RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000548524.5

USP15-208, Transcript of ubiquitin specific peptidase 15, humanhuman

TSL 2

Gene USP15, Length 648 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP15-208ENST00000548524 FUBP1Q96AE4 644 aaKnown RBP9.51□□□□□ -0.89
USP15-208ENST00000548524 DTD2Q96FN9 168 aa9.51□□□□□ -0.89
USP15-208ENST00000548524 RBM41Q96IZ5 413 aaKnown RBP9.51□□□□□ -0.89
USP15-208ENST00000548524 TBATAQ96M53 351 aa9.51□□□□□ -0.89
USP15-208ENST00000548524 AGAP3Q96P47 875 aa9.51□□□□□ -0.89
USP15-208ENST00000548524 MCCC1Q96RQ3 725 aaPredicted RBP9.51□□□□□ -0.89
USP15-208ENST00000548524 BAG1Q99933 345 aaPredicted RBP9.51□□□□□ -0.89
USP15-208ENST00000548524 LRRC61Q9BV99 259 aa9.51□□□□□ -0.89
USP15-208ENST00000548524 TDRD1Q9BXT4 1180 aaKnown RBP9.51□□□□□ -0.89
USP15-208ENST00000548524 CEP41Q9BYV8 373 aa9.51□□□□□ -0.89
USP15-208ENST00000548524 USP29Q9HBJ7 922 aa9.51□□□□□ -0.89
USP15-208ENST00000548524 PCDH9Q9HC56 1237 aa9.51□□□□□ -0.89
USP15-208ENST00000548524 PHPT1Q9NRX4 125 aaPredicted RBP9.51□□□□□ -0.89
USP15-208ENST00000548524 NCKIPSDQ9NZQ3 722 aa9.51□□□□□ -0.89
USP15-208ENST00000548524 MOSPD1Q9UJG1 213 aa9.51□□□□□ -0.89
USP15-208ENST00000548524 SALL4Q9UJQ4 1053 aa9.51□□□□□ -0.89
USP15-208ENST00000548524 DNPEPQ9ULA0 475 aa9.51□□□□□ -0.89
USP15-208ENST00000548524 PPIL1Q9Y3C6 166 aa9.51□□□□□ -0.89
USP15-208ENST00000548524 CHD5Q8TDI0 1954 aa9.51□□□□□ -0.89
USP15-208ENST00000548524 SPTBN2O15020 2390 aa9.51□□□□□ -0.89
USP15-208ENST00000548524 A0A0J9YYE9 177 aa9.5□□□□□ -0.89
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USP15-208ENST00000548524 LMO7DNF2Z398 122 aa9.5□□□□□ -0.89
USP15-208ENST00000548524 YY2O15391 372 aa9.5□□□□□ -0.89
USP15-208ENST00000548524 FZD6O60353 706 aa9.5□□□□□ -0.89
USP15-208ENST00000548524 GCATO75600 419 aa9.5□□□□□ -0.89
USP15-208ENST00000548524 TRBC1P01850 177 aa9.5□□□□□ -0.89
USP15-208ENST00000548524 HOXC4P09017 264 aaPredicted RBP9.5□□□□□ -0.89
USP15-208ENST00000548524 ZNF30P17039 623 aa9.5□□□□□ -0.89
USP15-208ENST00000548524 GM2AP17900 193 aa9.5□□□□□ -0.89
USP15-208ENST00000548524 TGM2P21980 687 aa9.5□□□□□ -0.89
USP15-208ENST00000548524 GPR1P46091 355 aa9.5□□□□□ -0.89
USP15-208ENST00000548524 RPL26P61254 145 aaKnown RBP9.5□□□□□ -0.89
USP15-208ENST00000548524 CDKN3Q16667 212 aa9.5□□□□□ -0.89
USP15-208ENST00000548524 TFDP3Q5H9I0 405 aa9.5□□□□□ -0.89
USP15-208ENST00000548524 CCDC181Q5TID7 509 aa9.5□□□□□ -0.89
USP15-208ENST00000548524 LRRC66Q68CR7 880 aa9.5□□□□□ -0.89
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USP15-208ENST00000548524 Q6ZVL8 140 aa9.5□□□□□ -0.89
USP15-208ENST00000548524 B4GALNT4Q76KP1 1039 aa9.5□□□□□ -0.89
USP15-208ENST00000548524 NT5DC3Q86UY8 548 aa9.5□□□□□ -0.89
USP15-208ENST00000548524 KATNAL2Q8IYT4 538 aa9.5□□□□□ -0.89
USP15-208ENST00000548524 TXLNBQ8N3L3 684 aa9.5□□□□□ -0.89
USP15-208ENST00000548524 IFI44Q8TCB0 444 aa9.5□□□□□ -0.89
USP15-208ENST00000548524 TFB1MQ8WVM0 346 aaKnown RBP9.5□□□□□ -0.89
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USP15-208ENST00000548524 P3H4Q92791 437 aa9.5□□□□□ -0.89
USP15-208ENST00000548524 OLFM3Q96PB7 478 aa9.5□□□□□ -0.89
