RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000512014.5

SH3BP2-222, Transcript of SH3 domain binding protein 2, human

TSL 3

Gene SH3BP2, Length 688 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
SH3BP2-222	ENST00000512014	WDR92	Q96MX6	357 aa		12.72	□□□□□ -0.37
SH3BP2-222	ENST00000512014	TDRD1	Q9BXT4	1180 aa	Known RBP	12.72	□□□□□ -0.37
SH3BP2-222	ENST00000512014	CCDC86	Q9H6F5	360 aa	Known RBP	12.72	□□□□□ -0.37
SH3BP2-222	ENST00000512014	USP29	Q9HBJ7	922 aa		12.72	□□□□□ -0.37
SH3BP2-222	ENST00000512014	MRPL40	Q9NQ50	206 aa	Known RBP	12.72	□□□□□ -0.37
SH3BP2-222	ENST00000512014	REXO2	Q9Y3B8	237 aa	Known RBP	12.72	□□□□□ -0.37
SH3BP2-222	ENST00000512014	PCDHA13	Q9Y5I0	950 aa		12.72	□□□□□ -0.37
SH3BP2-222	ENST00000512014	ALG6	Q9Y672	507 aa		12.72	□□□□□ -0.37
SH3BP2-222	ENST00000512014	DGKB	Q9Y6T7	804 aa		12.72	□□□□□ -0.37
SH3BP2-222	ENST00000512014	SMG1	Q96Q15	3661 aa	Known RBP	12.72	□□□□□ -0.37
SH3BP2-222	ENST00000512014	EME2	A4GXA9	379 aa	Predicted RBP	12.71	□□□□□ -0.37
SH3BP2-222	ENST00000512014	SOWAHD	A6NJG2	315 aa		12.71	□□□□□ -0.37
SH3BP2-222	ENST00000512014	PSMD11	O00231	422 aa		12.71	□□□□□ -0.37
SH3BP2-222	ENST00000512014	OPA1	O60313	960 aa		12.71	□□□□□ -0.37
SH3BP2-222	ENST00000512014	SOD1	P00441	154 aa		12.71	□□□□□ -0.37
SH3BP2-222	ENST00000512014	JCHAIN	P01591	159 aa		12.71	□□□□□ -0.37
SH3BP2-222	ENST00000512014	GP1BA	P07359	652 aa		12.71	□□□□□ -0.37
SH3BP2-222	ENST00000512014	NOP2	P46087	812 aa	Known RBP	12.71	□□□□□ -0.37
SH3BP2-222	ENST00000512014	SKOR1	P84550	965 aa		12.71	□□□□□ -0.37
SH3BP2-222	ENST00000512014	E2F1	Q01094	437 aa		12.71	□□□□□ -0.37
SH3BP2-222	ENST00000512014	PTS	Q03393	145 aa		12.71	□□□□□ -0.37
SH3BP2-222	ENST00000512014	CYP4F3	Q08477	520 aa		12.71	□□□□□ -0.37
SH3BP2-222	ENST00000512014	ITK	Q08881	620 aa		12.71	□□□□□ -0.37
SH3BP2-222	ENST00000512014	TCEA2	Q15560	299 aa		12.71	□□□□□ -0.37
SH3BP2-222	ENST00000512014	CDKN3	Q16667	212 aa		12.71	□□□□□ -0.37
SH3BP2-222	ENST00000512014	PERM1	Q5SV97	790 aa		12.71	□□□□□ -0.37
SH3BP2-222	ENST00000512014	ZFYVE27	Q5T4F4	411 aa		12.71	□□□□□ -0.37
SH3BP2-222	ENST00000512014	CRTC1	Q6UUV9	634 aa		12.71	□□□□□ -0.37
SH3BP2-222	ENST00000512014		Q6ZVL8	140 aa		12.71	□□□□□ -0.37
SH3BP2-222	ENST00000512014	B4GALNT4	Q76KP1	1039 aa		12.71	□□□□□ -0.37
SH3BP2-222	ENST00000512014	CCDC170	Q8IYT3	715 aa		12.71	□□□□□ -0.37
SH3BP2-222	ENST00000512014	PDCD7	Q8N8D1	485 aa	Known RBP	12.71	□□□□□ -0.37
