RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000568586.5

RAB40C-211, Transcript of RAB40C, member RAS oncogene family, humanhuman

TSL 2

Gene RAB40C, Length 648 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB40C-211ENST00000568586 HSD11B1LQ7Z5J1 315 aa29.41■■■□□ 2.3
RAB40C-211ENST00000568586 TECPR1Q7Z6L1 1165 aa29.41■■■□□ 2.3
RAB40C-211ENST00000568586 NDUFAF2Q8N183 169 aa29.41■■■□□ 2.3
RAB40C-211ENST00000568586 CNTD1Q8N815 330 aa29.41■■■□□ 2.3
RAB40C-211ENST00000568586 TRAF3IP1Q8TDR0 691 aaPredicted RBP29.41■■■□□ 2.3
RAB40C-211ENST00000568586 LRRN4Q8WUT4 740 aa29.41■■■□□ 2.3
RAB40C-211ENST00000568586 NUS1Q96E22 293 aa29.41■■■□□ 2.3
RAB40C-211ENST00000568586 MAK16Q9BXY0 300 aaKnown RBP29.41■■■□□ 2.3
RAB40C-211ENST00000568586 BRD8Q9H0E9 1235 aa29.41■■■□□ 2.3
RAB40C-211ENST00000568586 KLQ9UEF7 1012 aa29.41■■■□□ 2.3
RAB40C-211ENST00000568586 HYOU1Q9Y4L1 999 aa29.41■■■□□ 2.3
RAB40C-211ENST00000568586 HEY1Q9Y5J3 304 aa29.41■■■□□ 2.3
RAB40C-211ENST00000568586 ASXL3Q9C0F0 2248 aa29.4■■■□□ 2.3
RAB40C-211ENST00000568586 LRP4O75096 1905 aa29.4■■■□□ 2.3
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RAB40C-211ENST00000568586 TMEM202A6NGA9 273 aa29.4■■■□□ 2.3
RAB40C-211ENST00000568586 JCHAINP01591 159 aa29.4■■■□□ 2.3
RAB40C-211ENST00000568586 TRBC1P01850 177 aa29.4■■■□□ 2.3
RAB40C-211ENST00000568586 ANXA6P08133 673 aa29.4■■■□□ 2.3
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RAB40C-211ENST00000568586 DPTQ07507 201 aa29.4■■■□□ 2.3
RAB40C-211ENST00000568586 PDK1Q15118 436 aa29.4■■■□□ 2.3
RAB40C-211ENST00000568586 PTPRRQ15256 657 aa29.4■■■□□ 2.3
RAB40C-211ENST00000568586 KCTD16Q68DU8 428 aa29.4■■■□□ 2.3
RAB40C-211ENST00000568586 MFSD7Q6UXD7 560 aa29.4■■■□□ 2.3
RAB40C-211ENST00000568586 NYAP1Q6ZVC0 841 aa29.4■■■□□ 2.3
RAB40C-211ENST00000568586 TSPAN33Q86UF1 283 aa29.4■■■□□ 2.3
RAB40C-211ENST00000568586 NLRP8Q86W28 1048 aa29.4■■■□□ 2.3
RAB40C-211ENST00000568586 GAS2L3Q86XJ1 694 aa29.4■■■□□ 2.3
RAB40C-211ENST00000568586 RAVER1Q8IY67 606 aaKnown RBP29.4■■■□□ 2.3
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RAB40C-211ENST00000568586 MDM1Q8TC05 714 aa29.4■■■□□ 2.3
RAB40C-211ENST00000568586 RNF25Q96BH1 459 aaPredicted RBP29.4■■■□□ 2.3
RAB40C-211ENST00000568586 RBM15Q96T37 977 aaKnown RBP eCLIP29.4■■■□□ 2.31e-6■■■■■ 29.9
RAB40C-211ENST00000568586 TEX101Q9BY14 249 aa29.4■■■□□ 2.3
RAB40C-211ENST00000568586 WDR26Q9H7D7 661 aa29.4■■■□□ 2.3
RAB40C-211ENST00000568586 CLCA2Q9UQC9 943 aa29.4■■■□□ 2.3
RAB40C-211ENST00000568586 CELSR3Q9NYQ7 3312 aa29.4■■■□□ 2.3
RAB40C-211ENST00000568586 KCNK1O00180 336 aa29.39■■■□□ 2.3
RAB40C-211ENST00000568586 SPOPO43791 374 aa29.39■■■□□ 2.3
RAB40C-211ENST00000568586 MMP2P08253 660 aa29.39■■■□□ 2.3
RAB40C-211ENST00000568586 CYLC1P35663 651 aaPredicted RBP29.39■■■□□ 2.3
