RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000547298.5

CS-208, Transcript of citrate synthase, humanhuman

TSL 3

Gene CS, Length 656 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CS-208ENST00000547298 DNM1Q05193 864 aaKnown RBP11.26□□□□□ -0.61
CS-208ENST00000547298 ILF3Q12906 894 aaKnown RBP eCLIP11.26□□□□□ -0.61
CS-208ENST00000547298 DNASE1L3Q13609 305 aa11.26□□□□□ -0.61
CS-208ENST00000547298 RAPGEF1Q13905 1077 aa11.26□□□□□ -0.61
CS-208ENST00000547298 ZRSR2Q15696 482 aaKnown RBP11.26□□□□□ -0.61
CS-208ENST00000547298 TSR1Q2NL82 804 aaKnown RBP11.26□□□□□ -0.61
CS-208ENST00000547298 C8orf34Q49A92 452 aa11.26□□□□□ -0.61
CS-208ENST00000547298 CRB2Q5IJ48 1285 aa11.26□□□□□ -0.61
CS-208ENST00000547298 CHCHD2P9Q5T1J5 151 aaPredicted RBP11.26□□□□□ -0.61
CS-208ENST00000547298 PNCKQ6P2M8 343 aa11.26□□□□□ -0.61
CS-208ENST00000547298 LIPIQ6XZB0 460 aa11.26□□□□□ -0.61
CS-208ENST00000547298 SLC26A9Q7LBE3 791 aa11.26□□□□□ -0.61
CS-208ENST00000547298 BNIPLQ7Z465 357 aa11.26□□□□□ -0.61
CS-208ENST00000547298 SMYD4Q8IYR2 804 aaPredicted RBP11.26□□□□□ -0.61
CS-208ENST00000547298 ZNF397Q8NF99 534 aaPredicted RBP11.26□□□□□ -0.61
CS-208ENST00000547298 PNPLA2Q96AD5 504 aa11.26□□□□□ -0.61
CS-208ENST00000547298 GDAP1L1Q96MZ0 367 aa11.26□□□□□ -0.61
CS-208ENST00000547298 BARD1Q99728 777 aaKnown RBP11.26□□□□□ -0.61
CS-208ENST00000547298 FRMD8Q9BZ67 464 aaPredicted RBP11.26□□□□□ -0.61
CS-208ENST00000547298 SLAMF7Q9NQ25 335 aa11.26□□□□□ -0.61
CS-208ENST00000547298 MAP10Q9P2G4 905 aa11.26□□□□□ -0.61
CS-208ENST00000547298 PPARGC1AQ9UBK2 798 aaKnown RBP11.26□□□□□ -0.61
CS-208ENST00000547298 NEU3Q9UQ49 428 aa11.26□□□□□ -0.61
CS-208ENST00000547298 CFAP69A5D8W1 941 aa11.25□□□□□ -0.61
CS-208ENST00000547298 A6NCN8 305 aa11.25□□□□□ -0.61
CS-208ENST00000547298 SLC16A3O15427 465 aaKnown RBP11.25□□□□□ -0.61
CS-208ENST00000547298 EML2O95834 649 aa11.25□□□□□ -0.61
CS-208ENST00000547298 MYCLP1P12525 358 aaPredicted RBP11.25□□□□□ -0.61
CS-208ENST00000547298 GNPDA1P46926 289 aa11.25□□□□□ -0.61
CS-208ENST00000547298 NDST2P52849 883 aa11.25□□□□□ -0.61
CS-208ENST00000547298 PMS1P54277 932 aaKnown RBP11.25□□□□□ -0.61
CS-208ENST00000547298 ITGA1P56199 1179 aa11.25□□□□□ -0.61
CS-208ENST00000547298 GEMIN4P57678 1058 aaKnown RBP11.25□□□□□ -0.61
CS-208ENST00000547298 SLC6A3Q01959 620 aa11.25□□□□□ -0.61
CS-208ENST00000547298 BIRC2Q13490 618 aa11.25□□□□□ -0.61
CS-208ENST00000547298 MANEALQ5VSG8 457 aa11.25□□□□□ -0.61
CS-208ENST00000547298 C11orf57Q6ZUT1 292 aaPredicted RBP11.25□□□□□ -0.61
CS-208ENST00000547298 OR10G6Q8NH81 332 aa11.25□□□□□ -0.61
CS-208ENST00000547298 SLC37A2Q8TED4 501 aa11.25□□□□□ -0.61
CS-208ENST00000547298 CT55Q8WUE5 264 aa11.25□□□□□ -0.61
CS-208ENST00000547298 TBCBQ99426 244 aa11.25□□□□□ -0.61
CS-208ENST00000547298 KLC2Q9H0B6 622 aa11.25□□□□□ -0.61
CS-208ENST00000547298 ING2Q9H160 280 aa11.25□□□□□ -0.61
CS-208ENST00000547298 WDR26Q9H7D7 661 aa11.25□□□□□ -0.61
CS-208ENST00000547298 AKIRIN1Q9H9L7 192 aaPredicted RBP11.25□□□□□ -0.61
CS-208ENST00000547298 PPP4R2Q9NY27 417 aa11.25□□□□□ -0.61
CS-208ENST00000547298 LHX3Q9UBR4 397 aa11.25□□□□□ -0.61
CS-208ENST00000547298 SUFUQ9UMX1 484 aa11.25□□□□□ -0.61
