RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000626236.2

SGMS1-211, Transcript of sphingomyelin synthase 1, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene SGMS1, Length 1,013 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGMS1-211ENST00000626236 SRPK1Q96SB4 655 aaKnown RBP8.53□□□□□ -1.04
SGMS1-211ENST00000626236 FRMD8Q9BZ67 464 aaPredicted RBP8.53□□□□□ -1.04
SGMS1-211ENST00000626236 GPR63Q9BZJ6 419 aa8.53□□□□□ -1.04
SGMS1-211ENST00000626236 SGK2Q9HBY8 427 aa8.53□□□□□ -1.04
SGMS1-211ENST00000626236 MAGEE1Q9HCI5 957 aa8.53□□□□□ -1.04
SGMS1-211ENST00000626236 PREBQ9HCU5 417 aa8.53□□□□□ -1.04
SGMS1-211ENST00000626236 ZDHHC18Q9NUE0 388 aa8.53□□□□□ -1.04
SGMS1-211ENST00000626236 SYBUQ9NX95 663 aa8.53□□□□□ -1.04
SGMS1-211ENST00000626236 IGF2BP1Q9NZI8 577 aaKnown RBP eCLIP8.53□□□□□ -1.04
SGMS1-211ENST00000626236 BFARQ9NZS9 450 aa8.53□□□□□ -1.04
SGMS1-211ENST00000626236 HACD3Q9P035 362 aa8.53□□□□□ -1.04
SGMS1-211ENST00000626236 FBXO4Q9UKT5 387 aa8.53□□□□□ -1.04
SGMS1-211ENST00000626236 CACNA1IQ9P0X4 2223 aa8.52□□□□□ -1.05
SGMS1-211ENST00000626236 CCDC78A2IDD5 438 aa8.52□□□□□ -1.05
SGMS1-211ENST00000626236 SDR42E2A6NKP2 422 aa8.52□□□□□ -1.05
SGMS1-211ENST00000626236 GOLGA8CPA6NN73 597 aa8.52□□□□□ -1.05
SGMS1-211ENST00000626236 C2orf81A6NN90 581 aa8.52□□□□□ -1.05
SGMS1-211ENST00000626236 H0Y858 1186 aa8.52□□□□□ -1.05
SGMS1-211ENST00000626236 AURKAO14965 403 aa8.52□□□□□ -1.05
SGMS1-211ENST00000626236 BUD23O43709 281 aaKnown RBP8.52□□□□□ -1.05
SGMS1-211ENST00000626236 MMP20O60882 483 aa8.52□□□□□ -1.05
SGMS1-211ENST00000626236 RNGTTO60942 597 aaKnown RBP8.52□□□□□ -1.05
SGMS1-211ENST00000626236 NDUFS2O75306 463 aa8.52□□□□□ -1.05
SGMS1-211ENST00000626236 PPFIA2O75334 1257 aa8.52□□□□□ -1.05
SGMS1-211ENST00000626236 BANF1O75531 89 aa8.52□□□□□ -1.05
SGMS1-211ENST00000626236 CRTAMO95727 393 aa8.52□□□□□ -1.05
SGMS1-211ENST00000626236 SEMA4FO95754 770 aa8.52□□□□□ -1.05
SGMS1-211ENST00000626236 C6P13671 934 aa8.52□□□□□ -1.05
SGMS1-211ENST00000626236 ZNF30P17039 623 aa8.52□□□□□ -1.05
SGMS1-211ENST00000626236 HOXA6P31267 233 aa8.52□□□□□ -1.05
SGMS1-211ENST00000626236 LIG3P49916 1009 aa8.52□□□□□ -1.05
SGMS1-211ENST00000626236 PPP2CBP62714 309 aa8.52□□□□□ -1.05
SGMS1-211ENST00000626236 PPP2CAP67775 309 aa8.52□□□□□ -1.05
SGMS1-211ENST00000626236 PTSQ03393 145 aa8.52□□□□□ -1.05
SGMS1-211ENST00000626236 DHX9Q08211 1270 aaKnown RBP8.52□□□□□ -1.05
SGMS1-211ENST00000626236 MSLNQ13421 630 aaPredicted RBP8.52□□□□□ -1.05
SGMS1-211ENST00000626236 NAA30Q147X3 362 aaPredicted RBP8.52□□□□□ -1.05
SGMS1-211ENST00000626236 ANGPT1Q15389 498 aa8.52□□□□□ -1.05
SGMS1-211ENST00000626236 TAF1AQ15573 450 aaPredicted RBP8.52□□□□□ -1.05
SGMS1-211ENST00000626236 CNGA3Q16281 694 aa8.52□□□□□ -1.05
SGMS1-211ENST00000626236 CDKN3Q16667 212 aa8.52□□□□□ -1.05
SGMS1-211ENST00000626236 BBS9Q3SYG4 887 aa8.52□□□□□ -1.05
SGMS1-211ENST00000626236 TMEM52BQ4KMG9 183 aa8.52□□□□□ -1.05
SGMS1-211ENST00000626236 MSS51Q4VC12 460 aa8.52□□□□□ -1.05
SGMS1-211ENST00000626236 HP1BP3Q5SSJ5 553 aaPredicted RBP8.52□□□□□ -1.05
SGMS1-211ENST00000626236 SEL1L3Q68CR1 1132 aa8.52□□□□□ -1.05
SGMS1-211ENST00000626236 CASC4Q6P4E1 433 aa8.52□□□□□ -1.05
SGMS1-211ENST00000626236 LIPIQ6XZB0 460 aa8.52□□□□□ -1.05
