RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000435535.1

RPS3AP54-201, Transcript of ribosomal protein S3a pseudogene 54, humanhuman

BASIC

Gene RPS3AP54, Length 734 nt, Biotype processed pseudogene.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPS3AP54-201ENST00000435535 FRYQ5TBA9 3013 aa4.63□□□□□ -1.67
RPS3AP54-201ENST00000435535 TDRD6O60522 2096 aaKnown RBP4.63□□□□□ -1.67
RPS3AP54-201ENST00000435535 CACNA1EQ15878 2313 aa4.62□□□□□ -1.67
RPS3AP54-201ENST00000435535 FAM237AA0A1B0GTK4 181 aa4.62□□□□□ -1.67
RPS3AP54-201ENST00000435535 COCHO43405 550 aa4.62□□□□□ -1.67
RPS3AP54-201ENST00000435535 TLR5O60602 858 aa4.62□□□□□ -1.67
RPS3AP54-201ENST00000435535 PEX14O75381 377 aa4.62□□□□□ -1.67
RPS3AP54-201ENST00000435535 NFATC1O95644 943 aa4.62□□□□□ -1.67
RPS3AP54-201ENST00000435535 ASS1P00966 412 aaKnown RBP4.62□□□□□ -1.67
RPS3AP54-201ENST00000435535 FAM200BP0CF97 657 aa4.62□□□□□ -1.67
RPS3AP54-201ENST00000435535 CCDC192P0DO97 292 aa4.62□□□□□ -1.67
RPS3AP54-201ENST00000435535 TDGF1P13385 188 aa4.62□□□□□ -1.67
RPS3AP54-201ENST00000435535 P4HA1P13674 534 aa4.62□□□□□ -1.67
RPS3AP54-201ENST00000435535 MGAT1P26572 445 aa4.62□□□□□ -1.67
RPS3AP54-201ENST00000435535 SLC7A1P30825 629 aa4.62□□□□□ -1.67
RPS3AP54-201ENST00000435535 ATICP31939 592 aa4.62□□□□□ -1.67
RPS3AP54-201ENST00000435535 PRCPP42785 496 aa4.62□□□□□ -1.67
RPS3AP54-201ENST00000435535 MAGEA9P43362 315 aa4.62□□□□□ -1.67
RPS3AP54-201ENST00000435535 RPS9P46781 194 aaKnown RBP4.62□□□□□ -1.67
RPS3AP54-201ENST00000435535 CXCL12P48061 93 aa4.62□□□□□ -1.67
RPS3AP54-201ENST00000435535 PGFP49763 221 aa4.62□□□□□ -1.67
RPS3AP54-201ENST00000435535 ARFIP2P53365 341 aa4.62□□□□□ -1.67
RPS3AP54-201ENST00000435535 SNRPFP62306 86 aaKnown RBP4.62□□□□□ -1.67
RPS3AP54-201ENST00000435535 ZXDBP98169 803 aa4.62□□□□□ -1.67
RPS3AP54-201ENST00000435535 NHLH2Q02577 135 aa4.62□□□□□ -1.67
RPS3AP54-201ENST00000435535 GRSF1Q12849 480 aaKnown RBP eCLIP4.62□□□□□ -1.67
RPS3AP54-201ENST00000435535 GOLGA7BQ2TAP0 167 aa4.62□□□□□ -1.67
RPS3AP54-201ENST00000435535 CCDC40Q4G0X9 1142 aa4.62□□□□□ -1.67
RPS3AP54-201ENST00000435535 CBWD6Q4V339 395 aa4.62□□□□□ -1.67
RPS3AP54-201ENST00000435535 CRB2Q5IJ48 1285 aa4.62□□□□□ -1.67
RPS3AP54-201ENST00000435535 CBWD3Q5JTY5 395 aa4.62□□□□□ -1.67
