RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000370002.7

PITX3-201, Transcript of paired like homeodomain 3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene PITX3, Length 1,391 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PITX3-201ENST00000370002 PRLP01236 227 aa20.28■□□□□ 0.84
PITX3-201ENST00000370002 MLLT3P42568 568 aaPredicted RBP20.28■□□□□ 0.84
PITX3-201ENST00000370002 CDK3Q00526 305 aa20.28■□□□□ 0.84
PITX3-201ENST00000370002 DSC2Q02487 901 aa20.28■□□□□ 0.84
PITX3-201ENST00000370002 PTSQ03393 145 aa20.28■□□□□ 0.84
PITX3-201ENST00000370002 TBC1D25Q3MII6 688 aa20.28■□□□□ 0.84
PITX3-201ENST00000370002 ADAMTSL4Q6UY14 1074 aa20.28■□□□□ 0.84
PITX3-201ENST00000370002 GPBAR1Q8TDU6 330 aa20.28■□□□□ 0.84
PITX3-201ENST00000370002 SCARF2Q96GP6 870 aaPredicted RBP20.28■□□□□ 0.84
PITX3-201ENST00000370002 OLFM3Q96PB7 478 aa20.28■□□□□ 0.84
PITX3-201ENST00000370002 CCDC3Q9BQI4 270 aa20.28■□□□□ 0.84
PITX3-201ENST00000370002 ADGRE3Q9BY15 652 aa20.28■□□□□ 0.84
PITX3-201ENST00000370002 FRMD8Q9BZ67 464 aaPredicted RBP20.28■□□□□ 0.84
PITX3-201ENST00000370002 PCDH9Q9HC56 1237 aa20.28■□□□□ 0.84
PITX3-201ENST00000370002 SLC17A4Q9Y2C5 497 aa20.28■□□□□ 0.84
PITX3-201ENST00000370002 DSPP15924 2871 aaKnown RBP20.28■□□□□ 0.84
PITX3-201ENST00000370002 APC2O95996 2303 aa20.27■□□□□ 0.84
PITX3-201ENST00000370002 A0A0A6YYK5 440 aaPredicted RBP20.27■□□□□ 0.84
PITX3-201ENST00000370002 PSTPIP1O43586 416 aa20.27■□□□□ 0.84
PITX3-201ENST00000370002 BRINP1O60477 761 aa20.27■□□□□ 0.84
PITX3-201ENST00000370002 USP12O75317 370 aa20.27■□□□□ 0.84
PITX3-201ENST00000370002 HLA-DQB2P05538 268 aa20.27■□□□□ 0.84
PITX3-201ENST00000370002 CELA2BP08218 269 aaPredicted RBP20.27■□□□□ 0.84
PITX3-201ENST00000370002 GLB1P16278 677 aa20.27■□□□□ 0.84
PITX3-201ENST00000370002 TFDP2Q14188 446 aa20.27■□□□□ 0.84
PITX3-201ENST00000370002 PERM1Q5SV97 790 aa20.27■□□□□ 0.84
PITX3-201ENST00000370002 LRRC66Q68CR7 880 aa20.27■□□□□ 0.84
PITX3-201ENST00000370002 TAF8Q7Z7C8 310 aa20.27■□□□□ 0.84
PITX3-201ENST00000370002 TSPAN33Q86UF1 283 aa20.27■□□□□ 0.84
PITX3-201ENST00000370002 HEATR4Q86WZ0 1026 aa20.27■□□□□ 0.84
PITX3-201ENST00000370002 KIAA1524Q8TCG1 905 aa20.27■□□□□ 0.84
PITX3-201ENST00000370002 LGMNQ99538 433 aa20.27■□□□□ 0.84
PITX3-201ENST00000370002 CYP4F12Q9HCS2 524 aa20.27■□□□□ 0.84
PITX3-201ENST00000370002 GULP1Q9UBP9 304 aa20.27■□□□□ 0.84
PITX3-201ENST00000370002 PCDHB1Q9Y5F3 818 aa20.27■□□□□ 0.84
PITX3-201ENST00000370002 PCDHGA8Q9Y5G5 932 aa20.27■□□□□ 0.84
PITX3-201ENST00000370002 HEY1Q9Y5J3 304 aa20.27■□□□□ 0.84
PITX3-201ENST00000370002 ACACAQ13085 2346 aa20.26■□□□□ 0.83
PITX3-201ENST00000370002 ANKRD66B4E2M5 251 aa20.26■□□□□ 0.83
PITX3-201ENST00000370002 SPOPO43791 374 aa20.26■□□□□ 0.83
PITX3-201ENST00000370002 MAP3K6O95382 1288 aa20.26■□□□□ 0.83
PITX3-201ENST00000370002 JCHAINP01591 159 aa20.26■□□□□ 0.83
PITX3-201ENST00000370002 CEACAM5P06731 702 aa20.26■□□□□ 0.83
PITX3-201ENST00000370002 IVLP07476 585 aa20.26■□□□□ 0.83
PITX3-201ENST00000370002 MAGEA1P43355 309 aa20.26■□□□□ 0.83
PITX3-201ENST00000370002 STC1P52823 247 aa20.26■□□□□ 0.83
PITX3-201ENST00000370002 NIPAL4Q0D2K0 466 aa20.26■□□□□ 0.83
PITX3-201ENST00000370002 ILF3Q12906 894 aaKnown RBP eCLIP20.26■□□□□ 0.83
PITX3-201ENST00000370002 IHHQ14623 411 aa20.26■□□□□ 0.83
