RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000470089.5

FBXO18-208, Transcript of F-box DNA helicase 1, humanhuman

TSL 5

Gene FBXO18, Length 979 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FBXO18-208ENST00000470089 PACSIN2Q9UNF0 486 aaPredicted RBP29.26■■■□□ 2.27
FBXO18-208ENST00000470089 MAP1BP46821 2468 aaKnown RBP29.26■■■□□ 2.27
FBXO18-208ENST00000470089 LY6G6EA0A0G2JKS1 128 aa29.25■■■□□ 2.27
FBXO18-208ENST00000470089 FTCDO95954 541 aa29.25■■■□□ 2.27
FBXO18-208ENST00000470089 MT-CYBP00156 380 aaPredicted RBP29.25■■■□□ 2.27
FBXO18-208ENST00000470089 ZNF30P17039 623 aa29.25■■■□□ 2.27
FBXO18-208ENST00000470089 STC1P52823 247 aa29.25■■■□□ 2.27
FBXO18-208ENST00000470089 SMAD1Q15797 465 aaKnown RBP29.25■■■□□ 2.27
FBXO18-208ENST00000470089 RAET1GQ6H3X3 334 aa29.25■■■□□ 2.27
FBXO18-208ENST00000470089 ZCCHC8Q6NZY4 707 aaKnown RBP29.25■■■□□ 2.27
FBXO18-208ENST00000470089 CCNI2Q6ZMN8 369 aaPredicted RBP29.25■■■□□ 2.27
FBXO18-208ENST00000470089 PEX26Q7Z412 305 aa29.25■■■□□ 2.27
FBXO18-208ENST00000470089 OR56A4Q8NGH8 313 aa29.25■■■□□ 2.27
FBXO18-208ENST00000470089 TBATAQ96M53 351 aa29.25■■■□□ 2.27
FBXO18-208ENST00000470089 QKIQ96PU8 341 aaKnown RBP eCLIP29.25■■■□□ 2.275e-7■■■□□ 16.4
FBXO18-208ENST00000470089 MLPHQ9BV36 600 aaPredicted RBP29.25■■■□□ 2.27
FBXO18-208ENST00000470089 ABCG8Q9H221 673 aa29.25■■■□□ 2.27
FBXO18-208ENST00000470089 C10orf88Q9H8K7 445 aa29.25■■■□□ 2.27
FBXO18-208ENST00000470089 UBP1Q9NZI7 540 aa29.25■■■□□ 2.27
FBXO18-208ENST00000470089 MOSPD1Q9UJG1 213 aa29.25■■■□□ 2.27
FBXO18-208ENST00000470089 U3KQA8 63 aa29.25■■■□□ 2.27
FBXO18-208ENST00000470089 ANKRD66B4E2M5 251 aa29.24■■■□□ 2.27
FBXO18-208ENST00000470089 F5H423 210 aaPredicted RBP29.24■■■□□ 2.27
FBXO18-208ENST00000470089 APOC4-APOC2K7ER74 178 aa29.24■■■□□ 2.27
FBXO18-208ENST00000470089 TNFP01375 233 aa29.24■■■□□ 2.27
FBXO18-208ENST00000470089 APOC2P02655 101 aa29.24■■■□□ 2.27
FBXO18-208ENST00000470089 ANXA6P08133 673 aa29.24■■■□□ 2.27
FBXO18-208ENST00000470089 HOXC4P09017 264 aaPredicted RBP29.24■■■□□ 2.27
FBXO18-208ENST00000470089 CKMT1AP12532 417 aa29.24■■■□□ 2.27
FBXO18-208ENST00000470089 CD68P34810 354 aaPredicted RBP29.24■■■□□ 2.27