SH3BP2-222	ENST00000512014	TPCN2	Q8NHX9	752 aa		12.71	□□□□□ -0.37
SH3BP2-222	ENST00000512014	IFI44	Q8TCB0	444 aa		12.71	□□□□□ -0.37
SH3BP2-222	ENST00000512014	PTCD2	Q8WV60	388 aa	Known RBP	12.71	□□□□□ -0.37
SH3BP2-222	ENST00000512014	TADA1	Q96BN2	335 aa		12.71	□□□□□ -0.37
SH3BP2-222	ENST00000512014	NUS1	Q96E22	293 aa		12.71	□□□□□ -0.37
SH3BP2-222	ENST00000512014	PANX2	Q96RD6	677 aa		12.71	□□□□□ -0.37
SH3BP2-222	ENST00000512014	RBM15	Q96T37	977 aa	Known RBP eCLIP	12.71	□□□□□ -0.37
SH3BP2-222	ENST00000512014	TEX101	Q9BY14	249 aa		12.71	□□□□□ -0.37
SH3BP2-222	ENST00000512014	SLC13A1	Q9BZW2	595 aa		12.71	□□□□□ -0.37
SH3BP2-222	ENST00000512014	KL	Q9UEF7	1012 aa		12.71	□□□□□ -0.37
SH3BP2-222	ENST00000512014	CHKB	Q9Y259	395 aa		12.71	□□□□□ -0.37
SH3BP2-222	ENST00000512014	HEY1	Q9Y5J3	304 aa		12.71	□□□□□ -0.37
SH3BP2-222	ENST00000512014	ARHGEF17	Q96PE2	2063 aa	Predicted RBP	12.71	□□□□□ -0.38
SH3BP2-222	ENST00000512014	URB1	O60287	2271 aa	Known RBP	12.71	□□□□□ -0.38
SH3BP2-222	ENST00000512014		A0A0A6YYK5	440 aa	Predicted RBP	12.7	□□□□□ -0.38
SH3BP2-222	ENST00000512014	APOL1	O14791	398 aa		12.7	□□□□□ -0.38
SH3BP2-222	ENST00000512014	PSTPIP1	O43586	416 aa		12.7	□□□□□ -0.38
SH3BP2-222	ENST00000512014	RASGRP1	O95267	797 aa		12.7	□□□□□ -0.38
SH3BP2-222	ENST00000512014	MT-CO3	P00414	261 aa		12.7	□□□□□ -0.38
SH3BP2-222	ENST00000512014	CYP2A6	P11509	494 aa	Predicted RBP	12.7	□□□□□ -0.38
SH3BP2-222	ENST00000512014	KRT10	P13645	584 aa		12.7	□□□□□ -0.38
SH3BP2-222	ENST00000512014	TNNT1	P13805	278 aa		12.7	□□□□□ -0.38
SH3BP2-222	ENST00000512014	PECAM1	P16284	738 aa	Predicted RBP	12.7	□□□□□ -0.38
SH3BP2-222	ENST00000512014	TGM2	P21980	687 aa		12.7	□□□□□ -0.38
SH3BP2-222	ENST00000512014	CES1	P23141	567 aa		12.7	□□□□□ -0.38
SH3BP2-222	ENST00000512014	HTR1B	P28222	390 aa		12.7	□□□□□ -0.38
SH3BP2-222	ENST00000512014	BLK	P51451	505 aa		12.7	□□□□□ -0.38
SH3BP2-222	ENST00000512014	STC1	P52823	247 aa		12.7	□□□□□ -0.38
SH3BP2-222	ENST00000512014	LLGL1	Q15334	1064 aa		12.7	□□□□□ -0.38
SH3BP2-222	ENST00000512014	HS1BP3	Q53T59	392 aa		12.7	□□□□□ -0.38
SH3BP2-222	ENST00000512014	LRRC66	Q68CR7	880 aa		12.7	□□□□□ -0.38
SH3BP2-222	ENST00000512014	DENND2C	Q68D51	928 aa		12.7	□□□□□ -0.38
SH3BP2-222	ENST00000512014	RAD9B	Q6WBX8	426 aa		12.7	□□□□□ -0.38
SH3BP2-222	ENST00000512014	USP45	Q70EL2	814 aa		12.7	□□□□□ -0.38
