RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000442708.5

USP39-205, Transcript of ubiquitin specific peptidase 39, humanhuman

TSL 4

Gene USP39, Length 561 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP39-205ENST00000442708 PTPRZ1P23471 2315 aaPredicted RBP16.01■□□□□ 0.15
USP39-205ENST00000442708 A6NNZ2 444 aa16■□□□□ 0.15
USP39-205ENST00000442708 BUD23O43709 281 aaKnown RBP16■□□□□ 0.15
USP39-205ENST00000442708 SOD1P00441 154 aa16■□□□□ 0.15
USP39-205ENST00000442708 TPH1P17752 444 aa16■□□□□ 0.15
USP39-205ENST00000442708 ACTN2P35609 894 aa16■□□□□ 0.15
USP39-205ENST00000442708 PTGIRP43119 386 aa16■□□□□ 0.15
USP39-205ENST00000442708 SPINT3P49223 89 aa16■□□□□ 0.15
USP39-205ENST00000442708 VPS41P49754 854 aa16■□□□□ 0.15
USP39-205ENST00000442708 C21orf59P57076 290 aa16■□□□□ 0.15
USP39-205ENST00000442708 LMNB2Q03252 620 aa16■□□□□ 0.15
USP39-205ENST00000442708 HLA-BQ31612 363 aa16■□□□□ 0.15
USP39-205ENST00000442708 AASDHQ4L235 1098 aaPredicted RBP16■□□□□ 0.15
USP39-205ENST00000442708 PNCKQ6P2M8 343 aa16■□□□□ 0.15
USP39-205ENST00000442708 PTAR1Q7Z6K3 402 aaPredicted RBP16■□□□□ 0.15
USP39-205ENST00000442708 KLHL7Q8IXQ5 586 aa16■□□□□ 0.15
USP39-205ENST00000442708 BLOC1S5Q8TDH9 187 aa16■□□□□ 0.15
USP39-205ENST00000442708 AGAP2Q99490 1192 aa16■□□□□ 0.15
USP39-205ENST00000442708 EDEM2Q9BV94 578 aa16■□□□□ 0.15
USP39-205ENST00000442708 GTPBP2Q9BX10 602 aaKnown RBP16■□□□□ 0.15
USP39-205ENST00000442708 LRRC40Q9H9A6 602 aa16■□□□□ 0.15
USP39-205ENST00000442708 ZFYVE1Q9HBF4 777 aa16■□□□□ 0.15
USP39-205ENST00000442708 PNMA8BQ9ULN7 279 aaPredicted RBP16■□□□□ 0.15
USP39-205ENST00000442708 OR1A2Q9Y585 309 aa16■□□□□ 0.15
USP39-205ENST00000442708 LRP4O75096 1905 aa16■□□□□ 0.15
USP39-205ENST00000442708 ZNF106Q9H2Y7 1883 aaKnown RBP15.99■□□□□ 0.15
USP39-205ENST00000442708 TCRBV7S3A2A0A539 114 aa15.99■□□□□ 0.15
USP39-205ENST00000442708 PSMD3O43242 534 aa15.99■□□□□ 0.15
USP39-205ENST00000442708 SUN1O94901 812 aa15.99■□□□□ 0.15
USP39-205ENST00000442708 PAFAH1B1P43034 410 aa15.99■□□□□ 0.15
USP39-205ENST00000442708 TERF1P54274 439 aa15.99■□□□□ 0.15
USP39-205ENST00000442708 PTPRCAPQ14761 206 aa15.99■□□□□ 0.15
USP39-205ENST00000442708 KCTD16Q68DU8 428 aa15.99■□□□□ 0.15
USP39-205ENST00000442708 ESRP1Q6NXG1 681 aaKnown RBP15.99■□□□□ 0.15
USP39-205ENST00000442708 MICALCLQ6ZW33 695 aa15.99■□□□□ 0.15
USP39-205ENST00000442708 MINDY1Q8N5J2 469 aa15.99■□□□□ 0.15
USP39-205ENST00000442708 GPR161Q8N6U8 529 aaKnown RBP15.99■□□□□ 0.15
USP39-205ENST00000442708 GPR26Q8NDV2 337 aa15.99■□□□□ 0.15
USP39-205ENST00000442708 OR52K1Q8NGK4 314 aa15.99■□□□□ 0.15
USP39-205ENST00000442708 GPR63Q9BZJ6 419 aa15.99■□□□□ 0.15
USP39-205ENST00000442708 BPIFA1Q9NP55 256 aa15.99■□□□□ 0.15
USP39-205ENST00000442708 RNF14Q9UBS8 474 aa15.99■□□□□ 0.15
USP39-205ENST00000442708 PCYOX1Q9UHG3 505 aa15.99■□□□□ 0.15
USP39-205ENST00000442708 FNDC3AQ9Y2H6 1198 aaKnown RBP15.99■□□□□ 0.15
USP39-205ENST00000442708 KCTD3Q9Y597 815 aa15.99■□□□□ 0.15
USP39-205ENST00000442708 ARL5AQ9Y689 179 aa15.99■□□□□ 0.15
USP39-205ENST00000442708 TDRD6O60522 2096 aaKnown RBP15.99■□□□□ 0.15
USP39-205ENST00000442708 TRBV21OR9-2A0A075B6F4 123 aaPredicted RBP15.98■□□□□ 0.15
USP39-205ENST00000442708 GOLGA6CA6NDK9 693 aa15.98■□□□□ 0.15
