RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000368547.3

ECHS1-201, Transcript of enoyl-CoA hydratase, short chain 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene ECHS1, Length 1,617 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ECHS1-201ENST00000368547 NDUFS2O75306 463 aa29.55■■■□□ 2.32
ECHS1-201ENST00000368547 BANF1O75531 89 aa29.55■■■□□ 2.32
ECHS1-201ENST00000368547 SP9P0CG40 484 aa29.55■■■□□ 2.32
ECHS1-201ENST00000368547 C6P13671 934 aa29.55■■■□□ 2.32
ECHS1-201ENST00000368547 PPP2CBP62714 309 aa29.55■■■□□ 2.32
ECHS1-201ENST00000368547 RPS21P63220 83 aaKnown RBP29.55■■■□□ 2.32
ECHS1-201ENST00000368547 PPP2CAP67775 309 aa29.55■■■□□ 2.32
ECHS1-201ENST00000368547 BBS9Q3SYG4 887 aa29.55■■■□□ 2.32
ECHS1-201ENST00000368547 KIAA1161Q6NSJ0 714 aa29.55■■■□□ 2.32
ECHS1-201ENST00000368547 HSD11B1LQ7Z5J1 315 aa29.55■■■□□ 2.32
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ECHS1-201ENST00000368547 C6orf106Q9H6K1 298 aaPredicted RBP29.55■■■□□ 2.32
ECHS1-201ENST00000368547 OGFRQ9NZT2 677 aa29.55■■■□□ 2.32
ECHS1-201ENST00000368547 COQ6Q9Y2Z9 468 aa29.55■■■□□ 2.32
ECHS1-201ENST00000368547 KCTD3Q9Y597 815 aa29.55■■■□□ 2.32
ECHS1-201ENST00000368547 ZNF318Q5VUA4 2279 aa29.55■■■□□ 2.32
ECHS1-201ENST00000368547 IGLON5A6NGN9 336 aa29.54■■■□□ 2.32
ECHS1-201ENST00000368547 C2orf81A6NN90 581 aa29.54■■■□□ 2.32
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ECHS1-201ENST00000368547 ADRA1DP25100 572 aa29.54■■■□□ 2.32
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ECHS1-201ENST00000368547 STC1P52823 247 aa29.54■■■□□ 2.32
ECHS1-201ENST00000368547 NUBP1P53384 320 aa29.54■■■□□ 2.32
ECHS1-201ENST00000368547 HSP90B2PQ58FF3 399 aa29.54■■■□□ 2.32
ECHS1-201ENST00000368547 PCID2Q5JVF3 399 aa29.54■■■□□ 2.32
ECHS1-201ENST00000368547 CROCCP2Q86T23 111 aa29.54■■■□□ 2.32
ECHS1-201ENST00000368547 HORMAD1Q86X24 394 aa29.54■■■□□ 2.32
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ECHS1-201ENST00000368547 C9orf72Q96LT7 481 aa29.54■■■□□ 2.32
ECHS1-201ENST00000368547 TMEM109Q9BVC6 243 aa29.54■■■□□ 2.32
ECHS1-201ENST00000368547 TEX264Q9Y6I9 313 aa29.54■■■□□ 2.32
ECHS1-201ENST00000368547 CEP192Q8TEP8 1941 aa29.53■■■□□ 2.32
ECHS1-201ENST00000368547 HEATR9A2RTY3 570 aa29.53■■■□□ 2.32
ECHS1-201ENST00000368547 PSMD11O00231 422 aa29.53■■■□□ 2.32
ECHS1-201ENST00000368547 BCKDHBP21953 392 aa29.53■■■□□ 2.32
ECHS1-201ENST00000368547 ACOX1Q15067 660 aa29.53■■■□□ 2.32
ECHS1-201ENST00000368547 TMEM259Q4ZIN3 620 aa29.53■■■□□ 2.32
ECHS1-201ENST00000368547 CASC4Q6P4E1 433 aa29.53■■■□□ 2.32
ECHS1-201ENST00000368547 PYROXD1Q8WU10 500 aa29.53■■■□□ 2.32
