RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000590546.6

USP36-218, Transcript of ubiquitin specific peptidase 36, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene USP36, Length 1,771 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP36-218ENST00000590546 HLA-FP30511 346 aa22.41■■□□□ 1.18
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USP36-218ENST00000590546 ABL2P42684 1182 aa22.41■■□□□ 1.18
USP36-218ENST00000590546 ZNF460Q14592 562 aa22.41■■□□□ 1.18
USP36-218ENST00000590546 ACAP2Q15057 778 aa22.41■■□□□ 1.18
USP36-218ENST00000590546 MTDHQ86UE4 582 aaKnown RBP22.41■■□□□ 1.18
USP36-218ENST00000590546 EFHBQ8N7U6 833 aa22.41■■□□□ 1.18
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USP36-218ENST00000590546 SLC2A11Q9BYW1 496 aa22.41■■□□□ 1.18
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USP36-218ENST00000590546 DNAJC16Q9Y2G8 782 aa22.41■■□□□ 1.18
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USP36-218ENST00000590546 DOCK6Q96HP0 2047 aa22.41■■□□□ 1.18
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USP36-218ENST00000590546 ITM2AO43736 263 aa22.4■■□□□ 1.18
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USP36-218ENST00000590546 HMGCLP35914 325 aa22.4■■□□□ 1.18
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USP36-218ENST00000590546 HK2P52789 917 aa22.4■■□□□ 1.18
USP36-218ENST00000590546 LDB1Q86U70 411 aaPredicted RBP22.4■■□□□ 1.18
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USP36-218ENST00000590546 ZNF395Q9H8N7 513 aaPredicted RBP22.4■■□□□ 1.18
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USP36-218ENST00000590546 EVLQ9UI08 416 aaPredicted RBP22.4■■□□□ 1.18
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USP36-218ENST00000590546 NEDD8-MDP1E9PL57 170 aa22.4■■□□□ 1.18
USP36-218ENST00000590546 TRAFD1O14545 582 aaPredicted RBP22.4■■□□□ 1.18
USP36-218ENST00000590546 NDUFS3O75489 264 aa22.4■■□□□ 1.18
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USP36-218ENST00000590546 ZNF707Q96C28 371 aaPredicted RBP22.4■■□□□ 1.18
USP36-218ENST00000590546 SORT1Q99523 831 aa22.4■■□□□ 1.18
USP36-218ENST00000590546 GPR63Q9BZJ6 419 aa22.4■■□□□ 1.18
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USP36-218ENST00000590546 PALM2-AKAP2B1ALY0 433 aaPredicted RBP22.39■■□□□ 1.17
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USP36-218ENST00000590546 LMAN2LQ9H0V9 348 aa22.39■■□□□ 1.17
USP36-218ENST00000590546 POLR3BQ9NW08 1133 aaPredicted RBP22.39■■□□□ 1.17
USP36-218ENST00000590546 IL17CQ9P0M4 197 aa22.39■■□□□ 1.17
USP36-218ENST00000590546 NOTCH4Q99466 2003 aa22.39■■□□□ 1.17
USP36-218ENST00000590546 A0A1W2PQ67 120 aa22.38■■□□□ 1.17
USP36-218ENST00000590546 PER2O15055 1255 aa22.38■■□□□ 1.17
USP36-218ENST00000590546 LYPLA1O75608 230 aaPredicted RBP22.38■■□□□ 1.17
USP36-218ENST00000590546 PAPLNO95428 1278 aa22.38■■□□□ 1.17
USP36-218ENST00000590546 PRAMEF12O95522 483 aa22.38■■□□□ 1.17
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USP36-218ENST00000590546 DNAJB13P59910 316 aa22.38■■□□□ 1.17
USP36-218ENST00000590546 NTHL1P78549 312 aa22.38■■□□□ 1.17
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USP36-218ENST00000590546 CELF5Q8N6W0 485 aaKnown RBP22.38■■□□□ 1.17
USP36-218ENST00000590546 PAF1Q8N7H5 531 aa22.38■■□□□ 1.17
USP36-218ENST00000590546 RIN3Q8TB24 985 aa22.38■■□□□ 1.17
USP36-218ENST00000590546 TBRG4Q969Z0 631 aaKnown RBP eCLIP22.38■■□□□ 1.173e-8■■■■■ 70.6
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USP36-218ENST00000590546 A0A0J9YYE9 177 aa22.38■■□□□ 1.17
USP36-218ENST00000590546 ZNF821O75541 412 aaPredicted RBP22.38■■□□□ 1.17
USP36-218ENST00000590546 TRBC1P01850 177 aa22.38■■□□□ 1.17
USP36-218ENST00000590546 TYRP14679 529 aa22.38■■□□□ 1.17
USP36-218ENST00000590546 ALOX15P16050 662 aaPredicted RBP22.38■■□□□ 1.17
USP36-218ENST00000590546 MC4RP32245 332 aa22.38■■□□□ 1.17
USP36-218ENST00000590546 PPARGP37231 505 aaPredicted RBP22.38■■□□□ 1.17
USP36-218ENST00000590546 CDKN2DP55273 166 aa22.38■■□□□ 1.17
USP36-218ENST00000590546 FUT11Q495W5 492 aa22.38■■□□□ 1.17
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