RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000582772.1

MSI2-216, Transcript of musashi RNA binding protein 2, human

TSL 3

Gene MSI2, Length 398 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
MSI2-216	ENST00000582772	FOXR2	Q6PJQ5	311 aa		4.93	□□□□□ -1.62
MSI2-216	ENST00000582772	BPHL	Q86WA6	291 aa	Predicted RBP	4.93	□□□□□ -1.62
MSI2-216	ENST00000582772	OR1N1	Q8NGS0	311 aa		4.93	□□□□□ -1.62
MSI2-216	ENST00000582772	NCOA7	Q8NI08	942 aa		4.93	□□□□□ -1.62
MSI2-216	ENST00000582772	ZDHHC1	Q8WTX9	485 aa		4.93	□□□□□ -1.62
MSI2-216	ENST00000582772	TAF4B	Q92750	862 aa		4.93	□□□□□ -1.62
MSI2-216	ENST00000582772	SNX21	Q969T3	373 aa		4.93	□□□□□ -1.62
MSI2-216	ENST00000582772	ZBED6CL	Q96FA7	236 aa	Predicted RBP	4.93	□□□□□ -1.62
MSI2-216	ENST00000582772	SLC2A13	Q96QE2	648 aa		4.93	□□□□□ -1.62
MSI2-216	ENST00000582772	NTPCR	Q9BSD7	190 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
MSI2-216	ENST00000582772	XYLT2	Q9H1B5	865 aa		4.93	□□□□□ -1.62
MSI2-216	ENST00000582772	EPB41L1	Q9H4G0	881 aa		4.93	□□□□□ -1.62
MSI2-216	ENST00000582772	C17orf75	Q9HAS0	396 aa		4.93	□□□□□ -1.62
MSI2-216	ENST00000582772	NMUR1	Q9HB89	426 aa		4.93	□□□□□ -1.62
MSI2-216	ENST00000582772	SPATS2L	Q9NUQ6	558 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
MSI2-216	ENST00000582772	GAR1	Q9NY12	217 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
MSI2-216	ENST00000582772	CCDC88C	Q9P219	2028 aa		4.93	□□□□□ -1.62
MSI2-216	ENST00000582772	MED12	Q93074	2177 aa		4.92	□□□□□ -1.62
MSI2-216	ENST00000582772	IGLON5	A6NGN9	336 aa		4.92	□□□□□ -1.62
MSI2-216	ENST00000582772	CCDC69	A6NI79	296 aa		4.92	□□□□□ -1.62
MSI2-216	ENST00000582772	PPP1R3G	B7ZBB8	358 aa		4.92	□□□□□ -1.62
MSI2-216	ENST00000582772	RNF223	E7ERA6	249 aa		4.92	□□□□□ -1.62
MSI2-216	ENST00000582772	CES2	O00748	559 aa		4.92	□□□□□ -1.62
MSI2-216	ENST00000582772	IRAK2	O43187	625 aa		4.92	□□□□□ -1.62
MSI2-216	ENST00000582772	TSPAN6	O43657	245 aa		4.92	□□□□□ -1.62
MSI2-216	ENST00000582772	CPNE3	O75131	537 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
MSI2-216	ENST00000582772	CDC45	O75419	566 aa		4.92	□□□□□ -1.62
MSI2-216	ENST00000582772	WISP2	O76076	250 aa		4.92	□□□□□ -1.62
MSI2-216	ENST00000582772	LRIG2	O94898	1065 aa		4.92	□□□□□ -1.62
MSI2-216	ENST00000582772	RASAL1	O95294	804 aa		4.92	□□□□□ -1.62
MSI2-216	ENST00000582772	MLYCD	O95822	493 aa		4.92	□□□□□ -1.62
