RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000447232.6

PMS1-215, Transcript of PMS1 homolog 1, mismatch repair system component, humanhuman

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Gene PMS1, Length 2,576 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PMS1-215ENST00000447232 FAM213AQ9BRX8 229 aa3.3□□□□□ -1.88
PMS1-215ENST00000447232 MED10Q9BTT4 135 aa3.3□□□□□ -1.88
PMS1-215ENST00000447232 PDE11AQ9HCR9 933 aa3.3□□□□□ -1.88
PMS1-215ENST00000447232 APMAPQ9HDC9 416 aa3.3□□□□□ -1.88
PMS1-215ENST00000447232 ACSS2Q9NR19 701 aa3.3□□□□□ -1.88
PMS1-215ENST00000447232 AGPAT4Q9NRZ5 378 aa3.3□□□□□ -1.88
PMS1-215ENST00000447232 RBAKQ9NYW8 714 aaPredicted RBP3.3□□□□□ -1.88
PMS1-215ENST00000447232 STRIP2Q9ULQ0 834 aa3.3□□□□□ -1.88
PMS1-215ENST00000447232 TLN2Q9Y4G6 2542 aa3.3□□□□□ -1.88
PMS1-215ENST00000447232 NPHP3-ACAD11A0A0J9YXS1 232 aa3.29□□□□□ -1.88
PMS1-215ENST00000447232 SSU72P8A0A1W2PR75 194 aa3.29□□□□□ -1.88
PMS1-215ENST00000447232 PP2D1A8MPX8 630 aa3.29□□□□□ -1.88
PMS1-215ENST00000447232 IRAK2O43187 625 aa3.29□□□□□ -1.88
PMS1-215ENST00000447232 PCDH8O95206 1070 aa3.29□□□□□ -1.88
PMS1-215ENST00000447232 KIF20AO95235 890 aa3.29□□□□□ -1.88
PMS1-215ENST00000447232 INHBBP09529 407 aa3.29□□□□□ -1.88
PMS1-215ENST00000447232 CCDC130P13994 396 aa3.29□□□□□ -1.88
PMS1-215ENST00000447232 XBP1P17861 261 aa3.29□□□□□ -1.88
PMS1-215ENST00000447232 TRHRP34981 398 aaPredicted RBP3.29□□□□□ -1.88
PMS1-215ENST00000447232 NOP2P46087 812 aaKnown RBP3.29□□□□□ -1.88
PMS1-215ENST00000447232 MEOX1P50221 254 aa3.29□□□□□ -1.88
PMS1-215ENST00000447232 NDST1P52848 882 aa3.29□□□□□ -1.88
PMS1-215ENST00000447232 SLC12A3P55017 1021 aa3.29□□□□□ -1.88
PMS1-215ENST00000447232 CCDC15Q0P6D6 951 aa3.29□□□□□ -1.88
PMS1-215ENST00000447232 ALG11Q2TAA5 492 aa3.29□□□□□ -1.88
PMS1-215ENST00000447232 AMZ1Q400G9 498 aa3.29□□□□□ -1.88
PMS1-215ENST00000447232 RFWD3Q6PCD5 774 aa3.29□□□□□ -1.88
PMS1-215ENST00000447232 IGFL3Q6UXB1 125 aa3.29□□□□□ -1.88
PMS1-215ENST00000447232 RPTNQ6XPR3 784 aa3.29□□□□□ -1.88
PMS1-215ENST00000447232 SLC47A2Q86VL8 602 aa3.29□□□□□ -1.88
PMS1-215ENST00000447232 TSPYL5Q86VY4 417 aaPredicted RBP3.29□□□□□ -1.88
PMS1-215ENST00000447232 ZSCAN30Q86W11 494 aa3.29□□□□□ -1.88
PMS1-215ENST00000447232 APCDD1Q8J025 514 aa3.29□□□□□ -1.88
PMS1-215ENST00000447232 SLC2A14Q8TDB8 520 aa3.29□□□□□ -1.88
PMS1-215ENST00000447232 POMGNT1Q8WZA1 660 aa3.29□□□□□ -1.88
PMS1-215ENST00000447232 SEC14L1Q92503 715 aa3.29□□□□□ -1.88
PMS1-215ENST00000447232 MYEOVQ96EZ4 313 aa3.29□□□□□ -1.88
PMS1-215ENST00000447232 RBM15Q96T37 977 aaKnown RBP eCLIP3.29□□□□□ -1.88
PMS1-215ENST00000447232 TMEM121Q9BTD3 319 aa3.29□□□□□ -1.88
PMS1-215ENST00000447232 MMTAG2Q9BU76 263 aaKnown RBP3.29□□□□□ -1.88
PMS1-215ENST00000447232 HDAC8Q9BY41 377 aa3.29□□□□□ -1.88
PMS1-215ENST00000447232 ST6GALNAC4Q9H4F1 302 aa3.29□□□□□ -1.88