FBXO18-208ENST00000470089 GALNT15Q8N3T1 639 aa29.24■■■□□ 2.27
FBXO18-208ENST00000470089 FAM181AQ8N9Y4 354 aa29.24■■■□□ 2.27
FBXO18-208ENST00000470089 SCAMP4Q969E2 229 aa29.24■■■□□ 2.27
FBXO18-208ENST00000470089 TRIB3Q96RU7 358 aa29.24■■■□□ 2.27
FBXO18-208ENST00000470089 ADGRE3Q9BY15 652 aa29.24■■■□□ 2.27
FBXO18-208ENST00000470089 PHPT1Q9NRX4 125 aaPredicted RBP29.24■■■□□ 2.27
FBXO18-208ENST00000470089 KLHL8Q9P2G9 620 aaPredicted RBP29.24■■■□□ 2.27
FBXO18-208ENST00000470089 DNPEPQ9ULA0 475 aa29.24■■■□□ 2.27
FBXO18-208ENST00000470089 C1orf232A0A0U1RR37 186 aa29.23■■■□□ 2.27
FBXO18-208ENST00000470089 LMO7DNF2Z398 122 aa29.23■■■□□ 2.27
FBXO18-208ENST00000470089 H7C0C1 242 aa29.23■■■□□ 2.27
FBXO18-208ENST00000470089 TPP1O14773 563 aa29.23■■■□□ 2.27
FBXO18-208ENST00000470089 YY2O15391 372 aa29.23■■■□□ 2.27
FBXO18-208ENST00000470089 PYGMP11217 842 aa29.23■■■□□ 2.27
FBXO18-208ENST00000470089 MYCLP1P12525 358 aaPredicted RBP29.23■■■□□ 2.27
FBXO18-208ENST00000470089 NFKB1P19838 968 aa29.23■■■□□ 2.27
FBXO18-208ENST00000470089 KELP23276 732 aa29.23■■■□□ 2.27
FBXO18-208ENST00000470089 ATP5OP48047 213 aa29.23■■■□□ 2.27
FBXO18-208ENST00000470089 ILKQ13418 452 aa29.23■■■□□ 2.27
FBXO18-208ENST00000470089 NOMO1Q15155 1222 aa29.23■■■□□ 2.27
FBXO18-208ENST00000470089 SYCE1Q8N0S2 351 aa29.23■■■□□ 2.27
FBXO18-208ENST00000470089 HTR3CQ8WXA8 447 aa29.23■■■□□ 2.27
FBXO18-208ENST00000470089 TADA1Q96BN2 335 aa29.23■■■□□ 2.27
FBXO18-208ENST00000470089 AP2M1Q96CW1 435 aa29.23■■■□□ 2.27
FBXO18-208ENST00000470089 LYSMD1Q96S90 227 aa29.23■■■□□ 2.27
FBXO18-208ENST00000470089 FAM118BQ9BPY3 351 aa29.23■■■□□ 2.27
FBXO18-208ENST00000470089 SUDS3Q9H7L9 328 aaPredicted RBP29.23■■■□□ 2.27
FBXO18-208ENST00000470089 DOLKQ9UPQ8 538 aa29.23■■■□□ 2.27
FBXO18-208ENST00000470089 ADGRG1Q9Y653 693 aa29.23■■■□□ 2.27
FBXO18-208ENST00000470089 CAPN6Q9Y6Q1 641 aa29.23■■■□□ 2.27
FBXO18-208ENST00000470089 MYLKQ15746 1914 aa29.22■■■□□ 2.27
FBXO18-208ENST00000470089 HACD1B0YJ81 288 aa29.22■■■□□ 2.27
FBXO18-208ENST00000470089 MTSS1O43312 755 aa29.22■■■□□ 2.27
FBXO18-208ENST00000470089 PMPCBO75439 489 aa29.22■■■□□ 2.27
FBXO18-208ENST00000470089 PIRTP0C851 137 aa29.22■■■□□ 2.27
FBXO18-208ENST00000470089 GPR1P46091 355 aa29.22■■■□□ 2.27
