RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000312233.4

GLIS1-201, Transcript of GLIS family zinc finger 1, humanhuman

APPRIS P2 TSL 2 BASIC

Gene GLIS1, Length 2,812 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GLIS1-201ENST00000312233 NODALQ96S42 347 aa17.46■□□□□ 0.39
GLIS1-201ENST00000312233 FTHL17Q9BXU8 183 aa17.46■□□□□ 0.39
GLIS1-201ENST00000312233 LDHAL6BQ9BYZ2 381 aaPredicted RBP17.46■□□□□ 0.39
GLIS1-201ENST00000312233 ZNF556Q9HAH1 456 aa17.46■□□□□ 0.39
GLIS1-201ENST00000312233 IARS2Q9NSE4 1012 aaKnown RBP17.46■□□□□ 0.39
GLIS1-201ENST00000312233 INTS10Q9NVR2 710 aaKnown RBP17.46■□□□□ 0.39
GLIS1-201ENST00000312233 ZNF639Q9UID6 485 aa17.46■□□□□ 0.39
GLIS1-201ENST00000312233 PNMA8BQ9ULN7 279 aaPredicted RBP17.46■□□□□ 0.39
GLIS1-201ENST00000312233 HMX3A6NHT5 357 aa17.46■□□□□ 0.39
GLIS1-201ENST00000312233 KPNA7A9QM74 516 aa17.46■□□□□ 0.39
GLIS1-201ENST00000312233 CAPN5O15484 640 aaPredicted RBP17.46■□□□□ 0.39
GLIS1-201ENST00000312233 KDELR1P24390 212 aa17.46■□□□□ 0.39
GLIS1-201ENST00000312233 ACVR2AP27037 513 aa17.46■□□□□ 0.39
GLIS1-201ENST00000312233 ATICP31939 592 aa17.46■□□□□ 0.39
GLIS1-201ENST00000312233 TGFBR1P36897 503 aa17.46■□□□□ 0.39
GLIS1-201ENST00000312233 ST13P50502 369 aaKnown RBP17.46■□□□□ 0.39
GLIS1-201ENST00000312233 MGAT3Q09327 533 aa17.46■□□□□ 0.39
GLIS1-201ENST00000312233 LILRB2Q8N423 598 aa17.46■□□□□ 0.39
GLIS1-201ENST00000312233 PARP16Q8N5Y8 322 aa17.46■□□□□ 0.39
GLIS1-201ENST00000312233 ZFAND1Q8TCF1 268 aa17.46■□□□□ 0.39
GLIS1-201ENST00000312233 CRYGNQ8WXF5 182 aa17.46■□□□□ 0.39
GLIS1-201ENST00000312233 GAD1Q99259 594 aa17.46■□□□□ 0.39
GLIS1-201ENST00000312233 TOR3AQ9H497 397 aa17.46■□□□□ 0.39
GLIS1-201ENST00000312233 SNX15Q9NRS6 342 aa17.46■□□□□ 0.39
GLIS1-201ENST00000312233 DTLQ9NZJ0 730 aa17.46■□□□□ 0.39
GLIS1-201ENST00000312233 EGFL7Q9UHF1 273 aa17.46■□□□□ 0.39
GLIS1-201ENST00000312233 NAALAD2Q9Y3Q0 740 aa17.46■□□□□ 0.39
GLIS1-201ENST00000312233 PSAT1Q9Y617 370 aa17.46■□□□□ 0.39
GLIS1-201ENST00000312233 MSH4O15457 936 aa17.45■□□□□ 0.38
GLIS1-201ENST00000312233 SRP72O76094 671 aaKnown RBP17.45■□□□□ 0.38
GLIS1-201ENST00000312233 CYP2A6P11509 494 aaPredicted RBP17.45■□□□□ 0.38