ECHS1-201ENST00000368547 TCAF1Q9Y4C2 921 aa29.53■■■□□ 2.32
ECHS1-201ENST00000368547 CCDC78A2IDD5 438 aa29.53■■■□□ 2.32
ECHS1-201ENST00000368547 MAP3K13O43283 966 aa29.53■■■□□ 2.32
ECHS1-201ENST00000368547 ACSL3O95573 720 aa29.53■■■□□ 2.32
ECHS1-201ENST00000368547 LPOP22079 712 aaPredicted RBP29.53■■■□□ 2.32
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ECHS1-201ENST00000368547 SLC36A4Q6YBV0 504 aa29.53■■■□□ 2.32
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ECHS1-201ENST00000368547 BPIFA1Q9NP55 256 aa29.53■■■□□ 2.32
ECHS1-201ENST00000368547 CHRAC1Q9NRG0 131 aa29.53■■■□□ 2.32
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ECHS1-201ENST00000368547 WDFY4Q6ZS81 3184 aa29.52■■■□□ 2.32
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ECHS1-201ENST00000368547 KRT222Q8N1A0 295 aa29.52■■■□□ 2.32
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ECHS1-201ENST00000368547 COQ10AQ96MF6 247 aa29.52■■■□□ 2.32
ECHS1-201ENST00000368547 LRRC4CQ9HCJ2 640 aa29.52■■■□□ 2.32
ECHS1-201ENST00000368547 ZSCAN32Q9NX65 697 aa29.52■■■□□ 2.32
ECHS1-201ENST00000368547 IL17CQ9P0M4 197 aa29.52■■■□□ 2.32
ECHS1-201ENST00000368547 BPTFQ12830 3046 aa29.52■■■□□ 2.32
ECHS1-201ENST00000368547 DLL1O00548 723 aa29.51■■■□□ 2.31
ECHS1-201ENST00000368547 ETV3P41162 512 aa29.51■■■□□ 2.31
ECHS1-201ENST00000368547 IFFO1Q0D2I5 559 aa29.51■■■□□ 2.31
ECHS1-201ENST00000368547 LAMB3Q13751 1172 aa29.51■■■□□ 2.31
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ECHS1-201ENST00000368547 Q6ZVL8 140 aa29.51■■■□□ 2.31
ECHS1-201ENST00000368547 GOLGA6L1Q8N7Z2 621 aa29.51■■■□□ 2.31
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ECHS1-201ENST00000368547 ZNF778Q96MU6 729 aa29.51■■■□□ 2.31
ECHS1-201ENST00000368547 WDR83Q9BRX9 315 aaKnown RBP29.51■■■□□ 2.31
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ECHS1-201ENST00000368547 C10orf142B7Z368 130 aa29.5■■■□□ 2.31
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ECHS1-201ENST00000368547 SPAG6O75602 509 aa29.5■■■□□ 2.31
ECHS1-201ENST00000368547 RECQL5O94762 991 aaPredicted RBP29.5■■■□□ 2.31
ECHS1-201ENST00000368547 SPINT3P49223 89 aa29.5■■■□□ 2.31
ECHS1-201ENST00000368547 ZNF140P52738 457 aaPredicted RBP29.5■■■□□ 2.31
ECHS1-201ENST00000368547 DEFB119Q8N690 84 aa29.5■■■□□ 2.31
ECHS1-201ENST00000368547 OR4K2Q8NGD2 314 aa29.5■■■□□ 2.31
ECHS1-201ENST00000368547 OR13C4Q8NGS5 318 aa29.5■■■□□ 2.31
ECHS1-201ENST00000368547 PTCD2Q8WV60 388 aaKnown RBP29.5■■■□□ 2.31
ECHS1-201ENST00000368547 KIFC1Q9BW19 673 aa29.5■■■□□ 2.31
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