RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000261333.10

ZNF397-201, Transcript of zinc finger protein 397, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene ZNF397, Length 1,419 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF397-201ENST00000261333 GSDMDP57764 484 aa15.98■□□□□ 0.15
ZNF397-201ENST00000261333 KIAA1024LP59773 190 aa15.98■□□□□ 0.15
ZNF397-201ENST00000261333 SRP54P61011 504 aaKnown RBP15.98■□□□□ 0.15
ZNF397-201ENST00000261333 PTSQ03393 145 aa15.98■□□□□ 0.15
ZNF397-201ENST00000261333 NOMO1Q15155 1222 aa15.98■□□□□ 0.15
ZNF397-201ENST00000261333 TEX44Q53QW1 395 aa15.98■□□□□ 0.15
ZNF397-201ENST00000261333 HS1BP3Q53T59 392 aa15.98■□□□□ 0.15
ZNF397-201ENST00000261333 PEX26Q7Z412 305 aa15.98■□□□□ 0.15
ZNF397-201ENST00000261333 CBARPQ8N350 705 aaPredicted RBP15.98■□□□□ 0.15
ZNF397-201ENST00000261333 PTCD2Q8WV60 388 aaKnown RBP15.98■□□□□ 0.15
ZNF397-201ENST00000261333 GATA6Q92908 595 aa15.98■□□□□ 0.15
ZNF397-201ENST00000261333 SCAMP4Q969E2 229 aa15.98■□□□□ 0.15
ZNF397-201ENST00000261333 OSBPL8Q9BZF1 889 aa15.98■□□□□ 0.15
ZNF397-201ENST00000261333 SLC25A51Q9H1U9 297 aa15.98■□□□□ 0.15
ZNF397-201ENST00000261333 KLHL8Q9P2G9 620 aaPredicted RBP15.98■□□□□ 0.15
ZNF397-201ENST00000261333 SPASTQ9UBP0 616 aa15.98■□□□□ 0.15
ZNF397-201ENST00000261333 MOSPD1Q9UJG1 213 aa15.98■□□□□ 0.15
ZNF397-201ENST00000261333 AMFRQ9UKV5 643 aa15.98■□□□□ 0.15
ZNF397-201ENST00000261333 ADGRG1Q9Y653 693 aa15.98■□□□□ 0.15
ZNF397-201ENST00000261333 COL27A1Q8IZC6 1860 aaPredicted RBP15.98■□□□□ 0.15
ZNF397-201ENST00000261333 C1orf232A0A0U1RR37 186 aa15.97■□□□□ 0.15
ZNF397-201ENST00000261333 NEMP2A6NFY4 417 aa15.97■□□□□ 0.15
ZNF397-201ENST00000261333 H7C0C1 242 aa15.97■□□□□ 0.15
ZNF397-201ENST00000261333 APOC4-APOC2K7ER74 178 aa15.97■□□□□ 0.15
ZNF397-201ENST00000261333 TOR1BO14657 336 aa15.97■□□□□ 0.15
ZNF397-201ENST00000261333 PMPCBO75439 489 aa15.97■□□□□ 0.15
ZNF397-201ENST00000261333 SOD1P00441 154 aa15.97■□□□□ 0.15
ZNF397-201ENST00000261333 APOC2P02655 101 aa15.97■□□□□ 0.15
ZNF397-201ENST00000261333 ATP5OP48047 213 aa15.97■□□□□ 0.15
ZNF397-201ENST00000261333 KNTC1P50748 2209 aa15.97■□□□□ 0.15
ZNF397-201ENST00000261333 STC1P52823 247 aa15.97■□□□□ 0.15
ZNF397-201ENST00000261333 OTUD4Q01804 1114 aaKnown RBP15.97■□□□□ 0.15
ZNF397-201ENST00000261333 BZW1Q7L1Q6 419 aaKnown RBP15.97■□□□□ 0.15
ZNF397-201ENST00000261333 TECPR1Q7Z6L1 1165 aa15.97■□□□□ 0.15
ZNF397-201ENST00000261333 TRIM74Q86UV6 250 aa15.97■□□□□ 0.15
ZNF397-201ENST00000261333 ZNF567Q8N184 647 aa15.97■□□□□ 0.15
ZNF397-201ENST00000261333 ACTL9Q8TC94 416 aa15.97■□□□□ 0.15
ZNF397-201ENST00000261333 BTN2A2Q8WVV5 523 aa15.97■□□□□ 0.15
ZNF397-201ENST00000261333 TEKT5Q96M29 485 aa15.97■□□□□ 0.15
ZNF397-201ENST00000261333 TRIB3Q96RU7 358 aa15.97■□□□□ 0.15
ZNF397-201ENST00000261333 AGAP2Q99490 1192 aa15.97■□□□□ 0.15
ZNF397-201ENST00000261333 ABCG8Q9H221 673 aa15.97■□□□□ 0.15
ZNF397-201ENST00000261333 MSRB2Q9Y3D2 182 aa15.97■□□□□ 0.15
ZNF397-201ENST00000261333 PSMD11O00231 422 aa15.96■□□□□ 0.15
ZNF397-201ENST00000261333 CASC3O15234 703 aaKnown RBP15.96■□□□□ 0.15
ZNF397-201ENST00000261333 DDX3YO15523 660 aaKnown RBP15.96■□□□□ 0.15
ZNF397-201ENST00000261333 RASGRP1O95267 797 aa15.96■□□□□ 0.15
ZNF397-201ENST00000261333 RBL1P28749 1068 aa15.96■□□□□ 0.15
ZNF397-201ENST00000261333 TRIM23P36406 574 aa15.96■□□□□ 0.15
