RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000563200.5

PPP4C-205, Transcript of protein phosphatase 4 catalytic subunit, human

TSL 5

Gene PPP4C, Length 1,447 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PPP4C-205	ENST00000563200	NFKBIA	P25963	317 aa		21.79	■■□□□ 1.08
PPP4C-205	ENST00000563200	ETV3	P41162	512 aa		21.79	■■□□□ 1.08
PPP4C-205	ENST00000563200	SLC1A1	P43005	524 aa		21.79	■■□□□ 1.08
PPP4C-205	ENST00000563200	ITK	Q08881	620 aa		21.79	■■□□□ 1.08
PPP4C-205	ENST00000563200	NIPAL4	Q0D2K0	466 aa		21.79	■■□□□ 1.08
PPP4C-205	ENST00000563200	ZFYVE27	Q5T4F4	411 aa		21.79	■■□□□ 1.08
PPP4C-205	ENST00000563200	EFL1	Q7Z2Z2	1120 aa	Known RBP	21.79	■■□□□ 1.08
PPP4C-205	ENST00000563200	RD3	Q7Z3Z2	195 aa		21.79	■■□□□ 1.08
PPP4C-205	ENST00000563200	CCDC13	Q8IYE1	715 aa		21.79	■■□□□ 1.08
PPP4C-205	ENST00000563200	NUS1	Q96E22	293 aa		21.79	■■□□□ 1.08
PPP4C-205	ENST00000563200	SMIM14	Q96QK8	99 aa		21.79	■■□□□ 1.08
PPP4C-205	ENST00000563200	LGMN	Q99538	433 aa		21.79	■■□□□ 1.08
PPP4C-205	ENST00000563200	TDRD1	Q9BXT4	1180 aa	Known RBP	21.79	■■□□□ 1.08
PPP4C-205	ENST00000563200	WDR26	Q9H7D7	661 aa		21.79	■■□□□ 1.08
PPP4C-205	ENST00000563200	KCTD5	Q9NXV2	234 aa		21.79	■■□□□ 1.08
PPP4C-205	ENST00000563200	ARHGEF17	Q96PE2	2063 aa	Predicted RBP	21.78	■■□□□ 1.08
PPP4C-205	ENST00000563200	IGSF10	Q6WRI0	2623 aa		21.78	■■□□□ 1.08
PPP4C-205	ENST00000563200	ADAMTS20	P59510	1910 aa		21.78	■■□□□ 1.08
PPP4C-205	ENST00000563200	CPED1	A4D0V7	1026 aa		21.78	■■□□□ 1.08
PPP4C-205	ENST00000563200	PRL	P01236	227 aa		21.78	■■□□□ 1.08
PPP4C-205	ENST00000563200	ALPI	P09923	528 aa		21.78	■■□□□ 1.08
PPP4C-205	ENST00000563200	TGM2	P21980	687 aa		21.78	■■□□□ 1.08
PPP4C-205	ENST00000563200	HADHB	P55084	474 aa	Known RBP	21.78	■■□□□ 1.08
PPP4C-205	ENST00000563200	PPID	Q08752	370 aa	Known RBP	21.78	■■□□□ 1.08
PPP4C-205	ENST00000563200	USP45	Q70EL2	814 aa		21.78	■■□□□ 1.08
PPP4C-205	ENST00000563200	TECPR1	Q7Z6L1	1165 aa		21.78	■■□□□ 1.08
PPP4C-205	ENST00000563200	MAPK15	Q8TD08	544 aa		21.78	■■□□□ 1.08
PPP4C-205	ENST00000563200	TEX101	Q9BY14	249 aa		21.78	■■□□□ 1.08
PPP4C-205	ENST00000563200	MRPL40	Q9NQ50	206 aa	Known RBP	21.78	■■□□□ 1.08
PPP4C-205	ENST00000563200	SMG1	Q96Q15	3661 aa	Known RBP	21.77	■■□□□ 1.08
PPP4C-205	ENST00000563200		A0A0J9YYE9	177 aa		21.77	■■□□□ 1.08
