RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000582821.5

GGA3-215, Transcript of golgi associated, gamma adaptin ear containing, ARF binding protein 3, human

TSL 2

Gene GGA3, Length 1,018 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
GGA3-215	ENST00000582821	ZNF548	Q8NEK5	533 aa	Predicted RBP	13.98	□□□□□ -0.17
GGA3-215	ENST00000582821	DTD2	Q96FN9	168 aa		13.98	□□□□□ -0.17
GGA3-215	ENST00000582821	VAT1	Q99536	393 aa		13.98	□□□□□ -0.17
GGA3-215	ENST00000582821	DESI2	Q9BSY9	194 aa		13.98	□□□□□ -0.17
GGA3-215	ENST00000582821	OSBPL8	Q9BZF1	889 aa		13.98	□□□□□ -0.17
GGA3-215	ENST00000582821	GLOD4	Q9HC38	313 aa		13.98	□□□□□ -0.17
GGA3-215	ENST00000582821	SPAST	Q9UBP0	616 aa		13.98	□□□□□ -0.17
GGA3-215	ENST00000582821	AMFR	Q9UKV5	643 aa		13.98	□□□□□ -0.17
GGA3-215	ENST00000582821	PNMA8B	Q9ULN7	279 aa	Predicted RBP	13.98	□□□□□ -0.17
GGA3-215	ENST00000582821	MSRB2	Q9Y3D2	182 aa		13.98	□□□□□ -0.17
GGA3-215	ENST00000582821	ADGRG1	Q9Y653	693 aa		13.98	□□□□□ -0.17
GGA3-215	ENST00000582821	ARHGEF17	Q96PE2	2063 aa	Predicted RBP	13.98	□□□□□ -0.17
GGA3-215	ENST00000582821	EPG5	Q9HCE0	2579 aa		13.98	□□□□□ -0.17
GGA3-215	ENST00000582821	LRP4	O75096	1905 aa		13.98	□□□□□ -0.17
GGA3-215	ENST00000582821	MIF4GD	A9UHW6	222 aa	Known RBP	13.97	□□□□□ -0.17
GGA3-215	ENST00000582821	ANKRD66	B4E2M5	251 aa		13.97	□□□□□ -0.17
GGA3-215	ENST00000582821		K7ESM1	405 aa		13.97	□□□□□ -0.17
GGA3-215	ENST00000582821	TNFRSF10C	O14798	259 aa		13.97	□□□□□ -0.17
GGA3-215	ENST00000582821	ARHGAP6	O43182	974 aa		13.97	□□□□□ -0.17
GGA3-215	ENST00000582821	AQP9	O43315	295 aa		13.97	□□□□□ -0.17
GGA3-215	ENST00000582821	PCCB	P05166	539 aa		13.97	□□□□□ -0.17
GGA3-215	ENST00000582821	ALPI	P09923	528 aa		13.97	□□□□□ -0.17
GGA3-215	ENST00000582821	ALPPL2	P10696	532 aa		13.97	□□□□□ -0.17
GGA3-215	ENST00000582821	TSHR	P16473	764 aa		13.97	□□□□□ -0.17
GGA3-215	ENST00000582821	CTPS1	P17812	591 aa		13.97	□□□□□ -0.17
GGA3-215	ENST00000582821	ACP1	P24666	158 aa		13.97	□□□□□ -0.17
GGA3-215	ENST00000582821	CETN2	P41208	172 aa		13.97	□□□□□ -0.17
GGA3-215	ENST00000582821	HK3	P52790	923 aa		13.97	□□□□□ -0.17
GGA3-215	ENST00000582821	EPHB1	P54762	984 aa		13.97	□□□□□ -0.17
GGA3-215	ENST00000582821	KIAA1024L	P59773	190 aa		13.97	□□□□□ -0.17
GGA3-215	ENST00000582821	WASHC5	Q12768	1159 aa		13.97	□□□□□ -0.17
