RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000511185.5

SH3BP2-218, Transcript of SH3 domain binding protein 2, humanhuman

TSL 2

Gene SH3BP2, Length 1,071 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP2-218ENST00000511185 NFKB1P19838 968 aa18.68■□□□□ 0.58
SH3BP2-218ENST00000511185 CES1P23141 567 aa18.68■□□□□ 0.58
SH3BP2-218ENST00000511185 HTR1BP28222 390 aa18.68■□□□□ 0.58
SH3BP2-218ENST00000511185 TRIM23P36406 574 aa18.68■□□□□ 0.58
SH3BP2-218ENST00000511185 NR2C2P49116 596 aa18.68■□□□□ 0.58
SH3BP2-218ENST00000511185 STC1P52823 247 aa18.68■□□□□ 0.58
SH3BP2-218ENST00000511185 PTSQ03393 145 aa18.68■□□□□ 0.58
SH3BP2-218ENST00000511185 CDKN3Q16667 212 aa18.68■□□□□ 0.58
SH3BP2-218ENST00000511185 ST3GAL2Q16842 350 aa18.68■□□□□ 0.58
SH3BP2-218ENST00000511185 HES3Q5TGS1 186 aa18.68■□□□□ 0.58
SH3BP2-218ENST00000511185 RAET1GQ6H3X3 334 aa18.68■□□□□ 0.58
SH3BP2-218ENST00000511185 TRIM74Q86UV6 250 aa18.68■□□□□ 0.58
SH3BP2-218ENST00000511185 SFTPA2Q8IWL1 248 aa18.68■□□□□ 0.58
SH3BP2-218ENST00000511185 BTN2A2Q8WVV5 523 aa18.68■□□□□ 0.58
SH3BP2-218ENST00000511185 P3H4Q92791 437 aa18.68■□□□□ 0.58
SH3BP2-218ENST00000511185 SCAMP4Q969E2 229 aa18.68■□□□□ 0.58
SH3BP2-218ENST00000511185 TADA1Q96BN2 335 aa18.68■□□□□ 0.58
SH3BP2-218ENST00000511185 SUDS3Q9H7L9 328 aaPredicted RBP18.68■□□□□ 0.58
SH3BP2-218ENST00000511185 HAUS2Q9NVX0 235 aa18.68■□□□□ 0.58
SH3BP2-218ENST00000511185 UBP1Q9NZI7 540 aa18.68■□□□□ 0.58
SH3BP2-218ENST00000511185 SBDSQ9Y3A5 250 aaKnown RBP eCLIP18.68■□□□□ 0.58
SH3BP2-218ENST00000511185 CSNK1G3Q9Y6M4 447 aa18.68■□□□□ 0.58
SH3BP2-218ENST00000511185 C1orf232A0A0U1RR37 186 aa18.67■□□□□ 0.58
SH3BP2-218ENST00000511185 NEMP2A6NFY4 417 aa18.67■□□□□ 0.58
SH3BP2-218ENST00000511185 CACNB4O00305 520 aaPredicted RBP18.67■□□□□ 0.58
SH3BP2-218ENST00000511185 RASGRP1O95267 797 aa18.67■□□□□ 0.58
SH3BP2-218ENST00000511185 SLC4A1P02730 911 aa18.67■□□□□ 0.58
SH3BP2-218ENST00000511185 PROS1P07225 676 aa18.67■□□□□ 0.58
SH3BP2-218ENST00000511185 MYCLP1P12525 358 aaPredicted RBP18.67■□□□□ 0.58
SH3BP2-218ENST00000511185 CA4P22748 312 aa18.67■□□□□ 0.58
SH3BP2-218ENST00000511185 CDK3Q00526 305 aa18.67■□□□□ 0.58
