RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000355530.6

SPNS3-201, Transcript of sphingolipid transporter 3 (putative), humanhuman

APPRIS P1 TSL 2 BASIC

Gene SPNS3, Length 2,133 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPNS3-201ENST00000355530 CCL22O00626 93 aa18.23■□□□□ 0.51
SPNS3-201ENST00000355530 NME4O00746 187 aa18.23■□□□□ 0.51
SPNS3-201ENST00000355530 ANGPT2O15123 496 aa18.23■□□□□ 0.51
SPNS3-201ENST00000355530 CDK14O94921 469 aa18.23■□□□□ 0.51
SPNS3-201ENST00000355530 ATXN1LP0C7T5 689 aaKnown RBP18.23■□□□□ 0.51
SPNS3-201ENST00000355530 HSD17B1P14061 328 aa18.23■□□□□ 0.51
SPNS3-201ENST00000355530 SUOXP51687 545 aa18.23■□□□□ 0.51
SPNS3-201ENST00000355530 INPP5AQ14642 412 aa18.23■□□□□ 0.51
SPNS3-201ENST00000355530 NHSL2Q5HYW2 709 aa18.23■□□□□ 0.51
SPNS3-201ENST00000355530 KANK2Q63ZY3 851 aa18.23■□□□□ 0.51
SPNS3-201ENST00000355530 MINDY1Q8N5J2 469 aa18.23■□□□□ 0.51
SPNS3-201ENST00000355530 FAM81AQ8TBF8 368 aa18.23■□□□□ 0.51
SPNS3-201ENST00000355530 TWIST2Q8WVJ9 160 aa18.23■□□□□ 0.51
SPNS3-201ENST00000355530 EXT2Q93063 718 aa18.23■□□□□ 0.51
SPNS3-201ENST00000355530 OLAHQ9NV23 265 aa18.23■□□□□ 0.51
SPNS3-201ENST00000355530 DDX18Q9NVP1 670 aaKnown RBP18.23■□□□□ 0.51
SPNS3-201ENST00000355530 CRYL1Q9Y2S2 319 aa18.23■□□□□ 0.51
SPNS3-201ENST00000355530 SCN10AQ9Y5Y9 1956 aa18.23■□□□□ 0.51
SPNS3-201ENST00000355530 LOC285095A0A1B0GVY8 99 aa18.23■□□□□ 0.51
SPNS3-201ENST00000355530 OR51F1A6NGY5 319 aa18.23■□□□□ 0.51
SPNS3-201ENST00000355530 H3BSA7 217 aa18.23■□□□□ 0.51
SPNS3-201ENST00000355530 AZIN1O14977 448 aa18.23■□□□□ 0.51
SPNS3-201ENST00000355530 HNRNPRO43390 633 aaKnown RBP18.23■□□□□ 0.51
SPNS3-201ENST00000355530 KPNA6O60684 536 aa18.23■□□□□ 0.51
SPNS3-201ENST00000355530 TRMUO75648 421 aaKnown RBP18.23■□□□□ 0.51
SPNS3-201ENST00000355530 SLC4A1P02730 911 aa18.23■□□□□ 0.51
SPNS3-201ENST00000355530 ZNF37AP17032 561 aaPredicted RBP18.23■□□□□ 0.51
SPNS3-201ENST00000355530 CDH13P55290 713 aa18.23■□□□□ 0.51
SPNS3-201ENST00000355530 IHHQ14623 411 aa18.23■□□□□ 0.51
SPNS3-201ENST00000355530 GEN1Q17RS7 908 aa18.23■□□□□ 0.51
SPNS3-201ENST00000355530 SPATS1Q496A3 300 aa18.23■□□□□ 0.51