PMS1-215ENST00000447232 CCM2LQ9NUG4 571 aaPredicted RBP3.29□□□□□ -1.88
PMS1-215ENST00000447232 GPATCH2Q9NW75 528 aa3.29□□□□□ -1.88
PMS1-215ENST00000447232 TMEM9Q9P0T7 183 aa3.29□□□□□ -1.88
PMS1-215ENST00000447232 C5AR2Q9P296 337 aa3.29□□□□□ -1.88
PMS1-215ENST00000447232 ODF2LQ9ULJ1 636 aa3.29□□□□□ -1.88
PMS1-215ENST00000447232 AKAP6Q13023 2319 aa3.29□□□□□ -1.88
PMS1-215ENST00000447232 HIVEP2P31629 2446 aa3.29□□□□□ -1.88
PMS1-215ENST00000447232 ARGFXA6NJG6 315 aa3.29□□□□□ -1.88
PMS1-215ENST00000447232 TOR1BO14657 336 aa3.29□□□□□ -1.88
PMS1-215ENST00000447232 CPLX1O14810 134 aa3.29□□□□□ -1.88
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PMS1-215ENST00000447232 KATNA1O75449 491 aa3.29□□□□□ -1.88
PMS1-215ENST00000447232 ZGLP1P0C6A0 271 aa3.29□□□□□ -1.88
PMS1-215ENST00000447232 ZSCAN22P10073 491 aaPredicted RBP3.29□□□□□ -1.88
PMS1-215ENST00000447232 ZNF28P17035 718 aa3.29□□□□□ -1.88
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PMS1-215ENST00000447232 ABCD1P33897 745 aa3.29□□□□□ -1.88
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PMS1-215ENST00000447232 POSTNQ15063 836 aa3.29□□□□□ -1.88
PMS1-215ENST00000447232 CDSNQ15517 529 aa3.29□□□□□ -1.88
PMS1-215ENST00000447232 EFHC1Q5JVL4 640 aa3.29□□□□□ -1.88
PMS1-215ENST00000447232 RNF219Q5W0B1 726 aaPredicted RBP3.29□□□□□ -1.88
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PMS1-215ENST00000447232 TMIEQ8NEW7 156 aa3.29□□□□□ -1.88
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PMS1-215ENST00000447232 SAAL1Q96ER3 474 aa3.29□□□□□ -1.88
PMS1-215ENST00000447232 ANKRD36BP1Q96IX9 119 aa3.29□□□□□ -1.88
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PMS1-215ENST00000447232 DPYSL5Q9BPU6 564 aa3.29□□□□□ -1.88
PMS1-215ENST00000447232 SLX1AQ9BQ83 275 aa3.29□□□□□ -1.88
PMS1-215ENST00000447232 DUSP13Q9UII6 198 aa3.29□□□□□ -1.88
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PMS1-215ENST00000447232 FRMD3A2A2Y4 597 aa3.28□□□□□ -1.88
PMS1-215ENST00000447232 GOLGA6L3A6NEY3 463 aa3.28□□□□□ -1.88
PMS1-215ENST00000447232 ETV2O00321 342 aaPredicted RBP3.28□□□□□ -1.88
PMS1-215ENST00000447232 AP1G1O43747 822 aa3.28□□□□□ -1.88
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PMS1-215ENST00000447232 IGLV3-27P01718 113 aa3.28□□□□□ -1.88
PMS1-215ENST00000447232 PF4P02776 101 aa3.28□□□□□ -1.88
PMS1-215ENST00000447232 TMEM253P0C7T8 217 aa3.28□□□□□ -1.88
PMS1-215ENST00000447232 FAM200BP0CF97 657 aa3.28□□□□□ -1.88
PMS1-215ENST00000447232 MED14OSP0DP75 135 aa3.28□□□□□ -1.88
PMS1-215ENST00000447232 CTSEP14091 401 aa3.28□□□□□ -1.88
PMS1-215ENST00000447232 PCSK6P29122 969 aa3.28□□□□□ -1.88
PMS1-215ENST00000447232 NNMTP40261 264 aa3.28□□□□□ -1.88
PMS1-215ENST00000447232 GPR3P46089 330 aa3.28□□□□□ -1.88
PMS1-215ENST00000447232 NDST2P52849 883 aa3.28□□□□□ -1.88
PMS1-215ENST00000447232 RPS24P62847 133 aaKnown RBP3.28□□□□□ -1.88
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