PPP4C-205	ENST00000563200		A0A0U1RQS6	177 aa		21.77	■■□□□ 1.08
PPP4C-205	ENST00000563200	TNF	P01375	233 aa		21.77	■■□□□ 1.08
PPP4C-205	ENST00000563200	TRBC1	P01850	177 aa		21.77	■■□□□ 1.08
PPP4C-205	ENST00000563200	CTSE	P14091	401 aa		21.77	■■□□□ 1.08
PPP4C-205	ENST00000563200	CTPS1	P17812	591 aa		21.77	■■□□□ 1.08
PPP4C-205	ENST00000563200	KEL	P23276	732 aa		21.77	■■□□□ 1.08
PPP4C-205	ENST00000563200	RPIA	P49247	311 aa		21.77	■■□□□ 1.08
PPP4C-205	ENST00000563200	PERM1	Q5SV97	790 aa		21.77	■■□□□ 1.08
PPP4C-205	ENST00000563200	DENND2C	Q68D51	928 aa		21.77	■■□□□ 1.08
PPP4C-205	ENST00000563200	CRTC1	Q6UUV9	634 aa		21.77	■■□□□ 1.08
PPP4C-205	ENST00000563200		Q6ZVL8	140 aa		21.77	■■□□□ 1.08
PPP4C-205	ENST00000563200	CNTD1	Q8N815	330 aa		21.77	■■□□□ 1.08
PPP4C-205	ENST00000563200	CCNY	Q8ND76	341 aa		21.77	■■□□□ 1.08
PPP4C-205	ENST00000563200	GLMN	Q92990	594 aa		21.77	■■□□□ 1.08
PPP4C-205	ENST00000563200	OLFM3	Q96PB7	478 aa		21.77	■■□□□ 1.08
PPP4C-205	ENST00000563200	HYOU1	Q9Y4L1	999 aa		21.77	■■□□□ 1.08
PPP4C-205	ENST00000563200	PCDHB1	Q9Y5F3	818 aa		21.77	■■□□□ 1.08
PPP4C-205	ENST00000563200	KCNK1	O00180	336 aa		21.76	■■□□□ 1.07
PPP4C-205	ENST00000563200	MMP2	P08253	660 aa		21.76	■■□□□ 1.07
PPP4C-205	ENST00000563200	MYCLP1	P12525	358 aa	Predicted RBP	21.76	■■□□□ 1.07
PPP4C-205	ENST00000563200	TEAD1	P28347	426 aa		21.76	■■□□□ 1.07
PPP4C-205	ENST00000563200	IFI35	P80217	286 aa	Predicted RBP	21.76	■■□□□ 1.07
PPP4C-205	ENST00000563200	PTS	Q03393	145 aa		21.76	■■□□□ 1.07
PPP4C-205	ENST00000563200	RHOT1	Q8IXI2	618 aa		21.76	■■□□□ 1.07
PPP4C-205	ENST00000563200	ZC3H8	Q8N5P1	291 aa	Known RBP eCLIP	21.76	■■□□□ 1.07
PPP4C-205	ENST00000563200	ARL10	Q8N8L6	244 aa		21.76	■■□□□ 1.07
PPP4C-205	ENST00000563200	NAT6	Q93015	286 aa		21.76	■■□□□ 1.07
PPP4C-205	ENST00000563200	ABCG4	Q9H172	646 aa		21.76	■■□□□ 1.07
PPP4C-205	ENST00000563200	CHKB	Q9Y259	395 aa		21.76	■■□□□ 1.07
PPP4C-205	ENST00000563200	TTLL3	Q9Y4R7	772 aa		21.76	■■□□□ 1.07
PPP4C-205	ENST00000563200	HEY1	Q9Y5J3	304 aa		21.76	■■□□□ 1.07
PPP4C-205	ENST00000563200	JCHAIN	P01591	159 aa		21.75	■■□□□ 1.07
PPP4C-205	ENST00000563200	COMT	P21964	271 aa		21.75	■■□□□ 1.07
PPP4C-205	ENST00000563200	MAGEA1	P43355	309 aa		21.75	■■□□□ 1.07
PPP4C-205	ENST00000563200	DPT	Q07507	201 aa		21.75	■■□□□ 1.07
PPP4C-205	ENST00000563200	ZBTB17	Q13105	803 aa		21.75	■■□□□ 1.07