SPNS3-201ENST00000355530 INTS11Q5TA45 600 aaKnown RBP18.23■□□□□ 0.51
SPNS3-201ENST00000355530 SPRYD7Q5W111 196 aa18.23■□□□□ 0.51
SPNS3-201ENST00000355530 MRNIPQ6NTE8 343 aa18.23■□□□□ 0.51
SPNS3-201ENST00000355530 NUP93Q8N1F7 819 aa18.23■□□□□ 0.51
SPNS3-201ENST00000355530 GPR150Q8NGU9 434 aa18.23■□□□□ 0.51
SPNS3-201ENST00000355530 RHEBL1Q8TAI7 183 aa18.23■□□□□ 0.51
SPNS3-201ENST00000355530 PSMG2Q969U7 264 aa18.23■□□□□ 0.51
SPNS3-201ENST00000355530 CAAP1Q9H8G2 361 aa18.23■□□□□ 0.51
SPNS3-201ENST00000355530 MID1IP1Q9NPA3 183 aa18.23■□□□□ 0.51
SPNS3-201ENST00000355530 DUS2Q9NX74 493 aaKnown RBP18.23■□□□□ 0.51
SPNS3-201ENST00000355530 PIP5K1BO14986 540 aa18.22■□□□□ 0.51
SPNS3-201ENST00000355530 MATN4O95460 622 aa18.22■□□□□ 0.51
SPNS3-201ENST00000355530 GLP2RO95838 553 aa18.22■□□□□ 0.51
SPNS3-201ENST00000355530 TBX4P57082 545 aa18.22■□□□□ 0.51
SPNS3-201ENST00000355530 MGAT3Q09327 533 aa18.22■□□□□ 0.51
SPNS3-201ENST00000355530 COQ5Q5HYK3 327 aa18.22■□□□□ 0.51
SPNS3-201ENST00000355530 MS4A13Q5J8X5 152 aa18.22■□□□□ 0.51
SPNS3-201ENST00000355530 PITRM1Q5JRX3 1037 aa18.22■□□□□ 0.51
SPNS3-201ENST00000355530 GDF6Q6KF10 455 aaPredicted RBP18.22■□□□□ 0.51
SPNS3-201ENST00000355530 ZNF549Q6P9A3 640 aa18.22■□□□□ 0.51
SPNS3-201ENST00000355530 MON1AQ86VX9 555 aa18.22■□□□□ 0.51
SPNS3-201ENST00000355530 SCN4BQ8IWT1 228 aa18.22■□□□□ 0.51
SPNS3-201ENST00000355530 MFSD2AQ8NA29 543 aa18.22■□□□□ 0.51
SPNS3-201ENST00000355530 ARRDC2Q8TBH0 407 aa18.22■□□□□ 0.51
SPNS3-201ENST00000355530 TRPC4APQ8TEL6 797 aa18.22■□□□□ 0.51
SPNS3-201ENST00000355530 CYP2S1Q96SQ9 504 aa18.22■□□□□ 0.51
SPNS3-201ENST00000355530 MTG1Q9BT17 334 aaPredicted RBP18.22■□□□□ 0.51
SPNS3-201ENST00000355530 CLK4Q9HAZ1 481 aaKnown RBP18.22■□□□□ 0.51
SPNS3-201ENST00000355530 MAP10Q9P2G4 905 aa18.22■□□□□ 0.51
SPNS3-201ENST00000355530 SLC8A2Q9UPR5 921 aa18.22■□□□□ 0.51
SPNS3-201ENST00000355530 SCML2Q9UQR0 700 aa18.22■□□□□ 0.51
SPNS3-201ENST00000355530 DHRS12A0PJE2 317 aa18.22■□□□□ 0.51
SPNS3-201ENST00000355530 SOCS2O14508 198 aa18.22■□□□□ 0.51
SPNS3-201ENST00000355530 CKMT2P17540 419 aa18.22■□□□□ 0.51
SPNS3-201ENST00000355530 PCSK6P29122 969 aa18.22■□□□□ 0.51