PITX3-201ENST00000370002 TAZQ16635 292 aa20.26■□□□□ 0.83
PITX3-201ENST00000370002 RAET1GQ6H3X3 334 aa20.26■□□□□ 0.83
PITX3-201ENST00000370002 LRRC69Q6ZNQ3 347 aa20.26■□□□□ 0.83
PITX3-201ENST00000370002 PELI3Q8N2H9 469 aa20.26■□□□□ 0.83
PITX3-201ENST00000370002 FAM46DQ8NEK8 389 aa20.26■□□□□ 0.83
PITX3-201ENST00000370002 AP2M1Q96CW1 435 aa20.26■□□□□ 0.83
PITX3-201ENST00000370002 SRPK1Q96SB4 655 aaKnown RBP20.26■□□□□ 0.83
PITX3-201ENST00000370002 GSDMCQ9BYG8 508 aa20.26■□□□□ 0.83
PITX3-201ENST00000370002 TMEM168Q9H0V1 697 aa20.26■□□□□ 0.83
PITX3-201ENST00000370002 CDH19Q9H159 772 aa20.26■□□□□ 0.83
PITX3-201ENST00000370002 CHKBQ9Y259 395 aa20.26■□□□□ 0.83
PITX3-201ENST00000370002 TTLL3Q9Y4R7 772 aa20.26■□□□□ 0.83
PITX3-201ENST00000370002 FAM208BQ5VWN6 2430 aa20.25■□□□□ 0.83
PITX3-201ENST00000370002 KCNK1O00180 336 aa20.25■□□□□ 0.83
PITX3-201ENST00000370002 ZW10O43264 779 aa20.25■□□□□ 0.83
PITX3-201ENST00000370002 NUDT21O43809 227 aaKnown RBP20.25■□□□□ 0.83
PITX3-201ENST00000370002 KRT1P04264 644 aa20.25■□□□□ 0.83
PITX3-201ENST00000370002 CTPS1P17812 591 aa20.25■□□□□ 0.83
PITX3-201ENST00000370002 COMTP21964 271 aa20.25■□□□□ 0.83
PITX3-201ENST00000370002 CYLC1P35663 651 aaPredicted RBP20.25■□□□□ 0.83
PITX3-201ENST00000370002 GPR1P46091 355 aa20.25■□□□□ 0.83
PITX3-201ENST00000370002 EIF3IQ13347 325 aaKnown RBP20.25■□□□□ 0.83
PITX3-201ENST00000370002 SPIDRQ14159 915 aa20.25■□□□□ 0.83
PITX3-201ENST00000370002 SPA17Q15506 151 aa20.25■□□□□ 0.83
PITX3-201ENST00000370002 DENND2CQ68D51 928 aa20.25■□□□□ 0.83
PITX3-201ENST00000370002 CNTD1Q8N815 330 aa20.25■□□□□ 0.83
PITX3-201ENST00000370002 KYQ8NBH2 561 aa20.25■□□□□ 0.83
PITX3-201ENST00000370002 EXD1Q8NHP7 514 aa20.25■□□□□ 0.83
PITX3-201ENST00000370002 PANX2Q96RD6 677 aa20.25■□□□□ 0.83
PITX3-201ENST00000370002 MLPHQ9BV36 600 aaPredicted RBP20.25■□□□□ 0.83
PITX3-201ENST00000370002 ABCG8Q9H221 673 aa20.25■□□□□ 0.83
PITX3-201ENST00000370002 CARS2Q9HA77 564 aaKnown RBP20.25■□□□□ 0.83
PITX3-201ENST00000370002 MRPL40Q9NQ50 206 aaKnown RBP20.25■□□□□ 0.83
PITX3-201ENST00000370002 ALG6Q9Y672 507 aa20.25■□□□□ 0.83
PITX3-201ENST00000370002 MTSS1O43312 755 aa20.24■□□□□ 0.83
PITX3-201ENST00000370002 NRDCO43847 1150 aa20.24■□□□□ 0.83
PITX3-201ENST00000370002 MMP2P08253 660 aa20.24■□□□□ 0.83
PITX3-201ENST00000370002 ABCG1P45844 678 aa20.24■□□□□ 0.83
PITX3-201ENST00000370002 SKOR1P84550 965 aa20.24■□□□□ 0.83
PITX3-201ENST00000370002 HLTFQ14527 1009 aaKnown RBP eCLIP20.24■□□□□ 0.83
PITX3-201ENST00000370002 CLPPQ16740 277 aaPredicted RBP20.24■□□□□ 0.83
PITX3-201ENST00000370002 C14orf28Q4W4Y0 310 aa20.24■□□□□ 0.83
PITX3-201ENST00000370002 CERCAMQ5T4B2 595 aa20.24■□□□□ 0.83
PITX3-201ENST00000370002 KCTD16Q68DU8 428 aa20.24■□□□□ 0.83
PITX3-201ENST00000370002 NT5DC3Q86UY8 548 aa20.24■□□□□ 0.83
PITX3-201ENST00000370002 C17orf82Q86X59 251 aaPredicted RBP20.24■□□□□ 0.83
PITX3-201ENST00000370002 CCHCR1Q8TD31 782 aa20.24■□□□□ 0.83
PITX3-201ENST00000370002 IMP4Q96G21 291 aaKnown RBP20.24■□□□□ 0.83
PITX3-201ENST00000370002 SLC25A51Q9H1U9 297 aa20.24■□□□□ 0.83
PITX3-201ENST00000370002 SBDSQ9Y3A5 250 aaKnown RBP eCLIP20.24■□□□□ 0.83
PITX3-201ENST00000370002 ENTPD2Q9Y5L3 495 aa20.24■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 22.6 ms