RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000511185.5

SH3BP2-218, Transcript of SH3 domain binding protein 2, humanhuman

TSL 2

Gene SH3BP2, Length 1,071 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP2-218ENST00000511185 TMEM202A6NGA9 273 aa18.72■□□□□ 0.59
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SH3BP2-218ENST00000511185 BTNL10A8MVZ5 291 aa18.72■□□□□ 0.59
SH3BP2-218ENST00000511185 AQP9O43315 295 aa18.72■□□□□ 0.59
SH3BP2-218ENST00000511185 CYP2A6P11509 494 aaPredicted RBP18.72■□□□□ 0.59
SH3BP2-218ENST00000511185 ZFXP17010 805 aaPredicted RBP18.72■□□□□ 0.59
SH3BP2-218ENST00000511185 PTPN3P26045 913 aa18.72■□□□□ 0.59
SH3BP2-218ENST00000511185 ZNF211Q13398 564 aaPredicted RBP18.72■□□□□ 0.59
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SH3BP2-218ENST00000511185 FAM118BQ9BPY3 351 aa18.7■□□□□ 0.58
SH3BP2-218ENST00000511185 WDR26Q9H7D7 661 aa18.7■□□□□ 0.58
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SH3BP2-218ENST00000511185 GOLGA6BA6NDN3 693 aa18.69■□□□□ 0.58
SH3BP2-218ENST00000511185 PSMD11O00231 422 aa18.69■□□□□ 0.58
SH3BP2-218ENST00000511185 TOR1BO14657 336 aa18.69■□□□□ 0.58
SH3BP2-218ENST00000511185 ZRANB2O95218 330 aaKnown RBP eCLIP18.69■□□□□ 0.58
SH3BP2-218ENST00000511185 GOLGA6DP0CG33 693 aa18.69■□□□□ 0.58
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SH3BP2-218ENST00000511185 HK3P52790 923 aa18.69■□□□□ 0.58
SH3BP2-218ENST00000511185 SRP54P61011 504 aaKnown RBP18.69■□□□□ 0.58
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SH3BP2-218ENST00000511185 TECPR1Q7Z6L1 1165 aa18.69■□□□□ 0.58
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SH3BP2-218ENST00000511185 RCOR2Q8IZ40 523 aa18.69■□□□□ 0.58
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SH3BP2-218ENST00000511185 SLC13A1Q9BZW2 595 aa18.69■□□□□ 0.58
SH3BP2-218ENST00000511185 GOLGA6AQ9NYA3 693 aa18.69■□□□□ 0.58
SH3BP2-218ENST00000511185 SPASTQ9UBP0 616 aa18.69■□□□□ 0.58
SH3BP2-218ENST00000511185 PCDHGA1Q9Y5H4 931 aa18.69■□□□□ 0.58
SH3BP2-218ENST00000511185 PCDHA3Q9Y5H8 950 aa18.69■□□□□ 0.58
SH3BP2-218ENST00000511185 CELSR3Q9NYQ7 3312 aa18.68■□□□□ 0.58
SH3BP2-218ENST00000511185 CLDN7O95471 211 aa18.68■□□□□ 0.58
SH3BP2-218ENST00000511185 FTCDO95954 541 aa18.68■□□□□ 0.58
SH3BP2-218ENST00000511185 PIRTP0C851 137 aa18.68■□□□□ 0.58
SH3BP2-218ENST00000511185 ALPPL2P10696 532 aa18.68■□□□□ 0.58
SH3BP2-218ENST00000511185 CKMT1AP12532 417 aa18.68■□□□□ 0.58
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