RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000550233.1

TMEM116-211, Transcript of transmembrane protein 116, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 5

Gene TMEM116, Length 571 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM116-211ENST00000550233 TMCC1O94876 653 aa4.89□□□□□ -1.63
TMEM116-211ENST00000550233 NFATC1O95644 943 aa4.89□□□□□ -1.63
TMEM116-211ENST00000550233 SUPT20HL2P0C7V6 817 aa4.89□□□□□ -1.63
TMEM116-211ENST00000550233 ANXA7P20073 488 aaKnown RBP4.89□□□□□ -1.63
TMEM116-211ENST00000550233 KLRC2P26717 231 aa4.89□□□□□ -1.63
TMEM116-211ENST00000550233 ACADLP28330 430 aa4.89□□□□□ -1.63
TMEM116-211ENST00000550233 IDUAP35475 653 aa4.89□□□□□ -1.63
TMEM116-211ENST00000550233 SOX2P48431 317 aa4.89□□□□□ -1.63
TMEM116-211ENST00000550233 CCT8P50990 548 aa4.89□□□□□ -1.63
TMEM116-211ENST00000550233 GPR143P51810 404 aa4.89□□□□□ -1.63
TMEM116-211ENST00000550233 ZNF131P52739 623 aa4.89□□□□□ -1.63
TMEM116-211ENST00000550233 SIRPAP78324 504 aa4.89□□□□□ -1.63
TMEM116-211ENST00000550233 ACTN3Q08043 901 aaPredicted RBP4.89□□□□□ -1.63
TMEM116-211ENST00000550233 TEFQ10587 303 aa4.89□□□□□ -1.63
TMEM116-211ENST00000550233 SUPT20HL1Q3ZLR7 823 aa4.89□□□□□ -1.63
TMEM116-211ENST00000550233 ANKRD20A4Q4UJ75 823 aa4.89□□□□□ -1.63
TMEM116-211ENST00000550233 PLEKHO1Q53GL0 409 aaPredicted RBP4.89□□□□□ -1.63
TMEM116-211ENST00000550233 ANKRD20A8PQ5CZ79 823 aa4.89□□□□□ -1.63
TMEM116-211ENST00000550233 ANKRD20A2Q5SQ80 823 aa4.89□□□□□ -1.63
TMEM116-211ENST00000550233 ANKRD20A1Q5TYW2 823 aa4.89□□□□□ -1.63
TMEM116-211ENST00000550233 ANKRD20A3Q5VUR7 823 aa4.89□□□□□ -1.63
TMEM116-211ENST00000550233 LAIR1Q6GTX8 287 aa4.89□□□□□ -1.63
TMEM116-211ENST00000550233 RAB12Q6IQ22 244 aa4.89□□□□□ -1.63
TMEM116-211ENST00000550233 MOXD1Q6UVY6 613 aa4.89□□□□□ -1.63
TMEM116-211ENST00000550233 LCTLQ6UWM7 567 aa4.89□□□□□ -1.63
TMEM116-211ENST00000550233 TRIM72Q6ZMU5 477 aa4.89□□□□□ -1.63
TMEM116-211ENST00000550233 CYB5R4Q7L1T6 521 aa4.89□□□□□ -1.63
TMEM116-211ENST00000550233 SPATA19Q7Z5L4 167 aa4.89□□□□□ -1.63
TMEM116-211ENST00000550233 WDR63Q8IWG1 891 aa4.89□□□□□ -1.63
TMEM116-211ENST00000550233 TIGD4Q8IY51 512 aa4.89□□□□□ -1.63
TMEM116-211ENST00000550233 CADM3Q8N126 398 aa4.89□□□□□ -1.63
TMEM116-211ENST00000550233 TMEM217Q8N7C4 229 aa4.89□□□□□ -1.63
TMEM116-211ENST00000550233 SPATA20Q8TB22 786 aa4.89□□□□□ -1.63
TMEM116-211ENST00000550233 IP6K1Q92551 441 aa4.89□□□□□ -1.63
TMEM116-211ENST00000550233 CORO2AQ92828 525 aa4.89□□□□□ -1.63
TMEM116-211ENST00000550233 LENG9Q96B70 501 aa4.89□□□□□ -1.63
TMEM116-211ENST00000550233 SLC41A2Q96JW4 573 aa4.89□□□□□ -1.63
TMEM116-211ENST00000550233 Q96MF0 132 aa4.89□□□□□ -1.63
TMEM116-211ENST00000550233 CDRT15Q96T59 188 aa4.89□□□□□ -1.63
TMEM116-211ENST00000550233 AGAP2Q99490 1192 aa4.89□□□□□ -1.63
TMEM116-211ENST00000550233 FAM110AQ9BQ89 295 aa4.89□□□□□ -1.63
TMEM116-211ENST00000550233 MXRA8Q9BRK3 442 aa4.89□□□□□ -1.63
TMEM116-211ENST00000550233 FRMD8Q9BZ67 464 aaPredicted RBP4.89□□□□□ -1.63
TMEM116-211ENST00000550233 WDR11Q9BZH6 1224 aa4.89□□□□□ -1.63
TMEM116-211ENST00000550233 MAGEE1Q9HCI5 957 aa4.89□□□□□ -1.63
TMEM116-211ENST00000550233 HAO2Q9NYQ3 351 aa4.89□□□□□ -1.63
TMEM116-211ENST00000550233 CTNNAL1Q9UBT7 734 aa4.89□□□□□ -1.63
TMEM116-211ENST00000550233 DNAJB4Q9UDY4 337 aa4.89□□□□□ -1.63
TMEM116-211ENST00000550233 ERVK-11Q9UQG0 969 aa4.89□□□□□ -1.63