SPNS3-201ENST00000355530 CDK9P50750 372 aaKnown RBP18.22■□□□□ 0.51
SPNS3-201ENST00000355530 PRKCQQ04759 706 aa18.22■□□□□ 0.51
SPNS3-201ENST00000355530 YWHAHQ04917 246 aaPredicted RBP18.22■□□□□ 0.51
SPNS3-201ENST00000355530 FOXM1Q08050 763 aa18.22■□□□□ 0.51
SPNS3-201ENST00000355530 TBCELQ5QJ74 424 aa18.22■□□□□ 0.51
SPNS3-201ENST00000355530 FAM219BQ5XKK7 198 aa18.22■□□□□ 0.51
SPNS3-201ENST00000355530 LCN8Q6JVE9 175 aa18.22■□□□□ 0.51
SPNS3-201ENST00000355530 SERINC5Q86VE9 423 aa18.22■□□□□ 0.51
SPNS3-201ENST00000355530 ZNF354CQ86Y25 554 aa18.22■□□□□ 0.51
SPNS3-201ENST00000355530 PHYKPLQ8IUZ5 450 aa18.22■□□□□ 0.51
SPNS3-201ENST00000355530 FIBCD1Q8N539 461 aa18.22■□□□□ 0.51
SPNS3-201ENST00000355530 SH3RF2Q8TEC5 729 aa18.22■□□□□ 0.51
SPNS3-201ENST00000355530 TFAP2CQ92754 450 aa18.22■□□□□ 0.51
SPNS3-201ENST00000355530 GID8Q9NWU2 228 aa18.22■□□□□ 0.51
SPNS3-201ENST00000355530 KCTD3Q9Y597 815 aa18.22■□□□□ 0.51
SPNS3-201ENST00000355530 IGLV3-10A0A075B6K4 115 aa18.21■□□□□ 0.51
SPNS3-201ENST00000355530 MYADML2A6NDP7 307 aa18.21■□□□□ 0.51
SPNS3-201ENST00000355530 CD3EAPO15446 510 aaKnown RBP18.21■□□□□ 0.51
SPNS3-201ENST00000355530 FGF1P05230 155 aa18.21■□□□□ 0.51
SPNS3-201ENST00000355530 ITGB1P05556 798 aa18.21■□□□□ 0.51
SPNS3-201ENST00000355530 CAPN3P20807 821 aa18.21■□□□□ 0.51
SPNS3-201ENST00000355530 PSMA4P25789 261 aaKnown RBP18.21■□□□□ 0.51
SPNS3-201ENST00000355530 HPCAP84074 193 aa18.21■□□□□ 0.51
SPNS3-201ENST00000355530 OR4D1Q15615 310 aa18.21■□□□□ 0.51
SPNS3-201ENST00000355530 KCTD21Q4G0X4 260 aa18.21■□□□□ 0.51
SPNS3-201ENST00000355530 ALFQ53S48 1182 aa18.21■□□□□ 0.51
SPNS3-201ENST00000355530 CAMK1DQ8IU85 385 aa18.21■□□□□ 0.51
SPNS3-201ENST00000355530 DDIASQ8IXT1 998 aa18.21■□□□□ 0.51
SPNS3-201ENST00000355530 RYBPQ8N488 228 aaPredicted RBP18.21■□□□□ 0.51
SPNS3-201ENST00000355530 TBATAQ96M53 351 aa18.21■□□□□ 0.51
SPNS3-201ENST00000355530 ZNF512Q96ME7 567 aaPredicted RBP18.21■□□□□ 0.51
SPNS3-201ENST00000355530 TFB2MQ9H5Q4 396 aaKnown RBP18.21■□□□□ 0.51
SPNS3-201ENST00000355530 SDR39U1Q9NRG7 319 aaPredicted RBP18.21■□□□□ 0.51
SPNS3-201ENST00000355530 IGF2BP1Q9NZI8 577 aaKnown RBP eCLIP18.21■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 23.5 ms