PPP4C-205	ENST00000563200	ARHGEF7	Q14155	803 aa		21.75	■■□□□ 1.07
PPP4C-205	ENST00000563200	TCEA2	Q15560	299 aa		21.75	■■□□□ 1.07
PPP4C-205	ENST00000563200	TAZ	Q16635	292 aa		21.75	■■□□□ 1.07
PPP4C-205	ENST00000563200	LRRC66	Q68CR7	880 aa		21.75	■■□□□ 1.07
PPP4C-205	ENST00000563200	RFLNA	Q6ZTI6	216 aa		21.75	■■□□□ 1.07
PPP4C-205	ENST00000563200	HEATR4	Q86WZ0	1026 aa		21.75	■■□□□ 1.07
PPP4C-205	ENST00000563200	GKN2	Q86XP6	184 aa		21.75	■■□□□ 1.07
PPP4C-205	ENST00000563200	NDUFAF2	Q8N183	169 aa		21.75	■■□□□ 1.07
PPP4C-205	ENST00000563200	KY	Q8NBH2	561 aa		21.75	■■□□□ 1.07
PPP4C-205	ENST00000563200	SCG3	Q8WXD2	468 aa	Known RBP	21.75	■■□□□ 1.07
PPP4C-205	ENST00000563200	ZNF830	Q96NB3	372 aa	Predicted RBP	21.75	■■□□□ 1.07
PPP4C-205	ENST00000563200	DEPDC7	Q96QD5	511 aa		21.75	■■□□□ 1.07
PPP4C-205	ENST00000563200	HAUS2	Q9NVX0	235 aa		21.75	■■□□□ 1.07
PPP4C-205	ENST00000563200	RALY	Q9UKM9	306 aa	Known RBP	21.75	■■□□□ 1.07
PPP4C-205	ENST00000563200	PADI4	Q9UM07	663 aa		21.75	■■□□□ 1.07
PPP4C-205	ENST00000563200	DOLK	Q9UPQ8	538 aa		21.75	■■□□□ 1.07
PPP4C-205	ENST00000563200		A0A087WV48	116 aa		21.74	■■□□□ 1.07
PPP4C-205	ENST00000563200	PDE2A	O00408	941 aa	Predicted RBP	21.74	■■□□□ 1.07
PPP4C-205	ENST00000563200	APOL1	O14791	398 aa		21.74	■■□□□ 1.07
PPP4C-205	ENST00000563200	CASC3	O15234	703 aa	Known RBP	21.74	■■□□□ 1.07
PPP4C-205	ENST00000563200	SOD1	P00441	154 aa		21.74	■■□□□ 1.07
PPP4C-205	ENST00000563200	FUCA1	P04066	466 aa		21.74	■■□□□ 1.07
PPP4C-205	ENST00000563200	KRT1	P04264	644 aa		21.74	■■□□□ 1.07
PPP4C-205	ENST00000563200	KRT10	P13645	584 aa		21.74	■■□□□ 1.07
PPP4C-205	ENST00000563200	RPL26	P61254	145 aa	Known RBP	21.74	■■□□□ 1.07
PPP4C-205	ENST00000563200	CDK3	Q00526	305 aa		21.74	■■□□□ 1.07
PPP4C-205	ENST00000563200	MFSD7	Q6UXD7	560 aa		21.74	■■□□□ 1.07
PPP4C-205	ENST00000563200	CCDC170	Q8IYT3	715 aa		21.74	■■□□□ 1.07
PPP4C-205	ENST00000563200	TRAF3IP1	Q8TDR0	691 aa	Predicted RBP	21.74	■■□□□ 1.07
PPP4C-205	ENST00000563200	RNF25	Q96BH1	459 aa	Predicted RBP	21.74	■■□□□ 1.07
PPP4C-205	ENST00000563200	LYSMD1	Q96S90	227 aa		21.74	■■□□□ 1.07
PPP4C-205	ENST00000563200	TMEM168	Q9H0V1	697 aa		21.74	■■□□□ 1.07
PPP4C-205	ENST00000563200	RBSN	Q9H1K0	784 aa		21.74	■■□□□ 1.07

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 88.2 ms