RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000511747.5

SH3BP2-221, Transcript of SH3 domain binding protein 2, humanhuman

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene SH3BP2, Length 2,351 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP2-221ENST00000511747 H3BNH8 94 aa27.11■■□□□ 1.93
SH3BP2-221ENST00000511747 PPP6CO00743 305 aa27.11■■□□□ 1.93
SH3BP2-221ENST00000511747 MMP2P08253 660 aa27.11■■□□□ 1.93
SH3BP2-221ENST00000511747 NME5P56597 212 aa27.11■■□□□ 1.93
SH3BP2-221ENST00000511747 DSC2Q02487 901 aa27.11■■□□□ 1.93
SH3BP2-221ENST00000511747 CCL14Q16627 93 aa27.11■■□□□ 1.93
SH3BP2-221ENST00000511747 FSCN1Q16658 493 aaKnown RBP27.11■■□□□ 1.93
SH3BP2-221ENST00000511747 KIF19Q2TAC6 998 aa27.11■■□□□ 1.93
SH3BP2-221ENST00000511747 CD300LGQ6UXG3 332 aa27.11■■□□□ 1.93
SH3BP2-221ENST00000511747 OR2T34Q8NGX1 318 aa27.11■■□□□ 1.93
SH3BP2-221ENST00000511747 OR2T3Q8NH03 318 aa27.11■■□□□ 1.93
SH3BP2-221ENST00000511747 PHF24Q9UPV7 400 aa27.11■■□□□ 1.93
SH3BP2-221ENST00000511747 MYRFQ9Y2G1 1151 aa27.11■■□□□ 1.93
SH3BP2-221ENST00000511747 TRPV2Q9Y5S1 764 aa27.11■■□□□ 1.93
SH3BP2-221ENST00000511747 A0A0J9YYE9 177 aa27.11■■□□□ 1.93
SH3BP2-221ENST00000511747 AKAP10O43572 662 aa27.11■■□□□ 1.93
SH3BP2-221ENST00000511747 TRMUO75648 421 aaKnown RBP27.11■■□□□ 1.93
SH3BP2-221ENST00000511747 HAPLN1P10915 354 aaPredicted RBP27.11■■□□□ 1.93
SH3BP2-221ENST00000511747 BMP2P12643 396 aa27.11■■□□□ 1.93
SH3BP2-221ENST00000511747 PRKCQQ04759 706 aa27.11■■□□□ 1.93
SH3BP2-221ENST00000511747 MAP2K5Q13163 448 aa27.11■■□□□ 1.93
SH3BP2-221ENST00000511747 NHSL2Q5HYW2 709 aa27.11■■□□□ 1.93
SH3BP2-221ENST00000511747 PIK3R6Q5UE93 754 aa27.11■■□□□ 1.93
SH3BP2-221ENST00000511747 UMODL1-AS1Q8N2C9 162 aa27.11■■□□□ 1.93
SH3BP2-221ENST00000511747 FAM81AQ8TBF8 368 aa27.11■■□□□ 1.93
SH3BP2-221ENST00000511747 HMCESQ96FZ2 354 aa27.11■■□□□ 1.93
SH3BP2-221ENST00000511747 C1orf74Q96LT6 269 aa27.11■■□□□ 1.93
SH3BP2-221ENST00000511747 IL1RL2Q9HB29 575 aa27.11■■□□□ 1.93
SH3BP2-221ENST00000511747 ARMC1Q9NVT9 282 aa27.11■■□□□ 1.93
SH3BP2-221ENST00000511747 MAP10Q9P2G4 905 aa27.11■■□□□ 1.93
SH3BP2-221ENST00000511747 KCTD3Q9Y597 815 aa27.11■■□□□ 1.93
SH3BP2-221ENST00000511747 DOCK3Q8IZD9 2030 aa27.1■■□□□ 1.93