ZNF397-201ENST00000261333 COPS2P61201 443 aa15.96■□□□□ 0.15
ZNF397-201ENST00000261333 CDK3Q00526 305 aa15.96■□□□□ 0.15
ZNF397-201ENST00000261333 CDKN3Q16667 212 aa15.96■□□□□ 0.15
ZNF397-201ENST00000261333 DOK6Q6PKX4 331 aa15.96■□□□□ 0.15
ZNF397-201ENST00000261333 LYSMD3Q7Z3D4 306 aa15.96■□□□□ 0.15
ZNF397-201ENST00000261333 NDUFAF2Q8N183 169 aa15.96■□□□□ 0.15
ZNF397-201ENST00000261333 OR56A4Q8NGH8 313 aa15.96■□□□□ 0.15
ZNF397-201ENST00000261333 HTR3CQ8WXA8 447 aa15.96■□□□□ 0.15
ZNF397-201ENST00000261333 TADA1Q96BN2 335 aa15.96■□□□□ 0.15
ZNF397-201ENST00000261333 AP2M1Q96CW1 435 aa15.96■□□□□ 0.15
ZNF397-201ENST00000261333 CALR3Q96L12 384 aaKnown RBP15.96■□□□□ 0.15
ZNF397-201ENST00000261333 CYP4F12Q9HCS2 524 aa15.96■□□□□ 0.15
ZNF397-201ENST00000261333 SIRPGQ9P1W8 387 aa15.96■□□□□ 0.15
ZNF397-201ENST00000261333 GUCA1BQ9UMX6 200 aa15.96■□□□□ 0.15
ZNF397-201ENST00000261333 SHOC2Q9UQ13 582 aa15.96■□□□□ 0.15
ZNF397-201ENST00000261333 PCDHGA1Q9Y5H4 931 aa15.96■□□□□ 0.15
ZNF397-201ENST00000261333 ANKRD66B4E2M5 251 aa15.95■□□□□ 0.14
ZNF397-201ENST00000261333 LMO7DNF2Z398 122 aa15.95■□□□□ 0.14
ZNF397-201ENST00000261333 YY2O15391 372 aa15.95■□□□□ 0.14
ZNF397-201ENST00000261333 MYCLP1P12525 358 aaPredicted RBP15.95■□□□□ 0.14
ZNF397-201ENST00000261333 CTSEP14091 401 aa15.95■□□□□ 0.14
ZNF397-201ENST00000261333 ZNF30P17039 623 aa15.95■□□□□ 0.14
ZNF397-201ENST00000261333 ACP1P24666 158 aa15.95■□□□□ 0.14
ZNF397-201ENST00000261333 PTPN7P35236 360 aa15.95■□□□□ 0.14
ZNF397-201ENST00000261333 GPR1P46091 355 aa15.95■□□□□ 0.14
ZNF397-201ENST00000261333 POLD2P49005 469 aa15.95■□□□□ 0.14
ZNF397-201ENST00000261333 RPL26P61254 145 aaKnown RBP15.95■□□□□ 0.14
ZNF397-201ENST00000261333 SMAD1Q15797 465 aaKnown RBP15.95■□□□□ 0.14
ZNF397-201ENST00000261333 HES3Q5TGS1 186 aa15.95■□□□□ 0.14
ZNF397-201ENST00000261333 ZCCHC8Q6NZY4 707 aaKnown RBP15.95■□□□□ 0.14
ZNF397-201ENST00000261333 GUSBP11Q6P575 273 aa15.95■□□□□ 0.14
ZNF397-201ENST00000261333 TMPRSS7Q7RTY8 843 aa15.95■□□□□ 0.14
ZNF397-201ENST00000261333 SLC35F3Q8IY50 421 aa15.95■□□□□ 0.14
ZNF397-201ENST00000261333 CCL4L1Q8NHW4 92 aa15.95■□□□□ 0.14
ZNF397-201ENST00000261333 OXNAD1Q96HP4 312 aaPredicted RBP15.95■□□□□ 0.14
ZNF397-201ENST00000261333 MLPHQ9BV36 600 aaPredicted RBP15.95■□□□□ 0.14
ZNF397-201ENST00000261333 DUSP23Q9BVJ7 150 aa15.95■□□□□ 0.14
ZNF397-201ENST00000261333 RPL26L1Q9UNX3 145 aaKnown RBP15.95■□□□□ 0.14
ZNF397-201ENST00000261333 CSNK1G3Q9Y6M4 447 aa15.95■□□□□ 0.14
ZNF397-201ENST00000261333 KMT2BQ9UMN6 2715 aaPredicted RBP15.95■□□□□ 0.14
ZNF397-201ENST00000261333 CACNA1BQ00975 2339 aa15.95■□□□□ 0.14
ZNF397-201ENST00000261333 PRSS38A1L453 326 aa15.94■□□□□ 0.14
ZNF397-201ENST00000261333 INPP4BO15327 924 aa15.94■□□□□ 0.14
ZNF397-201ENST00000261333 ANXA6P08133 673 aa15.94■□□□□ 0.14
ZNF397-201ENST00000261333 CKMT1AP12532 417 aa15.94■□□□□ 0.14
ZNF397-201ENST00000261333 BLKP51451 505 aa15.94■□□□□ 0.14
ZNF397-201ENST00000261333 EIF3EP60228 445 aaKnown RBP15.94■□□□□ 0.14
ZNF397-201ENST00000261333 CDK18Q07002 472 aa15.94■□□□□ 0.14
ZNF397-201ENST00000261333 C6orf132Q5T0Z8 1188 aa15.94■□□□□ 0.14
ZNF397-201ENST00000261333 CCNI2Q6ZMN8 369 aaPredicted RBP15.94■□□□□ 0.14
ZNF397-201ENST00000261333 SFTPA2Q8IWL1 248 aa15.94■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 38 ms