MSI2-216	ENST00000582772	HRG	P04196	525 aa		4.92	□□□□□ -1.62
MSI2-216	ENST00000582772	ADRB3	P13945	408 aa		4.92	□□□□□ -1.62
MSI2-216	ENST00000582772	GCFC2	P16383	781 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
MSI2-216	ENST00000582772	CHRNA3	P32297	505 aa		4.92	□□□□□ -1.62
MSI2-216	ENST00000582772	PTH2R	P49190	550 aa		4.92	□□□□□ -1.62
MSI2-216	ENST00000582772	NEK3	P51956	506 aa		4.92	□□□□□ -1.62
MSI2-216	ENST00000582772	EPHA4	P54764	986 aa		4.92	□□□□□ -1.62
MSI2-216	ENST00000582772	SH3BP2	P78314	561 aa		4.92	□□□□□ -1.62
MSI2-216	ENST00000582772	SULT2A1	Q06520	285 aa		4.92	□□□□□ -1.62
MSI2-216	ENST00000582772	EFEMP1	Q12805	493 aa		4.92	□□□□□ -1.62
MSI2-216	ENST00000582772	MFAP5	Q13361	173 aa		4.92	□□□□□ -1.62
MSI2-216	ENST00000582772	TDRD12	Q587J7	1177 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
MSI2-216	ENST00000582772	FAM26F	Q5R3K3	315 aa		4.92	□□□□□ -1.62
MSI2-216	ENST00000582772	PIK3R6	Q5UE93	754 aa		4.92	□□□□□ -1.62
MSI2-216	ENST00000582772	PWWP2B	Q6NUJ5	590 aa		4.92	□□□□□ -1.62
MSI2-216	ENST00000582772	ABHD17C	Q6PCB6	329 aa		4.92	□□□□□ -1.62
MSI2-216	ENST00000582772	FAM198B	Q6UWH4	519 aa		4.92	□□□□□ -1.62
MSI2-216	ENST00000582772	HS2ST1	Q7LGA3	356 aa		4.92	□□□□□ -1.62
MSI2-216	ENST00000582772	PPP1R32	Q7Z5V6	425 aa		4.92	□□□□□ -1.62
MSI2-216	ENST00000582772	TP53I13	Q8NBR0	393 aa	Predicted RBP	4.92	□□□□□ -1.62
MSI2-216	ENST00000582772	MAPK1IP1L	Q8NDC0	245 aa		4.92	□□□□□ -1.62
MSI2-216	ENST00000582772	CATSPER1	Q8NEC5	780 aa		4.92	□□□□□ -1.62
MSI2-216	ENST00000582772	RND1	Q92730	232 aa		4.92	□□□□□ -1.62
MSI2-216	ENST00000582772	HAS2	Q92819	552 aa		4.92	□□□□□ -1.62
MSI2-216	ENST00000582772	ERCC4	Q92889	916 aa	Predicted RBP	4.92	□□□□□ -1.62
MSI2-216	ENST00000582772	REPS1	Q96D71	796 aa		4.92	□□□□□ -1.62
MSI2-216	ENST00000582772	RNF31	Q96EP0	1072 aa		4.92	□□□□□ -1.62
MSI2-216	ENST00000582772	C1orf159	Q96HA4	380 aa		4.92	□□□□□ -1.62
MSI2-216	ENST00000582772	AHCYL2	Q96HN2	611 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
MSI2-216	ENST00000582772	PPP1R16A	Q96I34	528 aa		4.92	□□□□□ -1.62
MSI2-216	ENST00000582772	RPL10L	Q96L21	214 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
MSI2-216	ENST00000582772	WDR92	Q96MX6	357 aa		4.92	□□□□□ -1.62
MSI2-216	ENST00000582772	LMF1	Q96S06	567 aa		4.92	□□□□□ -1.62
MSI2-216	ENST00000582772	B3GNT5	Q9BYG0	378 aa		4.92	□□□□□ -1.62
MSI2-216	ENST00000582772	REG4	Q9BYZ8	158 aa		4.92	□□□□□ -1.62