SH3BP2-221ENST00000511747 WASH4PA8MWX3 477 aa27.1■■□□□ 1.93
SH3BP2-221ENST00000511747 IRF5Q13568 498 aa27.1■■□□□ 1.93
SH3BP2-221ENST00000511747 MAPRE1Q15691 268 aaKnown RBP27.1■■□□□ 1.93
SH3BP2-221ENST00000511747 MORN1Q5T089 497 aa27.1■■□□□ 1.93
SH3BP2-221ENST00000511747 PPP4R4Q6NUP7 873 aa27.1■■□□□ 1.93
SH3BP2-221ENST00000511747 RYBPQ8N488 228 aaPredicted RBP27.1■■□□□ 1.93
SH3BP2-221ENST00000511747 ANKFN1Q8N957 763 aa27.1■■□□□ 1.93
SH3BP2-221ENST00000511747 FAM110BQ8TC76 370 aa27.1■■□□□ 1.93
SH3BP2-221ENST00000511747 TMIGD2Q96BF3 282 aa27.1■■□□□ 1.93
SH3BP2-221ENST00000511747 RGS18Q9NS28 235 aa27.1■■□□□ 1.93
SH3BP2-221ENST00000511747 PNPLA3Q9NST1 481 aa27.1■■□□□ 1.93
SH3BP2-221ENST00000511747 POLR3BQ9NW08 1133 aaPredicted RBP27.1■■□□□ 1.93
SH3BP2-221ENST00000511747 DUS2Q9NX74 493 aaKnown RBP27.1■■□□□ 1.93
SH3BP2-221ENST00000511747 A0A1W2PQH9 124 aa27.09■■□□□ 1.93
SH3BP2-221ENST00000511747 CHRNA1P02708 482 aa27.09■■□□□ 1.93
SH3BP2-221ENST00000511747 NFKB2Q00653 900 aa27.09■■□□□ 1.93
SH3BP2-221ENST00000511747 EXT2Q93063 718 aa27.09■■□□□ 1.93
SH3BP2-221ENST00000511747 GPATCH1Q9BRR8 931 aaKnown RBP27.09■■□□□ 1.93
SH3BP2-221ENST00000511747 ANKRD60Q9BZ19 345 aa27.09■■□□□ 1.93
SH3BP2-221ENST00000511747 AGO3Q9H9G7 860 aaKnown RBP27.09■■□□□ 1.93
SH3BP2-221ENST00000511747 PTGDR2Q9Y5Y4 395 aa27.09■■□□□ 1.93
SH3BP2-221ENST00000511747 PLOD2O00469 737 aa27.09■■□□□ 1.93
SH3BP2-221ENST00000511747 SOCS2O14508 198 aa27.09■■□□□ 1.93
SH3BP2-221ENST00000511747 SLC4A1P02730 911 aa27.09■■□□□ 1.93
SH3BP2-221ENST00000511747 ATP6V1B2P21281 511 aa27.09■■□□□ 1.93
SH3BP2-221ENST00000511747 NRG1Q02297 640 aaPredicted RBP27.09■■□□□ 1.93
SH3BP2-221ENST00000511747 VPS26BQ4G0F5 336 aa27.09■■□□□ 1.93
SH3BP2-221ENST00000511747 SIRPB2Q5JXA9 342 aa27.09■■□□□ 1.93
SH3BP2-221ENST00000511747 SPATA2LQ8IUW3 424 aaPredicted RBP27.09■■□□□ 1.93
SH3BP2-221ENST00000511747 RMND5BQ96G75 393 aaPredicted RBP27.09■■□□□ 1.93
SH3BP2-221ENST00000511747 DSEQ9UL01 958 aa27.09■■□□□ 1.93
SH3BP2-221ENST00000511747 M0QZQ0 153 aa27.08■■□□□ 1.93
SH3BP2-221ENST00000511747 TSPY1Q01534 308 aa27.08■■□□□ 1.93
SH3BP2-221ENST00000511747 IL31Q6EBC2 164 aa27.08■■□□□ 1.93
