RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000330233.11

CRIP1-201, Transcript of cysteine rich protein 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CRIP1, Length 1,311 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRIP1-201ENST00000330233 IGFALSP35858 605 aa26.73■■□□□ 1.87
CRIP1-201ENST00000330233 HMGCLP35914 325 aa26.73■■□□□ 1.87
CRIP1-201ENST00000330233 ATXN3P54252 364 aaPredicted RBP26.73■■□□□ 1.87
CRIP1-201ENST00000330233 BASP1P80723 227 aaKnown RBP26.73■■□□□ 1.87
CRIP1-201ENST00000330233 DPTQ07507 201 aa26.73■■□□□ 1.87
CRIP1-201ENST00000330233 MTM1Q13496 603 aa26.73■■□□□ 1.87
CRIP1-201ENST00000330233 TRIP13Q15645 432 aaPredicted RBP26.73■■□□□ 1.87
CRIP1-201ENST00000330233 AASDHQ4L235 1098 aaPredicted RBP26.73■■□□□ 1.87
CRIP1-201ENST00000330233 DENND5AQ6IQ26 1287 aa26.73■■□□□ 1.87
CRIP1-201ENST00000330233 ESRP1Q6NXG1 681 aaKnown RBP26.73■■□□□ 1.87
CRIP1-201ENST00000330233 ZNF765Q7L2R6 523 aa26.73■■□□□ 1.87
CRIP1-201ENST00000330233 BLOC1S5Q8TDH9 187 aa26.73■■□□□ 1.87
CRIP1-201ENST00000330233 EIF2B3Q9NR50 452 aaKnown RBP26.73■■□□□ 1.87
CRIP1-201ENST00000330233 NEU2Q9Y3R4 380 aa26.73■■□□□ 1.87
CRIP1-201ENST00000330233 SPO11Q9Y5K1 396 aa26.73■■□□□ 1.87
CRIP1-201ENST00000330233 TMEM131Q92545 1883 aa26.73■■□□□ 1.87
CRIP1-201ENST00000330233 PIEZO1Q92508 2521 aa26.72■■□□□ 1.87
CRIP1-201ENST00000330233 LNP1A1A4G5 178 aa26.72■■□□□ 1.87
CRIP1-201ENST00000330233 GOLGA8CPA6NN73 597 aa26.72■■□□□ 1.87
CRIP1-201ENST00000330233 DFNA5O60443 496 aa26.72■■□□□ 1.87
CRIP1-201ENST00000330233 URI1O94763 535 aaPredicted RBP26.72■■□□□ 1.87
CRIP1-201ENST00000330233 SPINT3P49223 89 aa26.72■■□□□ 1.87
CRIP1-201ENST00000330233 PFN3P60673 137 aa26.72■■□□□ 1.87
CRIP1-201ENST00000330233 CDK16Q00536 496 aa26.72■■□□□ 1.87
CRIP1-201ENST00000330233 GRIK2Q13002 908 aa26.72■■□□□ 1.87
CRIP1-201ENST00000330233 GPS1Q13098 491 aa26.72■■□□□ 1.87
CRIP1-201ENST00000330233 OLIG2Q13516 323 aa26.72■■□□□ 1.87
CRIP1-201ENST00000330233 TUBB2AQ13885 445 aa26.72■■□□□ 1.87
CRIP1-201ENST00000330233 INPP5AQ14642 412 aa26.72■■□□□ 1.87
CRIP1-201ENST00000330233 KIF19Q2TAC6 998 aa26.72■■□□□ 1.87
CRIP1-201ENST00000330233 PNCKQ6P2M8 343 aa26.72■■□□□ 1.87
CRIP1-201ENST00000330233 GLT6D1Q7Z4J2 308 aa26.72■■□□□ 1.87
CRIP1-201ENST00000330233 PTAR1Q7Z6K3 402 aaPredicted RBP26.72■■□□□ 1.87
CRIP1-201ENST00000330233 OR13H1Q8NG92 308 aa26.72■■□□□ 1.87
CRIP1-201ENST00000330233 BRSK1Q8TDC3 778 aa26.72■■□□□ 1.87
CRIP1-201ENST00000330233 TUBB2BQ9BVA1 445 aa26.72■■□□□ 1.87
CRIP1-201ENST00000330233 CDC23Q9UJX2 597 aa26.72■■□□□ 1.87
CRIP1-201ENST00000330233 CABIN1Q9Y6J0 2220 aa26.72■■□□□ 1.87
CRIP1-201ENST00000330233 TDRD6O60522 2096 aaKnown RBP26.71■■□□□ 1.87
CRIP1-201ENST00000330233 PYGLP06737 847 aa26.71■■□□□ 1.87
CRIP1-201ENST00000330233 TSHRP16473 764 aa26.71■■□□□ 1.87
CRIP1-201ENST00000330233 TRIM23P36406 574 aa26.71■■□□□ 1.87
CRIP1-201ENST00000330233 CTSKP43235 329 aa26.71■■□□□ 1.87
CRIP1-201ENST00000330233 NXPH1P58417 271 aa26.71■■□□□ 1.87
CRIP1-201ENST00000330233 PDE1BQ01064 536 aa26.71■■□□□ 1.87
CRIP1-201ENST00000330233 PTK2BQ14289 1009 aa26.71■■□□□ 1.87
CRIP1-201ENST00000330233 PPP1R7Q15435 360 aa26.71■■□□□ 1.87
CRIP1-201ENST00000330233 LAYNQ6UX15 382 aa26.71■■□□□ 1.87
