RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000574217.1

PRPF8-210, Transcript of pre-mRNA processing factor 8, humanhuman

TSL 2

Gene PRPF8, Length 310 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRPF8-210ENST00000574217 PCID2Q5JVF3 399 aa6.71□□□□□ -1.34
PRPF8-210ENST00000574217 CERCAMQ5T4B2 595 aa6.71□□□□□ -1.34
PRPF8-210ENST00000574217 PIP5KL1Q5T9C9 394 aa6.71□□□□□ -1.34
PRPF8-210ENST00000574217 ARMC3Q5W041 872 aa6.71□□□□□ -1.34
PRPF8-210ENST00000574217 RAB11FIP1Q6WKZ4 1283 aaPredicted RBP6.71□□□□□ -1.34
PRPF8-210ENST00000574217 GSPT2Q8IYD1 628 aaKnown RBP6.71□□□□□ -1.34
PRPF8-210ENST00000574217 ZBED8Q8IZ13 594 aa6.71□□□□□ -1.34
PRPF8-210ENST00000574217 MPP5Q8N3R9 675 aa6.71□□□□□ -1.34
PRPF8-210ENST00000574217 DEFB119Q8N690 84 aa6.71□□□□□ -1.34
PRPF8-210ENST00000574217 BRSK1Q8TDC3 778 aa6.71□□□□□ -1.34
PRPF8-210ENST00000574217 PTCD2Q8WV60 388 aaKnown RBP6.71□□□□□ -1.34
PRPF8-210ENST00000574217 FAM131CQ96AQ9 280 aa6.71□□□□□ -1.34
PRPF8-210ENST00000574217 STAMBPL1Q96FJ0 436 aa6.71□□□□□ -1.34
PRPF8-210ENST00000574217 SPACA7Q96KW9 195 aa6.71□□□□□ -1.34
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PRPF8-210ENST00000574217 RANBP9Q96S59 729 aa6.71□□□□□ -1.34
PRPF8-210ENST00000574217 LYSMD1Q96S90 227 aa6.71□□□□□ -1.34
PRPF8-210ENST00000574217 NAT9Q9BTE0 207 aa6.71□□□□□ -1.34
PRPF8-210ENST00000574217 GPR63Q9BZJ6 419 aa6.71□□□□□ -1.34
PRPF8-210ENST00000574217 DUSP15Q9H1R2 295 aaPredicted RBP6.71□□□□□ -1.34
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PRPF8-210ENST00000574217 SYBUQ9NX95 663 aa6.71□□□□□ -1.34
PRPF8-210ENST00000574217 WSB2Q9NYS7 404 aaPredicted RBP6.71□□□□□ -1.34
PRPF8-210ENST00000574217 IGF2BP1Q9NZI8 577 aaKnown RBP eCLIP6.71□□□□□ -1.34
PRPF8-210ENST00000574217 B4GALT6Q9UBX8 382 aa6.71□□□□□ -1.34
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PRPF8-210ENST00000574217 RAB21Q9UL25 225 aa6.71□□□□□ -1.34
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PRPF8-210ENST00000574217 ZNF711Q9Y462 761 aa6.71□□□□□ -1.34
PRPF8-210ENST00000574217 TCAF1Q9Y4C2 921 aa6.71□□□□□ -1.34
PRPF8-210ENST00000574217 SPO11Q9Y5K1 396 aa6.71□□□□□ -1.34
PRPF8-210ENST00000574217 NUMA1Q14980 2115 aa6.71□□□□□ -1.34
PRPF8-210ENST00000574217 MSANTD3-TMEFF1A0A0A6YYJ0 341 aa6.7□□□□□ -1.34
PRPF8-210ENST00000574217 FAM237BA0A1B0GVD1 139 aa6.7□□□□□ -1.34
PRPF8-210ENST00000574217 MROH6A6NGR9 719 aa6.7□□□□□ -1.34
PRPF8-210ENST00000574217 PROB1E7EW31 1015 aa6.7□□□□□ -1.34
PRPF8-210ENST00000574217 AURKAO14965 403 aa6.7□□□□□ -1.34
PRPF8-210ENST00000574217 AREL1O15033 823 aa6.7□□□□□ -1.34
PRPF8-210ENST00000574217 SPINT1O43278 529 aa6.7□□□□□ -1.34
PRPF8-210ENST00000574217 MAP3K13O43283 966 aa6.7□□□□□ -1.34
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PRPF8-210ENST00000574217 TTC4O95801 387 aa6.7□□□□□ -1.34
PRPF8-210ENST00000574217 POLBP06746 335 aa6.7□□□□□ -1.34
PRPF8-210ENST00000574217 FAM153BP0C7A2 387 aa6.7□□□□□ -1.34
PRPF8-210ENST00000574217 ELFN1P0C7U0 828 aa6.7□□□□□ -1.34
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PRPF8-210ENST00000574217 LPOP22079 712 aaPredicted RBP6.7□□□□□ -1.34
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PRPF8-210ENST00000574217 RALGDSQ12967 914 aa6.7□□□□□ -1.34
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PRPF8-210ENST00000574217 PTPRRQ15256 657 aa6.7□□□□□ -1.34
PRPF8-210ENST00000574217 CNGA3Q16281 694 aa6.7□□□□□ -1.34
PRPF8-210ENST00000574217 FAM153CQ494X1 144 aa6.7□□□□□ -1.34
PRPF8-210ENST00000574217 HP1BP3Q5SSJ5 553 aaPredicted RBP6.7□□□□□ -1.34
PRPF8-210ENST00000574217 LRRC66Q68CR7 880 aa6.7□□□□□ -1.34
PRPF8-210ENST00000574217 PMS2CLQ68D20 193 aa6.7□□□□□ -1.34
PRPF8-210ENST00000574217 EMBQ6PCB8 327 aa6.7□□□□□ -1.34
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PRPF8-210ENST00000574217 ARMCX6Q7L4S7 300 aa6.7□□□□□ -1.34
PRPF8-210ENST00000574217 NLRP9Q7RTR0 991 aa6.7□□□□□ -1.34
PRPF8-210ENST00000574217 LYSMD3Q7Z3D4 306 aa6.7□□□□□ -1.34
PRPF8-210ENST00000574217 TMC3Q7Z5M5 1100 aa6.7□□□□□ -1.34
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PRPF8-210ENST00000574217 TOE1Q96GM8 510 aaKnown RBP6.7□□□□□ -1.34
PRPF8-210ENST00000574217 ZC3H10Q96K80 434 aaKnown RBP6.7□□□□□ -1.34
PRPF8-210ENST00000574217 SIGLEC10Q96LC7 697 aa6.7□□□□□ -1.34
PRPF8-210ENST00000574217 PHF12Q96QT6 1004 aa6.7□□□□□ -1.34
PRPF8-210ENST00000574217 EBNA1BP2Q99848 306 aaKnown RBP6.7□□□□□ -1.34
PRPF8-210ENST00000574217 WRAP53Q9BUR4 548 aaKnown RBP6.7□□□□□ -1.34
PRPF8-210ENST00000574217 KIFC1Q9BW19 673 aa6.7□□□□□ -1.34
PRPF8-210ENST00000574217 GPR174Q9BXC1 333 aa6.7□□□□□ -1.34
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