RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000478087.5

HPS1-211, Transcript of HPS1, biogenesis of lysosomal organelles complex 3 subunit 1, humanhuman

TSL 5

Gene HPS1, Length 971 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HPS1-211ENST00000478087 SCAMP4Q969E2 229 aa13.01□□□□□ -0.33
HPS1-211ENST00000478087 RNF25Q96BH1 459 aaPredicted RBP13.01□□□□□ -0.33
HPS1-211ENST00000478087 DTD2Q96FN9 168 aa13.01□□□□□ -0.33
HPS1-211ENST00000478087 NAF1Q96HR8 494 aaKnown RBP13.01□□□□□ -0.33
HPS1-211ENST00000478087 TSGA13Q96PP4 275 aa13.01□□□□□ -0.33
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HPS1-211ENST00000478087 MCCC1Q96RQ3 725 aaPredicted RBP13.01□□□□□ -0.33
HPS1-211ENST00000478087 RBM15Q96T37 977 aaKnown RBP eCLIP13.01□□□□□ -0.33
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HPS1-211ENST00000478087 PLEKHM1Q9Y4G2 1056 aa13.01□□□□□ -0.33
HPS1-211ENST00000478087 HEY1Q9Y5J3 304 aa13.01□□□□□ -0.33
HPS1-211ENST00000478087 ENTPD2Q9Y5L3 495 aa13.01□□□□□ -0.33
HPS1-211ENST00000478087 ST14Q9Y5Y6 855 aa13.01□□□□□ -0.33
HPS1-211ENST00000478087 DGKBQ9Y6T7 804 aa13.01□□□□□ -0.33
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HPS1-211ENST00000478087 NRROSQ86YC3 692 aa13□□□□□ -0.33
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HPS1-211ENST00000478087 SPATS2LQ9NUQ6 558 aaKnown RBP13□□□□□ -0.33
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HPS1-211ENST00000478087 C3orf38Q5JPI3 329 aa12.99□□□□□ -0.33
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HPS1-211ENST00000478087 B4DGG1 531 aa12.98□□□□□ -0.33
HPS1-211ENST00000478087 NTN3O00634 580 aaPredicted RBP12.98□□□□□ -0.33
HPS1-211ENST00000478087 TNFRSF10CO14798 259 aa12.98□□□□□ -0.33
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HPS1-211ENST00000478087 MYCLP1P12525 358 aaPredicted RBP12.98□□□□□ -0.33
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HPS1-211ENST00000478087 CD86P42081 329 aa12.98□□□□□ -0.33
HPS1-211ENST00000478087 NOP2P46087 812 aaKnown RBP12.98□□□□□ -0.33
HPS1-211ENST00000478087 GNPDA1P46926 289 aa12.98□□□□□ -0.33
HPS1-211ENST00000478087 DYNLT1P63172 113 aa12.98□□□□□ -0.33
HPS1-211ENST00000478087 SKOR1P84550 965 aa12.98□□□□□ -0.33
HPS1-211ENST00000478087 CDK3Q00526 305 aa12.98□□□□□ -0.33
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