RAB40C-211ENST00000568586 ETV3P41162 512 aa29.39■■■□□ 2.3
RAB40C-211ENST00000568586 CDKN2BP42772 138 aa29.39■■■□□ 2.3
RAB40C-211ENST00000568586 SPA17Q15506 151 aa29.39■■■□□ 2.3
RAB40C-211ENST00000568586 CRTC1Q6UUV9 634 aa29.39■■■□□ 2.3
RAB40C-211ENST00000568586 SLC35F3Q8IY50 421 aa29.39■■■□□ 2.3
RAB40C-211ENST00000568586 OR1E3Q8WZA6 343 aa29.39■■■□□ 2.3
RAB40C-211ENST00000568586 LYSMD1Q96S90 227 aa29.39■■■□□ 2.3
RAB40C-211ENST00000568586 LGR4Q9BXB1 951 aa29.39■■■□□ 2.3
RAB40C-211ENST00000568586 NRSN2Q9GZP1 204 aa29.39■■■□□ 2.3
RAB40C-211ENST00000568586 FGF22Q9HCT0 170 aa29.39■■■□□ 2.3
RAB40C-211ENST00000568586 LUC7LQ9NQ29 371 aaKnown RBP29.39■■■□□ 2.3
RAB40C-211ENST00000568586 EPN1Q9Y6I3 576 aaPredicted RBP29.39■■■□□ 2.3
RAB40C-211ENST00000568586 PDE2AO00408 941 aaPredicted RBP29.38■■■□□ 2.29
RAB40C-211ENST00000568586 MT-CO3P00414 261 aa29.38■■■□□ 2.29
RAB40C-211ENST00000568586 TNFP01375 233 aa29.38■■■□□ 2.29
RAB40C-211ENST00000568586 CELA2BP08218 269 aaPredicted RBP29.38■■■□□ 2.29
RAB40C-211ENST00000568586 ZNF30P17039 623 aa29.38■■■□□ 2.29
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RAB40C-211ENST00000568586 NOP2P46087 812 aaKnown RBP29.38■■■□□ 2.29
RAB40C-211ENST00000568586 ZBTB17Q13105 803 aa29.38■■■□□ 2.29
RAB40C-211ENST00000568586 ARHGEF7Q14155 803 aa29.38■■■□□ 2.29
RAB40C-211ENST00000568586 RTP5Q14D33 572 aa29.38■■■□□ 2.29
RAB40C-211ENST00000568586 NR0B2Q15466 257 aa29.38■■■□□ 2.29
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RAB40C-211ENST00000568586 TMTC1Q8IUR5 882 aa29.38■■■□□ 2.29
RAB40C-211ENST00000568586 IFI44Q8TCB0 444 aa29.38■■■□□ 2.29
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RAB40C-211ENST00000568586 CHKBQ9Y259 395 aa29.38■■■□□ 2.29
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RAB40C-211ENST00000568586 NR2C2P49116 596 aa29.37■■■□□ 2.29
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RAB40C-211ENST00000568586 CYP4F3Q08477 520 aa29.37■■■□□ 2.29
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RAB40C-211ENST00000568586 KATNAL2Q8IYT4 538 aa29.37■■■□□ 2.29
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RAB40C-211ENST00000568586 ZNF765Q7L2R6 523 aa29.36■■■□□ 2.29
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RAB40C-211ENST00000568586 CALR3Q96L12 384 aaKnown RBP29.36■■■□□ 2.29
RAB40C-211ENST00000568586 SMIM14Q96QK8 99 aa29.36■■■□□ 2.29
RAB40C-211ENST00000568586 PCDH9Q9HC56 1237 aa29.36■■■□□ 2.29
RAB40C-211ENST00000568586 TTLL3Q9Y4R7 772 aa29.36■■■□□ 2.29
RAB40C-211ENST00000568586 ITPR1Q14643 2758 aa29.36■■■□□ 2.29
RAB40C-211ENST00000568586 MYLKQ15746 1914 aa29.35■■■□□ 2.29
RAB40C-211ENST00000568586 STC1P52823 247 aa29.35■■■□□ 2.29
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