RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000530756.1

BRMS1-208, Transcript of BRMS1, transcriptional repressor and anoikis regulator, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene BRMS1, Length 963 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRMS1-208ENST00000530756 CTRCQ99895 268 aa14.6□□□□□ -0.07
BRMS1-208ENST00000530756 CINPQ9BW66 212 aaPredicted RBP14.6□□□□□ -0.07
BRMS1-208ENST00000530756 B3GNT4Q9C0J1 378 aa14.6□□□□□ -0.07
BRMS1-208ENST00000530756 DHX35Q9H5Z1 703 aaKnown RBP14.6□□□□□ -0.07
BRMS1-208ENST00000530756 ZNF71Q9NQZ8 489 aaPredicted RBP14.6□□□□□ -0.07
BRMS1-208ENST00000530756 PCSK1NQ9UHG2 260 aa14.6□□□□□ -0.07
BRMS1-208ENST00000530756 TRBV23OR9-2A0A075B6M9 112 aa14.59□□□□□ -0.07
BRMS1-208ENST00000530756 DFFAO00273 331 aa14.59□□□□□ -0.07
BRMS1-208ENST00000530756 EEF2KO00418 725 aaKnown RBP14.59□□□□□ -0.07
BRMS1-208ENST00000530756 HEXIM1O94992 359 aaKnown RBP14.59□□□□□ -0.07
BRMS1-208ENST00000530756 ERCC2P18074 760 aa14.59□□□□□ -0.07
BRMS1-208ENST00000530756 EEF1GP26641 437 aaKnown RBP14.59□□□□□ -0.07
BRMS1-208ENST00000530756 ADCY8P40145 1251 aa14.59□□□□□ -0.07
BRMS1-208ENST00000530756 FOXK1P85037 733 aa14.59□□□□□ -0.07
BRMS1-208ENST00000530756 CDK3Q00526 305 aa14.59□□□□□ -0.07
BRMS1-208ENST00000530756 TRAF2Q12933 501 aa14.59□□□□□ -0.07
BRMS1-208ENST00000530756 UBAP2LQ14157 1087 aaKnown RBP14.59□□□□□ -0.07
BRMS1-208ENST00000530756 SYCP1Q15431 976 aa14.59□□□□□ -0.07
BRMS1-208ENST00000530756 TMEM164Q5U3C3 297 aa14.59□□□□□ -0.07
BRMS1-208ENST00000530756 DOK6Q6PKX4 331 aa14.59□□□□□ -0.07
BRMS1-208ENST00000530756 Q6ZVL8 140 aa14.59□□□□□ -0.07
BRMS1-208ENST00000530756 TIPARPQ7Z3E1 657 aaKnown RBP14.59□□□□□ -0.07
BRMS1-208ENST00000530756 CACNA2D3Q8IZS8 1091 aa14.59□□□□□ -0.07
BRMS1-208ENST00000530756 DTD2Q96FN9 168 aa14.59□□□□□ -0.07
BRMS1-208ENST00000530756 SNRNP25Q9BV90 132 aaKnown RBP14.59□□□□□ -0.07
BRMS1-208ENST00000530756 ETNK2Q9NVF9 386 aa14.59□□□□□ -0.07
BRMS1-208ENST00000530756 TRNAU1APQ9NX07 287 aaKnown RBP14.59□□□□□ -0.07
BRMS1-208ENST00000530756 PILRAQ9UKJ1 303 aa14.59□□□□□ -0.07
BRMS1-208ENST00000530756 TMEM98Q9Y2Y6 226 aa14.59□□□□□ -0.07
BRMS1-208ENST00000530756 LOC101059948A0A1B0GTJ6 334 aa14.58□□□□□ -0.08