SH3BP2-218ENST00000511185 INSM1Q01101 510 aaPredicted RBP18.67■□□□□ 0.58
SH3BP2-218ENST00000511185 NOMO1Q15155 1222 aa18.67■□□□□ 0.58
SH3BP2-218ENST00000511185 TEX44Q53QW1 395 aa18.67■□□□□ 0.58
SH3BP2-218ENST00000511185 ZCCHC8Q6NZY4 707 aaKnown RBP18.67■□□□□ 0.58
SH3BP2-218ENST00000511185 GUSBP11Q6P575 273 aa18.67■□□□□ 0.58
SH3BP2-218ENST00000511185 LYSMD3Q7Z3D4 306 aa18.67■□□□□ 0.58
SH3BP2-218ENST00000511185 SLC35F3Q8IY50 421 aa18.67■□□□□ 0.58
SH3BP2-218ENST00000511185 FAM181AQ8N9Y4 354 aa18.67■□□□□ 0.58
SH3BP2-218ENST00000511185 KYQ8NBH2 561 aa18.67■□□□□ 0.58
SH3BP2-218ENST00000511185 OR56A4Q8NGH8 313 aa18.67■□□□□ 0.58
SH3BP2-218ENST00000511185 CCL4L1Q8NHW4 92 aa18.67■□□□□ 0.58
SH3BP2-218ENST00000511185 KIAA1524Q8TCG1 905 aa18.67■□□□□ 0.58
SH3BP2-218ENST00000511185 EID2BQ96D98 161 aa18.67■□□□□ 0.58
SH3BP2-218ENST00000511185 TEKT5Q96M29 485 aa18.67■□□□□ 0.58
SH3BP2-218ENST00000511185 BOCQ9BWV1 1114 aa18.67■□□□□ 0.58
SH3BP2-218ENST00000511185 SLC25A51Q9H1U9 297 aa18.67■□□□□ 0.58
SH3BP2-218ENST00000511185 ABCG8Q9H221 673 aa18.67■□□□□ 0.58
SH3BP2-218ENST00000511185 GLOD4Q9HC38 313 aa18.67■□□□□ 0.58
SH3BP2-218ENST00000511185 SIRPGQ9P1W8 387 aa18.67■□□□□ 0.58
SH3BP2-218ENST00000511185 CACNA1BQ00975 2339 aa18.67■□□□□ 0.58
SH3BP2-218ENST00000511185 LMO7DNF2Z398 122 aa18.66■□□□□ 0.58
SH3BP2-218ENST00000511185 APOC4-APOC2K7ER74 178 aa18.66■□□□□ 0.58
SH3BP2-218ENST00000511185 YY2O15391 372 aa18.66■□□□□ 0.58
SH3BP2-218ENST00000511185 APOC2P02655 101 aa18.66■□□□□ 0.58
SH3BP2-218ENST00000511185 FUCA1P04066 466 aa18.66■□□□□ 0.58
SH3BP2-218ENST00000511185 PYGMP11217 842 aa18.66■□□□□ 0.58
SH3BP2-218ENST00000511185 ZNF30P17039 623 aa18.66■□□□□ 0.58
SH3BP2-218ENST00000511185 NFKBIAP25963 317 aa18.66■□□□□ 0.58
SH3BP2-218ENST00000511185 OTUD4Q01804 1114 aaKnown RBP18.66■□□□□ 0.58
SH3BP2-218ENST00000511185 HS1BP3Q53T59 392 aa18.66■□□□□ 0.58
SH3BP2-218ENST00000511185 C6orf132Q5T0Z8 1188 aa18.66■□□□□ 0.58
SH3BP2-218ENST00000511185 ZNF567Q8N184 647 aa18.66■□□□□ 0.58
SH3BP2-218ENST00000511185 ACTL9Q8TC94 416 aa18.66■□□□□ 0.58
SH3BP2-218ENST00000511185 ZCCHC14Q8WYQ9 949 aaKnown RBP18.66■□□□□ 0.58
SH3BP2-218ENST00000511185 TBATAQ96M53 351 aa18.66■□□□□ 0.58
