RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000488380.5

NISCH-212, Transcript of nischarin, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene NISCH, Length 3,168 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NISCH-212ENST00000488380 OR13F1Q8NGS4 319 aa13.49□□□□□ -0.25
NISCH-212ENST00000488380 NXNL1Q96CM4 212 aa13.49□□□□□ -0.25
NISCH-212ENST00000488380 ZNF560Q96MR9 790 aa13.49□□□□□ -0.25
NISCH-212ENST00000488380 NPY6RQ99463 290 aa13.49□□□□□ -0.25
NISCH-212ENST00000488380 SEPHS2Q99611 448 aa13.49□□□□□ -0.25
NISCH-212ENST00000488380 TDRD1Q9BXT4 1180 aaKnown RBP13.49□□□□□ -0.25
NISCH-212ENST00000488380 MROQ9BYG7 248 aa13.49□□□□□ -0.25
NISCH-212ENST00000488380 IL22Q9GZX6 179 aa13.49□□□□□ -0.25
NISCH-212ENST00000488380 ARMC1Q9NVT9 282 aa13.49□□□□□ -0.25
NISCH-212ENST00000488380 TRAF6Q9Y4K3 522 aa13.49□□□□□ -0.25
NISCH-212ENST00000488380 FAM47E-STBD1D6RA91 191 aa13.49□□□□□ -0.25
NISCH-212ENST00000488380 EEF2KO00418 725 aaKnown RBP13.49□□□□□ -0.25
NISCH-212ENST00000488380 ALBP02768 609 aa13.49□□□□□ -0.25
NISCH-212ENST00000488380 NPR3P17342 541 aa13.49□□□□□ -0.25
NISCH-212ENST00000488380 TSPAN8P19075 237 aa13.49□□□□□ -0.25
NISCH-212ENST00000488380 YWHAQP27348 245 aa13.49□□□□□ -0.25
NISCH-212ENST00000488380 ACADSBP45954 432 aa13.49□□□□□ -0.25
NISCH-212ENST00000488380 RPS9P46781 194 aaKnown RBP13.49□□□□□ -0.25
NISCH-212ENST00000488380 HK2P52789 917 aa13.49□□□□□ -0.25
NISCH-212ENST00000488380 MPP1Q00013 466 aa13.49□□□□□ -0.25
NISCH-212ENST00000488380 POLD3Q15054 466 aaPredicted RBP13.49□□□□□ -0.25
NISCH-212ENST00000488380 CCL14Q16627 93 aa13.49□□□□□ -0.25
NISCH-212ENST00000488380 CCNYL2Q5T2Q4 361 aa13.49□□□□□ -0.25
NISCH-212ENST00000488380 IQSEC1Q6DN90 963 aa13.49□□□□□ -0.25
NISCH-212ENST00000488380 NEPROQ6NW34 567 aa13.49□□□□□ -0.25
NISCH-212ENST00000488380 RNF19BQ6ZMZ0 732 aa13.49□□□□□ -0.25
NISCH-212ENST00000488380 SPNS2Q8IVW8 549 aa13.49□□□□□ -0.25
NISCH-212ENST00000488380 SPPL2BQ8TCT7 592 aa13.49□□□□□ -0.25
NISCH-212ENST00000488380 MUS81Q96NY9 551 aa13.49□□□□□ -0.25
NISCH-212ENST00000488380 HGH1Q9BTY7 390 aa13.49□□□□□ -0.25
NISCH-212ENST00000488380 ULBP1Q9BZM6 244 aa13.49□□□□□ -0.25
NISCH-212ENST00000488380 TRIM15Q9C019 465 aa13.49□□□□□ -0.25
NISCH-212ENST00000488380 CD320Q9NPF0 282 aa13.49□□□□□ -0.25
NISCH-212ENST00000488380 CRTAC1Q9NQ79 661 aa13.49□□□□□ -0.25
NISCH-212ENST00000488380 UBP1Q9NZI7 540 aa13.49□□□□□ -0.25
NISCH-212ENST00000488380 ACOT9Q9Y305 439 aa13.49□□□□□ -0.25
NISCH-212ENST00000488380 ANKRD12Q6UB98 2062 aa13.48□□□□□ -0.25
NISCH-212ENST00000488380 SMIM35A0A1B0GVV1 85 aa13.48□□□□□ -0.25
NISCH-212ENST00000488380 CCDC162PA2VCL2 907 aa13.48□□□□□ -0.25
NISCH-212ENST00000488380 NR5A2O00482 541 aa13.48□□□□□ -0.25
NISCH-212ENST00000488380 DAB1O75553 588 aa13.48□□□□□ -0.25
NISCH-212ENST00000488380 SBK3P0C264 359 aa13.48□□□□□ -0.25
NISCH-212ENST00000488380 HLCSP50747 726 aa13.48□□□□□ -0.25
NISCH-212ENST00000488380 PRKAA2P54646 552 aa13.48□□□□□ -0.25
NISCH-212ENST00000488380 STX1BP61266 288 aa13.48□□□□□ -0.25
NISCH-212ENST00000488380 LSM3P62310 102 aaKnown RBP13.48□□□□□ -0.25
NISCH-212ENST00000488380 ADAM17P78536 824 aa13.48□□□□□ -0.25
NISCH-212ENST00000488380 SQLEQ14534 574 aa13.48□□□□□ -0.25
NISCH-212ENST00000488380 TWF2Q6IBS0 349 aaKnown RBP13.48□□□□□ -0.25
