RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000485532.1

PRAME-212, Transcript of preferentially expressed antigen in melanoma, humanhuman

TSL 3

Gene PRAME, Length 709 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAME-212ENST00000485532 PSKH2Q96QS6 385 aa12.65□□□□□ -0.38
PRAME-212ENST00000485532 LACRTQ9GZZ8 138 aa12.65□□□□□ -0.38
PRAME-212ENST00000485532 ZWILCHQ9H900 591 aa12.65□□□□□ -0.38
PRAME-212ENST00000485532 NOD2Q9HC29 1040 aa12.65□□□□□ -0.38
PRAME-212ENST00000485532 SEPT3Q9UH03 358 aa12.65□□□□□ -0.38
PRAME-212ENST00000485532 RNF215Q9Y6U7 377 aa12.65□□□□□ -0.38
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PRAME-212ENST00000485532 CFAP69A5D8W1 941 aa12.64□□□□□ -0.39
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PRAME-212ENST00000485532 STAU2Q9NUL3 570 aaKnown RBP eCLIP12.64□□□□□ -0.39
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PRAME-212ENST00000485532 INTUQ9ULD6 942 aa12.64□□□□□ -0.39
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PRAME-212ENST00000485532 C14orf28Q4W4Y0 310 aa12.63□□□□□ -0.39
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PRAME-212ENST00000485532 CCDC81Q6ZN84 652 aa12.63□□□□□ -0.39
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PRAME-212ENST00000485532 NUS1Q96E22 293 aa12.63□□□□□ -0.39
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PRAME-212ENST00000485532 NUDCD1Q96RS6 583 aa12.63□□□□□ -0.39
PRAME-212ENST00000485532 THAP2Q9H0W7 228 aa12.63□□□□□ -0.39
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PRAME-212ENST00000485532 LUC7LQ9NQ29 371 aaKnown RBP12.63□□□□□ -0.39
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PRAME-212ENST00000485532 ST14Q9Y5Y6 855 aa12.63□□□□□ -0.39
PRAME-212ENST00000485532 SCINQ9Y6U3 715 aa12.63□□□□□ -0.39
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PRAME-212ENST00000485532 ZSCAN12O43309 604 aa12.62□□□□□ -0.39
PRAME-212ENST00000485532 B4GAT1O43505 415 aa12.62□□□□□ -0.39
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PRAME-212ENST00000485532 CYP1A2P05177 515 aa12.62□□□□□ -0.39
PRAME-212ENST00000485532 CEACAM5P06731 702 aa12.62□□□□□ -0.39
PRAME-212ENST00000485532 HOXC4P09017 264 aaPredicted RBP12.62□□□□□ -0.39
PRAME-212ENST00000485532 JMJD7P0C870 316 aa12.62□□□□□ -0.39
PRAME-212ENST00000485532 GOLGA6DP0CG33 693 aa12.62□□□□□ -0.39
PRAME-212ENST00000485532 CTPS1P17812 591 aa12.62□□□□□ -0.39
PRAME-212ENST00000485532 CCKBRP32239 447 aa12.62□□□□□ -0.39
PRAME-212ENST00000485532 PCK1P35558 622 aa12.62□□□□□ -0.39
PRAME-212ENST00000485532 ARL4AP40617 200 aa12.62□□□□□ -0.39
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