SH3BP2-221ENST00000511747 THEM5Q8N1Q8 247 aa27.08■■□□□ 1.93
SH3BP2-221ENST00000511747 RSPH1Q8WYR4 309 aa27.08■■□□□ 1.93
SH3BP2-221ENST00000511747 FNIP2Q9P278 1114 aa27.08■■□□□ 1.93
SH3BP2-221ENST00000511747 GIMAP2Q9UG22 337 aa27.08■■□□□ 1.93
SH3BP2-221ENST00000511747 CPA4Q9UI42 421 aa27.08■■□□□ 1.93
SH3BP2-221ENST00000511747 NR5A2O00482 541 aa27.08■■□□□ 1.93
SH3BP2-221ENST00000511747 NME4O00746 187 aa27.08■■□□□ 1.93
SH3BP2-221ENST00000511747 CDK14O94921 469 aa27.08■■□□□ 1.93
SH3BP2-221ENST00000511747 SIX3O95343 332 aaPredicted RBP27.08■■□□□ 1.93
SH3BP2-221ENST00000511747 CD1DP15813 335 aa27.08■■□□□ 1.93
SH3BP2-221ENST00000511747 NDST2P52849 883 aa27.08■■□□□ 1.93
SH3BP2-221ENST00000511747 GEN1Q17RS7 908 aa27.08■■□□□ 1.93
SH3BP2-221ENST00000511747 ERMP1Q7Z2K6 904 aa27.08■■□□□ 1.93
SH3BP2-221ENST00000511747 TBATAQ96M53 351 aa27.08■■□□□ 1.93
SH3BP2-221ENST00000511747 SERPINB11Q96P15 392 aa27.08■■□□□ 1.93
SH3BP2-221ENST00000511747 HOPXQ9BPY8 73 aaPredicted RBP27.08■■□□□ 1.93
SH3BP2-221ENST00000511747 TIMMDC1Q9NPL8 285 aa27.08■■□□□ 1.93
SH3BP2-221ENST00000511747 CCM2LQ9NUG4 571 aaPredicted RBP27.08■■□□□ 1.93
SH3BP2-221ENST00000511747 UXTQ9UBK9 157 aaPredicted RBP27.08■■□□□ 1.93
SH3BP2-221ENST00000511747 RSL24D1Q9UHA3 163 aaKnown RBP27.08■■□□□ 1.93
SH3BP2-221ENST00000511747 BBIP1A8MTZ0 92 aa27.07■■□□□ 1.92
SH3BP2-221ENST00000511747 FAM155AB1AL88 458 aaPredicted RBP27.07■■□□□ 1.92
SH3BP2-221ENST00000511747 LDB2O43679 373 aa27.07■■□□□ 1.92
SH3BP2-221ENST00000511747 ITGB1P05556 798 aa27.07■■□□□ 1.92
SH3BP2-221ENST00000511747 FGF4P08620 206 aa27.07■■□□□ 1.92
SH3BP2-221ENST00000511747 CDK4P11802 303 aa27.07■■□□□ 1.92
SH3BP2-221ENST00000511747 IRAK1BP1Q5VVH5 260 aa27.07■■□□□ 1.92
SH3BP2-221ENST00000511747 MRPL10Q7Z7H8 261 aaKnown RBP27.07■■□□□ 1.92
SH3BP2-221ENST00000511747 PTGR2Q8N8N7 351 aaPredicted RBP27.07■■□□□ 1.92
SH3BP2-221ENST00000511747 TFAP2CQ92754 450 aa27.07■■□□□ 1.92
SH3BP2-221ENST00000511747 PSMG2Q969U7 264 aa27.07■■□□□ 1.92
SH3BP2-221ENST00000511747 MID1IP1Q9NPA3 183 aa27.07■■□□□ 1.92
SH3BP2-221ENST00000511747 AURKCQ9UQB9 309 aa27.07■■□□□ 1.92
SH3BP2-221ENST00000511747 HNRNPRO43390 633 aaKnown RBP27.07■■□□□ 1.92
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 26.5 ms