BRMS1-208ENST00000530756 NPIPB15A6NHN6 443 aaPredicted RBP14.58□□□□□ -0.08
BRMS1-208ENST00000530756 ARHGAP42A6NI28 874 aa14.58□□□□□ -0.08
BRMS1-208ENST00000530756 EFCAB7A8K855 629 aa14.58□□□□□ -0.08
BRMS1-208ENST00000530756 K7EM74 188 aa14.58□□□□□ -0.08
BRMS1-208ENST00000530756 HTRA2O43464 458 aaPredicted RBP14.58□□□□□ -0.08
BRMS1-208ENST00000530756 RAD1O60671 282 aa14.58□□□□□ -0.08
BRMS1-208ENST00000530756 CR2P20023 1033 aa14.58□□□□□ -0.08
BRMS1-208ENST00000530756 OAS2P29728 719 aaKnown RBP14.58□□□□□ -0.08
BRMS1-208ENST00000530756 NSUN2Q08J23 767 aaKnown RBP eCLIP14.58□□□□□ -0.08
BRMS1-208ENST00000530756 ILF3Q12906 894 aaKnown RBP eCLIP14.58□□□□□ -0.08
BRMS1-208ENST00000530756 IHHQ14623 411 aa14.58□□□□□ -0.08
BRMS1-208ENST00000530756 RFX8Q6ZV50 586 aa14.58□□□□□ -0.08
BRMS1-208ENST00000530756 MCOLN2Q8IZK6 566 aa14.58□□□□□ -0.08
BRMS1-208ENST00000530756 IL22RA1Q8N6P7 574 aa14.58□□□□□ -0.08
BRMS1-208ENST00000530756 OR4D9Q8NGE8 314 aa14.58□□□□□ -0.08
BRMS1-208ENST00000530756 PSKH2Q96QS6 385 aa14.58□□□□□ -0.08
BRMS1-208ENST00000530756 AGAP2Q99490 1192 aa14.58□□□□□ -0.08
BRMS1-208ENST00000530756 AGPAT1Q99943 283 aa14.58□□□□□ -0.08
BRMS1-208ENST00000530756 GSDMCQ9BYG8 508 aa14.58□□□□□ -0.08
BRMS1-208ENST00000530756 ADNPQ9H2P0 1102 aa14.58□□□□□ -0.08
BRMS1-208ENST00000530756 SP110Q9HB58 689 aa14.58□□□□□ -0.08
BRMS1-208ENST00000530756 NOD2Q9HC29 1040 aa14.58□□□□□ -0.08
BRMS1-208ENST00000530756 APMAPQ9HDC9 416 aa14.58□□□□□ -0.08
BRMS1-208ENST00000530756 SEPT11Q9NVA2 429 aaKnown RBP14.58□□□□□ -0.08
BRMS1-208ENST00000530756 SLC39A1Q9NY26 324 aa14.58□□□□□ -0.08
BRMS1-208ENST00000530756 CD84Q9UIB8 345 aa14.58□□□□□ -0.08
BRMS1-208ENST00000530756 SLC17A4Q9Y2C5 497 aa14.58□□□□□ -0.08
BRMS1-208ENST00000530756 PRKAR1AP10644 381 aa14.57□□□□□ -0.08
BRMS1-208ENST00000530756 TCF4P15884 667 aa14.57□□□□□ -0.08
BRMS1-208ENST00000530756 CTPS1P17812 591 aa14.57□□□□□ -0.08
BRMS1-208ENST00000530756 NR1D1P20393 614 aa14.57□□□□□ -0.08
BRMS1-208ENST00000530756 VIPR1P32241 457 aa14.57□□□□□ -0.08
BRMS1-208ENST00000530756 ATP1A2P50993 1020 aa14.57□□□□□ -0.08
BRMS1-208ENST00000530756 AIF1P55008 147 aa14.57□□□□□ -0.08
BRMS1-208ENST00000530756 IL10RBQ08334 325 aa14.57□□□□□ -0.08
BRMS1-208ENST00000530756 SQSTM1Q13501 440 aa14.57□□□□□ -0.08
