RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000516896.1

RNU6-175P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 175, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-175P, Length 107 nt, Biotype snRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-175P-201ENST00000516896 ZNHIT1O43257 154 aa-0.03□□□□□ -2.41
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RNU6-175P-201ENST00000516896 CDC123O75794 336 aaPredicted RBP-0.03□□□□□ -2.41
RNU6-175P-201ENST00000516896 AP2A2O94973 939 aa-0.03□□□□□ -2.41
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RNU6-175P-201ENST00000516896 WISP3O95389 354 aaPredicted RBP-0.03□□□□□ -2.41
RNU6-175P-201ENST00000516896 TNFRSF6BO95407 300 aa-0.03□□□□□ -2.41
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RNU6-175P-201ENST00000516896 PCDHGB5Q9Y5G0 923 aa-0.03□□□□□ -2.41
RNU6-175P-201ENST00000516896 STYXL1Q9Y6J8 313 aa-0.03□□□□□ -2.41
RNU6-175P-201ENST00000516896 FLT1P17948 1338 aa-0.04□□□□□ -2.42
RNU6-175P-201ENST00000516896 TBC1D3DA0A087WVF3 549 aa-0.04□□□□□ -2.42
RNU6-175P-201ENST00000516896 TBC1D3IA0A087WXS9 549 aa-0.04□□□□□ -2.42
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