RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000520276.5

TRPS1-211, Transcript of transcriptional repressor GATA binding 1, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene TRPS1, Length 4,083 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRPS1-211ENST00000520276 KCNE1P15382 129 aa10.13□□□□□ -0.79
TRPS1-211ENST00000520276 POLR2EP19388 210 aaKnown RBP10.13□□□□□ -0.79
TRPS1-211ENST00000520276 NDUFV1P49821 464 aa10.13□□□□□ -0.79
TRPS1-211ENST00000520276 PRKAA2P54646 552 aa10.13□□□□□ -0.79
TRPS1-211ENST00000520276 COPZ1P61923 177 aa10.13□□□□□ -0.79
TRPS1-211ENST00000520276 SLC13A2Q13183 592 aa10.13□□□□□ -0.79
TRPS1-211ENST00000520276 AQP6Q13520 282 aa10.13□□□□□ -0.79
TRPS1-211ENST00000520276 CEP78Q5JTW2 689 aa10.13□□□□□ -0.79
TRPS1-211ENST00000520276 TMTC4Q5T4D3 741 aa10.13□□□□□ -0.79
TRPS1-211ENST00000520276 UGT3A1Q6NUS8 523 aa10.13□□□□□ -0.79
TRPS1-211ENST00000520276 SLC22A16Q86VW1 577 aa10.13□□□□□ -0.79
TRPS1-211ENST00000520276 HEATR4Q86WZ0 1026 aa10.13□□□□□ -0.79
TRPS1-211ENST00000520276 MPP5Q8N3R9 675 aa10.13□□□□□ -0.79
TRPS1-211ENST00000520276 NATD1Q8N6N6 113 aa10.13□□□□□ -0.79
TRPS1-211ENST00000520276 CYGBQ8WWM9 190 aa10.13□□□□□ -0.79
TRPS1-211ENST00000520276 ZUFSPQ96AP4 578 aa10.13□□□□□ -0.79
TRPS1-211ENST00000520276 ADI1Q9BV57 179 aa10.13□□□□□ -0.79
TRPS1-211ENST00000520276 FANCEQ9HB96 536 aa10.13□□□□□ -0.79
TRPS1-211ENST00000520276 NGRNQ9NPE2 291 aaKnown RBP10.13□□□□□ -0.79
TRPS1-211ENST00000520276 TCF7L2Q9NQB0 619 aa10.13□□□□□ -0.79
TRPS1-211ENST00000520276 IPO11Q9UI26 975 aaKnown RBP10.13□□□□□ -0.79
TRPS1-211ENST00000520276 PTBP2Q9UKA9 531 aaKnown RBP10.13□□□□□ -0.79
TRPS1-211ENST00000520276 MEIS3P2A8K0S8 358 aa10.12□□□□□ -0.79
TRPS1-211ENST00000520276 AXIN1O15169 862 aa10.12□□□□□ -0.79
TRPS1-211ENST00000520276 NOL3O60936 208 aaKnown RBP10.12□□□□□ -0.79
TRPS1-211ENST00000520276 TSHRP16473 764 aa10.12□□□□□ -0.79
TRPS1-211ENST00000520276 MYF6P23409 242 aa10.12□□□□□ -0.79
TRPS1-211ENST00000520276 RACK1P63244 317 aaKnown RBP10.12□□□□□ -0.79
TRPS1-211ENST00000520276 NOMO3P69849 1222 aa10.12□□□□□ -0.79
TRPS1-211ENST00000520276 PHC1P78364 1004 aa10.12□□□□□ -0.79
TRPS1-211ENST00000520276 LGSNQ5TDP6 509 aa10.12□□□□□ -0.79
TRPS1-211ENST00000520276 SLC39A4Q6P5W5 647 aa10.12□□□□□ -0.79
TRPS1-211ENST00000520276 NPNTQ6UXI9 565 aa10.12□□□□□ -0.79
TRPS1-211ENST00000520276 ZNF280BQ86YH2 543 aa10.12□□□□□ -0.79
TRPS1-211ENST00000520276 GRAMD2AQ8IUY3 354 aa10.12□□□□□ -0.79
TRPS1-211ENST00000520276 OR13F1Q8NGS4 319 aa10.12□□□□□ -0.79
TRPS1-211ENST00000520276 POF1BQ8WVV4 589 aa10.12□□□□□ -0.79
TRPS1-211ENST00000520276 SNX19Q92543 992 aa10.12□□□□□ -0.79
TRPS1-211ENST00000520276 SGCDQ92629 289 aa10.12□□□□□ -0.79
TRPS1-211ENST00000520276 HTRA1Q92743 480 aa10.12□□□□□ -0.79
TRPS1-211ENST00000520276 CYP3A43Q9HB55 503 aa10.12□□□□□ -0.79
TRPS1-211ENST00000520276 MRPL47Q9HD33 250 aaKnown RBP10.12□□□□□ -0.79
TRPS1-211ENST00000520276 WDR70Q9NW82 654 aa10.12□□□□□ -0.79
TRPS1-211ENST00000520276 VPS28Q9UK41 221 aa10.12□□□□□ -0.79
TRPS1-211ENST00000520276 STYXL1Q9Y6J8 313 aa10.12□□□□□ -0.79
TRPS1-211ENST00000520276 TRIP12Q14669 1992 aaPredicted RBP10.12□□□□□ -0.79
TRPS1-211ENST00000520276 CCRL2O00421 344 aa10.12□□□□□ -0.79
TRPS1-211ENST00000520276 PRKCHP24723 683 aa10.12□□□□□ -0.79
