RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000299259.10

COPS2-201, Transcript of COP9 signalosome subunit 2, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene COPS2, Length 2,036 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COPS2-201ENST00000299259 ZSWIM9Q86XI8 627 aa10.5□□□□□ -0.73
COPS2-201ENST00000299259 CYB5D2Q8WUJ1 264 aa10.5□□□□□ -0.73
COPS2-201ENST00000299259 SREK1Q8WXA9 508 aaKnown RBP10.5□□□□□ -0.73
COPS2-201ENST00000299259 ECHDC3Q96DC8 303 aa10.5□□□□□ -0.73
COPS2-201ENST00000299259 ZFYVE19Q96K21 471 aa10.5□□□□□ -0.73
COPS2-201ENST00000299259 TCF12Q99081 682 aa10.5□□□□□ -0.73
COPS2-201ENST00000299259 TRIM55Q9BYV6 548 aa10.5□□□□□ -0.73
COPS2-201ENST00000299259 EBF3Q9H4W6 596 aa10.5□□□□□ -0.73
COPS2-201ENST00000299259 GPAMQ9HCL2 828 aa10.5□□□□□ -0.73
COPS2-201ENST00000299259 BPIFA1Q9NP55 256 aa10.5□□□□□ -0.73
COPS2-201ENST00000299259 IL17CQ9P0M4 197 aa10.5□□□□□ -0.73
COPS2-201ENST00000299259 XPR1Q9UBH6 696 aa10.5□□□□□ -0.73
COPS2-201ENST00000299259 FBXO10Q9UK96 956 aa10.5□□□□□ -0.73
COPS2-201ENST00000299259 SLC8A2Q9UPR5 921 aa10.5□□□□□ -0.73
COPS2-201ENST00000299259 VWA7Q9Y334 891 aa10.5□□□□□ -0.73
COPS2-201ENST00000299259 PLXNA2O75051 1894 aa10.49□□□□□ -0.73
COPS2-201ENST00000299259 PIKFYVEQ9Y2I7 2098 aa10.49□□□□□ -0.73
COPS2-201ENST00000299259 A0A0U1RQS6 177 aa10.49□□□□□ -0.73
COPS2-201ENST00000299259 UBA6A0AVT1 1052 aaPredicted RBP10.49□□□□□ -0.73
COPS2-201ENST00000299259 PFDN6O15212 129 aa10.49□□□□□ -0.73
COPS2-201ENST00000299259 DNAJC6O75061 913 aa10.49□□□□□ -0.73
COPS2-201ENST00000299259 SNNO75324 88 aaPredicted RBP10.49□□□□□ -0.73
COPS2-201ENST00000299259 TULP3O75386 442 aa10.49□□□□□ -0.73
COPS2-201ENST00000299259 NDUFS3O75489 264 aa10.49□□□□□ -0.73
COPS2-201ENST00000299259 KLHL2O95198 593 aa10.49□□□□□ -0.73
COPS2-201ENST00000299259 ASLP04424 464 aa10.49□□□□□ -0.73
COPS2-201ENST00000299259 UGT2B4P06133 528 aa10.49□□□□□ -0.73
COPS2-201ENST00000299259 MYL2P10916 166 aa10.49□□□□□ -0.73
COPS2-201ENST00000299259 FDXRP22570 491 aa10.49□□□□□ -0.73
COPS2-201ENST00000299259 GRK2P25098 689 aa10.49□□□□□ -0.73
COPS2-201ENST00000299259 TTPAP49638 278 aa10.49□□□□□ -0.73
COPS2-201ENST00000299259 CDKN2DP55273 166 aa10.49□□□□□ -0.73
COPS2-201ENST00000299259 OCRLQ01968 901 aa10.49□□□□□ -0.73
COPS2-201ENST00000299259 STX3Q13277 289 aa10.49□□□□□ -0.73
COPS2-201ENST00000299259 ZRANB3Q5FWF4 1079 aa10.49□□□□□ -0.73
COPS2-201ENST00000299259 PSAPL1Q6NUJ1 521 aa10.49□□□□□ -0.73
COPS2-201ENST00000299259 ZNF549Q6P9A3 640 aa10.49□□□□□ -0.73
COPS2-201ENST00000299259 CCDC121Q6ZUS5 278 aa10.49□□□□□ -0.73
COPS2-201ENST00000299259 USP45Q70EL2 814 aa10.49□□□□□ -0.73
COPS2-201ENST00000299259 TRPM8Q7Z2W7 1104 aa10.49□□□□□ -0.73
COPS2-201ENST00000299259 PIM3Q86V86 326 aa10.49□□□□□ -0.73
COPS2-201ENST00000299259 ETFBKMTQ8IXQ9 262 aa10.49□□□□□ -0.73
COPS2-201ENST00000299259 GRIN3AQ8TCU5 1115 aa10.49□□□□□ -0.73
COPS2-201ENST00000299259 C10orf82Q8WW14 230 aa10.49□□□□□ -0.73
COPS2-201ENST00000299259 SORCS1Q8WY21 1168 aa10.49□□□□□ -0.73
COPS2-201ENST00000299259 MYLIPQ8WY64 445 aa10.49□□□□□ -0.73
COPS2-201ENST00000299259 LPGAT1Q92604 370 aa10.49□□□□□ -0.73
COPS2-201ENST00000299259 VOPP1Q96AW1 172 aa10.49□□□□□ -0.73
COPS2-201ENST00000299259 MRGPRX3Q96LB0 322 aa10.49□□□□□ -0.73