MSI2-216	ENST00000582772	ZMYND15	Q9H091	742 aa		4.92	□□□□□ -1.62
MSI2-216	ENST00000582772	CHST8	Q9H2A9	424 aa		4.92	□□□□□ -1.62
MSI2-216	ENST00000582772	CHMP4B	Q9H444	224 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
MSI2-216	ENST00000582772	CSNK1G1	Q9HCP0	422 aa		4.92	□□□□□ -1.62
MSI2-216	ENST00000582772	ATP13A2	Q9NQ11	1180 aa		4.92	□□□□□ -1.62
MSI2-216	ENST00000582772	DYRK4	Q9NR20	520 aa		4.92	□□□□□ -1.62
MSI2-216	ENST00000582772	FAM13B	Q9NYF5	915 aa		4.92	□□□□□ -1.62
MSI2-216	ENST00000582772	CHMP5	Q9NZZ3	219 aa		4.92	□□□□□ -1.62
MSI2-216	ENST00000582772	NUDT5	Q9UKK9	219 aa		4.92	□□□□□ -1.62
MSI2-216	ENST00000582772	SNX9	Q9Y5X1	595 aa		4.92	□□□□□ -1.62
MSI2-216	ENST00000582772	NPFFR2	Q9Y5X5	522 aa		4.92	□□□□□ -1.62
MSI2-216	ENST00000582772	PLXNB1	O43157	2135 aa		4.91	□□□□□ -1.62
MSI2-216	ENST00000582772		A0A0A6YYJ9	748 aa		4.91	□□□□□ -1.62
MSI2-216	ENST00000582772		A0A1W2PQH9	124 aa		4.91	□□□□□ -1.62
MSI2-216	ENST00000582772	CLCA1	A8K7I4	914 aa		4.91	□□□□□ -1.62
MSI2-216	ENST00000582772	SLCO1B7	G3V0H7	640 aa		4.91	□□□□□ -1.62
MSI2-216	ENST00000582772		M0R2N6	131 aa		4.91	□□□□□ -1.62
MSI2-216	ENST00000582772	KPNA3	O00505	521 aa	Predicted RBP	4.91	□□□□□ -1.62
MSI2-216	ENST00000582772	PRRG2	O14669	202 aa		4.91	□□□□□ -1.62
MSI2-216	ENST00000582772	TNFRSF10C	O14798	259 aa		4.91	□□□□□ -1.62
MSI2-216	ENST00000582772	CLIC2	O15247	247 aa		4.91	□□□□□ -1.62
MSI2-216	ENST00000582772	MOCS3	O95396	460 aa		4.91	□□□□□ -1.62
MSI2-216	ENST00000582772	STAU1	O95793	577 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
MSI2-216	ENST00000582772	LTF	P02788	710 aa		4.91	□□□□□ -1.62
MSI2-216	ENST00000582772	PRNP	P04156	253 aa		4.91	□□□□□ -1.62
MSI2-216	ENST00000582772	CCNB1	P14635	433 aa		4.91	□□□□□ -1.62
MSI2-216	ENST00000582772	TIMP2	P16035	220 aa		4.91	□□□□□ -1.62
MSI2-216	ENST00000582772	POLR2B	P30876	1174 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
MSI2-216	ENST00000582772	PEX3	P56589	373 aa		4.91	□□□□□ -1.62
MSI2-216	ENST00000582772	GSDMD	P57764	484 aa		4.91	□□□□□ -1.62
MSI2-216	ENST00000582772	ACTG1	P63261	375 aa		4.91	□□□□□ -1.62
MSI2-216	ENST00000582772	STRN3	Q13033	797 aa		4.91	□□□□□ -1.62
MSI2-216	ENST00000582772	GPS2	Q13227	327 aa		4.91	□□□□□ -1.62
MSI2-216	ENST00000582772	ABHD17B	Q5VST6	288 aa		4.91	□□□□□ -1.62

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 49.5 ms