 717 aaPredicted RBP14.61□□□□□ -0.07
LETMD1-218ENST00000549340 LYPLAL1Q5VWZ2 237 aa14.61□□□□□ -0.07
LETMD1-218ENST00000549340 LYSMD3Q7Z3D4 306 aa14.61□□□□□ -0.07
LETMD1-218ENST00000549340 ADGRG2Q8IZP9 1017 aa14.61□□□□□ -0.07
LETMD1-218ENST00000549340 AHI1Q8N157 1196 aa14.61□□□□□ -0.07
LETMD1-218ENST00000549340 WFIKKN2Q8TEU8 576 aa14.61□□□□□ -0.07
LETMD1-218ENST00000549340 CNDP1Q96KN2 507 aa14.61□□□□□ -0.07
LETMD1-218ENST00000549340 ZSWIM3Q96MP5 696 aa14.61□□□□□ -0.07
LETMD1-218ENST00000549340 TMEM237Q96Q45 408 aa14.61□□□□□ -0.07
LETMD1-218ENST00000549340 CDCA3Q99618 268 aaPredicted RBP14.61□□□□□ -0.07
LETMD1-218ENST00000549340 LRMDAQ9H2I8 198 aa14.61□□□□□ -0.07
LETMD1-218ENST00000549340 SFXN1Q9H9B4 322 aa14.61□□□□□ -0.07
LETMD1-218ENST00000549340 PIDD1Q9HB75 910 aa14.61□□□□□ -0.07
LETMD1-218ENST00000549340 ARHGEF3Q9NR81 526 aa14.61□□□□□ -0.07
LETMD1-218ENST00000549340 VTI1BQ9UEU0 232 aa14.61□□□□□ -0.07
LETMD1-218ENST00000549340 FBXO10Q9UK96 956 aa14.61□□□□□ -0.07
LETMD1-218ENST00000549340 APPL1Q9UKG1 709 aa14.61□□□□□ -0.07
LETMD1-218ENST00000549340 SLC30A1Q9Y6M5 507 aa14.61□□□□□ -0.07
LETMD1-218ENST00000549340 PLXNB3Q9ULL4 1909 aa14.6□□□□□ -0.07
LETMD1-218ENST00000549340 GOLGA8CPA6NN73 597 aa14.6□□□□□ -0.07
LETMD1-218ENST00000549340 GRXCR1A8MXD5 290 aa14.6□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 23.3 ms