SGMS1-211ENST00000626236 CENPUQ71F23 418 aa8.52□□□□□ -1.05
SGMS1-211ENST00000626236 WDR5BQ86VZ2 330 aa8.52□□□□□ -1.05
SGMS1-211ENST00000626236 LONP2Q86WA8 852 aa8.52□□□□□ -1.05
SGMS1-211ENST00000626236 CCDC25Q86WR0 208 aa8.52□□□□□ -1.05
SGMS1-211ENST00000626236 OR2T34Q8NGX1 318 aa8.52□□□□□ -1.05
SGMS1-211ENST00000626236 BRSK1Q8TDC3 778 aa8.52□□□□□ -1.05
SGMS1-211ENST00000626236 GPR174Q9BXC1 333 aa8.52□□□□□ -1.05
SGMS1-211ENST00000626236 C1QTNF1Q9BXJ1 281 aa8.52□□□□□ -1.05
SGMS1-211ENST00000626236 FAM129AQ9BZQ8 928 aa8.52□□□□□ -1.05
SGMS1-211ENST00000626236 IL22Q9GZX6 179 aa8.52□□□□□ -1.05
SGMS1-211ENST00000626236 KDM4CQ9H3R0 1056 aa8.52□□□□□ -1.05
SGMS1-211ENST00000626236 TRABDQ9H4I3 376 aa8.52□□□□□ -1.05
SGMS1-211ENST00000626236 ZFYVE1Q9HBF4 777 aa8.52□□□□□ -1.05
SGMS1-211ENST00000626236 WSB2Q9NYS7 404 aaPredicted RBP8.52□□□□□ -1.05
SGMS1-211ENST00000626236 SAMD15Q9P1V8 674 aa8.52□□□□□ -1.05
SGMS1-211ENST00000626236 MTRF1LQ9UGC7 380 aaKnown RBP8.52□□□□□ -1.05
SGMS1-211ENST00000626236 NFU1Q9UMS0 254 aa8.52□□□□□ -1.05
SGMS1-211ENST00000626236 COQ6Q9Y2Z9 468 aa8.52□□□□□ -1.05
SGMS1-211ENST00000626236 KCTD3Q9Y597 815 aa8.52□□□□□ -1.05
SGMS1-211ENST00000626236 ARL5AQ9Y689 179 aa8.52□□□□□ -1.05
SGMS1-211ENST00000626236 NUMA1Q14980 2115 aa8.51□□□□□ -1.05
SGMS1-211ENST00000626236 DOCK9Q9BZ29 2069 aa8.51□□□□□ -1.05
SGMS1-211ENST00000626236 CCDC163A0A0D9SF12 145 aa8.51□□□□□ -1.05
SGMS1-211ENST00000626236 A0A1W2PQU0 124 aa8.51□□□□□ -1.05
SGMS1-211ENST00000626236 HEATR9A2RTY3 570 aa8.51□□□□□ -1.05
SGMS1-211ENST00000626236 IGLON5A6NGN9 336 aa8.51□□□□□ -1.05
SGMS1-211ENST00000626236 STX7O15400 261 aaKnown RBP8.51□□□□□ -1.05
SGMS1-211ENST00000626236 LDB2O43679 373 aa8.51□□□□□ -1.05
SGMS1-211ENST00000626236 LZTS3O60299 673 aaPredicted RBP8.51□□□□□ -1.05
SGMS1-211ENST00000626236 C1SP09871 688 aa8.51□□□□□ -1.05
SGMS1-211ENST00000626236 BCKDHBP21953 392 aa8.51□□□□□ -1.05
SGMS1-211ENST00000626236 LPOP22079 712 aaPredicted RBP8.51□□□□□ -1.05
SGMS1-211ENST00000626236 ADRA1DP25100 572 aa8.51□□□□□ -1.05
SGMS1-211ENST00000626236 TNFRSF8P28908 595 aa8.51□□□□□ -1.05
SGMS1-211ENST00000626236 ECHS1P30084 290 aa8.51□□□□□ -1.05
SGMS1-211ENST00000626236 MAT2AP31153 395 aaKnown RBP8.51□□□□□ -1.05
SGMS1-211ENST00000626236 ETV3P41162 512 aa8.51□□□□□ -1.05
SGMS1-211ENST00000626236 ELK3P41970 407 aa8.51□□□□□ -1.05
SGMS1-211ENST00000626236 MAGEA3P43357 314 aa8.51□□□□□ -1.05
SGMS1-211ENST00000626236 STC1P52823 247 aa8.51□□□□□ -1.05
SGMS1-211ENST00000626236 RPS21P63220 83 aaKnown RBP8.51□□□□□ -1.05
SGMS1-211ENST00000626236 TMPRSS15P98073 1019 aa8.51□□□□□ -1.05
SGMS1-211ENST00000626236 PDE1BQ01064 536 aa8.51□□□□□ -1.05
SGMS1-211ENST00000626236 RPL6Q02878 288 aaKnown RBP8.51□□□□□ -1.05
SGMS1-211ENST00000626236 PDIA2Q13087 525 aaKnown RBP8.51□□□□□ -1.05
SGMS1-211ENST00000626236 LAMB3Q13751 1172 aa8.51□□□□□ -1.05
SGMS1-211ENST00000626236 PTPRCAPQ14761 206 aa8.51□□□□□ -1.05
SGMS1-211ENST00000626236 ACOX1Q15067 660 aa8.51□□□□□ -1.05
SGMS1-211ENST00000626236 PCID2Q5JVF3 399 aa8.51□□□□□ -1.05
SGMS1-211ENST00000626236 KIAA1161Q6NSJ0 714 aa8.51□□□□□ -1.05
SGMS1-211ENST00000626236 HSD11B1LQ7Z5J1 315 aa8.51□□□□□ -1.05
SGMS1-211ENST00000626236 TMC3Q7Z5M5 1100 aa8.51□□□□□ -1.05
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