RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000232496.4

TUSC2-201, Transcript of tumor suppressor 2, mitochondrial calcium regulator, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene TUSC2, Length 1,691 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUSC2-201ENST00000232496 CALCOCO2Q13137 446 aa20.51■□□□□ 0.87
TUSC2-201ENST00000232496 SIM2Q14190 667 aaPredicted RBP20.51■□□□□ 0.87
TUSC2-201ENST00000232496 POU6F1Q14863 301 aa20.51■□□□□ 0.87
TUSC2-201ENST00000232496 ACOX1Q15067 660 aa20.51■□□□□ 0.87
TUSC2-201ENST00000232496 SETMARQ53H47 684 aaPredicted RBP20.51■□□□□ 0.87
TUSC2-201ENST00000232496 CEP68Q76N32 757 aa20.51■□□□□ 0.87
TUSC2-201ENST00000232496 CYP2U1Q7Z449 544 aa20.51■□□□□ 0.87
TUSC2-201ENST00000232496 DNASE2BQ8WZ79 361 aa20.51■□□□□ 0.87
TUSC2-201ENST00000232496 FRMD8Q9BZ67 464 aaPredicted RBP20.51■□□□□ 0.87
TUSC2-201ENST00000232496 IRF2BPLQ9H1B7 796 aa20.51■□□□□ 0.87
TUSC2-201ENST00000232496 IGF2BP1Q9NZI8 577 aaKnown RBP eCLIP20.51■□□□□ 0.87
TUSC2-201ENST00000232496 ARL5AQ9Y689 179 aa20.51■□□□□ 0.87
TUSC2-201ENST00000232496 LZTS3O60299 673 aaPredicted RBP20.5■□□□□ 0.87
TUSC2-201ENST00000232496 RECQL5O94762 991 aaPredicted RBP20.5■□□□□ 0.87
TUSC2-201ENST00000232496 CRTAMO95727 393 aa20.5■□□□□ 0.87
TUSC2-201ENST00000232496 PTGER3P43115 390 aa20.5■□□□□ 0.87
TUSC2-201ENST00000232496 SESN2P58004 480 aaPredicted RBP20.5■□□□□ 0.87
TUSC2-201ENST00000232496 SGCGQ13326 291 aa20.5■□□□□ 0.87
TUSC2-201ENST00000232496 CASP8Q14790 479 aa20.5■□□□□ 0.87
TUSC2-201ENST00000232496 DENND2CQ68D51 928 aa20.5■□□□□ 0.87
TUSC2-201ENST00000232496 Q6ZVL8 140 aa20.5■□□□□ 0.87
TUSC2-201ENST00000232496 KLK6Q92876 244 aa20.5■□□□□ 0.87
TUSC2-201ENST00000232496 ART4Q93070 314 aa20.5■□□□□ 0.87
TUSC2-201ENST00000232496 DTD2Q96FN9 168 aa20.5■□□□□ 0.87
TUSC2-201ENST00000232496 RANBP9Q96S59 729 aa20.5■□□□□ 0.87
TUSC2-201ENST00000232496 KLF6Q99612 283 aaPredicted RBP20.5■□□□□ 0.87
TUSC2-201ENST00000232496 C19orf43Q9BQ61 176 aa20.5■□□□□ 0.87
TUSC2-201ENST00000232496 IL22Q9GZX6 179 aa20.5■□□□□ 0.87
TUSC2-201ENST00000232496 EPB41L5Q9HCM4 733 aa20.5■□□□□ 0.87
TUSC2-201ENST00000232496 BFARQ9NZS9 450 aa20.5■□□□□ 0.87
TUSC2-201ENST00000232496 IL17CQ9P0M4 197 aa20.5■□□□□ 0.87
TUSC2-201ENST00000232496 PLXNB3Q9ULL4 1909 aa20.49■□□□□ 0.87
TUSC2-201ENST00000232496 A0A1W2PPC4 97 aa20.49■□□□□ 0.87
TUSC2-201ENST00000232496 ESYT3A0FGR9 886 aa20.49■□□□□ 0.87
TUSC2-201ENST00000232496 RGSL1A5PLK6 1076 aa20.49■□□□□ 0.87
TUSC2-201ENST00000232496 MROH6A6NGR9 719 aa20.49■□□□□ 0.87
TUSC2-201ENST00000232496 C2orf81A6NN90 581 aa20.49■□□□□ 0.87
TUSC2-201ENST00000232496 WNT9AO14904 365 aa20.49■□□□□ 0.87
TUSC2-201ENST00000232496 RHOBTB1O94844 696 aa20.49■□□□□ 0.87
TUSC2-201ENST00000232496 LPOP22079 712 aaPredicted RBP20.49■□□□□ 0.87
TUSC2-201ENST00000232496 ETV3P41162 512 aa20.49■□□□□ 0.87
TUSC2-201ENST00000232496 SPINT3P49223 89 aa20.49■□□□□ 0.87
TUSC2-201ENST00000232496 PTPN5P54829 565 aa20.49■□□□□ 0.87
TUSC2-201ENST00000232496 PDE1BQ01064 536 aa20.49■□□□□ 0.87
TUSC2-201ENST00000232496 RFLNAQ6ZTI6 216 aa20.49■□□□□ 0.87
TUSC2-201ENST00000232496 DGCR8Q8WYQ5 773 aaKnown RBP eCLIP20.49■□□□□ 0.87
TUSC2-201ENST00000232496 CENPTQ96BT3 561 aa20.49■□□□□ 0.87
TUSC2-201ENST00000232496 LENG8Q96PV6 779 aaPredicted RBP20.49■□□□□ 0.87