COPS2-201ENST00000299259 RMDN2Q96LZ7 410 aa10.49□□□□□ -0.73
COPS2-201ENST00000299259 ZNF641Q96N77 438 aaPredicted RBP10.49□□□□□ -0.73
COPS2-201ENST00000299259 C19orf43Q9BQ61 176 aa10.49□□□□□ -0.73
COPS2-201ENST00000299259 SUV39H2Q9H5I1 410 aa10.49□□□□□ -0.73
COPS2-201ENST00000299259 TRPV4Q9HBA0 871 aa10.49□□□□□ -0.73
COPS2-201ENST00000299259 ZFYVE1Q9HBF4 777 aa10.49□□□□□ -0.73
COPS2-201ENST00000299259 THG1LQ9NWX6 298 aaKnown RBP10.49□□□□□ -0.73
COPS2-201ENST00000299259 CPSF2Q9P2I0 782 aaKnown RBP10.49□□□□□ -0.73
COPS2-201ENST00000299259 CDH7Q9ULB5 785 aa10.49□□□□□ -0.73
COPS2-201ENST00000299259 RUVBL2Q9Y230 463 aaKnown RBP10.49□□□□□ -0.73
COPS2-201ENST00000299259 SLC27A6Q9Y2P4 619 aa10.49□□□□□ -0.73
COPS2-201ENST00000299259 A0A1W2PQ67 120 aa10.48□□□□□ -0.73
COPS2-201ENST00000299259 NPIPB15A6NHN6 443 aaPredicted RBP10.48□□□□□ -0.73
COPS2-201ENST00000299259 CCT8L1PA6NM43 557 aa10.48□□□□□ -0.73
COPS2-201ENST00000299259 WASH3PC4AMC7 463 aa10.48□□□□□ -0.73
COPS2-201ENST00000299259 G3V2L1 256 aa10.48□□□□□ -0.73
COPS2-201ENST00000299259 TGDSO95455 350 aa10.48□□□□□ -0.73
COPS2-201ENST00000299259 ATP5BP06576 529 aaKnown RBP10.48□□□□□ -0.73
COPS2-201ENST00000299259 SRPRAP08240 638 aaKnown RBP10.48□□□□□ -0.73
COPS2-201ENST00000299259 DLDP09622 509 aaKnown RBP10.48□□□□□ -0.73
COPS2-201ENST00000299259 CISD3P0C7P0 127 aa10.48□□□□□ -0.73
COPS2-201ENST00000299259 RALBP11234 206 aa10.48□□□□□ -0.73
COPS2-201ENST00000299259 HNF1BP35680 557 aa10.48□□□□□ -0.73
COPS2-201ENST00000299259 DLG1Q12959 904 aa10.48□□□□□ -0.73
COPS2-201ENST00000299259 PEX6Q13608 980 aa10.48□□□□□ -0.73
COPS2-201ENST00000299259 ITGA9Q13797 1035 aa10.48□□□□□ -0.73
COPS2-201ENST00000299259 CSHL1Q14406 222 aa10.48□□□□□ -0.73
COPS2-201ENST00000299259 PDGFRLQ15198 375 aa10.48□□□□□ -0.73
COPS2-201ENST00000299259 FAM83EQ2M2I3 478 aa10.48□□□□□ -0.73
COPS2-201ENST00000299259 ZYG11AQ6WRX3 759 aa10.48□□□□□ -0.73
COPS2-201ENST00000299259 PLPP6Q8IY26 295 aa10.48□□□□□ -0.73
COPS2-201ENST00000299259 TDHQ8IZJ6 230 aa10.48□□□□□ -0.73
COPS2-201ENST00000299259 FSTL5Q8N475 847 aaPredicted RBP10.48□□□□□ -0.73
COPS2-201ENST00000299259 CHST14Q8NCH0 376 aa10.48□□□□□ -0.73
COPS2-201ENST00000299259 OR2A12Q8NGT7 310 aa10.48□□□□□ -0.73
COPS2-201ENST00000299259 ZNF398Q8TD17 642 aa10.48□□□□□ -0.73
COPS2-201ENST00000299259 CCT6BQ92526 530 aa10.48□□□□□ -0.73
COPS2-201ENST00000299259 TBRG4Q969Z0 631 aaKnown RBP eCLIP10.48□□□□□ -0.73
COPS2-201ENST00000299259 NXNL1Q96CM4 212 aa10.48□□□□□ -0.73
COPS2-201ENST00000299259 EID2BQ96D98 161 aa10.48□□□□□ -0.73
COPS2-201ENST00000299259 LYSMD1Q96S90 227 aa10.48□□□□□ -0.73
COPS2-201ENST00000299259 AARSD1Q9BTE6 412 aaKnown RBP10.48□□□□□ -0.73
COPS2-201ENST00000299259 CCDC68Q9H2F9 335 aa10.48□□□□□ -0.73
COPS2-201ENST00000299259 MRPL46Q9H2W6 279 aaKnown RBP10.48□□□□□ -0.73
COPS2-201ENST00000299259 POPDC3Q9HBV1 291 aa10.48□□□□□ -0.73
COPS2-201ENST00000299259 ABCF3Q9NUQ8 709 aa10.48□□□□□ -0.73
COPS2-201ENST00000299259 THAP1Q9NVV9 213 aa10.48□□□□□ -0.73
COPS2-201ENST00000299259 SLC30A1Q9Y6M5 507 aa10.48□□□□□ -0.73
COPS2-201ENST00000299259 USH1CQ9Y6N9 552 aa10.48□□□□□ -0.73
COPS2-201ENST00000299259 C5orf42Q9H799 3197 aa10.48□□□□□ -0.73
COPS2-201ENST00000299259 TTC34A8MYJ7 566 aa10.48□□□□□ -0.73
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 17.7 ms