RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000509368.6

PDE4D-218, Transcript of phosphodiesterase 4D, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene PDE4D, Length 2,809 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE4D-218ENST00000509368 DMWDQ09019 674 aa2.3□□□□□ -2.04
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PDE4D-218ENST00000509368 IKQ13123 557 aaPredicted RBP2.3□□□□□ -2.04
PDE4D-218ENST00000509368 SLC14A1Q13336 389 aa2.3□□□□□ -2.04
PDE4D-218ENST00000509368 FRG1Q14331 258 aaKnown RBP2.3□□□□□ -2.04
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PDE4D-218ENST00000509368 ZNF831Q5JPB2 1677 aa2.3□□□□□ -2.04
PDE4D-218ENST00000509368 TOR1AIP1Q5JTV8 583 aa2.3□□□□□ -2.04
PDE4D-218ENST00000509368 CBWD3Q5JTY5 395 aa2.3□□□□□ -2.04
PDE4D-218ENST00000509368 KRBOX4Q5JUW0 171 aa2.3□□□□□ -2.04
PDE4D-218ENST00000509368 TMEM268Q5VZI3 342 aa2.3□□□□□ -2.04
PDE4D-218ENST00000509368 NAPEPLDQ6IQ20 393 aa2.3□□□□□ -2.04
PDE4D-218ENST00000509368 TSSK4Q6SA08 328 aa2.3□□□□□ -2.04
PDE4D-218ENST00000509368 TAX1BP1Q86VP1 789 aa2.3□□□□□ -2.04
PDE4D-218ENST00000509368 ANKRD13BQ86YJ7 626 aa2.3□□□□□ -2.04
PDE4D-218ENST00000509368 C4orf19Q8IY42 314 aa2.3□□□□□ -2.04
PDE4D-218ENST00000509368 ELOA2Q8IYF1 753 aaPredicted RBP2.3□□□□□ -2.04
PDE4D-218ENST00000509368 CCDC170Q8IYT3 715 aa2.3□□□□□ -2.04
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PDE4D-218ENST00000509368 MMP21Q8N119 569 aa2.3□□□□□ -2.04
PDE4D-218ENST00000509368 GHDCQ8N2G8 530 aa2.3□□□□□ -2.04
PDE4D-218ENST00000509368 EXD3Q8N9H8 876 aa2.3□□□□□ -2.04
PDE4D-218ENST00000509368 TC2NQ8N9U0 490 aa2.3□□□□□ -2.04
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PDE4D-218ENST00000509368 ABHD11Q8NFV4 315 aa2.3□□□□□ -2.04
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PDE4D-218ENST00000509368 DENND1AQ8TEH3 1009 aa2.3□□□□□ -2.04
PDE4D-218ENST00000509368 ADAMTS14Q8WXS8 1223 aa2.3□□□□□ -2.04
PDE4D-218ENST00000509368 KCNJ9Q92806 393 aa2.3□□□□□ -2.04
PDE4D-218ENST00000509368 TMEM125Q96AQ2 219 aa2.3□□□□□ -2.04
PDE4D-218ENST00000509368 PDLIM5Q96HC4 596 aaKnown RBP2.3□□□□□ -2.04
PDE4D-218ENST00000509368 CABS1Q96KC9 395 aa2.3□□□□□ -2.04
PDE4D-218ENST00000509368 CCDC114Q96M63 670 aa2.3□□□□□ -2.04
PDE4D-218ENST00000509368 CEP295NLQ96MC4 621 aa2.3□□□□□ -2.04
PDE4D-218ENST00000509368 LBHD1Q9BQE6 289 aaPredicted RBP2.3□□□□□ -2.04
PDE4D-218ENST00000509368 FERMT1Q9BQL6 677 aa2.3□□□□□ -2.04
PDE4D-218ENST00000509368 TNMDQ9H2S6 317 aa2.3□□□□□ -2.04
PDE4D-218ENST00000509368 ZCCHC4Q9H5U6 513 aa2.3□□□□□ -2.04
PDE4D-218ENST00000509368 TXNRD2Q9NNW7 524 aa2.3□□□□□ -2.04
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PDE4D-218ENST00000509368 INTS10Q9NVR2 710 aaKnown RBP2.3□□□□□ -2.04
PDE4D-218ENST00000509368 TRMT1Q9NXH9 659 aaKnown RBP2.3□□□□□ -2.04
PDE4D-218ENST00000509368 CNOT11Q9UKZ1 510 aaKnown RBP2.3□□□□□ -2.04
PDE4D-218ENST00000509368 COG5Q9UP83 839 aa2.3□□□□□ -2.04