RPS3AP54-201ENST00000435535 CBWD5Q5RIA9 395 aa4.62□□□□□ -1.67
RPS3AP54-201ENST00000435535 FAM102AQ5T9C2 384 aaPredicted RBP4.62□□□□□ -1.67
RPS3AP54-201ENST00000435535 ZNF585AQ6P3V2 769 aa4.62□□□□□ -1.67
RPS3AP54-201ENST00000435535 CLEC20AQ6ZU45 233 aa4.62□□□□□ -1.67
RPS3AP54-201ENST00000435535 PDSS2Q86YH6 399 aa4.62□□□□□ -1.67
RPS3AP54-201ENST00000435535 NUP93Q8N1F7 819 aa4.62□□□□□ -1.67
RPS3AP54-201ENST00000435535 KRT78Q8N1N4 520 aa4.62□□□□□ -1.67
RPS3AP54-201ENST00000435535 CCDC33Q8N5R6 958 aa4.62□□□□□ -1.67
RPS3AP54-201ENST00000435535 SUMF1Q8NBK3 374 aa4.62□□□□□ -1.67
RPS3AP54-201ENST00000435535 CCDC150Q8NCX0 1101 aa4.62□□□□□ -1.67
RPS3AP54-201ENST00000435535 ZMIZ2Q8NF64 920 aa4.62□□□□□ -1.67
RPS3AP54-201ENST00000435535 SPATA18Q8TC71 538 aa4.62□□□□□ -1.67
RPS3AP54-201ENST00000435535 OSCP1Q8WVF1 389 aa4.62□□□□□ -1.67
RPS3AP54-201ENST00000435535 RUBCNQ92622 972 aa4.62□□□□□ -1.67
RPS3AP54-201ENST00000435535 WBP2Q969T9 261 aa4.62□□□□□ -1.67
RPS3AP54-201ENST00000435535 CLDN23Q96B33 292 aa4.62□□□□□ -1.67
RPS3AP54-201ENST00000435535 CCDC34Q96HJ3 373 aa4.62□□□□□ -1.67
RPS3AP54-201ENST00000435535 TNIP3Q96KP6 325 aa4.62□□□□□ -1.67
RPS3AP54-201ENST00000435535 SPATA17Q96L03 361 aa4.62□□□□□ -1.67
RPS3AP54-201ENST00000435535 KLHL32Q96NJ5 620 aa4.62□□□□□ -1.67
RPS3AP54-201ENST00000435535 ADOQ96SZ5 270 aa4.62□□□□□ -1.67
RPS3AP54-201ENST00000435535 SMOQ99835 787 aa4.62□□□□□ -1.67
RPS3AP54-201ENST00000435535 P2RY13Q9BPV8 354 aa4.62□□□□□ -1.67
RPS3AP54-201ENST00000435535 TTLL2Q9BWV7 592 aa4.62□□□□□ -1.67
RPS3AP54-201ENST00000435535 TRIM54Q9BYV2 358 aa4.62□□□□□ -1.67
RPS3AP54-201ENST00000435535 ZNF700Q9H0M5 742 aa4.62□□□□□ -1.67
RPS3AP54-201ENST00000435535 C8orf33Q9H7E9 229 aaPredicted RBP4.62□□□□□ -1.67
RPS3AP54-201ENST00000435535 ECT2Q9H8V3 914 aa4.62□□□□□ -1.67
RPS3AP54-201ENST00000435535 FBRSL1Q9HCM7 1045 aaKnown RBP4.62□□□□□ -1.67
RPS3AP54-201ENST00000435535 TMEM8AQ9HCN3 771 aa4.62□□□□□ -1.67
RPS3AP54-201ENST00000435535 ST6GALNAC1Q9NSC7 600 aaPredicted RBP4.62□□□□□ -1.67
RPS3AP54-201ENST00000435535 RLIMQ9NVW2 624 aa4.62□□□□□ -1.67
RPS3AP54-201ENST00000435535 DMAC2Q9NW81 257 aa4.62□□□□□ -1.67
RPS3AP54-201ENST00000435535 ZSCAN32Q9NX65 697 aa4.62□□□□□ -1.67
RPS3AP54-201ENST00000435535 GCNT4Q9P109 453 aa4.62□□□□□ -1.67
