RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000379615.3

PGGT1B-202, Transcript of protein geranylgeranyltransferase type I subunit beta, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene PGGT1B, Length 903 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGGT1B-202ENST00000379615 GOLGA8CPA6NN73 597 aa15.37■□□□□ 0.05
PGGT1B-202ENST00000379615 F5H423 210 aaPredicted RBP15.37■□□□□ 0.05
PGGT1B-202ENST00000379615 H3BM21 787 aa15.37■□□□□ 0.05
PGGT1B-202ENST00000379615 FLRT2O43155 660 aa15.37■□□□□ 0.05
PGGT1B-202ENST00000379615 CLDN7O95471 211 aa15.37■□□□□ 0.05
PGGT1B-202ENST00000379615 IFNB1P01574 187 aa15.37■□□□□ 0.05
PGGT1B-202ENST00000379615 HOXC4P09017 264 aaPredicted RBP15.37■□□□□ 0.05
PGGT1B-202ENST00000379615 TEAD1P28347 426 aa15.37■□□□□ 0.05
PGGT1B-202ENST00000379615 DPTQ07507 201 aa15.37■□□□□ 0.05
PGGT1B-202ENST00000379615 SLC1A5Q15758 541 aa15.37■□□□□ 0.05
PGGT1B-202ENST00000379615 FAM182AQ5T1J6 154 aa15.37■□□□□ 0.05
PGGT1B-202ENST00000379615 TECPR1Q7Z6L1 1165 aa15.37■□□□□ 0.05
PGGT1B-202ENST00000379615 AP2M1Q96CW1 435 aa15.37■□□□□ 0.05
PGGT1B-202ENST00000379615 MRGPRX2Q96LB1 330 aa15.37■□□□□ 0.05
PGGT1B-202ENST00000379615 APOOQ9BUR5 198 aa15.37■□□□□ 0.05
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PGGT1B-202ENST00000379615 WDR26Q9H7D7 661 aa15.37■□□□□ 0.05
PGGT1B-202ENST00000379615 ZNF711Q9Y462 761 aa15.37■□□□□ 0.05
PGGT1B-202ENST00000379615 LAMA1P25391 3075 aa15.37■□□□□ 0.05
PGGT1B-202ENST00000379615 LRRK1Q38SD2 2015 aa15.36■□□□□ 0.05
PGGT1B-202ENST00000379615 CTAGE9A4FU28 777 aa15.36■□□□□ 0.05
PGGT1B-202ENST00000379615 ERI2A8K979 691 aaKnown RBP15.36■□□□□ 0.05
PGGT1B-202ENST00000379615 TM4SF5O14894 197 aa15.36■□□□□ 0.05
PGGT1B-202ENST00000379615 KRT37O76014 449 aa15.36■□□□□ 0.05
PGGT1B-202ENST00000379615 ATXN1LP0C7T5 689 aaKnown RBP15.36■□□□□ 0.05
PGGT1B-202ENST00000379615 CD59P13987 128 aa15.36■□□□□ 0.05
PGGT1B-202ENST00000379615 GM2AP17900 193 aa15.36■□□□□ 0.05
PGGT1B-202ENST00000379615 CSRP1P21291 193 aaKnown RBP15.36■□□□□ 0.05
PGGT1B-202ENST00000379615 TRIM23P36406 574 aa15.36■□□□□ 0.05
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PGGT1B-202ENST00000379615 GDF10P55107 478 aa15.36■□□□□ 0.05
PGGT1B-202ENST00000379615 HNRNPKP61978 463 aaKnown RBP eCLIP15.36■□□□□ 0.05
PGGT1B-202ENST00000379615 FZD2Q14332 565 aa15.36■□□□□ 0.05
PGGT1B-202ENST00000379615 NFATC4Q14934 902 aa15.36■□□□□ 0.05
PGGT1B-202ENST00000379615 PTPRRQ15256 657 aa15.36■□□□□ 0.05
PGGT1B-202ENST00000379615 SIX1Q15475 284 aaPredicted RBP15.36■□□□□ 0.05
PGGT1B-202ENST00000379615 CDKN3Q16667 212 aa15.36■□□□□ 0.05
PGGT1B-202ENST00000379615 PPM1JQ5JR12 505 aa15.36■□□□□ 0.05
PGGT1B-202ENST00000379615 SIRPB2Q5JXA9 342 aa15.36■□□□□ 0.05
PGGT1B-202ENST00000379615 PRAMEF14Q5SWL7 426 aa15.36■□□□□ 0.05
PGGT1B-202ENST00000379615 ZDHHC20Q5W0Z9 365 aa15.36■□□□□ 0.05
PGGT1B-202ENST00000379615 RAET1GQ6H3X3 334 aa15.36■□□□□ 0.05
PGGT1B-202ENST00000379615 RANBP10Q6VN20 620 aa15.36■□□□□ 0.05
PGGT1B-202ENST00000379615 MACC1Q6ZN28 852 aa15.36■□□□□ 0.05
PGGT1B-202ENST00000379615 SLC22A18ASQ8N1D0 253 aa15.36■□□□□ 0.05
