RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000481115.2

PKP4-211, Transcript of plakophilin 4, humanhuman

TSL 5

Gene PKP4, Length 884 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKP4-211ENST00000481115 ZNF556Q9HAH1 456 aa7.18□□□□□ -1.26
PKP4-211ENST00000481115 SACM1LQ9NTJ5 587 aa7.18□□□□□ -1.26
PKP4-211ENST00000481115 LUZP4Q9P127 313 aa7.18□□□□□ -1.26
PKP4-211ENST00000481115 MBD2Q9UBB5 411 aa7.18□□□□□ -1.26
PKP4-211ENST00000481115 MTRRQ9UBK8 725 aa7.18□□□□□ -1.26
PKP4-211ENST00000481115 ARPP21Q9UBL0 812 aaPredicted RBP7.18□□□□□ -1.26
PKP4-211ENST00000481115 DCDC2Q9UHG0 476 aa7.18□□□□□ -1.26
PKP4-211ENST00000481115 PGAP2Q9UHJ9 254 aa7.18□□□□□ -1.26
PKP4-211ENST00000481115 ATP6V1HQ9UI12 483 aa7.18□□□□□ -1.26
PKP4-211ENST00000481115 GLS2Q9UI32 602 aa7.18□□□□□ -1.26
PKP4-211ENST00000481115 NOCTQ9UK39 431 aaKnown RBP7.18□□□□□ -1.26
PKP4-211ENST00000481115 ZBTB21Q9ULJ3 1066 aa7.18□□□□□ -1.26
PKP4-211ENST00000481115 PCDHGB4Q9UN71 923 aa7.18□□□□□ -1.26
PKP4-211ENST00000481115 RBMX2Q9Y388 322 aaKnown RBP7.18□□□□□ -1.26
PKP4-211ENST00000481115 NAALAD2Q9Y3Q0 740 aa7.18□□□□□ -1.26
PKP4-211ENST00000481115 PCDHGB5Q9Y5G0 923 aa7.18□□□□□ -1.26
PKP4-211ENST00000481115 HEMK1Q9Y5R4 338 aaPredicted RBP7.18□□□□□ -1.26
PKP4-211ENST00000481115 AUP1Q9Y679 476 aa7.18□□□□□ -1.26
PKP4-211ENST00000481115 CNTNAP1P78357 1384 aa7.18□□□□□ -1.26
PKP4-211ENST00000481115 TRPM7Q96QT4 1865 aa7.17□□□□□ -1.26
PKP4-211ENST00000481115 PRR23AA6NEV1 266 aa7.17□□□□□ -1.26
PKP4-211ENST00000481115 GOLGA8JA6NMD2 632 aa7.17□□□□□ -1.26
PKP4-211ENST00000481115 ZNF487B1APH4 448 aa7.17□□□□□ -1.26
PKP4-211ENST00000481115 E5RJQ4 531 aa7.17□□□□□ -1.26
PKP4-211ENST00000481115 H7C0C1 242 aa7.17□□□□□ -1.26
PKP4-211ENST00000481115 EEF2KO00418 725 aaKnown RBP7.17□□□□□ -1.26
PKP4-211ENST00000481115 NOP56O00567 594 aaKnown RBP7.17□□□□□ -1.26
PKP4-211ENST00000481115 ZNF195O14628 629 aa7.17□□□□□ -1.26
PKP4-211ENST00000481115 RAD51BO15315 384 aa7.17□□□□□ -1.26
PKP4-211ENST00000481115 ARHGEF9O43307 516 aa7.17□□□□□ -1.26
PKP4-211ENST00000481115 EIF4EBP3O60516 100 aaPredicted RBP7.17□□□□□ -1.26
PKP4-211ENST00000481115 GAS7O60861 476 aa7.17□□□□□ -1.26
PKP4-211ENST00000481115 AVILO75366 819 aa7.17□□□□□ -1.26
PKP4-211ENST00000481115 RNASEH2AO75792 299 aaKnown RBP7.17□□□□□ -1.26
PKP4-211ENST00000481115 SLITRK5O94991 958 aa7.17□□□□□ -1.26
PKP4-211ENST00000481115 GABARAPO95166 117 aa7.17□□□□□ -1.26
PKP4-211ENST00000481115 NADKO95544 446 aaPredicted RBP7.17□□□□□ -1.26
PKP4-211ENST00000481115 PRLP01236 227 aa7.17□□□□□ -1.26
PKP4-211ENST00000481115 TP53P04637 393 aaPredicted RBP7.17□□□□□ -1.26
PKP4-211ENST00000481115 PLA2G4BP0C869 781 aa7.17□□□□□ -1.26
PKP4-211ENST00000481115 UMPSP11172 480 aa7.17□□□□□ -1.26
PKP4-211ENST00000481115 KRT10P13645 584 aa7.17□□□□□ -1.26
PKP4-211ENST00000481115 CD247P20963 164 aa7.17□□□□□ -1.26
PKP4-211ENST00000481115 PIK3R1P27986 724 aa7.17□□□□□ -1.26
PKP4-211ENST00000481115 EPHA3P29320 983 aa7.17□□□□□ -1.26
PKP4-211ENST00000481115 TRIM23P36406 574 aa7.17□□□□□ -1.26
PKP4-211ENST00000481115 GMPRP36959 345 aa7.17□□□□□ -1.26
PKP4-211ENST00000481115 CAPGP40121 348 aa7.17□□□□□ -1.26
PKP4-211ENST00000481115 SLC1A6P48664 564 aa7.17□□□□□ -1.26