BRMS1-208ENST00000530756 TSR1Q2NL82 804 aaKnown RBP14.57□□□□□ -0.08
BRMS1-208ENST00000530756 HIST2H2BCQ6DN03 193 aa14.57□□□□□ -0.08
BRMS1-208ENST00000530756 MARK2Q7KZI7 788 aaKnown RBP14.57□□□□□ -0.08
BRMS1-208ENST00000530756 FAM129CQ86XR2 697 aa14.57□□□□□ -0.08
BRMS1-208ENST00000530756 AGBL5Q8NDL9 886 aa14.57□□□□□ -0.08
BRMS1-208ENST00000530756 PDCD6IPQ8WUM4 868 aaKnown RBP14.57□□□□□ -0.08
BRMS1-208ENST00000530756 SCAMP4Q969E2 229 aa14.57□□□□□ -0.08
BRMS1-208ENST00000530756 RTP4Q96DX8 246 aa14.57□□□□□ -0.08
BRMS1-208ENST00000530756 SYT11Q9BT88 431 aa14.57□□□□□ -0.08
BRMS1-208ENST00000530756 DDA1Q9BW61 102 aa14.57□□□□□ -0.08
BRMS1-208ENST00000530756 CDH19Q9H159 772 aa14.57□□□□□ -0.08
BRMS1-208ENST00000530756 PHPT1Q9NRX4 125 aaPredicted RBP14.57□□□□□ -0.08
BRMS1-208ENST00000530756 CWC15Q9P013 229 aaKnown RBP14.57□□□□□ -0.08
BRMS1-208ENST00000530756 PLAAQ9Y263 795 aa14.57□□□□□ -0.08
BRMS1-208ENST00000530756 SPTAN1Q13813 2472 aaKnown RBP14.56□□□□□ -0.08
BRMS1-208ENST00000530756 A8MU76 341 aa14.56□□□□□ -0.08
BRMS1-208ENST00000530756 CPP00450 1065 aa14.56□□□□□ -0.08
BRMS1-208ENST00000530756 CASRP41180 1078 aa14.56□□□□□ -0.08
BRMS1-208ENST00000530756 ACTR1BP42025 376 aa14.56□□□□□ -0.08
BRMS1-208ENST00000530756 GPR3P46089 330 aa14.56□□□□□ -0.08
BRMS1-208ENST00000530756 ACTR1AP61163 376 aa14.56□□□□□ -0.08
BRMS1-208ENST00000530756 MAXP61244 160 aa14.56□□□□□ -0.08
BRMS1-208ENST00000530756 AP1S1P61966 158 aa14.56□□□□□ -0.08
BRMS1-208ENST00000530756 POLR2LP62875 67 aaKnown RBP14.56□□□□□ -0.08
BRMS1-208ENST00000530756 MAMLD1Q13495 774 aa14.56□□□□□ -0.08
BRMS1-208ENST00000530756 TRA2AQ13595 282 aaKnown RBP eCLIP14.56□□□□□ -0.08
BRMS1-208ENST00000530756 DPYSQ14117 519 aa14.56□□□□□ -0.08
BRMS1-208ENST00000530756 LBRQ14739 615 aaKnown RBP14.56□□□□□ -0.08
BRMS1-208ENST00000530756 PPP6R3Q5H9R7 873 aaPredicted RBP14.56□□□□□ -0.08
BRMS1-208ENST00000530756 SNAP47Q5SQN1 464 aa14.56□□□□□ -0.08
BRMS1-208ENST00000530756 RAET1GQ6H3X3 334 aa14.56□□□□□ -0.08
BRMS1-208ENST00000530756 DCUN1D2Q6PH85 259 aa14.56□□□□□ -0.08
BRMS1-208ENST00000530756 TECPR1Q7Z6L1 1165 aa14.56□□□□□ -0.08
BRMS1-208ENST00000530756 PAF1Q8N7H5 531 aa14.56□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 640.2 ms