SH3BP2-222	ENST00000512014	EFL1	Q7Z2Z2	1120 aa	Known RBP	12.7	□□□□□ -0.38
SH3BP2-222	ENST00000512014	TMEM139	Q8IV31	216 aa		12.7	□□□□□ -0.38
SH3BP2-222	ENST00000512014	SFTPA2	Q8IWL1	248 aa		12.7	□□□□□ -0.38
SH3BP2-222	ENST00000512014	FSTL5	Q8N475	847 aa	Predicted RBP	12.7	□□□□□ -0.38
SH3BP2-222	ENST00000512014	PAF1	Q8N7H5	531 aa		12.7	□□□□□ -0.38
SH3BP2-222	ENST00000512014	CCNY	Q8ND76	341 aa		12.7	□□□□□ -0.38
SH3BP2-222	ENST00000512014	OR56A4	Q8NGH8	313 aa		12.7	□□□□□ -0.38
SH3BP2-222	ENST00000512014	KRT35	Q92764	455 aa		12.7	□□□□□ -0.38
SH3BP2-222	ENST00000512014	TRIB3	Q96RU7	358 aa		12.7	□□□□□ -0.38
SH3BP2-222	ENST00000512014	WDR24	Q96S15	920 aa		12.7	□□□□□ -0.38
SH3BP2-222	ENST00000512014	LYSMD1	Q96S90	227 aa		12.7	□□□□□ -0.38
SH3BP2-222	ENST00000512014	CEP41	Q9BYV8	373 aa		12.7	□□□□□ -0.38
SH3BP2-222	ENST00000512014	FRMD8	Q9BZ67	464 aa	Predicted RBP	12.7	□□□□□ -0.38
SH3BP2-222	ENST00000512014	ABCG8	Q9H221	673 aa		12.7	□□□□□ -0.38
SH3BP2-222	ENST00000512014	WDR26	Q9H7D7	661 aa		12.7	□□□□□ -0.38
SH3BP2-222	ENST00000512014	DDX56	Q9NY93	547 aa	Known RBP	12.7	□□□□□ -0.38
SH3BP2-222	ENST00000512014	SAE1	Q9UBE0	346 aa	Predicted RBP	12.7	□□□□□ -0.38
SH3BP2-222	ENST00000512014	CLCA2	Q9UQC9	943 aa		12.7	□□□□□ -0.38
SH3BP2-222	ENST00000512014	PCDHB1	Q9Y5F3	818 aa		12.7	□□□□□ -0.38
SH3BP2-222	ENST00000512014	ST14	Q9Y5Y6	855 aa		12.7	□□□□□ -0.38
SH3BP2-222	ENST00000512014	EPN1	Q9Y6I3	576 aa	Predicted RBP	12.7	□□□□□ -0.38
SH3BP2-222	ENST00000512014	DUSP10	Q9Y6W6	482 aa		12.7	□□□□□ -0.38
SH3BP2-222	ENST00000512014	CAPN8	A6NHC0	703 aa		12.69	□□□□□ -0.38
SH3BP2-222	ENST00000512014	CACNB4	O00305	520 aa	Predicted RBP	12.69	□□□□□ -0.38
SH3BP2-222	ENST00000512014	TNFRSF10C	O14798	259 aa		12.69	□□□□□ -0.38
SH3BP2-222	ENST00000512014	SPOP	O43791	374 aa		12.69	□□□□□ -0.38
SH3BP2-222	ENST00000512014	NDUFA10	O95299	355 aa		12.69	□□□□□ -0.38
SH3BP2-222	ENST00000512014	CEACAM5	P06731	702 aa		12.69	□□□□□ -0.38
SH3BP2-222	ENST00000512014	ANXA6	P08133	673 aa		12.69	□□□□□ -0.38
SH3BP2-222	ENST00000512014	MYCLP1	P12525	358 aa	Predicted RBP	12.69	□□□□□ -0.38
SH3BP2-222	ENST00000512014	TEAD1	P28347	426 aa		12.69	□□□□□ -0.38
SH3BP2-222	ENST00000512014	CD86	P42081	329 aa		12.69	□□□□□ -0.38
SH3BP2-222	ENST00000512014	DUSP3	P51452	185 aa	Predicted RBP	12.69	□□□□□ -0.38
SH3BP2-222	ENST00000512014	DYNLT1	P63172	113 aa		12.69	□□□□□ -0.38

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