RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000492723.1

TOM1-216, Transcript of target of myb1 membrane trafficking protein, humanhuman

TSL 2

Gene TOM1, Length 2,568 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOM1-216ENST00000492723 RPS27LQ71UM5 84 aaKnown RBP16.72■□□□□ 0.27
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TOM1-216ENST00000492723 PTERQ96BW5 349 aa16.72■□□□□ 0.27
TOM1-216ENST00000492723 SMG9Q9H0W8 520 aaKnown RBP16.72■□□□□ 0.27
TOM1-216ENST00000492723 CCDC68Q9H2F9 335 aa16.72■□□□□ 0.27
TOM1-216ENST00000492723 EPB41L3Q9Y2J2 1087 aaPredicted RBP16.72■□□□□ 0.27
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TOM1-216ENST00000492723 RHOBTB1O94844 696 aa16.71■□□□□ 0.27
TOM1-216ENST00000492723 JUNP05412 331 aaKnown RBP16.71■□□□□ 0.27
TOM1-216ENST00000492723 SERPINB5P36952 375 aa16.71■□□□□ 0.27
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TOM1-216ENST00000492723 SLC22A17Q8WUG5 538 aa16.71■□□□□ 0.27
TOM1-216ENST00000492723 LPGAT1Q92604 370 aa16.71■□□□□ 0.27
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TOM1-216ENST00000492723 CMTM5Q96DZ9 223 aa16.71■□□□□ 0.27
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TOM1-216ENST00000492723 LOC100653049A0A140TA62 436 aa16.71■□□□□ 0.26
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TOM1-216ENST00000492723 H0Y3Z8 333 aa16.7■□□□□ 0.26
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TOM1-216ENST00000492723 F8W8V4 182 aa16.7■□□□□ 0.26
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TOM1-216ENST00000492723 SCUBE1Q8IWY4 988 aa16.7■□□□□ 0.26
TOM1-216ENST00000492723 TTC30BQ8N4P2 665 aa16.7■□□□□ 0.26
TOM1-216ENST00000492723 WDR60Q8WVS4 1066 aa16.7■□□□□ 0.26
TOM1-216ENST00000492723 SLC46A2Q9BY10 475 aa16.7■□□□□ 0.26
TOM1-216ENST00000492723 EML4Q9HC35 981 aaKnown RBP16.7■□□□□ 0.26
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TOM1-216ENST00000492723 FGBP02675 491 aa16.69■□□□□ 0.26
TOM1-216ENST00000492723 AP1S1P61966 158 aa16.69■□□□□ 0.26
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TOM1-216ENST00000492723 PTPRNQ16849 979 aa16.69■□□□□ 0.26
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TOM1-216ENST00000492723 INSL6Q9Y581 213 aa16.69■□□□□ 0.26
TOM1-216ENST00000492723 HIDE1A8MVS5 230 aa16.69■□□□□ 0.26
TOM1-216ENST00000492723 FZD6O60353 706 aa16.69■□□□□ 0.26
TOM1-216ENST00000492723 SMIM24O75264 130 aa16.69■□□□□ 0.26
TOM1-216ENST00000492723 PRAMEF12O95522 483 aa16.69■□□□□ 0.26
TOM1-216ENST00000492723 ANP32DO95626 131 aa16.69■□□□□ 0.26
TOM1-216ENST00000492723 GLUD1P00367 558 aa16.69■□□□□ 0.26
TOM1-216ENST00000492723 IMPDH1P20839 514 aa16.69■□□□□ 0.26
TOM1-216ENST00000492723 SP100P23497 879 aaPredicted RBP16.69■□□□□ 0.26
TOM1-216ENST00000492723 CD70P32970 193 aa16.69■□□□□ 0.26
TOM1-216ENST00000492723 RAP1GDS1P52306 607 aa16.69■□□□□ 0.26
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