NISCH-212ENST00000488380 CNSTQ6PJW8 725 aa13.48□□□□□ -0.25
NISCH-212ENST00000488380 LIMS2Q7Z4I7 341 aa13.48□□□□□ -0.25
NISCH-212ENST00000488380 TLK2Q86UE8 772 aa13.48□□□□□ -0.25
NISCH-212ENST00000488380 KIAA2013Q8IYS2 634 aa13.48□□□□□ -0.25
NISCH-212ENST00000488380 ZCCHC7Q8N3Z6 543 aaKnown RBP13.48□□□□□ -0.25
NISCH-212ENST00000488380 EDEM1Q92611 657 aa13.48□□□□□ -0.25
NISCH-212ENST00000488380 CCDC90BQ9GZT6 254 aa13.48□□□□□ -0.25
NISCH-212ENST00000488380 POMKQ9H5K3 350 aa13.48□□□□□ -0.25
NISCH-212ENST00000488380 NOL6Q9H6R4 1146 aaKnown RBP13.48□□□□□ -0.25
NISCH-212ENST00000488380 LRRC4Q9HBW1 653 aa13.48□□□□□ -0.25
NISCH-212ENST00000488380 FBRSL1Q9HCM7 1045 aaKnown RBP13.48□□□□□ -0.25
NISCH-212ENST00000488380 TMEM181Q9P2C4 612 aa13.48□□□□□ -0.25
NISCH-212ENST00000488380 TLL2Q9Y6L7 1015 aa13.48□□□□□ -0.25
NISCH-212ENST00000488380 MTHFD1P11586 935 aaKnown RBP13.48□□□□□ -0.25
NISCH-212ENST00000488380 ERCC2P18074 760 aa13.48□□□□□ -0.25
NISCH-212ENST00000488380 SPCS2Q15005 226 aa13.48□□□□□ -0.25
NISCH-212ENST00000488380 PAGE2BQ5JRK9 111 aa13.48□□□□□ -0.25
NISCH-212ENST00000488380 TMTC4Q5T4D3 741 aa13.48□□□□□ -0.25
NISCH-212ENST00000488380 BROXQ5VW32 411 aa13.48□□□□□ -0.25
NISCH-212ENST00000488380 PLEKHH3Q7Z736 793 aa13.48□□□□□ -0.25
NISCH-212ENST00000488380 HMGCLL1Q8TB92 370 aa13.48□□□□□ -0.25
NISCH-212ENST00000488380 NT5C3BQ969T7 300 aa13.48□□□□□ -0.25
NISCH-212ENST00000488380 TNIP3Q96KP6 325 aa13.48□□□□□ -0.25
NISCH-212ENST00000488380 CSF3RQ99062 836 aa13.48□□□□□ -0.25
NISCH-212ENST00000488380 PIF1Q9H611 641 aa13.48□□□□□ -0.25
NISCH-212ENST00000488380 AGPAT4Q9NRZ5 378 aa13.48□□□□□ -0.25
NISCH-212ENST00000488380 CPA4Q9UI42 421 aa13.48□□□□□ -0.25
NISCH-212ENST00000488380 TSC2P49815 1807 aa13.48□□□□□ -0.25
NISCH-212ENST00000488380 MYBPHLA2RUH7 354 aa13.48□□□□□ -0.25
NISCH-212ENST00000488380 DCLK1O15075 740 aa13.48□□□□□ -0.25
NISCH-212ENST00000488380 XYLBO75191 536 aa13.48□□□□□ -0.25
NISCH-212ENST00000488380 RSL1D1O76021 490 aaKnown RBP13.48□□□□□ -0.25
NISCH-212ENST00000488380 MYL3P08590 195 aa13.48□□□□□ -0.25
NISCH-212ENST00000488380 USP17L7P0C7H9 530 aa13.48□□□□□ -0.25
NISCH-212ENST00000488380 MBL2P11226 248 aaPredicted RBP13.48□□□□□ -0.25
NISCH-212ENST00000488380 KCNE1P15382 129 aa13.48□□□□□ -0.25
NISCH-212ENST00000488380 NOS2P35228 1153 aa13.48□□□□□ -0.25
NISCH-212ENST00000488380 MAGEA12P43365 314 aa13.48□□□□□ -0.25
NISCH-212ENST00000488380 C1QTNF8P60827 252 aa13.48□□□□□ -0.25
NISCH-212ENST00000488380 PIGFQ07326 219 aa13.48□□□□□ -0.25
NISCH-212ENST00000488380 MAPRE1Q15691 268 aaKnown RBP13.48□□□□□ -0.25
NISCH-212ENST00000488380 IMPG1Q17R60 797 aa13.48□□□□□ -0.25
NISCH-212ENST00000488380 SV2CQ496J9 727 aa13.48□□□□□ -0.25
NISCH-212ENST00000488380 CYBRD1Q53TN4 286 aa13.48□□□□□ -0.25
NISCH-212ENST00000488380 SLCO6A1Q86UG4 719 aa13.48□□□□□ -0.25
NISCH-212ENST00000488380 SGCDQ92629 289 aa13.48□□□□□ -0.25
NISCH-212ENST00000488380 LPPQ93052 612 aa13.48□□□□□ -0.25
NISCH-212ENST00000488380 PHF21BQ96EK2 531 aa13.48□□□□□ -0.25
NISCH-212ENST00000488380 CGREF1Q99674 301 aa13.48□□□□□ -0.25
NISCH-212ENST00000488380 PAAF1Q9BRP4 392 aa13.48□□□□□ -0.25
NISCH-212ENST00000488380 SEZ6LQ9BYH1 1024 aa13.48□□□□□ -0.25
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 19 ms