RPS3AP54-201ENST00000435535 CPNE7Q9UBL6 633 aa4.62□□□□□ -1.67
RPS3AP54-201ENST00000435535 GMEB2Q9UKD1 530 aa4.62□□□□□ -1.67
RPS3AP54-201ENST00000435535 MAN1B1Q9UKM7 699 aa4.62□□□□□ -1.67
RPS3AP54-201ENST00000435535 FBXO4Q9UKT5 387 aa4.62□□□□□ -1.67
RPS3AP54-201ENST00000435535 RAB23Q9ULC3 237 aa4.62□□□□□ -1.67
RPS3AP54-201ENST00000435535 PHTF1Q9UMS5 762 aa4.62□□□□□ -1.67
RPS3AP54-201ENST00000435535 ARHGAP26Q9UNA1 814 aa4.62□□□□□ -1.67
RPS3AP54-201ENST00000435535 TRAF3IP3Q9Y228 551 aa4.62□□□□□ -1.67
RPS3AP54-201ENST00000435535 DYNC1LI1Q9Y6G9 523 aaKnown RBP4.62□□□□□ -1.67
RPS3AP54-201ENST00000435535 IGF2BP2Q9Y6M1 599 aaKnown RBP eCLIP4.62□□□□□ -1.67
RPS3AP54-201ENST00000435535 ATXN2Q99700 1313 aaKnown RBP4.62□□□□□ -1.67
RPS3AP54-201ENST00000435535 CHD5Q8TDI0 1954 aa4.62□□□□□ -1.67
RPS3AP54-201ENST00000435535 LRRK1Q38SD2 2015 aa4.62□□□□□ -1.67
RPS3AP54-201ENST00000435535 KRTAP23-1A1A580 65 aa4.61□□□□□ -1.67
RPS3AP54-201ENST00000435535 ZNF840PA6NDX5 716 aa4.61□□□□□ -1.67
RPS3AP54-201ENST00000435535 ZNF785A8K8V0 405 aa4.61□□□□□ -1.67
RPS3AP54-201ENST00000435535 GOLGA6L6A8MZA4 724 aa4.61□□□□□ -1.67
RPS3AP54-201ENST00000435535 NEDD8-MDP1E9PL57 170 aa4.61□□□□□ -1.67
RPS3AP54-201ENST00000435535 E9PLN8 166 aa4.61□□□□□ -1.67
RPS3AP54-201ENST00000435535 TULP2O00295 520 aa4.61□□□□□ -1.67
RPS3AP54-201ENST00000435535 PSMA7O14818 248 aa4.61□□□□□ -1.67
RPS3AP54-201ENST00000435535 DCLK1O15075 740 aa4.61□□□□□ -1.67
RPS3AP54-201ENST00000435535 TRIM24O15164 1050 aa4.61□□□□□ -1.67
RPS3AP54-201ENST00000435535 CETN3O15182 167 aa4.61□□□□□ -1.67
RPS3AP54-201ENST00000435535 ZNF185O15231 689 aa4.61□□□□□ -1.67
RPS3AP54-201ENST00000435535 DNAJB5O75953 348 aa4.61□□□□□ -1.67
RPS3AP54-201ENST00000435535 RTN3O95197 1032 aaPredicted RBP4.61□□□□□ -1.67
RPS3AP54-201ENST00000435535 SMC2O95347 1197 aa4.61□□□□□ -1.67
RPS3AP54-201ENST00000435535 CD19P15391 556 aa4.61□□□□□ -1.67
RPS3AP54-201ENST00000435535 YWHAQP27348 245 aa4.61□□□□□ -1.67
RPS3AP54-201ENST00000435535 APOBEC3AP31941 199 aaPredicted RBP4.61□□□□□ -1.67
RPS3AP54-201ENST00000435535 PSMC2P35998 433 aaKnown RBP4.61□□□□□ -1.67
RPS3AP54-201ENST00000435535 OPRD1P41143 372 aa4.61□□□□□ -1.67
RPS3AP54-201ENST00000435535 PIK3CBP42338 1070 aa4.61□□□□□ -1.67
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 17.8 ms