FBXO18-208ENST00000470089 CDK3Q00526 305 aa29.22■■■□□ 2.27
FBXO18-208ENST00000470089 OTUD4Q01804 1114 aaKnown RBP29.22■■■□□ 2.27
FBXO18-208ENST00000470089 ELOCQ15369 112 aa29.22■■■□□ 2.27
FBXO18-208ENST00000470089 ZNF567Q8N184 647 aa29.22■■■□□ 2.27
FBXO18-208ENST00000470089 FSTL5Q8N475 847 aaPredicted RBP29.22■■■□□ 2.27
FBXO18-208ENST00000470089 ACTL9Q8TC94 416 aa29.22■■■□□ 2.27
FBXO18-208ENST00000470089 TEX101Q9BY14 249 aa29.22■■■□□ 2.27
FBXO18-208ENST00000470089 CYP4F12Q9HCS2 524 aa29.22■■■□□ 2.27
FBXO18-208ENST00000470089 EFR3BQ9Y2G0 817 aa29.22■■■□□ 2.27
FBXO18-208ENST00000470089 DGKBQ9Y6T7 804 aa29.22■■■□□ 2.27
FBXO18-208ENST00000470089 PTPN7P35236 360 aa29.21■■■□□ 2.27
FBXO18-208ENST00000470089 CETN2P41208 172 aa29.21■■■□□ 2.27
FBXO18-208ENST00000470089 CDK18Q07002 472 aa29.21■■■□□ 2.27
FBXO18-208ENST00000470089 DPTQ07507 201 aa29.21■■■□□ 2.27
FBXO18-208ENST00000470089 CDKN3Q16667 212 aa29.21■■■□□ 2.27
FBXO18-208ENST00000470089 HES3Q5TGS1 186 aa29.21■■■□□ 2.27
FBXO18-208ENST00000470089 PID1Q7Z2X4 250 aa29.21■■■□□ 2.27
FBXO18-208ENST00000470089 AGAP2Q99490 1192 aa29.21■■■□□ 2.27
FBXO18-208ENST00000470089 PDE2AO00408 941 aaPredicted RBP29.2■■■□□ 2.26
FBXO18-208ENST00000470089 SOD1P00441 154 aa29.2■■■□□ 2.26
FBXO18-208ENST00000470089 PROS1P07225 676 aa29.2■■■□□ 2.26
FBXO18-208ENST00000470089 CDK4P11802 303 aa29.2■■■□□ 2.26
FBXO18-208ENST00000470089 RBL1P28749 1068 aa29.2■■■□□ 2.26
FBXO18-208ENST00000470089 DUSP3P51452 185 aaPredicted RBP29.2■■■□□ 2.26
FBXO18-208ENST00000470089 XRCC4Q13426 336 aa29.2■■■□□ 2.26
FBXO18-208ENST00000470089 C6orf132Q5T0Z8 1188 aa29.2■■■□□ 2.26
FBXO18-208ENST00000470089 LYSMD3Q7Z3D4 306 aa29.2■■■□□ 2.26
FBXO18-208ENST00000470089 TMPRSS12Q86WS5 348 aa29.2■■■□□ 2.26
FBXO18-208ENST00000470089 UBL4BQ8N7F7 174 aa29.2■■■□□ 2.26
FBXO18-208ENST00000470089 RIOK2Q9BVS4 552 aaKnown RBP29.2■■■□□ 2.26
FBXO18-208ENST00000470089 BOCQ9BWV1 1114 aa29.2■■■□□ 2.26
FBXO18-208ENST00000470089 PRSS38A1L453 326 aa29.19■■■□□ 2.26
FBXO18-208ENST00000470089 CPED1A4D0V7 1026 aa29.19■■■□□ 2.26
FBXO18-208ENST00000470089 TNFRSF10CO14798 259 aa29.19■■■□□ 2.26
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 17.1 ms