PKP4-211ENST00000481115 ARSEP51690 589 aa7.17□□□□□ -1.26
PKP4-211ENST00000481115 NDST1P52848 882 aa7.17□□□□□ -1.26
PKP4-211ENST00000481115 EIF3EP60228 445 aaKnown RBP7.17□□□□□ -1.26
PKP4-211ENST00000481115 PRKCEQ02156 737 aa7.17□□□□□ -1.26
PKP4-211ENST00000481115 RUNX1T1Q06455 604 aa7.17□□□□□ -1.26
PKP4-211ENST00000481115 PPP3CAQ08209 521 aa7.17□□□□□ -1.26
PKP4-211ENST00000481115 CD300CQ08708 224 aa7.17□□□□□ -1.26
PKP4-211ENST00000481115 SCRN3Q0VDG4 424 aa7.17□□□□□ -1.26
PKP4-211ENST00000481115 STX5Q13190 355 aa7.17□□□□□ -1.26
PKP4-211ENST00000481115 SEMA3BQ13214 749 aa7.17□□□□□ -1.26
PKP4-211ENST00000481115 UBAP2LQ14157 1087 aaKnown RBP7.17□□□□□ -1.26
PKP4-211ENST00000481115 GK3PQ14409 553 aa7.17□□□□□ -1.26
PKP4-211ENST00000481115 GRM3Q14832 879 aa7.17□□□□□ -1.26
PKP4-211ENST00000481115 ACAP2Q15057 778 aa7.17□□□□□ -1.26
PKP4-211ENST00000481115 ACOX1Q15067 660 aa7.17□□□□□ -1.26
PKP4-211ENST00000481115 PDK2Q15119 407 aa7.17□□□□□ -1.26
PKP4-211ENST00000481115 ZFP69Q49AA0 526 aa7.17□□□□□ -1.26
PKP4-211ENST00000481115 ALFQ53S48 1182 aa7.17□□□□□ -1.26
PKP4-211ENST00000481115 BRMS1LQ5PSV4 323 aa7.17□□□□□ -1.26
PKP4-211ENST00000481115 TMEM240Q5SV17 173 aa7.17□□□□□ -1.26
PKP4-211ENST00000481115 DDX59Q5T1V6 619 aaKnown RBP eCLIP7.17□□□□□ -1.26
PKP4-211ENST00000481115 GPR158Q5T848 1215 aa7.17□□□□□ -1.26
PKP4-211ENST00000481115 MROH9Q5TGP6 573 aa7.17□□□□□ -1.26
PKP4-211ENST00000481115 FKBP1CQ5VVH2 108 aa7.17□□□□□ -1.26
PKP4-211ENST00000481115 RSBN1Q5VWQ0 802 aaPredicted RBP7.17□□□□□ -1.26
PKP4-211ENST00000481115 CDC42EP5Q6NZY7 148 aa7.17□□□□□ -1.26
PKP4-211ENST00000481115 PAOXQ6QHF9 649 aa7.17□□□□□ -1.26
PKP4-211ENST00000481115 CCBE1Q6UXH8 406 aaPredicted RBP7.17□□□□□ -1.26
PKP4-211ENST00000481115 DENND5BQ6ZUT9 1274 aa7.17□□□□□ -1.26
PKP4-211ENST00000481115 CREB3L2Q70SY1 520 aa7.17□□□□□ -1.26
PKP4-211ENST00000481115 SLC22A16Q86VW1 577 aa7.17□□□□□ -1.26
PKP4-211ENST00000481115 RALGPS2Q86X27 583 aaPredicted RBP7.17□□□□□ -1.26
PKP4-211ENST00000481115 TMEM192Q8IY95 271 aa7.17□□□□□ -1.26
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PKP4-211ENST00000481115 DSELQ8IZU8 1212 aa7.17□□□□□ -1.26
PKP4-211ENST00000481115 SCML4Q8N228 414 aa7.17□□□□□ -1.26
PKP4-211ENST00000481115 ZNF786Q8N393 782 aa7.17□□□□□ -1.26
PKP4-211ENST00000481115 TCAIMQ8N3R3 496 aa7.17□□□□□ -1.26
PKP4-211ENST00000481115 DHRSXQ8N5I4 330 aa7.17□□□□□ -1.26
PKP4-211ENST00000481115 BVESQ8NE79 360 aa7.17□□□□□ -1.26
PKP4-211ENST00000481115 SHCBP1Q8NEM2 672 aa7.17□□□□□ -1.26
PKP4-211ENST00000481115 BHLHE22Q8NFJ8 381 aaPredicted RBP7.17□□□□□ -1.26
PKP4-211ENST00000481115 CMASQ8NFW8 434 aaPredicted RBP7.17□□□□□ -1.26
PKP4-211ENST00000481115 LMO3Q8TAP4 145 aa7.17□□□□□ -1.26
PKP4-211ENST00000481115 ENKURQ8TC29 256 aa7.17□□□□□ -1.26
PKP4-211ENST00000481115 HDAC2Q92769 488 aaKnown RBP7.17□□□□□ -1.26
PKP4-211ENST00000481115 FKBP10Q96AY3 582 aa7.17□□□□□ -1.26
PKP4-211ENST00000481115 ELMO3Q96BJ8 720 aa7.17□□□□□ -1.26
PKP4-211ENST00000481115 CCDC124Q96CT7 223 aaKnown RBP7.17□□□□□ -1.26
PKP4-211ENST00000481115 TMEM80Q96HE8 168 aa7.17□□□□□ -1.26
PKP4-211ENST00000481115 ZNF512Q96ME7 567 aaPredicted RBP7.17□□□□□ -1.26
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