GGA3-215	ENST00000582821	PTPRR	Q15256	657 aa		13.97	□□□□□ -0.17
GGA3-215	ENST00000582821	CDKN3	Q16667	212 aa		13.97	□□□□□ -0.17
GGA3-215	ENST00000582821	HS1BP3	Q53T59	392 aa		13.97	□□□□□ -0.17
GGA3-215	ENST00000582821		Q6ZVL8	140 aa		13.97	□□□□□ -0.17
GGA3-215	ENST00000582821	TMPRSS7	Q7RTY8	843 aa		13.97	□□□□□ -0.17
GGA3-215	ENST00000582821	PEX26	Q7Z412	305 aa		13.97	□□□□□ -0.17
GGA3-215	ENST00000582821	HSD11B1L	Q7Z5J1	315 aa		13.97	□□□□□ -0.17
GGA3-215	ENST00000582821	TSPAN33	Q86UF1	283 aa		13.97	□□□□□ -0.17
GGA3-215	ENST00000582821	PHACTR4	Q8IZ21	702 aa		13.97	□□□□□ -0.17
GGA3-215	ENST00000582821	SDR16C5	Q8N3Y7	309 aa		13.97	□□□□□ -0.17
GGA3-215	ENST00000582821	ZC3H8	Q8N5P1	291 aa	Known RBP eCLIP	13.97	□□□□□ -0.17
GGA3-215	ENST00000582821	CCDC112	Q8NEF3	446 aa		13.97	□□□□□ -0.17
GGA3-215	ENST00000582821	ALG3	Q92685	438 aa		13.97	□□□□□ -0.17
GGA3-215	ENST00000582821	FUBP1	Q96AE4	644 aa	Known RBP	13.97	□□□□□ -0.17
GGA3-215	ENST00000582821	NUS1	Q96E22	293 aa		13.97	□□□□□ -0.17
GGA3-215	ENST00000582821	WDR92	Q96MX6	357 aa		13.97	□□□□□ -0.17
GGA3-215	ENST00000582821	AGAP3	Q96P47	875 aa		13.97	□□□□□ -0.17
GGA3-215	ENST00000582821	TRIB3	Q96RU7	358 aa		13.97	□□□□□ -0.17
GGA3-215	ENST00000582821	HEMGN	Q9BXL5	484 aa		13.97	□□□□□ -0.17
GGA3-215	ENST00000582821	ADGRE3	Q9BY15	652 aa		13.97	□□□□□ -0.17
GGA3-215	ENST00000582821	CAAP1	Q9H8G2	361 aa		13.97	□□□□□ -0.17
GGA3-215	ENST00000582821	USP29	Q9HBJ7	922 aa		13.97	□□□□□ -0.17
GGA3-215	ENST00000582821	SEPT10	Q9P0V9	454 aa		13.97	□□□□□ -0.17
GGA3-215	ENST00000582821	TRIM10	Q9UDY6	481 aa		13.97	□□□□□ -0.17
GGA3-215	ENST00000582821	OR1A2	Q9Y585	309 aa		13.97	□□□□□ -0.17
GGA3-215	ENST00000582821	DGKB	Q9Y6T7	804 aa		13.97	□□□□□ -0.17
GGA3-215	ENST00000582821	RP1	P56715	2156 aa		13.97	□□□□□ -0.17
GGA3-215	ENST00000582821	FRY	Q5TBA9	3013 aa		13.97	□□□□□ -0.17
GGA3-215	ENST00000582821		A0A0U1RQJ8	604 aa		13.96	□□□□□ -0.17
GGA3-215	ENST00000582821	MACROD2	A1Z1Q3	448 aa		13.96	□□□□□ -0.17
GGA3-215	ENST00000582821	CAPN8	A6NHC0	703 aa		13.96	□□□□□ -0.17
GGA3-215	ENST00000582821	CACNB4	O00305	520 aa	Predicted RBP	13.96	□□□□□ -0.17
GGA3-215	ENST00000582821	PDE2A	O00408	941 aa	Predicted RBP	13.96	□□□□□ -0.17
GGA3-215	ENST00000582821	RASGRP1	O95267	797 aa		13.96	□□□□□ -0.17
GGA3-215	ENST00000582821	PYGM	P11217	842 aa		13.96	□□□□□ -0.17
GGA3-215	ENST00000582821	KEL	P23276	732 aa		13.96	□□□□□ -0.17