PGGT1B-202ENST00000379615 SLC25A41Q8N5S1 370 aa15.36■□□□□ 0.05
PGGT1B-202ENST00000379615 ACTRT1Q8TDG2 376 aa15.36■□□□□ 0.05
PGGT1B-202ENST00000379615 SETD7Q8WTS6 366 aaKnown RBP15.36■□□□□ 0.05
PGGT1B-202ENST00000379615 BTN2A2Q8WVV5 523 aa15.36■□□□□ 0.05
PGGT1B-202ENST00000379615 SMIM14Q96QK8 99 aa15.36■□□□□ 0.05
PGGT1B-202ENST00000379615 NAPGQ99747 312 aaPredicted RBP15.36■□□□□ 0.05
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PGGT1B-202ENST00000379615 LRRC40Q9H9A6 602 aa15.36■□□□□ 0.05
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PGGT1B-202ENST00000379615 E7EVH7 732 aa15.35■□□□□ 0.05
PGGT1B-202ENST00000379615 AGTP01019 485 aa15.35■□□□□ 0.05
PGGT1B-202ENST00000379615 C1SP09871 688 aa15.35■□□□□ 0.05
PGGT1B-202ENST00000379615 EPHA8P29322 1005 aaPredicted RBP15.35■□□□□ 0.05
PGGT1B-202ENST00000379615 GRK6P43250 576 aa15.35■□□□□ 0.05
PGGT1B-202ENST00000379615 GPR1P46091 355 aa15.35■□□□□ 0.05
PGGT1B-202ENST00000379615 SPINT3P49223 89 aa15.35■□□□□ 0.05
PGGT1B-202ENST00000379615 KIAA1024LP59773 190 aa15.35■□□□□ 0.05
PGGT1B-202ENST00000379615 PPARDQ03181 441 aa15.35■□□□□ 0.05
PGGT1B-202ENST00000379615 HS1BP3Q53T59 392 aa15.35■□□□□ 0.05
PGGT1B-202ENST00000379615 DBX2Q6ZNG2 339 aa15.35■□□□□ 0.05
PGGT1B-202ENST00000379615 LYSMD3Q7Z3D4 306 aa15.35■□□□□ 0.05
PGGT1B-202ENST00000379615 TMC3Q7Z5M5 1100 aa15.35■□□□□ 0.05
PGGT1B-202ENST00000379615 LINC00523Q86TU6 105 aa15.35■□□□□ 0.05
PGGT1B-202ENST00000379615 KLHDC8BQ8IXV7 354 aa15.35■□□□□ 0.05
PGGT1B-202ENST00000379615 PRELID2Q8N945 189 aa15.35■□□□□ 0.05
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PGGT1B-202ENST00000379615 TBL1YQ9BQ87 522 aa15.35■□□□□ 0.05
PGGT1B-202ENST00000379615 SLC13A1Q9BZW2 595 aa15.35■□□□□ 0.05
PGGT1B-202ENST00000379615 ABCG8Q9H221 673 aa15.35■□□□□ 0.05
PGGT1B-202ENST00000379615 SHOC2Q9UQ13 582 aa15.35■□□□□ 0.05
PGGT1B-202ENST00000379615 OR1A2Q9Y585 309 aa15.35■□□□□ 0.05
PGGT1B-202ENST00000379615 A0A0U1RQS6 177 aa15.34■□□□□ 0.05
PGGT1B-202ENST00000379615 TNFRSF10CO14798 259 aa15.34■□□□□ 0.05
PGGT1B-202ENST00000379615 PPFIA2O75334 1257 aa15.34■□□□□ 0.05
PGGT1B-202ENST00000379615 RASGRP1O95267 797 aa15.34■□□□□ 0.05
PGGT1B-202ENST00000379615 METTL18O95568 372 aa15.34■□□□□ 0.05
PGGT1B-202ENST00000379615 GAS8O95995 478 aa15.34■□□□□ 0.05
PGGT1B-202ENST00000379615 CSF2P04141 144 aa15.34■□□□□ 0.05
PGGT1B-202ENST00000379615 PIRTP0C851 137 aa15.34■□□□□ 0.05
PGGT1B-202ENST00000379615 CEACAM1P13688 526 aa15.34■□□□□ 0.05
PGGT1B-202ENST00000379615 NME1P15531 152 aaKnown RBP15.34■□□□□ 0.05
PGGT1B-202ENST00000379615 JUNDP17535 347 aa15.34■□□□□ 0.05
PGGT1B-202ENST00000379615 ADRA1AP35348 466 aa15.34■□□□□ 0.05
PGGT1B-202ENST00000379615 HMGCLP35914 325 aa15.34■□□□□ 0.05
PGGT1B-202ENST00000379615 CHRNA4P43681 627 aa15.34■□□□□ 0.05
PGGT1B-202ENST00000379615 LMAN1P49257 510 aa15.34■□□□□ 0.05
PGGT1B-202ENST00000379615 PDE1BQ01064 536 aa15.34■□□□□ 0.05
PGGT1B-202ENST00000379615 FAXCQ5TGI0 409 aa15.34■□□□□ 0.05
PGGT1B-202ENST00000379615 PAPD7Q5XG87 772 aaKnown RBP15.34■□□□□ 0.05
PGGT1B-202ENST00000379615 ENPP7Q6UWV6 458 aa15.34■□□□□ 0.05
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