RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000326427.10

ITM2C-202, Transcript of integral membrane protein 2C, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene ITM2C, Length 2,078 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITM2C-202ENST00000326427 INPPL1O15357 1258 aa21.99■■□□□ 1.11
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ITM2C-202ENST00000326427 PITRM1Q5JRX3 1037 aa21.96■■□□□ 1.11
ITM2C-202ENST00000326427 ZNF354CQ86Y25 554 aa21.96■■□□□ 1.11
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