RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000532457.5

PACSIN3-209, Transcript of protein kinase C and casein kinase substrate in neurons 3, humanhuman

TSL 5

Gene PACSIN3, Length 1,845 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PACSIN3-209ENST00000532457 CCINQ13939 588 aa21.94■■□□□ 1.1
PACSIN3-209ENST00000532457 GRTP1Q5TC63 336 aa21.94■■□□□ 1.1
PACSIN3-209ENST00000532457 ZNF470Q6ECI4 717 aa21.94■■□□□ 1.1
PACSIN3-209ENST00000532457 C4orf33Q8N1A6 199 aa21.94■■□□□ 1.1
PACSIN3-209ENST00000532457 ZNF513Q8N8E2 541 aaPredicted RBP21.94■■□□□ 1.1
PACSIN3-209ENST00000532457 C2CD4AQ8NCU7 369 aaPredicted RBP21.94■■□□□ 1.1
PACSIN3-209ENST00000532457 MDM1Q8TC05 714 aa21.94■■□□□ 1.1
PACSIN3-209ENST00000532457 KCNV2Q8TDN2 545 aa21.94■■□□□ 1.1
PACSIN3-209ENST00000532457 LRIG1Q96JA1 1093 aa21.94■■□□□ 1.1
PACSIN3-209ENST00000532457 PKNOX2Q96KN3 472 aa21.94■■□□□ 1.1
PACSIN3-209ENST00000532457 RBBP8Q99708 897 aa21.94■■□□□ 1.1
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PACSIN3-209ENST00000532457 C16orf96A6NNT2 1141 aa21.94■■□□□ 1.1
PACSIN3-209ENST00000532457 GOLGA8RI6L899 631 aa21.94■■□□□ 1.1
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PACSIN3-209ENST00000532457 HAUS5O94927 633 aa21.94■■□□□ 1.1
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PACSIN3-209ENST00000532457 TMIEQ8NEW7 156 aa21.94■■□□□ 1.1
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PACSIN3-209ENST00000532457 B4GALT6Q9UBX8 382 aa21.94■■□□□ 1.1
PACSIN3-209ENST00000532457 SIT1Q9Y3P8 196 aa21.94■■□□□ 1.1
PACSIN3-209ENST00000532457 PLK4O00444 970 aa21.93■■□□□ 1.1
PACSIN3-209ENST00000532457 NPC1O15118 1278 aa21.93■■□□□ 1.1
PACSIN3-209ENST00000532457 ITGA2BP08514 1039 aa21.93■■□□□ 1.1
PACSIN3-209ENST00000532457 ATP5DP30049 168 aa21.93■■□□□ 1.1
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PACSIN3-209ENST00000532457 C2orf27AQ580R0 203 aa21.93■■□□□ 1.1
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PACSIN3-209ENST00000532457 OR4L1Q8NH43 312 aa21.93■■□□□ 1.1
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PACSIN3-209ENST00000532457 OR8D1Q8WZ84 308 aa21.93■■□□□ 1.1
PACSIN3-209ENST00000532457 FOXQ1Q9C009 403 aa21.93■■□□□ 1.1
PACSIN3-209ENST00000532457 PCDH12Q9NPG4 1184 aa21.93■■□□□ 1.1
PACSIN3-209ENST00000532457 DKK3Q9UBP4 350 aa21.93■■□□□ 1.1
PACSIN3-209ENST00000532457 SUN2Q9UH99 717 aa21.93■■□□□ 1.1
PACSIN3-209ENST00000532457 GOLGA8CPA6NN73 597 aa21.92■■□□□ 1.1
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PACSIN3-209ENST00000532457 SPAG7O75391 227 aa21.92■■□□□ 1.1
PACSIN3-209ENST00000532457 KRT37O76014 449 aa21.92■■□□□ 1.1
PACSIN3-209ENST00000532457 KRT38O76015 456 aa21.92■■□□□ 1.1
PACSIN3-209ENST00000532457 S1PR4O95977 384 aa21.92■■□□□ 1.1
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PACSIN3-209ENST00000532457 KRT4P19013 534 aa21.92■■□□□ 1.1
PACSIN3-209ENST00000532457 CA5AP35218 305 aa21.92■■□□□ 1.1
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PACSIN3-209ENST00000532457 TTC7BQ86TV6 843 aa21.92■■□□□ 1.1
PACSIN3-209ENST00000532457 CILP2Q8IUL8 1156 aa21.92■■□□□ 1.1
PACSIN3-209ENST00000532457 FAM96AQ9H5X1 160 aa21.92■■□□□ 1.1
PACSIN3-209ENST00000532457 LMAN1LQ9HAT1 526 aa21.92■■□□□ 1.1
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PACSIN3-209ENST00000532457 A0A1W2PQ67 120 aa21.92■■□□□ 1.1
PACSIN3-209ENST00000532457 GAPDHSO14556 408 aaPredicted RBP21.92■■□□□ 1.1
PACSIN3-209ENST00000532457 CD3EAPO15446 510 aaKnown RBP21.92■■□□□ 1.1
PACSIN3-209ENST00000532457 ALDOAP04075 364 aaKnown RBP21.92■■□□□ 1.1
PACSIN3-209ENST00000532457 PRNPP04156 253 aa21.92■■□□□ 1.1
PACSIN3-209ENST00000532457 CHRNB1P11230 501 aa21.92■■□□□ 1.1
PACSIN3-209ENST00000532457 BRAFP15056 766 aa21.92■■□□□ 1.1
PACSIN3-209ENST00000532457 PGGT1BP53609 377 aa21.92■■□□□ 1.1
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PACSIN3-209ENST00000532457 USP45Q70EL2 814 aa21.92■■□□□ 1.1
PACSIN3-209ENST00000532457 TRMT11Q7Z4G4 463 aaKnown RBP21.92■■□□□ 1.1
PACSIN3-209ENST00000532457 MMAAQ8IVH4 418 aaKnown RBP21.92■■□□□ 1.1
PACSIN3-209ENST00000532457 SPNS2Q8IVW8 549 aa21.92■■□□□ 1.1
PACSIN3-209ENST00000532457 ZNF687Q8N1G0 1237 aa21.92■■□□□ 1.1
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PACSIN3-209ENST00000532457 HCAR2Q8TDS4 363 aa21.92■■□□□ 1.1
PACSIN3-209ENST00000532457 FAM167BQ9BTA0 163 aa21.92■■□□□ 1.1
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PACSIN3-209ENST00000532457 ACTL7BQ9Y614 415 aa21.92■■□□□ 1.1
PACSIN3-209ENST00000532457 GPR39O43194 453 aa21.91■■□□□ 1.1
PACSIN3-209ENST00000532457 PYGBP11216 843 aa21.91■■□□□ 1.1
PACSIN3-209ENST00000532457 BPIP17213 487 aa21.91■■□□□ 1.1
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PACSIN3-209ENST00000532457 MRPS21P82921 87 aaKnown RBP21.91■■□□□ 1.1
PACSIN3-209ENST00000532457 PDE1BQ01064 536 aa21.91■■□□□ 1.1
PACSIN3-209ENST00000532457 LGSNQ5TDP6 509 aa21.91■■□□□ 1.1
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PACSIN3-209ENST00000532457 PIANPQ8IYJ0 282 aa21.91■■□□□ 1.1
PACSIN3-209ENST00000532457 DCLK2Q8N568 766 aa21.91■■□□□ 1.1
PACSIN3-209ENST00000532457 TXNDC16Q9P2K2 825 aa21.91■■□□□ 1.1
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