GLIS1-201ENST00000312233 EVI2BP34910 448 aa17.45■□□□□ 0.38
GLIS1-201ENST00000312233 CDK8P49336 464 aa17.45■□□□□ 0.38
GLIS1-201ENST00000312233 EMX1Q04741 257 aaPredicted RBP17.45■□□□□ 0.38
GLIS1-201ENST00000312233 AP3B2Q13367 1082 aa17.45■□□□□ 0.38
GLIS1-201ENST00000312233 MEP1AQ16819 746 aa17.45■□□□□ 0.38
GLIS1-201ENST00000312233 ARL13AQ5H913 290 aaPredicted RBP17.45■□□□□ 0.38
GLIS1-201ENST00000312233 STYK1Q6J9G0 422 aa17.45■□□□□ 0.38
GLIS1-201ENST00000312233 TXNRD3Q86VQ6 643 aa17.45■□□□□ 0.38
GLIS1-201ENST00000312233 RFX6Q8HWS3 928 aa17.45■□□□□ 0.38
GLIS1-201ENST00000312233 DAW1Q8N136 415 aa17.45■□□□□ 0.38
GLIS1-201ENST00000312233 PPP1R13LQ8WUF5 828 aa17.45■□□□□ 0.38
GLIS1-201ENST00000312233 USB1Q9BQ65 265 aaKnown RBP17.45■□□□□ 0.38
GLIS1-201ENST00000312233 LPIN3Q9BQK8 851 aa17.45■□□□□ 0.38
GLIS1-201ENST00000312233 KIFC1Q9BW19 673 aa17.45■□□□□ 0.38
GLIS1-201ENST00000312233 UCK2Q9BZX2 261 aa17.45■□□□□ 0.38
GLIS1-201ENST00000312233 POLR3BQ9NW08 1133 aaPredicted RBP17.45■□□□□ 0.38
GLIS1-201ENST00000312233 SLC9A2Q9UBY0 812 aa17.45■□□□□ 0.38
GLIS1-201ENST00000312233 VTI1BQ9UEU0 232 aa17.45■□□□□ 0.38
GLIS1-201ENST00000312233 SNX7Q9UNH6 387 aa17.45■□□□□ 0.38
GLIS1-201ENST00000312233 DIMT1Q9UNQ2 313 aaKnown RBP17.45■□□□□ 0.38
GLIS1-201ENST00000312233 GRIP1Q9Y3R0 1128 aa17.45■□□□□ 0.38
GLIS1-201ENST00000312233 MRASO14807 208 aa17.45■□□□□ 0.38
GLIS1-201ENST00000312233 FCGR1AP12314 374 aa17.45■□□□□ 0.38
GLIS1-201ENST00000312233 MAGEA3P43357 314 aa17.45■□□□□ 0.38
GLIS1-201ENST00000312233 PIGHQ14442 188 aaPredicted RBP17.45■□□□□ 0.38
GLIS1-201ENST00000312233 ZNF484Q5JVG2 852 aa17.45■□□□□ 0.38
GLIS1-201ENST00000312233 GRTP1Q5TC63 336 aa17.45■□□□□ 0.38
GLIS1-201ENST00000312233 NPNTQ6UXI9 565 aa17.45■□□□□ 0.38
GLIS1-201ENST00000312233 PLEKHM3Q6ZWE6 761 aa17.45■□□□□ 0.38
GLIS1-201ENST00000312233 C8orf59Q8N0T1 100 aaPredicted RBP17.45■□□□□ 0.38
GLIS1-201ENST00000312233 CCDC90BQ9GZT6 254 aa17.45■□□□□ 0.38
GLIS1-201ENST00000312233 MMP27Q9H306 513 aa17.45■□□□□ 0.38
GLIS1-201ENST00000312233 SMOC2Q9H3U7 446 aa17.45■□□□□ 0.38
GLIS1-201ENST00000312233 PAK5Q9P286 719 aa17.45■□□□□ 0.38
GLIS1-201ENST00000312233 IPPQ9Y573 584 aa17.45■□□□□ 0.38