SH3BP2-218ENST00000511185 WDR24Q96S15 920 aa18.66■□□□□ 0.58
SH3BP2-218ENST00000511185 LYSMD1Q96S90 227 aa18.66■□□□□ 0.58
SH3BP2-218ENST00000511185 GORASP1Q9BQQ3 440 aa18.66■□□□□ 0.58
SH3BP2-218ENST00000511185 DUSP23Q9BVJ7 150 aa18.66■□□□□ 0.58
SH3BP2-218ENST00000511185 TEX101Q9BY14 249 aa18.66■□□□□ 0.58
SH3BP2-218ENST00000511185 OSBPL8Q9BZF1 889 aa18.66■□□□□ 0.58
SH3BP2-218ENST00000511185 PRSS38A1L453 326 aa18.65■□□□□ 0.58
SH3BP2-218ENST00000511185 CCDC66A2RUB6 948 aa18.65■□□□□ 0.58
SH3BP2-218ENST00000511185 ANKRD66B4E2M5 251 aa18.65■□□□□ 0.58
SH3BP2-218ENST00000511185 DDX3YO15523 660 aaKnown RBP18.65■□□□□ 0.58
SH3BP2-218ENST00000511185 PMPCBO75439 489 aa18.65■□□□□ 0.58
SH3BP2-218ENST00000511185 PTPN7P35236 360 aa18.65■□□□□ 0.58
SH3BP2-218ENST00000511185 POLD2P49005 469 aa18.65■□□□□ 0.58
SH3BP2-218ENST00000511185 RWDD2BP57060 319 aa18.65■□□□□ 0.58
SH3BP2-218ENST00000511185 RPL26P61254 145 aaKnown RBP18.65■□□□□ 0.58
SH3BP2-218ENST00000511185 KIF5AQ12840 1032 aa18.65■□□□□ 0.58
SH3BP2-218ENST00000511185 CAMK2BQ13554 666 aa18.65■□□□□ 0.58
SH3BP2-218ENST00000511185 PERM1Q5SV97 790 aa18.65■□□□□ 0.58
SH3BP2-218ENST00000511185 DOK6Q6PKX4 331 aa18.65■□□□□ 0.58
SH3BP2-218ENST00000511185 GALNT15Q8N3T1 639 aa18.65■□□□□ 0.58
SH3BP2-218ENST00000511185 IFI44Q8TCB0 444 aa18.65■□□□□ 0.58
SH3BP2-218ENST00000511185 HTR3CQ8WXA8 447 aa18.65■□□□□ 0.58
SH3BP2-218ENST00000511185 AP2M1Q96CW1 435 aa18.65■□□□□ 0.58
SH3BP2-218ENST00000511185 OXNAD1Q96HP4 312 aaPredicted RBP18.65■□□□□ 0.58
SH3BP2-218ENST00000511185 RIOK2Q9BVS4 552 aaKnown RBP18.65■□□□□ 0.58
SH3BP2-218ENST00000511185 FRMD8Q9BZ67 464 aaPredicted RBP18.65■□□□□ 0.58
SH3BP2-218ENST00000511185 TMEM168Q9H0V1 697 aa18.65■□□□□ 0.58
SH3BP2-218ENST00000511185 CYP4F12Q9HCS2 524 aa18.65■□□□□ 0.58
SH3BP2-218ENST00000511185 KLHL8Q9P2G9 620 aaPredicted RBP18.65■□□□□ 0.58
SH3BP2-218ENST00000511185 MOSPD1Q9UJG1 213 aa18.65■□□□□ 0.58
SH3BP2-218ENST00000511185 RPL26L1Q9UNX3 145 aaKnown RBP18.65■□□□□ 0.58
SH3BP2-218ENST00000511185 SPO11Q9Y5K1 396 aa18.65■□□□□ 0.58
SH3BP2-218ENST00000511185 ADGRG1Q9Y653 693 aa18.65■□□□□ 0.58
SH3BP2-218ENST00000511185 DGKBQ9Y6T7 804 aa18.65■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 41.7 ms