TUSC2-201ENST00000232496 VIPAS39Q9H9C1 493 aa20.49■□□□□ 0.87
TUSC2-201ENST00000232496 KCTD5Q9NXV2 234 aa20.49■□□□□ 0.87
TUSC2-201ENST00000232496 DMTF1Q9Y222 760 aa20.49■□□□□ 0.87
TUSC2-201ENST00000232496 SLC31A1O15431 190 aa20.48■□□□□ 0.87
TUSC2-201ENST00000232496 ADRA1DP25100 572 aa20.48■□□□□ 0.87
TUSC2-201ENST00000232496 MGAT1P26572 445 aa20.48■□□□□ 0.87
TUSC2-201ENST00000232496 CD27P26842 260 aa20.48■□□□□ 0.87
TUSC2-201ENST00000232496 CARSP49589 748 aaKnown RBP20.48■□□□□ 0.87
TUSC2-201ENST00000232496 CAV1Q03135 178 aa20.48■□□□□ 0.87
TUSC2-201ENST00000232496 CBLBQ13191 982 aa20.48■□□□□ 0.87
TUSC2-201ENST00000232496 MTM1Q13496 603 aa20.48■□□□□ 0.87
TUSC2-201ENST00000232496 ARMC3Q5W041 872 aa20.48■□□□□ 0.87
TUSC2-201ENST00000232496 EMBQ6PCB8 327 aa20.48■□□□□ 0.87
TUSC2-201ENST00000232496 NRSN1Q8IZ57 195 aa20.48■□□□□ 0.87
TUSC2-201ENST00000232496 KRT222Q8N1A0 295 aa20.48■□□□□ 0.87
TUSC2-201ENST00000232496 C1orf216Q8TAB5 229 aa20.48■□□□□ 0.87
TUSC2-201ENST00000232496 PKD2L2Q9NZM6 624 aa20.48■□□□□ 0.87
TUSC2-201ENST00000232496 HEATR9A2RTY3 570 aa20.48■□□□□ 0.87
TUSC2-201ENST00000232496 PPFIA2O75334 1257 aa20.48■□□□□ 0.87
TUSC2-201ENST00000232496 SLC4A1P02730 911 aa20.48■□□□□ 0.87
TUSC2-201ENST00000232496 CRADDP78560 199 aa20.48■□□□□ 0.87
TUSC2-201ENST00000232496 PCID2Q5JVF3 399 aa20.48■□□□□ 0.87
TUSC2-201ENST00000232496 FNBP1LQ5T0N5 605 aa20.48■□□□□ 0.87
TUSC2-201ENST00000232496 ZDHHC24Q6UX98 284 aa20.48■□□□□ 0.87
TUSC2-201ENST00000232496 NLRP8Q86W28 1048 aa20.48■□□□□ 0.87
TUSC2-201ENST00000232496 AGGF1Q8N302 714 aaeCLIP20.48■□□□□ 0.87
TUSC2-201ENST00000232496 TP53I13Q8NBR0 393 aaPredicted RBP20.48■□□□□ 0.87
TUSC2-201ENST00000232496 CAVIN3Q969G5 261 aa20.48■□□□□ 0.87
TUSC2-201ENST00000232496 SIGLEC10Q96LC7 697 aa20.48■□□□□ 0.87
TUSC2-201ENST00000232496 C1QTNF7Q9BXJ2 289 aa20.48■□□□□ 0.87
TUSC2-201ENST00000232496 FAM114A2Q9NRY5 505 aa20.48■□□□□ 0.87
TUSC2-201ENST00000232496 SYBUQ9NX95 663 aa20.48■□□□□ 0.87
TUSC2-201ENST00000232496 NFKBIL1Q9UBC1 381 aaPredicted RBP20.48■□□□□ 0.87
TUSC2-201ENST00000232496 EIF2B4Q9UI10 523 aaKnown RBP20.48■□□□□ 0.87
TUSC2-201ENST00000232496 PKP3Q9Y446 797 aa20.48■□□□□ 0.87
TUSC2-201ENST00000232496 KCTD3Q9Y597 815 aa20.48■□□□□ 0.87
TUSC2-201ENST00000232496 CACNA1EQ15878 2313 aa20.47■□□□□ 0.87
TUSC2-201ENST00000232496 SDR42E2A6NKP2 422 aa20.47■□□□□ 0.87
TUSC2-201ENST00000232496 GOLGA8CPA6NN73 597 aa20.47■□□□□ 0.87
TUSC2-201ENST00000232496 MEI4A8MW99 385 aa20.47■□□□□ 0.87
TUSC2-201ENST00000232496 RAD51BO15315 384 aa20.47■□□□□ 0.87
TUSC2-201ENST00000232496 BUD23O43709 281 aaKnown RBP20.47■□□□□ 0.87
TUSC2-201ENST00000232496 BPIP17213 487 aa20.47■□□□□ 0.87
TUSC2-201ENST00000232496 HNRNPA2B1P22626 353 aaKnown RBP20.47■□□□□ 0.87
TUSC2-201ENST00000232496 PSMA3P25788 255 aa20.47■□□□□ 0.87
TUSC2-201ENST00000232496 DHPSP49366 369 aaPredicted RBP20.47■□□□□ 0.87
TUSC2-201ENST00000232496 ZNF140P52738 457 aaPredicted RBP20.47■□□□□ 0.87
TUSC2-201ENST00000232496 PLTPP55058 493 aa20.47■□□□□ 0.87
TUSC2-201ENST00000232496 DPTQ07507 201 aa20.47■□□□□ 0.87
TUSC2-201ENST00000232496 LAMB3Q13751 1172 aa20.47■□□□□ 0.87
TUSC2-201ENST00000232496 PTPRCAPQ14761 206 aa20.47■□□□□ 0.87
TUSC2-201ENST00000232496 LRRC14Q15048 493 aa20.47■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 19.8 ms