USP39-205ENST00000442708 GOLGA6BA6NDN3 693 aa15.98■□□□□ 0.15
USP39-205ENST00000442708 APRTP07741 180 aa15.98■□□□□ 0.15
USP39-205ENST00000442708 SYPP08247 313 aa15.98■□□□□ 0.15
USP39-205ENST00000442708 GOLGA6DP0CG33 693 aa15.98■□□□□ 0.15
USP39-205ENST00000442708 BPIP17213 487 aa15.98■□□□□ 0.15
USP39-205ENST00000442708 TRIM23P36406 574 aa15.98■□□□□ 0.15
USP39-205ENST00000442708 TNNT3P45378 269 aaPredicted RBP15.98■□□□□ 0.15
USP39-205ENST00000442708 BASP1P80723 227 aaKnown RBP15.98■□□□□ 0.15
USP39-205ENST00000442708 DPTQ07507 201 aa15.98■□□□□ 0.15
USP39-205ENST00000442708 OVGP1Q12889 678 aa15.98■□□□□ 0.15
USP39-205ENST00000442708 GPS1Q13098 491 aa15.98■□□□□ 0.15
USP39-205ENST00000442708 MTM1Q13496 603 aa15.98■□□□□ 0.15
USP39-205ENST00000442708 FZD2Q14332 565 aa15.98■□□□□ 0.15
USP39-205ENST00000442708 SHBQ15464 509 aa15.98■□□□□ 0.15
USP39-205ENST00000442708 ZNF423Q2M1K9 1284 aa15.98■□□□□ 0.15
USP39-205ENST00000442708 C4orf22Q6V702 233 aa15.98■□□□□ 0.15
USP39-205ENST00000442708 NRSN1Q8IZ57 195 aa15.98■□□□□ 0.15
USP39-205ENST00000442708 CCHCR1Q8TD31 782 aa15.98■□□□□ 0.15
USP39-205ENST00000442708 ZNF592Q92610 1267 aa15.98■□□□□ 0.15
USP39-205ENST00000442708 SLCO2A1Q92959 643 aa15.98■□□□□ 0.15
USP39-205ENST00000442708 APOOQ9BUR5 198 aa15.98■□□□□ 0.15
USP39-205ENST00000442708 RIOK2Q9BVS4 552 aaKnown RBP15.98■□□□□ 0.15
USP39-205ENST00000442708 LGR4Q9BXB1 951 aa15.98■□□□□ 0.15
USP39-205ENST00000442708 ZDHHC5Q9C0B5 715 aa15.98■□□□□ 0.15
USP39-205ENST00000442708 GAREM1Q9H706 876 aa15.98■□□□□ 0.15
USP39-205ENST00000442708 GOLGA6AQ9NYA3 693 aa15.98■□□□□ 0.15
USP39-205ENST00000442708 IL17CQ9P0M4 197 aa15.98■□□□□ 0.15
USP39-205ENST00000442708 SPTY2D1-AS1A0A0U1RR47 76 aa15.97■□□□□ 0.15
USP39-205ENST00000442708 LOC105378220A0A1B0GUY1 285 aaPredicted RBP15.97■□□□□ 0.15
USP39-205ENST00000442708 ERI2A8K979 691 aaKnown RBP15.97■□□□□ 0.15
USP39-205ENST00000442708 E7EVH7 732 aa15.97■□□□□ 0.15
USP39-205ENST00000442708 ECEL1O95672 775 aa15.97■□□□□ 0.15
USP39-205ENST00000442708 HMGCLP35914 325 aa15.97■□□□□ 0.15
USP39-205ENST00000442708 RABIFP47224 123 aa15.97■□□□□ 0.15
USP39-205ENST00000442708 PDE1CQ14123 709 aaPredicted RBP15.97■□□□□ 0.15
USP39-205ENST00000442708 KCNJ11Q14654 390 aa15.97■□□□□ 0.15
USP39-205ENST00000442708 ZNF542PQ5EBM4 170 aa15.97■□□□□ 0.15
USP39-205ENST00000442708 CERCAMQ5T4B2 595 aa15.97■□□□□ 0.15
USP39-205ENST00000442708 HENMT1Q5T8I9 393 aaKnown RBP15.97■□□□□ 0.15
USP39-205ENST00000442708 ANKRD22Q5VYY1 191 aa15.97■□□□□ 0.15
USP39-205ENST00000442708 ALS2CLQ60I27 953 aa15.97■□□□□ 0.15
USP39-205ENST00000442708 ZNF534Q76KX8 674 aa15.97■□□□□ 0.15
USP39-205ENST00000442708 ZNF765Q7L2R6 523 aa15.97■□□□□ 0.15
USP39-205ENST00000442708 GLT6D1Q7Z4J2 308 aa15.97■□□□□ 0.15
USP39-205ENST00000442708 FAM174AQ8TBP5 190 aa15.97■□□□□ 0.15
USP39-205ENST00000442708 GRK7Q8WTQ7 553 aa15.97■□□□□ 0.15
USP39-205ENST00000442708 AP2M1Q96CW1 435 aa15.97■□□□□ 0.15
USP39-205ENST00000442708 SRPK1Q96SB4 655 aaKnown RBP15.97■□□□□ 0.15
USP39-205ENST00000442708 FAM83DQ9H4H8 585 aa15.97■□□□□ 0.15
USP39-205ENST00000442708 TRABDQ9H4I3 376 aa15.97■□□□□ 0.15
USP39-205ENST00000442708 CASS4Q9NQ75 786 aa15.97■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 45.2 ms