RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000418331.6

PTPRJ-201, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type J, humanhuman

APPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRJ, Length 5,122 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRJ-201ENST00000418331 LGALS13Q9UHV8 139 aa21.39■■□□□ 1.02
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PTPRJ-201ENST00000418331 SPAM1P38567 509 aa21.37■■□□□ 1.01
PTPRJ-201ENST00000418331 SP2Q02086 613 aa21.37■■□□□ 1.01
PTPRJ-201ENST00000418331 PDK3Q15120 406 aa21.37■■□□□ 1.01
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