GLIS1-201ENST00000312233 TTC24A2A3L6 582 aaPredicted RBP17.44■□□□□ 0.38
GLIS1-201ENST00000312233 ATG13O75143 517 aa17.44■□□□□ 0.38
GLIS1-201ENST00000312233 ZNF543Q08ER8 600 aa17.44■□□□□ 0.38
GLIS1-201ENST00000312233 ZNF404Q494X3 552 aa17.44■□□□□ 0.38
GLIS1-201ENST00000312233 OTUD3Q5T2D3 398 aaPredicted RBP17.44■□□□□ 0.38
GLIS1-201ENST00000312233 FAM45BPQ6NSW5 357 aa17.44■□□□□ 0.38
GLIS1-201ENST00000312233 TMEM65Q6PI78 240 aa17.44■□□□□ 0.38
GLIS1-201ENST00000312233 ZNF767PQ75MW2 155 aa17.44■□□□□ 0.38
GLIS1-201ENST00000312233 CMC1Q7Z7K0 106 aa17.44■□□□□ 0.38
GLIS1-201ENST00000312233 METTL3Q86U44 580 aaKnown RBP17.44■□□□□ 0.38
GLIS1-201ENST00000312233 PLD3Q8IV08 490 aa17.44■□□□□ 0.38
GLIS1-201ENST00000312233 FAM45AQ8TCE6 357 aa17.44■□□□□ 0.38
GLIS1-201ENST00000312233 BCL7CQ8WUZ0 217 aaPredicted RBP17.44■□□□□ 0.38
GLIS1-201ENST00000312233 LGALS12Q96DT0 336 aa17.44■□□□□ 0.38
GLIS1-201ENST00000312233 P2RX7Q99572 595 aaKnown RBP17.44■□□□□ 0.38
GLIS1-201ENST00000312233 MTMR10Q9NXD2 777 aa17.44■□□□□ 0.38
GLIS1-201ENST00000312233 SNX6Q9UNH7 406 aa17.44■□□□□ 0.38
GLIS1-201ENST00000312233 MAN2B2Q9Y2E5 1009 aa17.44■□□□□ 0.38
GLIS1-201ENST00000312233 IRS2Q9Y4H2 1338 aa17.44■□□□□ 0.38
GLIS1-201ENST00000312233 PTGES3LE9PB15 166 aa17.44■□□□□ 0.38
GLIS1-201ENST00000312233 HOXB1P14653 301 aaPredicted RBP17.44■□□□□ 0.38
GLIS1-201ENST00000312233 NPR1P16066 1061 aa17.44■□□□□ 0.38
GLIS1-201ENST00000312233 LRPAP1P30533 357 aa17.44■□□□□ 0.38
GLIS1-201ENST00000312233 KRT20P35900 424 aa17.44■□□□□ 0.38
GLIS1-201ENST00000312233 LIG4P49917 911 aa17.44■□□□□ 0.38
GLIS1-201ENST00000312233 SLC25A11Q02978 314 aaKnown RBP17.44■□□□□ 0.38
GLIS1-201ENST00000312233 SNRNP35Q16560 246 aaKnown RBP17.44■□□□□ 0.38
GLIS1-201ENST00000312233 ARHGEF16Q5VV41 709 aa17.44■□□□□ 0.38
GLIS1-201ENST00000312233 TAF2Q6P1X5 1199 aa17.44■□□□□ 0.38
GLIS1-201ENST00000312233 ZNF517Q6ZMY9 492 aaPredicted RBP17.44■□□□□ 0.38
GLIS1-201ENST00000312233 ZNF534Q76KX8 674 aa17.44■□□□□ 0.38
GLIS1-201ENST00000312233 ZBTB33Q86T24 672 aa17.44■□□□□ 0.38
GLIS1-201ENST00000312233 FBXO11Q86XK2 927 aa17.44■□□□□ 0.38
GLIS1-201ENST00000312233 ERO1BQ86YB8 467 aa17.44■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 35.1 ms