TRPS1-211ENST00000520276 CCR10P46092 362 aa10.12□□□□□ -0.79
TRPS1-211ENST00000520276 IST1P53990 364 aa10.12□□□□□ -0.79
TRPS1-211ENST00000520276 ART3Q13508 389 aa10.12□□□□□ -0.79
TRPS1-211ENST00000520276 PLCL1Q15111 1095 aa10.12□□□□□ -0.79
TRPS1-211ENST00000520276 WSCD1Q658N2 575 aa10.12□□□□□ -0.79
TRPS1-211ENST00000520276 CES5AQ6NT32 575 aa10.12□□□□□ -0.79
TRPS1-211ENST00000520276 UNC5AQ6ZN44 842 aa10.12□□□□□ -0.79
TRPS1-211ENST00000520276 RTN4RL1Q86UN2 441 aaPredicted RBP10.12□□□□□ -0.79
TRPS1-211ENST00000520276 EPHX4Q8IUS5 362 aa10.12□□□□□ -0.79
TRPS1-211ENST00000520276 COLGALT1Q8NBJ5 622 aa10.12□□□□□ -0.79
TRPS1-211ENST00000520276 RNF34Q969K3 372 aa10.12□□□□□ -0.79
TRPS1-211ENST00000520276 TMEM216Q9P0N5 145 aa10.12□□□□□ -0.79
TRPS1-211ENST00000520276 SEPT3Q9UH03 358 aa10.12□□□□□ -0.79
TRPS1-211ENST00000520276 MRPL42Q9Y6G3 142 aaKnown RBP10.12□□□□□ -0.79
TRPS1-211ENST00000520276 SCN10AQ9Y5Y9 1956 aa10.12□□□□□ -0.79
TRPS1-211ENST00000520276 TPP1O14773 563 aa10.12□□□□□ -0.79
TRPS1-211ENST00000520276 RALBP11234 206 aa10.12□□□□□ -0.79
TRPS1-211ENST00000520276 EEF1DP29692 281 aaKnown RBP10.12□□□□□ -0.79
TRPS1-211ENST00000520276 KCNJ11Q14654 390 aa10.12□□□□□ -0.79
TRPS1-211ENST00000520276 EML3Q32P44 896 aa10.12□□□□□ -0.79
TRPS1-211ENST00000520276 CLLU1OSQ5K130 101 aa10.12□□□□□ -0.79
TRPS1-211ENST00000520276 PLEKHG7Q6ZR37 379 aa10.12□□□□□ -0.79
TRPS1-211ENST00000520276 AKAP14Q86UN6 197 aa10.12□□□□□ -0.79
TRPS1-211ENST00000520276 NEK6Q9HC98 313 aa10.12□□□□□ -0.79
TRPS1-211ENST00000520276 PNPLA8Q9NP80 782 aa10.12□□□□□ -0.79
TRPS1-211ENST00000520276 ZNF839A8K0R7 811 aa10.12□□□□□ -0.79
TRPS1-211ENST00000520276 TAF4O00268 1085 aa10.12□□□□□ -0.79
TRPS1-211ENST00000520276 CDK2AP1O14519 115 aa10.12□□□□□ -0.79
TRPS1-211ENST00000520276 DDHD2O94830 711 aa10.12□□□□□ -0.79
TRPS1-211ENST00000520276 GLUD1P00367 558 aa10.12□□□□□ -0.79
TRPS1-211ENST00000520276 JUNP05412 331 aaKnown RBP10.12□□□□□ -0.79
TRPS1-211ENST00000520276 F7P08709 466 aaPredicted RBP10.12□□□□□ -0.79
TRPS1-211ENST00000520276 OR1D2P34982 312 aa10.12□□□□□ -0.79
TRPS1-211ENST00000520276 FAM189BP81408 668 aa10.12□□□□□ -0.79
TRPS1-211ENST00000520276 RHDQ02161 417 aa10.12□□□□□ -0.79
TRPS1-211ENST00000520276 PPP4R4Q6NUP7 873 aa10.12□□□□□ -0.79
TRPS1-211ENST00000520276 PIGZQ86VD9 579 aa10.12□□□□□ -0.79
TRPS1-211ENST00000520276 SLC4A11Q8NBS3 891 aa10.12□□□□□ -0.79
TRPS1-211ENST00000520276 TNIP2Q8NFZ5 429 aa10.12□□□□□ -0.79
TRPS1-211ENST00000520276 CXorf38Q8TB03 319 aa10.12□□□□□ -0.79
TRPS1-211ENST00000520276 FAM149B1Q96BN6 582 aa10.12□□□□□ -0.79
TRPS1-211ENST00000520276 FAF2Q96CS3 445 aa10.12□□□□□ -0.79
TRPS1-211ENST00000520276 MED30Q96HR3 178 aa10.12□□□□□ -0.79
TRPS1-211ENST00000520276 IGSF21Q96ID5 467 aa10.12□□□□□ -0.79
TRPS1-211ENST00000520276 RAD21L1Q9H4I0 556 aa10.12□□□□□ -0.79
TRPS1-211ENST00000520276 ZNF576Q9H609 170 aa10.12□□□□□ -0.79
TRPS1-211ENST00000520276 TLR9Q9NR96 1032 aa10.12□□□□□ -0.79
TRPS1-211ENST00000520276 AASDHPPTQ9NRN7 309 aa10.12□□□□□ -0.79
TRPS1-211ENST00000520276 RAB6BQ9NRW1 208 aa10.12□□□□□ -0.79
TRPS1-211ENST00000520276 PSME2Q9UL46 239 aa10.12□□□□□ -0.79
TRPS1-211ENST00000520276 TMEM191CA6NGB0 347 aa10.11□□□□□ -0.79
TRPS1-211ENST00000520276 E7ENX8 843 aa10.11□□□□□ -0.79
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 45.2 ms