CRIP1-201ENST00000330233 SYDE1Q6ZW31 735 aaPredicted RBP26.71■■□□□ 1.87
CRIP1-201ENST00000330233 KLHL7Q8IXQ5 586 aa26.71■■□□□ 1.87
CRIP1-201ENST00000330233 KIF18AQ8NI77 898 aa26.71■■□□□ 1.87
CRIP1-201ENST00000330233 AP2M1Q96CW1 435 aa26.71■■□□□ 1.87
CRIP1-201ENST00000330233 EID2BQ96D98 161 aa26.71■■□□□ 1.87
CRIP1-201ENST00000330233 ABCG8Q9H221 673 aa26.71■■□□□ 1.87
CRIP1-201ENST00000330233 FAM83DQ9H4H8 585 aa26.71■■□□□ 1.87
CRIP1-201ENST00000330233 ERVMER34-1Q9H9K5 563 aa26.71■■□□□ 1.87
CRIP1-201ENST00000330233 GDF3Q9NR23 364 aa26.71■■□□□ 1.87
CRIP1-201ENST00000330233 SNX11Q9Y5W9 270 aa26.71■■□□□ 1.87
CRIP1-201ENST00000330233 C2orf81A6NN90 581 aa26.7■■□□□ 1.87
CRIP1-201ENST00000330233 AP3B1O00203 1094 aa26.7■■□□□ 1.87
CRIP1-201ENST00000330233 CRTAMO95727 393 aa26.7■■□□□ 1.87
CRIP1-201ENST00000330233 PCCBP05166 539 aa26.7■■□□□ 1.87
CRIP1-201ENST00000330233 TEAD1P28347 426 aa26.7■■□□□ 1.87
CRIP1-201ENST00000330233 BNC1Q01954 994 aa26.7■■□□□ 1.87
CRIP1-201ENST00000330233 CDH17Q12864 832 aa26.7■■□□□ 1.87
CRIP1-201ENST00000330233 TAF1AQ15573 450 aaPredicted RBP26.7■■□□□ 1.87
CRIP1-201ENST00000330233 ZDHHC20Q5W0Z9 365 aa26.7■■□□□ 1.87
CRIP1-201ENST00000330233 PPP1R21Q6ZMI0 780 aa26.7■■□□□ 1.87
CRIP1-201ENST00000330233 KIAA2013Q8IYS2 634 aa26.7■■□□□ 1.87
CRIP1-201ENST00000330233 DNAAF3Q8N9W5 541 aa26.7■■□□□ 1.87
CRIP1-201ENST00000330233 SPATA4Q8NEY3 305 aa26.7■■□□□ 1.87
CRIP1-201ENST00000330233 APOOQ9BUR5 198 aa26.7■■□□□ 1.87
CRIP1-201ENST00000330233 IGF2BP1Q9NZI8 577 aaKnown RBP eCLIP26.7■■□□□ 1.87
CRIP1-201ENST00000330233 DYNC1LI1Q9Y6G9 523 aaKnown RBP26.7■■□□□ 1.87
CRIP1-201ENST00000330233 GVINP1Q7Z2Y8 2422 aa26.7■■□□□ 1.86
CRIP1-201ENST00000330233 LAMA1P25391 3075 aa26.7■■□□□ 1.86
CRIP1-201ENST00000330233 SCN8AQ9UQD0 1980 aa26.69■■□□□ 1.86
CRIP1-201ENST00000330233 AURKAO14965 403 aa26.69■■□□□ 1.86
CRIP1-201ENST00000330233 PPFIA2O75334 1257 aa26.69■■□□□ 1.86
CRIP1-201ENST00000330233 CER1O95813 267 aa26.69■■□□□ 1.86
CRIP1-201ENST00000330233 HOXC4P09017 264 aaPredicted RBP26.69■■□□□ 1.86
CRIP1-201ENST00000330233 VPS41P49754 854 aa26.69■■□□□ 1.86
CRIP1-201ENST00000330233 THOP1P52888 689 aa26.69■■□□□ 1.86
CRIP1-201ENST00000330233 CKAP4Q07065 602 aaKnown RBP26.69■■□□□ 1.86
CRIP1-201ENST00000330233 MSLNQ13421 630 aaPredicted RBP26.69■■□□□ 1.86
CRIP1-201ENST00000330233 HLA-BQ31612 363 aa26.69■■□□□ 1.86
CRIP1-201ENST00000330233 TTC30BQ8N4P2 665 aa26.69■■□□□ 1.86
CRIP1-201ENST00000330233 PLA2G15Q8NCC3 412 aa26.69■■□□□ 1.86
CRIP1-201ENST00000330233 GTPBP2Q9BX10 602 aaKnown RBP26.69■■□□□ 1.86
CRIP1-201ENST00000330233 FSCN3Q9NQT6 498 aa26.69■■□□□ 1.86
CRIP1-201ENST00000330233 GPR27Q9NS67 375 aa26.69■■□□□ 1.86
CRIP1-201ENST00000330233 CD84Q9UIB8 345 aa26.69■■□□□ 1.86
CRIP1-201ENST00000330233 PKP3Q9Y446 797 aa26.69■■□□□ 1.86
CRIP1-201ENST00000330233 TPSB2P20231 275 aa26.68■■□□□ 1.86
CRIP1-201ENST00000330233 LPOP22079 712 aaPredicted RBP26.68■■□□□ 1.86
CRIP1-201ENST00000330233 SARNPP82979 210 aaKnown RBP26.68■■□□□ 1.86
CRIP1-201ENST00000330233 DR1Q01658 176 aa26.68■■□□□ 1.86
CRIP1-201ENST00000330233 DHX34Q14147 1143 aaKnown RBP26.68■■□□□ 1.86
CRIP1-201ENST00000330233 TPSAB1Q15661 275 aa26.68■■□□□ 1.86
CRIP1-201ENST00000330233 RFLNAQ6ZTI6 216 aa26.68■■□□□ 1.86
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 19.7 ms