TMEM116-211ENST00000550233 MTF2Q9Y483 593 aaPredicted RBP4.89□□□□□ -1.63
TMEM116-211ENST00000550233 TCAF1Q9Y4C2 921 aa4.89□□□□□ -1.63
TMEM116-211ENST00000550233 LIPGQ9Y5X9 500 aa4.89□□□□□ -1.63
TMEM116-211ENST00000550233 SPAG9O60271 1321 aaKnown RBP4.89□□□□□ -1.63
TMEM116-211ENST00000550233 A4D1N5 150 aa4.88□□□□□ -1.63
TMEM116-211ENST00000550233 OOEPA6NGQ2 149 aa4.88□□□□□ -1.63
TMEM116-211ENST00000550233 ENO4A6NNW6 628 aa4.88□□□□□ -1.63
TMEM116-211ENST00000550233 KLRF2D3W0D1 207 aa4.88□□□□□ -1.63
TMEM116-211ENST00000550233 RTN2O75298 545 aa4.88□□□□□ -1.63
TMEM116-211ENST00000550233 PPFIA2O75334 1257 aa4.88□□□□□ -1.63
TMEM116-211ENST00000550233 PENKP01210 267 aaPredicted RBP4.88□□□□□ -1.63
TMEM116-211ENST00000550233 TFEBP19484 476 aa4.88□□□□□ -1.63
TMEM116-211ENST00000550233 AGAP20933 346 aa4.88□□□□□ -1.63
TMEM116-211ENST00000550233 BMP5P22003 454 aa4.88□□□□□ -1.63
TMEM116-211ENST00000550233 IL10P22301 178 aa4.88□□□□□ -1.63
TMEM116-211ENST00000550233 GPTP24298 496 aa4.88□□□□□ -1.63
TMEM116-211ENST00000550233 SHMT1P34896 483 aa4.88□□□□□ -1.63
TMEM116-211ENST00000550233 HSPA4P34932 840 aa4.88□□□□□ -1.63
TMEM116-211ENST00000550233 PCGF2P35227 344 aa4.88□□□□□ -1.63
TMEM116-211ENST00000550233 PTGS2P35354 604 aa4.88□□□□□ -1.63
TMEM116-211ENST00000550233 CASP3P42574 277 aa4.88□□□□□ -1.63
TMEM116-211ENST00000550233 CLCN3P51790 818 aa4.88□□□□□ -1.63
TMEM116-211ENST00000550233 EVCP57679 992 aa4.88□□□□□ -1.63
TMEM116-211ENST00000550233 STX1BP61266 288 aa4.88□□□□□ -1.63
TMEM116-211ENST00000550233 HOXA4Q00056 320 aaPredicted RBP4.88□□□□□ -1.63
TMEM116-211ENST00000550233 SLC14A1Q13336 389 aa4.88□□□□□ -1.63
TMEM116-211ENST00000550233 ITGADQ13349 1161 aa4.88□□□□□ -1.63
TMEM116-211ENST00000550233 PPIGQ13427 754 aaKnown RBP eCLIP4.88□□□□□ -1.63
TMEM116-211ENST00000550233 PTPRCAPQ14761 206 aa4.88□□□□□ -1.63
TMEM116-211ENST00000550233 KPNB1Q14974 876 aaKnown RBP4.88□□□□□ -1.63
TMEM116-211ENST00000550233 PRKD1Q15139 912 aaPredicted RBP4.88□□□□□ -1.63
TMEM116-211ENST00000550233 FAM153CQ494X1 144 aa4.88□□□□□ -1.63
TMEM116-211ENST00000550233 FUT11Q495W5 492 aa4.88□□□□□ -1.63
TMEM116-211ENST00000550233 CDONQ4KMG0 1287 aa4.88□□□□□ -1.63
TMEM116-211ENST00000550233 DNAJC21Q5F1R6 531 aaKnown RBP4.88□□□□□ -1.63
TMEM116-211ENST00000550233 ZRANB3Q5FWF4 1079 aa4.88□□□□□ -1.63
TMEM116-211ENST00000550233 PLA2G4FQ68DD2 849 aa4.88□□□□□ -1.63
TMEM116-211ENST00000550233 KRT39Q6A163 491 aa4.88□□□□□ -1.63
TMEM116-211ENST00000550233 PLEKHA7Q6IQ23 1121 aa4.88□□□□□ -1.63
TMEM116-211ENST00000550233 DPY19L2P1Q6NXN4 242 aa4.88□□□□□ -1.63
TMEM116-211ENST00000550233 LRIG3Q6UXM1 1119 aa4.88□□□□□ -1.63
TMEM116-211ENST00000550233 Q6ZNX1 250 aa4.88□□□□□ -1.63
TMEM116-211ENST00000550233 LINGO2Q7L985 606 aa4.88□□□□□ -1.63
TMEM116-211ENST00000550233 CCDC13Q8IYE1 715 aa4.88□□□□□ -1.63
TMEM116-211ENST00000550233 GJC3Q8NFK1 279 aa4.88□□□□□ -1.63
TMEM116-211ENST00000550233 BEST2Q8NFU1 509 aa4.88□□□□□ -1.63
TMEM116-211ENST00000550233 CFAP61Q8NHU2 1237 aa4.88□□□□□ -1.63
TMEM116-211ENST00000550233 HUS1BQ8NHY5 278 aa4.88□□□□□ -1.63
TMEM116-211ENST00000550233 NEU4Q8WWR8 484 aaPredicted RBP4.88□□□□□ -1.63
TMEM116-211ENST00000550233 ASB10Q8WXI3 467 aa4.88□□□□□ -1.63
TMEM116-211ENST00000550233 TAF4BQ92750 862 aa4.88□□□□□ -1.63
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 34.6 ms