CS-208ENST00000547298 ATP8A1Q9Y2Q0 1164 aa11.25□□□□□ -0.61
CS-208ENST00000547298 ZNF451Q9Y4E5 1061 aa11.25□□□□□ -0.61
CS-208ENST00000547298 PCDHGB7Q9Y5F8 929 aa11.25□□□□□ -0.61
CS-208ENST00000547298 FBN3Q75N90 2809 aa11.25□□□□□ -0.61
CS-208ENST00000547298 PCSK5Q92824 1860 aa11.24□□□□□ -0.61
CS-208ENST00000547298 TRBV23OR9-2A0A075B6M9 112 aa11.24□□□□□ -0.61
CS-208ENST00000547298 ZSCAN5CA6NGD5 496 aaPredicted RBP11.24□□□□□ -0.61
CS-208ENST00000547298 ARGFXA6NJG6 315 aa11.24□□□□□ -0.61
CS-208ENST00000547298 TEX33O43247 280 aa11.24□□□□□ -0.61
CS-208ENST00000547298 KDELR3O43731 214 aa11.24□□□□□ -0.61
CS-208ENST00000547298 DPM1O60762 260 aa11.24□□□□□ -0.61
CS-208ENST00000547298 LRCH4O75427 683 aa11.24□□□□□ -0.61
CS-208ENST00000547298 KIAA0754O94854 1291 aa11.24□□□□□ -0.61
CS-208ENST00000547298 IGSF6O95976 241 aa11.24□□□□□ -0.61
CS-208ENST00000547298 XPAP23025 273 aaPredicted RBP11.24□□□□□ -0.61
CS-208ENST00000547298 ADCY8P40145 1251 aa11.24□□□□□ -0.61
CS-208ENST00000547298 POLD2P49005 469 aa11.24□□□□□ -0.61
CS-208ENST00000547298 SULT1E1P49888 294 aa11.24□□□□□ -0.61
CS-208ENST00000547298 SH3BP2P78314 561 aa11.24□□□□□ -0.61
CS-208ENST00000547298 DEUP1Q05D60 604 aa11.24□□□□□ -0.61
CS-208ENST00000547298 CHRNA6Q15825 494 aa11.24□□□□□ -0.61
CS-208ENST00000547298 UGT8Q16880 541 aa11.24□□□□□ -0.61
CS-208ENST00000547298 PLEKHN1Q494U1 663 aaPredicted RBP11.24□□□□□ -0.61
CS-208ENST00000547298 PTPN20Q4JDL3 420 aa11.24□□□□□ -0.61
CS-208ENST00000547298 ACBD5Q5T8D3 534 aaPredicted RBP11.24□□□□□ -0.61
CS-208ENST00000547298 AFMIDQ63HM1 303 aa11.24□□□□□ -0.61
CS-208ENST00000547298 TRNP1Q6NT89 227 aa11.24□□□□□ -0.61
CS-208ENST00000547298 SPNS3Q6ZMD2 512 aa11.24□□□□□ -0.61
CS-208ENST00000547298 SFRP1Q8N474 314 aa11.24□□□□□ -0.61
CS-208ENST00000547298 CISD2Q8N5K1 135 aaKnown RBP11.24□□□□□ -0.61
CS-208ENST00000547298 FDCSPQ8NFU4 85 aa11.24□□□□□ -0.61
CS-208ENST00000547298 THAP4Q8WY91 577 aa11.24□□□□□ -0.61
CS-208ENST00000547298 NCSTNQ92542 709 aa11.24□□□□□ -0.61
CS-208ENST00000547298 AHCYL2Q96HN2 611 aaKnown RBP11.24□□□□□ -0.61
CS-208ENST00000547298 INTS4Q96HW7 963 aaKnown RBP11.24□□□□□ -0.61
CS-208ENST00000547298 ZNF396Q96N95 335 aaPredicted RBP11.24□□□□□ -0.61
CS-208ENST00000547298 SLC38A3Q99624 504 aa11.24□□□□□ -0.61
CS-208ENST00000547298 NUDT9Q9BW91 350 aa11.24□□□□□ -0.61
CS-208ENST00000547298 TEX101Q9BY14 249 aa11.24□□□□□ -0.61
CS-208ENST00000547298 MAGEB5Q9BZ81 275 aa11.24□□□□□ -0.61
CS-208ENST00000547298 ACTL8Q9H568 366 aa11.24□□□□□ -0.61
CS-208ENST00000547298 SUV39H2Q9H5I1 410 aa11.24□□□□□ -0.61
CS-208ENST00000547298 DNAI1Q9UI46 699 aa11.24□□□□□ -0.61
CS-208ENST00000547298 HPSEQ9Y251 543 aa11.24□□□□□ -0.61
CS-208ENST00000547298 MTORP42345 2549 aa11.24□□□□□ -0.61
CS-208ENST00000547298 POLEQ07864 2286 aa11.23□□□□□ -0.61
CS-208ENST00000547298 HEATR9A2RTY3 570 aa11.23□□□□□ -0.61
CS-208ENST00000547298 THAP12O43422 761 aa11.23□□□□□ -0.61
CS-208ENST00000547298 MED7O43513 233 aa11.23□□□□□ -0.61
CS-208ENST00000547298 ANKRD34CP0C6C1 535 aa11.23□□□□□ -0.61
CS-208ENST00000547298 KRT5P13647 590 aa11.23□□□□□ -0.61
CS-208ENST00000547298 GNA15P30679 374 aa11.23□□□□□ -0.61
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 37.2 ms