PDE4D-218ENST00000509368 THSD7AQ9UPZ6 1657 aa2.3□□□□□ -2.04
PDE4D-218ENST00000509368 CMAHPQ9Y471 501 aa2.3□□□□□ -2.04
PDE4D-218ENST00000509368 PARP4Q9UKK3 1724 aaKnown RBP2.3□□□□□ -2.04
PDE4D-218ENST00000509368 MYOM2P54296 1465 aa2.3□□□□□ -2.04
PDE4D-218ENST00000509368 TECPR2O15040 1411 aa2.3□□□□□ -2.04
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PDE4D-218ENST00000509368 ZNF263O14978 683 aa2.3□□□□□ -2.04
PDE4D-218ENST00000509368 PGRMC2O15173 223 aa2.3□□□□□ -2.04
PDE4D-218ENST00000509368 IPO8O15397 1037 aaKnown RBP2.3□□□□□ -2.04
PDE4D-218ENST00000509368 MPPED1O15442 326 aa2.3□□□□□ -2.04
PDE4D-218ENST00000509368 HMMRO75330 724 aa2.3□□□□□ -2.04
PDE4D-218ENST00000509368 GATA3P23771 443 aa2.3□□□□□ -2.04
PDE4D-218ENST00000509368 KLRC2P26717 231 aa2.3□□□□□ -2.04
PDE4D-218ENST00000509368 AMPHP49418 695 aa2.3□□□□□ -2.04
PDE4D-218ENST00000509368 SNU13P55769 128 aaKnown RBP2.3□□□□□ -2.04
PDE4D-218ENST00000509368 PSMC6P62333 389 aa2.3□□□□□ -2.04
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PDE4D-218ENST00000509368 ITGA7Q13683 1181 aa2.3□□□□□ -2.04
PDE4D-218ENST00000509368 ZNF273Q14593 569 aa2.3□□□□□ -2.04
PDE4D-218ENST00000509368 NAB2Q15742 525 aa2.3□□□□□ -2.04
PDE4D-218ENST00000509368 LY6KQ17RY6 165 aa2.3□□□□□ -2.04
PDE4D-218ENST00000509368 CD300EQ496F6 205 aaPredicted RBP2.3□□□□□ -2.04
PDE4D-218ENST00000509368 SETMARQ53H47 684 aaPredicted RBP2.3□□□□□ -2.04
PDE4D-218ENST00000509368 SFMBT2Q5VUG0 894 aa2.3□□□□□ -2.04
PDE4D-218ENST00000509368 VSTM1Q6UX27 236 aa2.3□□□□□ -2.04
PDE4D-218ENST00000509368 KYAT3Q6YP21 454 aaKnown RBP2.3□□□□□ -2.04
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PDE4D-218ENST00000509368 SEPT14Q6ZU15 432 aa2.3□□□□□ -2.04
PDE4D-218ENST00000509368 Q6ZWC4 215 aa2.3□□□□□ -2.04
PDE4D-218ENST00000509368 DNAJB7Q7Z6W7 309 aaPredicted RBP2.3□□□□□ -2.04
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PDE4D-218ENST00000509368 ADGRF3Q8IZF5 1079 aa2.3□□□□□ -2.04
PDE4D-218ENST00000509368 HDDC3Q8N4P3 179 aa2.3□□□□□ -2.04
PDE4D-218ENST00000509368 PI4KAP1Q8N8J0 262 aa2.3□□□□□ -2.04
PDE4D-218ENST00000509368 NAT8LQ8N9F0 302 aa2.3□□□□□ -2.04
PDE4D-218ENST00000509368 OR52N4Q8NGI2 321 aa2.3□□□□□ -2.04
PDE4D-218ENST00000509368 BCAS4Q8TDM0 211 aa2.3□□□□□ -2.04
PDE4D-218ENST00000509368 ZFAND2BQ8WV99 257 aa2.3□□□□□ -2.04
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PDE4D-218ENST00000509368 NACC2Q96BF6 587 aa2.3□□□□□ -2.04
PDE4D-218ENST00000509368 PRR25Q96S07 402 aa2.3□□□□□ -2.04
PDE4D-218ENST00000509368 ABHD1Q96SE0 405 aa2.3□□□□□ -2.04
PDE4D-218ENST00000509368 FSD1LQ9BXM9 530 aa2.3□□□□□ -2.04
PDE4D-218ENST00000509368 ANKZF1Q9H8Y5 726 aa2.3□□□□□ -2.04
PDE4D-218ENST00000509368 TLR8Q9NR97 1041 aaKnown RBP2.3□□□□□ -2.04
PDE4D-218ENST00000509368 SNTG1Q9NSN8 517 aa2.3□□□□□ -2.04
PDE4D-218ENST00000509368 ABCB8Q9NUT2 735 aa2.3□□□□□ -2.04
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