GGA3-215	ENST00000582821	CD68	P34810	354 aa	Predicted RBP	13.96	□□□□□ -0.17
GGA3-215	ENST00000582821	ETV3	P41162	512 aa		13.96	□□□□□ -0.17
GGA3-215	ENST00000582821	ACADVL	P49748	655 aa		13.96	□□□□□ -0.17
GGA3-215	ENST00000582821	STC1	P52823	247 aa		13.96	□□□□□ -0.17
GGA3-215	ENST00000582821	SRP54	P61011	504 aa	Known RBP	13.96	□□□□□ -0.17
GGA3-215	ENST00000582821	DNAJC3	Q13217	504 aa		13.96	□□□□□ -0.17
GGA3-215	ENST00000582821	NOMO1	Q15155	1222 aa		13.96	□□□□□ -0.17
GGA3-215	ENST00000582821	SMAD1	Q15797	465 aa	Known RBP	13.96	□□□□□ -0.17
GGA3-215	ENST00000582821	QPCT	Q16769	361 aa		13.96	□□□□□ -0.17
GGA3-215	ENST00000582821	FAXC	Q5TGI0	409 aa		13.96	□□□□□ -0.17
GGA3-215	ENST00000582821	LRRC66	Q68CR7	880 aa		13.96	□□□□□ -0.17
GGA3-215	ENST00000582821	ENPP7	Q6UWV6	458 aa		13.96	□□□□□ -0.17
GGA3-215	ENST00000582821	B4GALNT4	Q76KP1	1039 aa		13.96	□□□□□ -0.17
GGA3-215	ENST00000582821	ZNF765	Q7L2R6	523 aa		13.96	□□□□□ -0.17
GGA3-215	ENST00000582821	ZC3H18	Q86VM9	953 aa	Known RBP	13.96	□□□□□ -0.17
GGA3-215	ENST00000582821	NRSN1	Q8IZ57	195 aa		13.96	□□□□□ -0.17
GGA3-215	ENST00000582821	PELI3	Q8N2H9	469 aa		13.96	□□□□□ -0.17
GGA3-215	ENST00000582821	FSTL5	Q8N475	847 aa	Predicted RBP	13.96	□□□□□ -0.17
GGA3-215	ENST00000582821	LMX1A	Q8TE12	382 aa		13.96	□□□□□ -0.17
GGA3-215	ENST00000582821	HTR3C	Q8WXA8	447 aa		13.96	□□□□□ -0.17
GGA3-215	ENST00000582821	QKI	Q96PU8	341 aa	Known RBP eCLIP	13.96	□□□□□ -0.17
GGA3-215	ENST00000582821	RBM15	Q96T37	977 aa	Known RBP eCLIP	13.96	□□□□□ -0.17
GGA3-215	ENST00000582821	MLPH	Q9BV36	600 aa	Predicted RBP	13.96	□□□□□ -0.17
GGA3-215	ENST00000582821	TEX101	Q9BY14	249 aa		13.96	□□□□□ -0.17
GGA3-215	ENST00000582821	CEP41	Q9BYV8	373 aa		13.96	□□□□□ -0.17
GGA3-215	ENST00000582821	SLC13A1	Q9BZW2	595 aa		13.96	□□□□□ -0.17
GGA3-215	ENST00000582821	TSGA10	Q9BZW7	698 aa		13.96	□□□□□ -0.17
GGA3-215	ENST00000582821	TCEAL2	Q9H3H9	227 aa	Predicted RBP	13.96	□□□□□ -0.17
GGA3-215	ENST00000582821	APOBEC3B	Q9UH17	382 aa	Known RBP	13.96	□□□□□ -0.17
GGA3-215	ENST00000582821	KLK13	Q9UKR3	277 aa		13.96	□□□□□ -0.17
GGA3-215	ENST00000582821	RGSL1	A5PLK6	1076 aa		13.95	□□□□□ -0.18
GGA3-215	ENST00000582821	LMO7DN	F2Z398	122 aa		13.95	□□□□□ -0.18
GGA3-215	ENST00000582821	GCAT	O75600	419 aa		13.95	□□□□□ -0.18

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