USP15-208ENST00000548524 RBM15Q96T37 977 aaKnown RBP eCLIP9.5□□□□□ -0.89
USP15-208ENST00000548524 ADGRE3Q9BY15 652 aa9.5□□□□□ -0.89
USP15-208ENST00000548524 CLPBQ9H078 707 aa9.5□□□□□ -0.89
USP15-208ENST00000548524 ABCG4Q9H172 646 aa9.5□□□□□ -0.89
USP15-208ENST00000548524 CCDC86Q9H6F5 360 aaKnown RBP9.5□□□□□ -0.89
USP15-208ENST00000548524 SUDS3Q9H7L9 328 aaPredicted RBP9.5□□□□□ -0.89
USP15-208ENST00000548524 IMPACTQ9P2X3 320 aa9.5□□□□□ -0.89
USP15-208ENST00000548524 GULP1Q9UBP9 304 aa9.5□□□□□ -0.89
USP15-208ENST00000548524 ZMIZ1Q9ULJ6 1067 aa9.5□□□□□ -0.89
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USP15-208ENST00000548524 RPL26L1Q9UNX3 145 aaKnown RBP9.5□□□□□ -0.89
USP15-208ENST00000548524 CNOT1A5YKK6 2376 aaKnown RBP9.49□□□□□ -0.89
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USP15-208ENST00000548524 TMEM202A6NGA9 273 aa9.49□□□□□ -0.89
USP15-208ENST00000548524 CAPN8A6NHC0 703 aa9.49□□□□□ -0.89
USP15-208ENST00000548524 BTNL10A8MVZ5 291 aa9.49□□□□□ -0.89
USP15-208ENST00000548524 TNFRSF10CO14798 259 aa9.49□□□□□ -0.89
USP15-208ENST00000548524 MT-CO3P00414 261 aa9.49□□□□□ -0.89
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USP15-208ENST00000548524 CELA2BP08218 269 aaPredicted RBP9.49□□□□□ -0.89
USP15-208ENST00000548524 MYCLP1P12525 358 aaPredicted RBP9.49□□□□□ -0.89
USP15-208ENST00000548524 PECAM1P16284 738 aaPredicted RBP9.49□□□□□ -0.89
USP15-208ENST00000548524 CDC25BP30305 580 aa9.49□□□□□ -0.89
USP15-208ENST00000548524 TRIM23P36406 574 aa9.49□□□□□ -0.89
USP15-208ENST00000548524 CETN2P41208 172 aa9.49□□□□□ -0.89
USP15-208ENST00000548524 SLC19A1P41440 591 aa9.49□□□□□ -0.89
USP15-208ENST00000548524 MARCKSL1P49006 195 aa9.49□□□□□ -0.89
USP15-208ENST00000548524 VAV2P52735 878 aa9.49□□□□□ -0.89
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USP15-208ENST00000548524 TARDBPQ13148 414 aaKnown RBP eCLIP9.49□□□□□ -0.894e-6■■□□□ 13.1
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USP15-208ENST00000548524 PPP2R5EQ16537 467 aa9.49□□□□□ -0.89
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USP15-208ENST00000548524 FAM182AQ5T1J6 154 aa9.49□□□□□ -0.89
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USP15-208ENST00000548524 LVRNQ6Q4G3 990 aa9.49□□□□□ -0.89
USP15-208ENST00000548524 RFLNAQ6ZTI6 216 aa9.49□□□□□ -0.89
USP15-208ENST00000548524 EFL1Q7Z2Z2 1120 aaKnown RBP9.49□□□□□ -0.89
USP15-208ENST00000548524 KDELC2Q7Z4H8 507 aa9.49□□□□□ -0.89
USP15-208ENST00000548524 TAF8Q7Z7C8 310 aa9.49□□□□□ -0.89
USP15-208ENST00000548524 ZC3H18Q86VM9 953 aaKnown RBP9.49□□□□□ -0.89
USP15-208ENST00000548524 HEATR4Q86WZ0 1026 aa9.49□□□□□ -0.89
USP15-208ENST00000548524 PELI3Q8N2H9 469 aa9.49□□□□□ -0.89
USP15-208ENST00000548524 CBARPQ8N350 705 aaPredicted RBP9.49□□□□□ -0.89
USP15-208ENST00000548524 SDR16C5Q8N3Y7 309 aa9.49□□□□□ -0.89
USP15-208ENST00000548524 CNTD1Q8N815 330 aa9.49□□□□□ -0.89
USP15-208ENST00000548524 EXD1Q8NHP7 514 aa9.49□□□□□ -0.89
USP15-208ENST00000548524 KIAA1524Q8TCG1 905 aa9.49□□□□□ -0.89
USP15-208ENST00000548524 MAPK15Q8TD08 544 aa9.49□□□□□ -0.89
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